A polinização cruzada ocorre quando o pólen de uma flor fecunda o estigma de outra flor, diferentemente da auto-polinização. Espécies com polinização cruzada apresentam maior variabilidade genética, facilitando melhoramentos através de cruzamentos. Uma controvérsia envolve a tecnologia Terminator, que torna sementes geneticamente modificadas estéreis para evitar propagação de pólen transgênico.