Curso: Medicina
Docente: Ivaneide Teixeira
Disciplina: Bioquímica
AMINOÁCIDOS, PEPTÍDICOS
E PROTEÍNAS
Proteínas
São polímeros compostos de n unidades monoméricas ligados entre si por ligações
peptídicas.
Proteína (polímero)
(monômero)
aminoácido
H3N —
COO
C — H
R
+
R – a cadeia lateral
R diferencia os aminoácidos entre si
influenciam a solubilidade em água
Aminoácido 1 Aminoácido 2
α-amino α-amino
100 aminoácidos (10 kDa) peptídeo
Mais de 100 aminoácidos proteína
dipeptídeo
Isomeria Óptica
C 𝛼 é um centro quiral/
carbono assimétrico
Molécula assimétrica e Carbono assimétrico
H3N —
COO
C — H
R
+
Quiral ou Assimétrico
Talidomida
Isômeros
ópticos/enantiômeros
Imagem não Superponível
Existem 2 isômeros ópticos do Cα: formas L e D
• São enantiômeros (imagens especulares) um do outro;
• Não são interconversíveis sem quebra de laços
Fonte: NELSON, D. L.;
COX, M.M. Princípios de
Bioquímica de Lehninger
efeito teratogênico
Bastante comercializado na Europa, nas décadas de 50 e 60, como
sedativo para aliviar náuseas em mulheres grávidas.
A molécula desse composto é assimétrica.
A talidomida possui dois isômeros espaciais ou estereoisômeros.
No entanto, essa diferença na conformação espacial dos átomos acaba
por resultar em diferentes propriedades biológicas exercidas em um
organismo vivo. Com o tempo, descobriu-se que somente o isômero
dextrógiro ou (D) era responsável pelas propriedades analgésicas,
sedativas e, enquanto a talidomida levógiro (L) é teratogênica, isto é,
provoca mutações no feto.
Curiosidade sobre a Talidomida
Isomeria óptica
Substâncias opticamente ativas (possuem C quirais) interagem com a luz polarizada,
girando o plano da luz para esquerda (levógiros) ou para a direita (dextrógiros).
Inicialmente descoberta para ácidos orgânicos e açúcares, com vários C quirais.
+
2. Solução de
substância opticamente
ativa causa rotação do
plano da luz polarizada
3. Plano da luz que
emerge da solução foi
desviado para a
esquerda ou para a
direita pela substância
em solução
4. Observador gira a
escala até coincidir com
a luz emergente, para
determinar o desvio
1. Um plano de
luz é
selecionado
Filtro
polarizador
Fonte de
luz
polarímetro
COO
C — H
R
H3N —
+
α
Proteínas naturais possuem somente L-
aminoácidos.
D-Aminoácidos ocorrem em peptídeos,
antibióticos, e carboidratos.
AQUI ENTRA
A CHAMADA
EM DESTAQUE
Paredes de células de bactérias (peptideoglicano);
D-serina - bicho-da-seda (entre 5 e 59%);
D-alanina e a D-serina - saliva, urina, plasma
sanguíneo, soro sanguíneo, leite e líquido céfalo-
raquidiano);
D-aminoácidos componentes de muitos peptídeos
antibióticos produzidos por bactérias (valinomicina,
gramicidina A, actinomicina D).
D-aminoácidos
Isomeria óptica: os açúcares naturais são de série D.
*
D- Gliceraldeído
1 carbono quiral
D-glicose
D-manose D-galactose
Glicose:
•4 Carbonos quirais
•16 isômeros possíveis
• Carbono 5 define a
configuração D- ou L-
D- Gliceraldeído
1 C quiral
*
AQUI ENTRA
A CHAMADA
EM DESTAQUE
Proteínas
Proteínas são moléculas tridimensionais.
A forma da molécula é determinante de sua função.
Somente os L-aminoácidos são
constituintes das proteínas
L-Alanina D-Alanina
Proteínas Uma das macromoléculas mais abundantes em sistemas orgânicos:
Representam 20% da massa de uma célula 7,9.109
proteínas/célula
100 mil proteínas diferentes em uma única célula
Enzima
Receptor
Transportadora
São as biomoléculas mais versáteis dos sistemas biológicos.
