State of the art
    Guia prática
Javier Rodriguez-Vera
Quê é state of the art

• Informação actualizada
• Informação válida
Pesquisa bibliográfica

Fontes que podemos consultar:
  – Apontamentos
  – Opiniões
  – Livros
  – Sites
  – Jornais
Apontamentos


Notas tomadas a mão habitualmente dum
 discurso oral:
  – Problemas de interpretação da escrita
  – “Bias” de interpretação da mensagem
  – O orador estava a dar um state of the art?
Opiniões

Falar com alguém do nosso entorno que
tem conhecimento adequado do tópico:
– A linguagem verbal tem “perdas”
– A pessoa quem perguntamos está
  actualizada ou enganada?
– Útil: pode dar alguma referência bibliográfica
Livros

•   Informação validada.
•   Muito condensada. Sem pormenores.
•   Não actualizados.
•   Úteis para ter uma visão global da
    questão.
Internet
• “Toda a informação do mondo está na
  net”
   – Limitação 1: Alta sensibilidade baixa
     especificidade:
        • Exemplo: “prostate cancer”: 9.660.000 entradas
   – Limitação 2: Não temos garantia da qualidade
     da informação: Cancer Charity - Front Page
            The Prostate
                         - [ Traduzir esta página ]
   The Prostate Cancer Charity offers support and information to anyone
concerned with prostate cancer. The site has information on the prostate, ...
   www.prostate-cancer.org.uk/ - 30k - Em cache - Páginas semelhantes
Precisamos aumentar a especificidade e
 diminuir a sensibilidade: EFICIÊNCIA
  • Jornais online/papel:
    – Informação validada.
    – Informação actualizada
    – Informação acessível
  • Quê tipos de jornais existem?
    – Indexados
    – Não indexados: “Grey literature”
Jornais: introdução histórica

• Resposta a necessidade histórica:
  – Informação rápida, manuseável e barata.
• Primeiros Jornais 1665:
  – Philosophical Transactions
  – Jornal de Savants
• 2000: 1.000.000 jornais científicos no
  mondo
Por quê indexar um jornal?
• Número de jornais muito elevado: é preciso
  discriminar aqueles de maior qualidade.
• Indexados: revisão interpares, publicação
  periódica durante um tempo, cumprem
  norma Vancouver, ultrapassam audit…
• Indexado= Garantia de qualidade.
• Não indexado não quer dizer má qualidade
Há um só índex?

• Não.
• Nos vão interessar aqueles indexados
  num médio acessível, rápido e barato.
Problemas e soluções: os
         compiladores
• PubMed e Embase: recursos que
  agrupam jornais “de qualidade” e os
  ordenam segundo vários parâmetros.
EMBASE
• 19 milhões de artigos indexados de 7,000
  jornais desde 1947.

• Preço elevado: eficaz, mas ineficiente
  – £4300 para 2008-2009
PubMed
•   Serviço da National Library of Medicine
•   Revisa milhares de Jornais:
•   5246 (Jan 2008) 70 países
•   Contém 10 milhões de referências
    bibliográficas desde 1966

            www.pubmed.org
Vantagens do PubMed

• Gratuito
• Instantâneo
• “Links” para artigos em fulltext

Inconvenientes do PubMed
• Precisa duma linguagem específica
• Há muitos artigos sem fulltext
Como Fazer uma pesquisa
  bibliográfica em PubMed
• 1. “Linguagem PubMed”
• 2. Restrictores
• 3. Selecção de artigos
Linguagem PubMed

• 10 milhões de referências bibliográficas:
  perante qualquer pergunta vamos a obter
  respostas.
• Respondem a nossa pergunta?
• Exemplo: prostate cancer: 78336 entradas

