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1 de 11
EpDist
Algoritmo para distribuição nacional de
órgãos por prova cruzada virtual
epitopica negativa
Discente: Mário Sérgio Coelho Marroquim
Orientadora: Dra. Semiramis Jamil Hadad do Monte
Coorientador: Dr. Luiz Cláudio Demes da Mata Sousa
Ranking de receptores
Prova cruzada real
Transplante
Tipagem HLA do doador
Notificação do doadorOPO / CNCDO
LABORATÓRIO
CN(N)CDO
LABORATÓRIO
HOSPITAL
1/9
Processo atual de distribuição de órgãos
Ranking de receptores
Prova cruzada virtual
Transplante
Tipagem HLA do doador
Notificação do doadorOPO / CNCDO
LABORATÓRIO
CN(N)CDO
EPDIST
HOSPITAL
2/9
Novo processo de distribuição de órgãos
3/9
Potencial do EpDist no Brasil
 24.007 pacientes na lista de espera
 5.923 transplantes renais por ano
 71% de aproveitamento de rins
4/9
Exemplo de receptor aceitável no EpDist
5/9
Exemplo de receptor inaceitável no EpDist
6/9
Comparação entre a prova cruzada virtual e a real
MÉTRICA CUTOFF EPASSISTANT
TP 78
FP 155
FN 9
TN 791
TOT 1.033
ACU 84%
SES 90%
ESP 84%
VPP 33%
VPN 99%
Aprovado no comitê de ética da UFPI: CAAE 0153.0.045.000-10.
7/9
Próximos desafios do EpDist
Performance (Big-O)Complexidade ciclomática
Fonte: https://www.javatpoint.com/software-engineering-cyclomatic-complexity Fonte: https://www.jessicayung.com/big-o-notation-a-common-mistake-and-documentation/
8/9
Cronograma do EpDist
ATIVIDADE 1 2 3 4 5 6
Créditos necessários para conclusão do doutorado X X X X X X
Ampla revisão da teoria e das soluções já existentes X X X X X X
Reuniões para coleta inicial de requisitos X
Coletar e armazenar dados dos laboratórios de histocompatibilidade X
Projetar, codificar, testar e validar o algoritmo de prova cruzada virtual X X X
Elaborar relatórios contendo indicadores de performance do algoritmo X
Integrar o algoritmo a ferramentas existentes e em uso pelo SNT (webservice) X X
Registro de software e redação de artigos científicos X X
Qualificação para defesa da tese X
Redação do texto final da tese X X
Defesa da tese X
9/9
Referências do EpDist
2019
2001
ANO AUTORES TÍTULO
2019 Oliveira, Deylane Menezes Teles et al pHLA3D: An online database of predicted three-dimensional structures of HLA…
2018 Duquesnoy, Rene, et al. Second update of the International Registry of HLA Epitopes…
2018 Aita, Keylla, et al. Time is life: EpAssistant - a new tool for the automatic ...
2017 Sousa, Luiz Claudio, et al. Kidney allocation strategy for highly sensitized patients based on...
2017 Teles, Vinícius Manhães. Extreme Programming: Aprenda como encantar seus usuários desenvolvendo...
2016 Aita, Keylla, et al. Web-based ecosystem software for virtual crossmatching in...
2015 Cardoso, Raimundo Antônio, et al. EpViX–Innovative free software to perform epitope virtual crossmatch
2015 Anunciação, F. A. C., et al. EpViX: A cloud-based tool for epitope reactivity analysis and...
2013 Duquesnoy, R. J., et al. 16th IHIW: a website for antibody‐defined HLA epitope Registry
2012 Sales Filho, H. L. A., et al. EpHLA software: A timesaving and accurate tool for improving...
2011 Eng, Hooi Sian, and Mary S. Leffell. Histocompatibility testing after fifty years of transplantation
2011 Amico, Patrizia, et al. Risk stratification by the virtual crossmatch: a prospective study...
2011 da Mata Sousa, L. C. D., et al. EpHLA: an innovative and user-friendly software automating the...
