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Evolution of Cortical Networks During Episodes of
                                     Mesial Temporal Epileptic Seizures
                                                         1,4,6                          2,5,6         ´       3                                    2,4,6
                    Abner Cardoso Rodrigues                      , Gerson Florence              , Andre Fujita and Koichi Sameshima
                         1                                ´         ¸˜                 ´                      ˜
                             Programa Interunidades de Pos-Graduacao em Bioinformatica, Universidade de Sao Paulo
                                    2                                                                         ˜
                                      Departamento de Radioogia, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo
                                                    3                   ´                                     ˜
                                                      Instituto de Matematica e Estat´stica, Universidade de Sao Paulo
                                                                                     ı
                                                        4                 `                        ˆ
                                                          Nucleo de Apoio a Pesquisa em Neurociencia Aplicada - USP
                                                            ´
                                                                                    5           6
                                                                                       LIM/26 e LIM/43 do HCFMUSP

Introduction                                                                                           Resultados

  ´
Analise de Grafos caracterizam propriedades importantes de sistemas                                    Ao todo foram analisados 9 pacientes, os exemplos abaixo mostram os
complexos quantificando a topologia desses sistemas.                                                    resultados das medidas para 3 deles.
     ´                  ˜       ´                                 ˜
Os nos representam regioes do cerebro. Arestas representam conexoes                                           ´
                                                                                                       Nos graficos,foram marcados 3 tempos diferentes:
    ˆ
anatomicas ou funcionais.                                                                                O marcador A indica o in´cio da crise, quando ainda era focal.
                                                                                                                                 ı
                                                                                                         O marcador B indica o grafo de quando a crise generalizou.
Vantagens da abordagem:
                                                                                                         O marcador C indica o grafo do fim da crise.
  Quantificam a rede com um pequeno numero de medidas com significados neurobiologicos e
                                          ´                                            ´
                      ´
  facilmente computaveis.                                                                                                            ı                  ¸˜
                                                                                                                                   In´cio (A) Generalizacao (B) Fim (C)
   ´                     ˜
  Util para explorar padroes de conectividade estruturais ou funcionais.                                                 Exemplo 1     74           101           144
                      ¸˜             ¸˜
  Facilita a comparacao entre populacoes de indiv´duos com caracter´sticas diferentes.
                                                  ı                   ı
                                                                                                                         Exemplo 2     121          166           170
                                                                                                                         Exemplo 3     57            80           120
Objetivos                                                                                                                                                                 ˆ
                                                                                                        Table: Tempos onde ocorrem os marcos importantes em cada um dos tres exemplos abaixo.


                                         ˆ                   ¸˜              ´
Identificar e caracterizar mudancas dinamicas na organizacao efetiva do cerebro
                                 ¸
            ı       ´ ı
durante per´odos pre-cr´tico e cr´tico de epilepsia do lobo temporal mesial.
                                 ı
                                                                      ˆ
  Outros trabalhos falham em fazer o paralelo entre as medidas e o fenomeno estudado.
   ˜                                ´
  Nao investigaram mudanccas topologicas durante a crise.
                          ¸                                                                            Resultados

                                                                                                       O primeiro exemplo foram criados 38 grafos:
Grafos




                                                                                                       Resultados

                                                                                                       No segundo exemplo foram criados 46 grafos:
Grafos podem ser representados visualmente como na forma de matriz de
      ˆ
adjacencias.
                                   ˜                           ˜
Arestas podem ser direcionadas ou nao direcionadas e podem ou nao possuir
pesos.
                              ˜                           ˆ
As medidas de agrupamentos sao baseadas no numero de triangulos ao redor
                                               ´
          ´
de cada no.
                     ¸˜   ˜
As medidas de integracao sao baseadas nos comprimento dos caminhos entre
       ´
dois nos.


Metodologia

                       ´
Trechos de registros pre-crise e cr´ticos de EEG de nove pacientes com epilepsia
                                   ı
de mesial temporal.                                                                                    Resultados
                                                   ¸˜
Sistema internacional 10-20 excluindo-se as derivacoes da linha mediana.
                                                                                                       No terceiro exemplo foram criados 35 grafos:
Um grafo estimado a cada cinco segundos do sinal, considerando 24 canais.
  ˆ
Tres medidas calculadas para cada grafo.