• PRECISAMOS AUMENTAR A
  ESPECIFICIDADE
PESQUISA BIBLIOGRÁFICA COM
          PUBMED
• Quê queremos saber?. Definir antes da
  pesquisa.
• Primeira aproximação: termos livres (não
  boleanos). Da uma ideia da quantidade de
  informação disponível na base de dados
Disponível em fulltext gratuito:
Disponível em fulltext, mas é preciso pagar. Abstract
  gratuito.
Nada gratuito
Formas de apresentação dos resultados
Podemos armazenar as pesquisas?
           Clipboard
Queremos eliminar um artigo do
         Clipboard
My NCBI
permite guardar critérios de búsqueda e
  definir diversos filtros personalizados
• Pesquisa actualizada e enviada ao mail periodicamente
Os filtros
Aumentam a especificidade da nossa pesquisa
Single Citation Matcher

• Para localizar artigos a partir de dados
  isolados (Autor, jornal, data de
  publicação)
• Útil para localizar os artigos sugeridos
  pelos peritos.
Os operadores booleanos
• Ferramenta lógica para relacionar diferentes términos
  nas pesquisas compostas.
   – AND: devem verificar-se cada uma das condições definidas
     (aumenta especificidade)
      • Exemplo: Cancer AND 2000/3: artigos publicados em Março de
        2003 em cujo título exista a palavra Cancer
   – OR: deverá verificar-se ao menos uma das condições definidas
     (aumenta a sensibilidade)
      • Exemplo: cancer[ti] OR cancer[tw] OR tumor[ti] OR tumor[tw] :
        Artigos que tenham a palavra cancer ou tumor no título ou texto
   – NOT: Deverá cumprir-se a condição da esquerda mas não a da
     direita
      • Exemplo:Young[au] NOT Nature[ta] :Artigos que Young tenha
        publicado em jornais não sendo Nature
Comodines

• Truncamento: Asterisco *
  – Implica escrever uma palavra incompleta, terminada
    em asterisco
     • Exemplo: muta*[ti] Busca os registos que tenham no título
       o término mutation, mutations, mutability ou, em general,
       qualquer término que começe pela raiz "muta".
• Termos com mais de duas palavras: Comas “”.
  – Escrever os registos entre comas “”.
     • Exemplo: "lung disease"[ti] pesquisa os artigos em cujo
       título poda ler-se o conjunto "lung disease" tal e como está
       escrito.
Límites

• Filtros predefinidos que, unidos a cadeia
  de búsqueda especificada, aumenta a
  rentabilidade da pesquisa.
Preview
• Para ver se o número de entradas tem atingido um nível
  aceitável
• Mostra os resultados das três últimas pesquisas
  realizadas
• Resulta possível combinar com operadores booleanos
  Exemplo: #1 AND #3
MeSH (Medical Subject Headings)

• Termo com que está indexado um artigo
  em Medline.
• Ao introduzir o nosso termo de busqueda
  no MeSH Browser:
  – 1. Diz-nos se esse termo está indexado
  – 2. Se o estiver, nos apresenta uma lista
    hierárquica de menos a mais concreto
Ingrese un término                              Cuadro de dialogo para la búsqueda en
                                                  Término     solicitadoPubMed
                                                                                                 Resultado
                                          Cuadro de dialogo de estrategia de de término MeSH para su búsqueda
                                                                      Envió
                                      Término MeSH dado por el sistema
                                          búsqueda                    (operadores booleanos: And, OR, NOT)

                                             Sinónimos de entrada del término

              Ejecutar búsqueda en PubMed           Términos controlados
                                 Selección del término MeSH

                                      Selección del término MeSH
Término controlado en el MeSH para Hepatic cirrhosis        Definición del Término
          Identificación del MeSH
                                                                 Estructura jerárquica (árbol) MeHS
                       Otra forma de identificar el MeSH         para el término liver cirrhosis


                              Página de inicio PubMed



                Subencabezamientos para especificar una búsqueda
Escolha de informação válida

1. Que venha do PubMed não quere dizer que seja fiável
   ou issenta de “bias”.
2. De esta informação, quê preferenciar:
   1. Metanálises
   2. Ensaios clínicos aleatorizados controlados
   3. Ensaios controlados
   4. Serie de casos
   5. Casos clínicos
   6. Editoriais
Neste momento, temos um