2010 Zachary, Andrea A., et al. Barriers to successful transplantation of the sensitized patient
2010 Lefaucheur, Carmen, et al. Preexisting donor-specific HLA antibodies predict outcome in...
2010 Campos, E. R., et al. Proposal for a program to enhance renal transplantation opportunity...
2009 Claas, Frans HJ, Axel Rahmel, et al. Enhanced kidney allocation to highly sensitized patients by the accept...
2008 Bingaman, Adam W., et al. A virtual crossmatch protocol significantly increases access of...
2007 Zangwill, Steven, et al. Practical application of the virtual crossmatch
2006 Bray, R. A., et al. Transplanting the highly sensitized patient: The emory algorithm
2006 Marinho, Alexandre. Um estudo sobre as filas para transplantes no Sistema Único de Saúde...
2005 Terasaki, Paul I., and Junchao Cai. Humoral theory of transplantation: further evidence. Current opinion...
2001 Duquesnoy, R. J. HLAMatchmaker: a molecularly based donor selection algorithm for...
EpDist
Algoritmo para distribuição nacional de
órgãos por prova cruzada virtual
epitopica negativa
Discente: Mário Sérgio Coelho Marroquim
Orientadora: Dra. Semiramis Jamil Hadad do Monte
Coorientador: Dr. Luiz Cláudio Demes da Mata Sousa

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  • 1. EpDist Algoritmo para distribuição nacional de órgãos por prova cruzada virtual epitopica negativa Discente: Mário Sérgio Coelho Marroquim Orientadora: Dra. Semiramis Jamil Hadad do Monte Coorientador: Dr. Luiz Cláudio Demes da Mata Sousa
  • 2. Ranking de receptores Prova cruzada real Transplante Tipagem HLA do doador Notificação do doadorOPO / CNCDO LABORATÓRIO CN(N)CDO LABORATÓRIO HOSPITAL 1/9 Processo atual de distribuição de órgãos
  • 3. Ranking de receptores Prova cruzada virtual Transplante Tipagem HLA do doador Notificação do doadorOPO / CNCDO LABORATÓRIO CN(N)CDO EPDIST HOSPITAL 2/9 Novo processo de distribuição de órgãos
  • 4. 3/9 Potencial do EpDist no Brasil  24.007 pacientes na lista de espera  5.923 transplantes renais por ano  71% de aproveitamento de rins
  • 5. 4/9 Exemplo de receptor aceitável no EpDist
  • 6. 5/9 Exemplo de receptor inaceitável no EpDist
  • 7. 6/9 Comparação entre a prova cruzada virtual e a real MÉTRICA CUTOFF EPASSISTANT TP 78 FP 155 FN 9 TN 791 TOT 1.033 ACU 84% SES 90% ESP 84% VPP 33% VPN 99% Aprovado no comitê de ética da UFPI: CAAE 0153.0.045.000-10.