574 aa
Proteínas
Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M.
Princípios de Bioquímica de Lehninger
★As proteínas possuem uma estrutura tridimensional, determinada por
sua sequência de aminoácidos e da qual depende a função da proteína;
★As forças mais importantes que estabilizam essa estrutura específica
são as FORÇAS NÃO-COVALENTES;
Conceituando, para ficar
inteirado !!!
Heme
O O2 liga-se ao átomo de Fe do heme.
Proteínas
Proteínas organizam moléculas de água em torno de si, formando uma
camada de solvatação, que garante a solubilidade em meio aquoso.
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Proteínas
A Citocromo C oxidase é uma proteína de
membrana.
Possuem uma região de aminoácidos hidrofóbicos apolares, cadeias laterais projetam-se
para “fora” e interagem com a porção lipídica de membrana celulares. Outras regiões
dessas proteínas ricas em aminoácidos hidrofílicos polares projetam-se para os meios
aquosos extra ou intracelular, e podem formar “canais” hidrofílicos que atravessam a
membrana, interconectando os meios separados por ela.
Corte transversal da membrana interna
da mitocôndria
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Responda às seguintes perguntas:
Como as proteínas assumem uma forma tridimensional a partir
de suas estruturas lineares ?
Que tipo de forças físicas mantêm a estrutura tridimensional das
proteínas ?
Calma ! Você saberá responder a essas questões até o final dessa aula.
Forças fracas estabiliza a proteína
Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios de
Bioquímica de Lehninger
Proteínas
Conformação = Arranjo espacial
dos átomos
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Forças fracas estabiliza a proteína
As características físico-químicas
★ da ligação peptídica
★ das cadeias laterais dos aminoácidos
determinam como o esqueleto covalente de uma proteína vai se enovelar
determinam os tipos de forças, covalentes e não covalentes, que irão estabilizar a
estrutura tridimensional de uma proteína.
Os aminoácidos apresentam várias funções químicas que podem se ionizar e
conferir carga elétrica à molécula.
★ Todos os aminoácidos
possuem um grupo
carboxila.
★ Ácido aspártico e ácido
glutâmico possuem 2
grupos carboxila
Exemplo:
Função carboxila
Função amina
estado de ionização depende do pH do meio
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
AQUI ENTRA A CHAMADA
EM DESTAQUE
Proteínas: Estruturas Primárias
É definida pela seqüência LINEAR dos aminoácidos unidos por ligações
covalentes.
A seqüência dos aminoácidos na proteínas é dependente do GENE.
Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios
de Bioquímica de Lehninger
★ Arranjo espacial dos aminoácidos na sequência primária da proteína resultante
da formação de pontes de H.
★ Existem duas conformações espaciais regulares para a cadeia polipeptídica:
a estrutura em Hélice α e a estrutura β também chamada Folha β-pregueada.
Proteínas: Estruturas Secundárias
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Estabilizada por PONTES DE HIDROGÊNIO
Proteínas: Estruturas Secundárias
α - hélice - A cadeia se retorce, assumindo forma semelhante a um bastão (helicoidal).
Fonte: NELSON, D. L.;
COX, M.M. Princípios de
Bioquímica de Lehninger
Proteínas: Estruturas Secundárias
★As α-hélices podem se entrelaçar formando uma estrutura muito estável.
★Estas super hélices de α-hélices são encontradas em várias proteínas estruturais,
como: MIOSINA e QUERATINA.
Propriedades Especiais
100nm
Molecular Biology of the cell, 2008
As MIOSINAS são uma ampla superfamília
de mecanoquímicas motoras.
Proteínas: Estruturas Secundárias
A folha β é formada pela união de dois ou mais filamentos β através de pontes de
hidrogênio;
Nessa estruturaas cadeias laterais dos aminoácidos em seqüência apontam para
lados opostos.
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
Proteínas: Estruturas Secundárias
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
Cadeias adjacentes podem se estender em sentidos opostos (folha β anti-paralela), ou
no mesmo sentido (folha β paralela) CONECTADAS POR PONTES ENTRE CO E
NH.