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Getting updated: Tricks&Tips

  • 1.
    State of theart Guia prática Javier Rodriguez-Vera
  • 2.
    Quê é stateof the art • Informação actualizada • Informação válida
  • 4.
    Pesquisa bibliográfica Fontes quepodemos consultar: – Apontamentos – Opiniões – Livros – Sites – Jornais
  • 5.
    Apontamentos Notas tomadas amão habitualmente dum discurso oral: – Problemas de interpretação da escrita – “Bias” de interpretação da mensagem – O orador estava a dar um state of the art?
  • 6.
    Opiniões Falar com alguémdo nosso entorno que tem conhecimento adequado do tópico: – A linguagem verbal tem “perdas” – A pessoa quem perguntamos está actualizada ou enganada? – Útil: pode dar alguma referência bibliográfica
  • 7.
    Livros • Informação validada. • Muito condensada. Sem pormenores. • Não actualizados. • Úteis para ter uma visão global da questão.
  • 8.
    Internet • “Toda ainformação do mondo está na net” – Limitação 1: Alta sensibilidade baixa especificidade: • Exemplo: “prostate cancer”: 9.660.000 entradas – Limitação 2: Não temos garantia da qualidade da informação: Cancer Charity - Front Page The Prostate - [ Traduzir esta página ] The Prostate Cancer Charity offers support and information to anyone concerned with prostate cancer. The site has information on the prostate, ... www.prostate-cancer.org.uk/ - 30k - Em cache - Páginas semelhantes
  • 9.
    Precisamos aumentar aespecificidade e diminuir a sensibilidade: EFICIÊNCIA • Jornais online/papel: – Informação validada. – Informação actualizada – Informação acessível • Quê tipos de jornais existem? – Indexados – Não indexados: “Grey literature”
  • 10.
    Jornais: introdução histórica •Resposta a necessidade histórica: – Informação rápida, manuseável e barata. • Primeiros Jornais 1665: – Philosophical Transactions – Jornal de Savants • 2000: 1.000.000 jornais científicos no mondo
  • 11.
    Por quê indexarum jornal? • Número de jornais muito elevado: é preciso discriminar aqueles de maior qualidade. • Indexados: revisão interpares, publicação periódica durante um tempo, cumprem norma Vancouver, ultrapassam audit… • Indexado= Garantia de qualidade. • Não indexado não quer dizer má qualidade
  • 12.
    Há um sóíndex? • Não. • Nos vão interessar aqueles indexados num médio acessível, rápido e barato.
  • 13.
    Problemas e soluções:os compiladores • PubMed e Embase: recursos que agrupam jornais “de qualidade” e os ordenam segundo vários parâmetros.
  • 14.
    EMBASE • 19 milhõesde artigos indexados de 7,000 jornais desde 1947. • Preço elevado: eficaz, mas ineficiente – £4300 para 2008-2009
  • 15.
    PubMed • Serviço da National Library of Medicine • Revisa milhares de Jornais: • 5246 (Jan 2008) 70 países • Contém 10 milhões de referências bibliográficas desde 1966 www.pubmed.org
  • 16.
    Vantagens do PubMed •Gratuito • Instantâneo • “Links” para artigos em fulltext Inconvenientes do PubMed • Precisa duma linguagem específica • Há muitos artigos sem fulltext
  • 17.
    Como Fazer umapesquisa bibliográfica em PubMed • 1. “Linguagem PubMed” • 2. Restrictores • 3. Selecção de artigos
  • 18.
    Linguagem PubMed • 10milhões de referências bibliográficas: perante qualquer pergunta vamos a obter respostas. • Respondem a nossa pergunta? • Exemplo: prostate cancer: 78336 entradas • PRECISAMOS AUMENTAR A ESPECIFICIDADE
  • 21.
    PESQUISA BIBLIOGRÁFICA COM PUBMED • Quê queremos saber?. Definir antes da pesquisa. • Primeira aproximação: termos livres (não boleanos). Da uma ideia da quantidade de informação disponível na base de dados