Medidas

Numero de arestas.
  ´
                                  ¸˜
Transitividade: medida de segregacao, contabiliza a presenca de agrupamentos.
                                                          ¸
                                         i∈N 2ti
                              T =
                                     i∈N ki (ki − 1)
            ´                    ´               ¸˜     ˜
Caminho medio: fornecem uma ideia de integracao, o quao facilmente a
         ¸˜ ´
informacao e distribu´da.
                     ı
                                       1
                                  L=          Li                                                              ˜
                                                                                                       Discussao
                                       n
                                               i∈N
                                                                                                                                               ´                             ˜
                                                                                                       Durante a crise a transitividade, fica proximo de zero, indicando que nao existem
                                                                                                       agrupamentos no grafo.
Construindo o Grafo                                                                                               ¸˜                  ´
                                                                                                       A comunicacao fica mais precaria:
                                                                                                                         ´
                                                                                                         Do marcador A ate o B, o numero de arestas diminui.
                                                                                                                                   ´
                                                                                                                     ´
                                                                                                         O caminho medio aumenta.
                                                                                                                             ´       ´                                            ¸˜
                                                                                                         Com menos arestas, e necessario percorrer um caminho maior para a informacao chegar aos
                                                                                                          ´
                                                                                                         nos.
                                                                                                                                        ´
                                                                                                       As medidas voltam aos valores pre-crise quando a mesma termina.
                                                                                                                                                          ¸˜
                                                                                                       A queda de arestas pode estar ligada com a manutencao da crise:
                                                                                                         No in´cio elas caem enquanto a crise esta focal.
                                                                                                              ı
                                                                                                                                                                 ´
                                                                                                         Quando a crise generaliza o numero de arestas aumenta ate terminar.
                                                                                                                                      ´
                                                                                                                       ´                     ˜
                                                                                                         Como se a propria queda nas conexoes impedisse a crise de se manter.




                                                                                                       Conclusions
                                                                                                       Trabalhos anteriores calculavam grafos para todo sinal estudado.
                                                                                                                     ´
                                                                                                         Calculando varios grafos no decorrer da crise foi possivel perceber mudancas discretas nos
                                                                                                                                                                                  ¸
          ˜                            ˆ                       ˜
As conexoes efetivas representam influencias causais de uma regiao para outra.                                ˜
                                                                                                         padroes de conectividade.
 ˜                           ˆ
Sao inferidas utilizando Coerencia Parcial Direcionada (PDC).                                                        ´
                                                                                                       Levantamos hipoteses sobre a natureza das crises do ponto de vista dos grafos:
            ˜
Os grafos sao direcionados e possuem 24 nos. ´                                                                     ¸˜                           ˜                            ´
                                                                                                         A propagracao da crise diminui as conexoes ao ponto qu fica insustentavel manter a si mesmo.