Proteínas: Estruturas Terciária
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
★ A ESTRUTURA TERCIÁRIA é o modo como a cadeia polipeptídica
de uma proteína globular se dobra conferindo a estrutura tridimensional
apresentada por esta proteína, determinada pela interação a longa
distância dos grupos R dos aminoácidos.
Proteínas: Estruturas Quaternárias
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
Arranjo espacial de molécula constituída por mais de uma cadeia proteínas
multiméricas
Revisando os níveis de organização das proteínas
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
As proteínas podem se conjugar a outros grupos químicos
PROTEÍNAS SIMPLES
Somente resíduos de
aminoácidos
PROTEÍNAS CONJUGADAS
Associadas a outros
componentes químicos
Quimotripsina (degradação
de proteínas)
Grupos prostéticos
(cofator)
Hemoglobina (Globinas ligadas ao Heme/Fe)
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
As proteínas podem se conjugar a outros grupos
químicos
São classificadas de acordo com a natureza química dos seus grupos prostéticos
Proteínas Fibrosas e Globulares
As proteínas podem enovelar-se e adquirir diferentes formatos. Porém,
os dois formatos principais são conhecidos como: PROTEÍNAS
GLOBULARES e PROTEÍNAS FIBROSAS
As proteínas globulares são as
mais diversas e se enovelam de
forma compacta (esférica).
As proteínas fibrosas têm
formatos alongados e são
insolúveis em água.
AS FUNÇÕES REFLETEM AS ESTRUTURAS
Queratina
Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
Referências
BOM FINAL DE SEMANA
Vamos conferir o aprendizado
molécula de anfetamina
Observe a estrutura abaixo:
Apresenta isomeria óptica, possuindo, portanto, um carbono com quatro diferentes
substituintes. Na anfetamina, esse átomo de carbono está representado pelo:
SEXTOU
BOM FINAL DE SEMANA

Aula 3 - Bioquímica metabolismos celular

  • 1.
    Curso: Medicina Docente: IvaneideTeixeira Disciplina: Bioquímica AMINOÁCIDOS, PEPTÍDICOS E PROTEÍNAS
  • 2.
    Proteínas São polímeros compostosde n unidades monoméricas ligados entre si por ligações peptídicas. Proteína (polímero) (monômero) aminoácido H3N — COO C — H R + R – a cadeia lateral R diferencia os aminoácidos entre si influenciam a solubilidade em água Aminoácido 1 Aminoácido 2 α-amino α-amino 100 aminoácidos (10 kDa) peptídeo Mais de 100 aminoácidos proteína dipeptídeo Isomeria Óptica C 𝛼 é um centro quiral/ carbono assimétrico
  • 3.
    Molécula assimétrica eCarbono assimétrico H3N — COO C — H R + Quiral ou Assimétrico Talidomida Isômeros ópticos/enantiômeros Imagem não Superponível Existem 2 isômeros ópticos do Cα: formas L e D • São enantiômeros (imagens especulares) um do outro; • Não são interconversíveis sem quebra de laços Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger efeito teratogênico
  • 4.
    Bastante comercializado naEuropa, nas décadas de 50 e 60, como sedativo para aliviar náuseas em mulheres grávidas. A molécula desse composto é assimétrica. A talidomida possui dois isômeros espaciais ou estereoisômeros. No entanto, essa diferença na conformação espacial dos átomos acaba por resultar em diferentes propriedades biológicas exercidas em um organismo vivo. Com o tempo, descobriu-se que somente o isômero dextrógiro ou (D) era responsável pelas propriedades analgésicas, sedativas e, enquanto a talidomida levógiro (L) é teratogênica, isto é, provoca mutações no feto. Curiosidade sobre a Talidomida
  • 5.
    Isomeria óptica Substâncias opticamenteativas (possuem C quirais) interagem com a luz polarizada, girando o plano da luz para esquerda (levógiros) ou para a direita (dextrógiros). Inicialmente descoberta para ácidos orgânicos e açúcares, com vários C quirais. + 2. Solução de substância opticamente ativa causa rotação do plano da luz polarizada 3. Plano da luz que emerge da solução foi desviado para a esquerda ou para a direita pela substância em solução 4. Observador gira a escala até coincidir com a luz emergente, para determinar o desvio 1. Um plano de luz é selecionado Filtro polarizador Fonte de luz polarímetro COO C — H R H3N — + α Proteínas naturais possuem somente L- aminoácidos. D-Aminoácidos ocorrem em peptídeos, antibióticos, e carboidratos.