  • 22.
  • 24.
    Disponível em fulltext,mas é preciso pagar. Abstract gratuito.
  • 26.
  • 31.
  • 32.
    Podemos armazenar aspesquisas? Clipboard
  • 35.
    Queremos eliminar umartigo do Clipboard
  • 37.
    My NCBI permite guardarcritérios de búsqueda e definir diversos filtros personalizados
  • 40.
    • Pesquisa actualizadae enviada ao mail periodicamente
  • 41.
    Os filtros Aumentam aespecificidade da nossa pesquisa
  • 44.
    Single Citation Matcher •Para localizar artigos a partir de dados isolados (Autor, jornal, data de publicação) • Útil para localizar os artigos sugeridos pelos peritos.
  • 47.
    Os operadores booleanos •Ferramenta lógica para relacionar diferentes términos nas pesquisas compostas. – AND: devem verificar-se cada uma das condições definidas (aumenta especificidade) • Exemplo: Cancer AND 2000/3: artigos publicados em Março de 2003 em cujo título exista a palavra Cancer – OR: deverá verificar-se ao menos uma das condições definidas (aumenta a sensibilidade) • Exemplo: cancer[ti] OR cancer[tw] OR tumor[ti] OR tumor[tw] : Artigos que tenham a palavra cancer ou tumor no título ou texto – NOT: Deverá cumprir-se a condição da esquerda mas não a da direita • Exemplo:Young[au] NOT Nature[ta] :Artigos que Young tenha publicado em jornais não sendo Nature
  • 49.
    Comodines • Truncamento: Asterisco* – Implica escrever uma palavra incompleta, terminada em asterisco • Exemplo: muta*[ti] Busca os registos que tenham no título o término mutation, mutations, mutability ou, em general, qualquer término que começe pela raiz "muta". • Termos com mais de duas palavras: Comas “”. – Escrever os registos entre comas “”. • Exemplo: "lung disease"[ti] pesquisa os artigos em cujo título poda ler-se o conjunto "lung disease" tal e como está escrito.
  • 50.
    Límites • Filtros predefinidosque, unidos a cadeia de búsqueda especificada, aumenta a rentabilidade da pesquisa.
  • 53.
    Preview • Para verse o número de entradas tem atingido um nível aceitável • Mostra os resultados das três últimas pesquisas realizadas • Resulta possível combinar com operadores booleanos Exemplo: #1 AND #3
  • 54.
    MeSH (Medical SubjectHeadings) • Termo com que está indexado um artigo em Medline. • Ao introduzir o nosso termo de busqueda no MeSH Browser: – 1. Diz-nos se esse termo está indexado – 2. Se o estiver, nos apresenta uma lista hierárquica de menos a mais concreto
  • 56.
    Ingrese un término Cuadro de dialogo para la búsqueda en Término solicitadoPubMed Resultado Cuadro de dialogo de estrategia de de término MeSH para su búsqueda Envió Término MeSH dado por el sistema búsqueda (operadores booleanos: And, OR, NOT) Sinónimos de entrada del término Ejecutar búsqueda en PubMed Términos controlados Selección del término MeSH Selección del término MeSH Término controlado en el MeSH para Hepatic cirrhosis Definición del Término Identificación del MeSH Estructura jerárquica (árbol) MeHS Otra forma de identificar el MeSH para el término liver cirrhosis Página de inicio PubMed Subencabezamientos para especificar una búsqueda
  • 57.
    Escolha de informaçãoválida 1. Que venha do PubMed não quere dizer que seja fiável ou issenta de “bias”. 2. De esta informação, quê preferenciar: 1. Metanálises 2. Ensaios clínicos aleatorizados controlados 3. Ensaios controlados 4. Serie de casos 5. Casos clínicos 6. Editoriais
  • 58.
    Neste momento, temosum State of the art