A Região Centro-Oeste do Brasil é drenada por três grandes bacias hidrográficas: a Bacia Amazônica, a Bacia do Tocantins-Araguaia e a Bacia Platina, subdividida nas bacias dos rios Paraná e Paraguai. A maior bacia é a do Rio Paraguai, que banha a imensa Planície Paraguaia, onde fica localizado o Pantanal Mato-grossense.