  • 6.
    AQUI ENTRA A CHAMADA EMDESTAQUE Paredes de células de bactérias (peptideoglicano); D-serina - bicho-da-seda (entre 5 e 59%); D-alanina e a D-serina - saliva, urina, plasma sanguíneo, soro sanguíneo, leite e líquido céfalo- raquidiano); D-aminoácidos componentes de muitos peptídeos antibióticos produzidos por bactérias (valinomicina, gramicidina A, actinomicina D). D-aminoácidos Isomeria óptica: os açúcares naturais são de série D. * D- Gliceraldeído 1 carbono quiral D-glicose D-manose D-galactose Glicose: •4 Carbonos quirais •16 isômeros possíveis • Carbono 5 define a configuração D- ou L- D- Gliceraldeído 1 C quiral *
  • 7.
    AQUI ENTRA A CHAMADA EMDESTAQUE Proteínas Proteínas são moléculas tridimensionais. A forma da molécula é determinante de sua função. Somente os L-aminoácidos são constituintes das proteínas L-Alanina D-Alanina
  • 8.
    Proteínas Uma dasmacromoléculas mais abundantes em sistemas orgânicos: Representam 20% da massa de uma célula 7,9.109 proteínas/célula 100 mil proteínas diferentes em uma única célula Enzima Receptor Transportadora São as biomoléculas mais versáteis dos sistemas biológicos. 574 aa
  • 9.
    Proteínas Fonte: NELSON, D.L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger
  • 10.
    ★As proteínas possuemuma estrutura tridimensional, determinada por sua sequência de aminoácidos e da qual depende a função da proteína; ★As forças mais importantes que estabilizam essa estrutura específica são as FORÇAS NÃO-COVALENTES; Conceituando, para ficar inteirado !!! Heme O O2 liga-se ao átomo de Fe do heme.
  • 11.
    Proteínas Proteínas organizam moléculasde água em torno de si, formando uma camada de solvatação, que garante a solubilidade em meio aquoso. Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 12.
    Proteínas A Citocromo Coxidase é uma proteína de membrana. Possuem uma região de aminoácidos hidrofóbicos apolares, cadeias laterais projetam-se para “fora” e interagem com a porção lipídica de membrana celulares. Outras regiões dessas proteínas ricas em aminoácidos hidrofílicos polares projetam-se para os meios aquosos extra ou intracelular, e podem formar “canais” hidrofílicos que atravessam a membrana, interconectando os meios separados por ela. Corte transversal da membrana interna da mitocôndria Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 13.
    Responda às seguintesperguntas: Como as proteínas assumem uma forma tridimensional a partir de suas estruturas lineares ? Que tipo de forças físicas mantêm a estrutura tridimensional das proteínas ? Calma ! Você saberá responder a essas questões até o final dessa aula.
  • 14.
    Forças fracas estabilizaa proteína Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger
  • 15.
    Proteínas Conformação = Arranjoespacial dos átomos Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 16.
    Forças fracas estabilizaa proteína As características físico-químicas ★ da ligação peptídica ★ das cadeias laterais dos aminoácidos determinam como o esqueleto covalente de uma proteína vai se enovelar determinam os tipos de forças, covalentes e não covalentes, que irão estabilizar a estrutura tridimensional de uma proteína. Os aminoácidos apresentam várias funções químicas que podem se ionizar e conferir carga elétrica à molécula. ★ Todos os aminoácidos possuem um grupo carboxila. ★ Ácido aspártico e ácido glutâmico possuem 2 grupos carboxila Exemplo: Função carboxila Função amina estado de ionização depende do pH do meio Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 17.
    AQUI ENTRA ACHAMADA EM DESTAQUE Proteínas: Estruturas Primárias É definida pela seqüência LINEAR dos aminoácidos unidos por ligações covalentes. A seqüência dos aminoácidos na proteínas é dependente do GENE. Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger
  • 18.