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  • 1. Evolution of Cortical Networks During Episodes of Mesial Temporal Epileptic Seizures 1,4,6 2,5,6 ´ 3 2,4,6 Abner Cardoso Rodrigues , Gerson Florence , Andre Fujita and Koichi Sameshima 1 ´ ¸˜ ´ ˜ Programa Interunidades de Pos-Graduacao em Bioinformatica, Universidade de Sao Paulo 2 ˜ Departamento de Radioogia, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo 3 ´ ˜ Instituto de Matematica e Estat´stica, Universidade de Sao Paulo ı 4 ` ˆ Nucleo de Apoio a Pesquisa em Neurociencia Aplicada - USP ´ 5 6 LIM/26 e LIM/43 do HCFMUSP Introduction Resultados ´ Analise de Grafos caracterizam propriedades importantes de sistemas Ao todo foram analisados 9 pacientes, os exemplos abaixo mostram os complexos quantificando a topologia desses sistemas. resultados das medidas para 3 deles. ´ ˜ ´ ˜ Os nos representam regioes do cerebro. Arestas representam conexoes ´ Nos graficos,foram marcados 3 tempos diferentes: ˆ anatomicas ou funcionais. O marcador A indica o in´cio da crise, quando ainda era focal. ı O marcador B indica o grafo de quando a crise generalizou. Vantagens da abordagem: O marcador C indica o grafo do fim da crise. Quantificam a rede com um pequeno numero de medidas com significados neurobiologicos e ´ ´ ´ facilmente computaveis. ı ¸˜ In´cio (A) Generalizacao (B) Fim (C) ´ ˜ Util para explorar padroes de conectividade estruturais ou funcionais. Exemplo 1 74 101 144 ¸˜ ¸˜ Facilita a comparacao entre populacoes de indiv´duos com caracter´sticas diferentes. ı ı Exemplo 2 121 166 170 Exemplo 3 57 80 120 Objetivos ˆ Table: Tempos onde ocorrem os marcos importantes em cada um dos tres exemplos abaixo. ˆ ¸˜ ´ Identificar e caracterizar mudancas dinamicas na organizacao efetiva do cerebro ¸ ı ´ ı durante per´odos pre-cr´tico e cr´tico de epilepsia do lobo temporal mesial. ı ˆ Outros trabalhos falham em fazer o paralelo entre as medidas e o fenomeno estudado. ˜ ´ Nao investigaram mudanccas topologicas durante a crise. ¸ Resultados O primeiro exemplo foram criados 38 grafos: Grafos Resultados No segundo exemplo foram criados 46 grafos: Grafos podem ser representados visualmente como na forma de matriz de ˆ adjacencias. ˜ ˜ Arestas podem ser direcionadas ou nao direcionadas e podem ou nao possuir pesos. ˜ ˆ As medidas de agrupamentos sao baseadas no numero de triangulos ao redor ´ ´ de cada no. ¸˜ ˜ As medidas de integracao sao baseadas nos comprimento dos caminhos entre ´ dois nos. Metodologia ´ Trechos de registros pre-crise e cr´ticos de EEG de nove pacientes com epilepsia ı de mesial temporal. Resultados ¸˜ Sistema internacional 10-20 excluindo-se as derivacoes da linha mediana. No terceiro exemplo foram criados 35 grafos: Um grafo estimado a cada cinco segundos do sinal, considerando 24 canais. ˆ Tres medidas calculadas para cada grafo. Medidas Numero de arestas. ´ ¸˜ Transitividade: medida de segregacao, contabiliza a presenca de agrupamentos. ¸ i∈N 2ti T = i∈N ki (ki − 1) ´ ´ ¸˜ ˜ Caminho medio: fornecem uma ideia de integracao, o quao facilmente a ¸˜ ´ informacao e distribu´da. ı 1 L= Li ˜ Discussao n i∈N ´ ˜ Durante a crise a transitividade, fica proximo de zero, indicando que nao existem agrupamentos no grafo. Construindo o Grafo ¸˜ ´ A comunicacao fica mais precaria: ´ Do marcador A ate o B, o numero de arestas diminui. ´ ´ O caminho medio aumenta. ´ ´ ¸˜ Com menos arestas, e necessario percorrer um caminho maior para a informacao chegar aos ´ nos. ´ As medidas voltam aos valores pre-crise quando a mesma termina. ¸˜ A queda de arestas pode estar ligada com a manutencao da crise: No in´cio elas caem enquanto a crise esta focal. ı ´ Quando a crise generaliza o numero de arestas aumenta ate terminar. ´ ´ ˜ Como se a propria queda nas conexoes impedisse a crise de se manter. Conclusions Trabalhos anteriores calculavam grafos para todo sinal estudado. ´ Calculando varios grafos no decorrer da crise foi possivel perceber mudancas discretas nos ¸ ˜ ˆ ˜ As conexoes efetivas representam influencias causais de uma regiao para outra. ˜ padroes de conectividade. ˜ ˆ Sao inferidas utilizando Coerencia Parcial Direcionada (PDC). ´ Levantamos hipoteses sobre a natureza das crises do ponto de vista dos grafos: ˜ Os grafos sao direcionados e possuem 24 nos. ´ ¸˜ ˜ ´ A propagracao da crise diminui as conexoes ao ponto qu fica insustentavel manter a si mesmo.