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Evolution of Cortical Networks During Episodes of
                                     Mesial Temporal Epileptic Seizures
                                                         1,4,6                          2,5,6         ´       3                                    2,4,6
                    Abner Cardoso Rodrigues                      , Gerson Florence              , Andre Fujita and Koichi Sameshima
                         1                                ´         ¸˜                 ´                      ˜
                             Programa Interunidades de Pos-Graduacao em Bioinformatica, Universidade de Sao Paulo
                                    2                                                                         ˜
                                      Departamento de Radioogia, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo
                                                    3                   ´                                     ˜
                                                      Instituto de Matematica e Estat´stica, Universidade de Sao Paulo
                                                                                     ı
                                                        4                 `                        ˆ
                                                          Nucleo de Apoio a Pesquisa em Neurociencia Aplicada - USP
                                                            ´
                                                                                    5           6
                                                                                       LIM/26 e LIM/43 do HCFMUSP

Objetivos                                                                                              Construindo o Grafo

                                         ˆ                   ¸˜              ´
Identificar e caracterizar mudancas dinamicas na organizacao efetiva do cerebro
                                 ¸
            ı       ´ ı
durante per´odos pre-cr´tico e cr´tico de epilepsia do lobo temporal mesial.
                                 ı
                                                                      ˆ
  Outros trabalhos falham em fazer o paralelo entre as medidas e o fenomeno estudado.
   ˜                                ´
  Nao investigaram mudanccas topologicas durante a crise.
                          ¸




Introduction

  ´
Analise de Grafos caracterizam propriedades importantes de sistemas
complexos quantificando a topologia desses sistemas.
     ´                  ˜       ´                                 ˜                                              ˜                            ˆ                       ˜
                                                                                                       As conexoes efetivas representam influencias causais de uma regiao para outra.
Os nos representam regioes do cerebro. Arestas representam conexoes
    ˆ
anatomicas ou funcionais.                                                                               ˜                           ˆ
                                                                                                       Sao inferidas utilizando Coerencia Parcial Direcionada (PDC).
Vantagens da abordagem:                                                                                            ˜
                                                                                                       Os grafos sao direcionados e possuem 24 nos. ´
  Quantificam a rede com um pequeno numero de medidas com significados neurobiologicos e
                                          ´                                            ´
                      ´
  facilmente computaveis.
   ´                     ˜
  Util para explorar padroes de conectividade estruturais ou funcionais.
                      ¸˜             ¸˜
  Facilita a comparacao entre populacoes de indiv´duos com caracter´sticas diferentes.
                                                  ı                   ı
                                                                                                       Resultados




Grafos




Grafos podem ser representados visualmente como na forma de matriz de
      ˆ
adjacencias.
                                   ˜                           ˜
Arestas podem ser direcionadas ou nao direcionadas e podem ou nao possuir
pesos.
                              ˜                           ˆ
As medidas de agrupamentos sao baseadas no numero de triangulos ao redor
                                               ´
          ´
de cada no.
                     ¸˜   ˜
As medidas de integracao sao baseadas nos comprimento dos caminhos entre
       ´
dois nos.




                                                                                                       Nesse exemplo foram criados 38 grafos:
                                                                                                         O marcador A indica o in´cio da crise, quando ainda era focal.
                                                                                                                                 ı
Medidas                                                                                                  O marcador B indica o grafo de quando a crise generalizou.
                                                                                                         O marcador C indica o grafo do fim da crise.
Numero de arestas.
  ´
                                  ¸˜
Transitividade: medida de segregacao, contabiliza a presenca de agrupamentos.
                                                          ¸
                                                                                                       Resultados
                                         i∈N 2ti
                              T =
                                     i∈N ki (ki − 1)                                                                                           ´                             ˜
                                                                                                       Durante a crise a transitividade, fica proximo de zero, indicando que nao existem
            ´                    ´               ¸˜     ˜
Caminho medio: fornecem uma ideia de integracao, o quao facilmente a                                   agrupamentos no grafo.
         ¸˜ ´
informacao e distribu´da.
                     ı                                                                                            ¸˜                  ´
                                                                                                       A comunicacao fica mais precaria:
                                       1                                                                                 ´
                                                                                                         Do marcador A ate o B, o numero de arestas diminui.
                                                                                                                                   ´
                                  L=          Li
                                       n                                                                             ´
                                                                                                         O caminho medio aumenta.
                                               i∈N                                                                           ´       ´                                            ¸˜
                                                                                                         Com menos arestas, e necessario percorrer um caminho maior para a informacao chegar aos
                                                                                                          ´
                                                                                                         nos.
                                                                                                                                        ´
                                                                                                       As medidas voltam aos valores pre-crise quando a mesma termina.
                                                                                                                                                          ¸˜
                                                                                                       A queda de arestas pode estar ligada com a manutencao da crise:
                                                                                                         No in´cio elas caem enquanto a crise esta focal.
                                                                                                              ı
                                                                                                                                                                 ´
                                                                                                         Quando a crise generaliza o numero de arestas aumenta ate terminar.
                                                                                                                                      ´
                                                                                                                       ´                     ˜
                                                                                                         Como se a propria queda nas conexoes impedisse a crise de se manter.