  • 8. 7/9 Próximos desafios do EpDist Performance (Big-O)Complexidade ciclomática Fonte: https://www.javatpoint.com/software-engineering-cyclomatic-complexity Fonte: https://www.jessicayung.com/big-o-notation-a-common-mistake-and-documentation/
  • 9. 8/9 Cronograma do EpDist ATIVIDADE 1 2 3 4 5 6 Créditos necessários para conclusão do doutorado X X X X X X Ampla revisão da teoria e das soluções já existentes X X X X X X Reuniões para coleta inicial de requisitos X Coletar e armazenar dados dos laboratórios de histocompatibilidade X Projetar, codificar, testar e validar o algoritmo de prova cruzada virtual X X X Elaborar relatórios contendo indicadores de performance do algoritmo X Integrar o algoritmo a ferramentas existentes e em uso pelo SNT (webservice) X X Registro de software e redação de artigos científicos X X Qualificação para defesa da tese X Redação do texto final da tese X X Defesa da tese X
  • 10. 9/9 Referências do EpDist 2019 2001 ANO AUTORES TÍTULO 2019 Oliveira, Deylane Menezes Teles et al pHLA3D: An online database of predicted three-dimensional structures of HLA… 2018 Duquesnoy, Rene, et al. Second update of the International Registry of HLA Epitopes… 2018 Aita, Keylla, et al. Time is life: EpAssistant - a new tool for the automatic ... 2017 Sousa, Luiz Claudio, et al. Kidney allocation strategy for highly sensitized patients based on... 2017 Teles, Vinícius Manhães. Extreme Programming: Aprenda como encantar seus usuários desenvolvendo... 2016 Aita, Keylla, et al. Web-based ecosystem software for virtual crossmatching in... 2015 Cardoso, Raimundo Antônio, et al. EpViX–Innovative free software to perform epitope virtual crossmatch 2015 Anunciação, F. A. C., et al. EpViX: A cloud-based tool for epitope reactivity analysis and... 2013 Duquesnoy, R. J., et al. 16th IHIW: a website for antibody‐defined HLA epitope Registry 2012 Sales Filho, H. L. A., et al. EpHLA software: A timesaving and accurate tool for improving... 2011 Eng, Hooi Sian, and Mary S. Leffell. Histocompatibility testing after fifty years of transplantation 2011 Amico, Patrizia, et al. Risk stratification by the virtual crossmatch: a prospective study... 2011 da Mata Sousa, L. C. D., et al. EpHLA: an innovative and user-friendly software automating the... 2010 Zachary, Andrea A., et al. Barriers to successful transplantation of the sensitized patient 2010 Lefaucheur, Carmen, et al. Preexisting donor-specific HLA antibodies predict outcome in... 2010 Campos, E. R., et al. Proposal for a program to enhance renal transplantation opportunity... 2009 Claas, Frans HJ, Axel Rahmel, et al. Enhanced kidney allocation to highly sensitized patients by the accept... 2008 Bingaman, Adam W., et al. A virtual crossmatch protocol significantly increases access of... 2007 Zangwill, Steven, et al. Practical application of the virtual crossmatch 2006 Bray, R. A., et al. Transplanting the highly sensitized patient: The emory algorithm 2006 Marinho, Alexandre. Um estudo sobre as filas para transplantes no Sistema Único de Saúde... 2005 Terasaki, Paul I., and Junchao Cai. Humoral theory of transplantation: further evidence. Current opinion... 2001 Duquesnoy, R. J. HLAMatchmaker: a molecularly based donor selection algorithm for...
  • 11. EpDist Algoritmo para distribuição nacional de órgãos por prova cruzada virtual epitopica negativa Discente: Mário Sérgio Coelho Marroquim Orientadora: Dra. Semiramis Jamil Hadad do Monte Coorientador: Dr. Luiz Cláudio Demes da Mata Sousa

Notas do Editor

  1. MOSTRAR PROCESSO DE TX ATUAL SIMPLIFICADO E QUE TENTATIVA E ERRO NA XM REAL RESULTA EM TEMPO DESPERDIÇADO
  2. MOSTRAR PROCESSO DE TX ATUAL SIMPLIFICADO E QUE TENTATIVA E ERRO NA XM REAL RESULTA EM TEMPO DESPERDIÇADO
  3. MOSTRAR A CAPACIDADE DE DISTRIBUIÇÃO NACIONAL APROVEITANDO O TEMPO ECONOMIZADO COM XM REAL EM DETRIMENTO DA VIRTUAL
  4. MOSTRAR CRUZAMENTO ENTRE MM EPLETS E ANTICORPOS ANTI-HLA PARA EXPLICAR O ALGORITMO
  5. MOSTRAR CRUZAMENTO ENTRE MM EPLETS E ANTICORPOS ANTI-HLA PARA EXPLICAR O ALGORITMO
  6. MOSTRAR A CAPACIDADE DE DISTRIBUIÇÃO NACIONAL APROVEITANDO O TEMPO ECONOMIZADO COM XM REAL EM DETRIMENTO DA VIRTUAL
  7. EXPLICAR QUE SO SE MELHORA O QUE SE MEDE E, UMA VEZ MEDIDO, É HORA DE MELHORAR O ALGORITMO