    ★ Arranjo espacialdos aminoácidos na sequência primária da proteína resultante da formação de pontes de H. ★ Existem duas conformações espaciais regulares para a cadeia polipeptídica: a estrutura em Hélice α e a estrutura β também chamada Folha β-pregueada. Proteínas: Estruturas Secundárias Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 19.
    Estabilizada por PONTESDE HIDROGÊNIO Proteínas: Estruturas Secundárias α - hélice - A cadeia se retorce, assumindo forma semelhante a um bastão (helicoidal). Fonte: NELSON, D. L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica de Lehninger
  • 20.
    Proteínas: Estruturas Secundárias ★Asα-hélices podem se entrelaçar formando uma estrutura muito estável. ★Estas super hélices de α-hélices são encontradas em várias proteínas estruturais, como: MIOSINA e QUERATINA. Propriedades Especiais 100nm Molecular Biology of the cell, 2008 As MIOSINAS são uma ampla superfamília de mecanoquímicas motoras.
  • 21.
    Proteínas: Estruturas Secundárias Afolha β é formada pela união de dois ou mais filamentos β através de pontes de hidrogênio; Nessa estruturaas cadeias laterais dos aminoácidos em seqüência apontam para lados opostos. Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
  • 22.
    Proteínas: Estruturas Secundárias MolecularBiology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008 Cadeias adjacentes podem se estender em sentidos opostos (folha β anti-paralela), ou no mesmo sentido (folha β paralela) CONECTADAS POR PONTES ENTRE CO E NH.
  • 23.
    Proteínas: Estruturas Terciária MolecularBiology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008 ★ A ESTRUTURA TERCIÁRIA é o modo como a cadeia polipeptídica de uma proteína globular se dobra conferindo a estrutura tridimensional apresentada por esta proteína, determinada pela interação a longa distância dos grupos R dos aminoácidos.
  • 24.
    Proteínas: Estruturas Quaternárias MolecularBiology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008 Arranjo espacial de molécula constituída por mais de uma cadeia proteínas multiméricas
  • 25.
    Revisando os níveisde organização das proteínas Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. e cols 2008
  • 26.
    As proteínas podemse conjugar a outros grupos químicos PROTEÍNAS SIMPLES Somente resíduos de aminoácidos PROTEÍNAS CONJUGADAS Associadas a outros componentes químicos Quimotripsina (degradação de proteínas) Grupos prostéticos (cofator) Hemoglobina (Globinas ligadas ao Heme/Fe) Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 27.
    Molecular Biology ofthe Cell. Alberts, B. e cols 2008 As proteínas podem se conjugar a outros grupos químicos São classificadas de acordo com a natureza química dos seus grupos prostéticos
  • 28.
    Proteínas Fibrosas eGlobulares As proteínas podem enovelar-se e adquirir diferentes formatos. Porém, os dois formatos principais são conhecidos como: PROTEÍNAS GLOBULARES e PROTEÍNAS FIBROSAS As proteínas globulares são as mais diversas e se enovelam de forma compacta (esférica). As proteínas fibrosas têm formatos alongados e são insolúveis em água. AS FUNÇÕES REFLETEM AS ESTRUTURAS Queratina Bioquímica Ilustrada de Harper 31ª Ed
  • 29.
  • 30.
  • 31.
    Vamos conferir oaprendizado molécula de anfetamina Observe a estrutura abaixo: Apresenta isomeria óptica, possuindo, portanto, um carbono com quatro diferentes substituintes. Na anfetamina, esse átomo de carbono está representado pelo:
  • 32.

Notas do Editor

  • #10 A forma globular da mioglobina, formando um bolsão hidrofóbico em torno do heme, é fundamental para o desempenho da função de armazenamento de O2.
  • #14 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #15 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #16 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #18 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #19 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #20 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #21 Para entender a estrutura 3D das proteínas, vamos “dissecá-la” em níveis organizacionais para facilitar o estudo:
  • #23 Superfície formada, em grande parte, de aminoácidos hidrofílicos que interagem com o meio aquoso; Interior formado por aminoácidos com cadeias laterais hidrófobas.