Metodologia
                                                                                                       Conclusions
                       ´
Trechos de registros pre-crise e cr´ticos de EEG de nove pacientes com epilepsia
                                   ı
de mesial temporal.                                                                                    Trabalhos anteriores calculavam grafos para todo sinal estudado.
                                                                                                                     ´
                                                                                                         Calculando varios grafos no decorrer da crise foi possivel perceber mudancas discretas nos
                                                                                                                                                                                  ¸
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Sistema internacional 10-20 excluindo-se as derivacoes da linha mediana.                                     ˜
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Um grafo estimado a cada cinco segundos do sinal, considerando 24 canais.                                            ´
                                                                                                       Levantamos hipoteses sobre a natureza das crises do ponto de vista dos grafos:
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Tres medidas calculadas para cada grafo.                                                                           ¸˜                           ˜                            ´
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  • 1. Evolution of Cortical Networks During Episodes of Mesial Temporal Epileptic Seizures 1,4,6 2,5,6 ´ 3 2,4,6 Abner Cardoso Rodrigues , Gerson Florence , Andre Fujita and Koichi Sameshima 1 ´ ¸˜ ´ ˜ Programa Interunidades de Pos-Graduacao em Bioinformatica, Universidade de Sao Paulo 2 ˜ Departamento de Radioogia, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo 3 ´ ˜ Instituto de Matematica e Estat´stica, Universidade de Sao Paulo ı 4 ` ˆ Nucleo de Apoio a Pesquisa em Neurociencia Aplicada - USP ´ 5 6 LIM/26 e LIM/43 do HCFMUSP Objetivos Construindo o Grafo ˆ ¸˜ ´ Identificar e caracterizar mudancas dinamicas na organizacao efetiva do cerebro ¸ ı ´ ı durante per´odos pre-cr´tico e cr´tico de epilepsia do lobo temporal mesial. ı ˆ Outros trabalhos falham em fazer o paralelo entre as medidas e o fenomeno estudado. ˜ ´ Nao investigaram mudanccas topologicas durante a crise. ¸ Introduction ´ Analise de Grafos caracterizam propriedades importantes de sistemas complexos quantificando a topologia desses sistemas. ´ ˜ ´ ˜ ˜ ˆ ˜ As conexoes efetivas representam influencias causais de uma regiao para outra. Os nos representam regioes do cerebro. Arestas representam conexoes ˆ anatomicas ou funcionais. ˜ ˆ Sao inferidas utilizando Coerencia Parcial Direcionada (PDC). Vantagens da abordagem: ˜ Os grafos sao direcionados e possuem 24 nos. ´ Quantificam a rede com um pequeno numero de medidas com significados neurobiologicos e ´ ´ ´ facilmente computaveis. ´ ˜ Util para explorar padroes de conectividade estruturais ou funcionais. ¸˜ ¸˜ Facilita a comparacao entre populacoes de indiv´duos com caracter´sticas diferentes. ı ı Resultados Grafos Grafos podem ser representados visualmente como na forma de matriz de ˆ adjacencias. ˜ ˜ Arestas podem ser direcionadas ou nao direcionadas e podem ou nao possuir pesos. ˜ ˆ As medidas de agrupamentos sao baseadas no numero de triangulos ao redor ´ ´ de cada no. ¸˜ ˜ As medidas de integracao sao baseadas nos comprimento dos caminhos entre ´ dois nos. Nesse exemplo foram criados 38 grafos: O marcador A indica o in´cio da crise, quando ainda era focal. ı Medidas O marcador B indica o grafo de quando a crise generalizou. O marcador C indica o grafo do fim da crise. Numero de arestas. ´ ¸˜ Transitividade: medida de segregacao, contabiliza a presenca de agrupamentos. ¸ Resultados i∈N 2ti T = i∈N ki (ki − 1) ´ ˜ Durante a crise a transitividade, fica proximo de zero, indicando que nao existem ´ ´ ¸˜ ˜ Caminho medio: fornecem uma ideia de integracao, o quao facilmente a agrupamentos no grafo. ¸˜ ´ informacao e distribu´da. ı ¸˜ ´ A comunicacao fica mais precaria: 1 ´ Do marcador A ate o B, o numero de arestas diminui. ´ L= Li n ´ O caminho medio aumenta. i∈N ´ ´ ¸˜ Com menos arestas, e necessario percorrer um caminho maior para a informacao chegar aos ´ nos. ´ As medidas voltam aos valores pre-crise quando a mesma termina. ¸˜ A queda de arestas pode estar ligada com a manutencao da crise: No in´cio elas caem enquanto a crise esta focal. ı ´ Quando a crise generaliza o numero de arestas aumenta ate terminar. ´ ´ ˜ Como se a propria queda nas conexoes impedisse a crise de se manter. Metodologia Conclusions ´ Trechos de registros pre-crise e cr´ticos de EEG de nove pacientes com epilepsia ı de mesial temporal. Trabalhos anteriores calculavam grafos para todo sinal estudado. ´ Calculando varios grafos no decorrer da crise foi possivel perceber mudancas discretas nos ¸ ¸˜ Sistema internacional 10-20 excluindo-se as derivacoes da linha mediana. ˜ padroes de conectividade. Um grafo estimado a cada cinco segundos do sinal, considerando 24 canais. ´ Levantamos hipoteses sobre a natureza das crises do ponto de vista dos grafos: ˆ Tres medidas calculadas para cada grafo. ¸˜ ˜ ´ A propagracao da crise diminui as conexoes ao ponto qu fica insustentavel manter a si mesmo.