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Avaliações Genéticas Abril/2012 ...
                                 O que há de novo ?

Atualmente diferentes fontes de informação são combinadas para
produzir a Avaliação Genômica, incluindo:

DGV-Direct Genomic Value-Valor Genômico Direto- baseado nos
efeitos estimados para cada marcador “SNP” que inclui um efeito
poligênico.
                               ■
Avaliações Tradicionais:, PA- Parent Average-Média dos Pais e
PTA – Habilidade de Transmissão Prevista-Tipo & Produção.
                               ■
Avaliação Secundária por Grupo, Avaliação estimada do
relacionamento de parentesco por Pedigree, entre os animais com
avaliação genômica.

Neste processamento das Avaliações Genéticas de Abril/2012, os
geneticistas do AIPL mudaram a forma como estas fontes de informação
são combinadas para nos oferecer Avaliações Genômicas com maior
precisão. Alguns pesos anteriormente colocados sobre o DGV – Valor
Genômico Direto – foram deslocados para a tradicional PA-Média dos
Pais ou para o PTA-Habilidade de Transmissão Prevista ou para a
Avaliação Secundária por Grupo de Parentesco, de acordo com o tipo de
avaliação disponível de cada indivíduo.

Os novos pesos melhoram o relacionamento entre as Avaliações
Genômicas de animais jovens Top e animais mais velhos. Isto tem
importância relevante porque temos mais informação sobre os animais
mais velhos, portanto quanto melhor a correlação entre os dois grupos
significa ter melhor acurácia nas avaliações. Antes das avaliações terem
sido divulgadas, o AIPL estimou um decréscimo geral de $40 no NM$-
Mérito Líquido Vitalício e 20 pontos no JPI nos animais jovens Jersey. O
impacto real desta mudança poderá ser observado após a geração de
todos os relatórios e rankings.
Nos touros jovens holandeses, tais pesos ficaram em 0,99 no DGV, 0,12 no
PTA, e −0,11 no SPTA. Isto causa decréscimos na avaliação de animais
jovens quando comparados a animais mais velhos. Por exemplo, os PTAs
genômicos dos mais altos Touros Jovens Holsteins cairam cerca de 100
lbs em Leite, 4 lbs em Gordura, 3 lbs em Proteína , 0,2 meses em Vida
Produtiva, e 0,15 em score final de Tipo, e $20 em NM$.

Correlações do novo x GPTA anterior foram acima de 0,998. Ao invés do
valor teórico de 1,0, o peso do DGV-Valor Genômico Direto- foi limitado a
0,95 em características de saúde, 0,90 em características de Tipo, e 0,75
em características de parição. Limites nas características de Produção
foram de 0,90 nos animais Holstein e 0,80 nos Jersey e Pardo-Suíço.

Com estes ajustes a Confiabilidade mudou ligeiramente mas poderia cair
mais se os pesos em DGV tiverem maiores reduções futuras. Regressões
em algumas características foram abaixo do esperado, e os pesos
revisados ajudaram a colocá-las em conformidade com os testes de
validação.

Em Março, as avaliações genômicas “8K” estavam previstas. As
avaliações “8K” são baseadas no genótipo de um novo chip chamado “
GeneSeek Genomic Profiler” . Aproximadamente 1.700 SNPs e
marcadores foram adicionados ao chip “Illumina Bovine LD” somando
um total em SNP/marcadores de 8.653. Os novos genótipos são rotulados
“8K” e juntam se aos genótipos 3K, 6K e 50K.

                         Fontes das informações:
 AIPL-USDA: http://aipl.arsusda.gov/reference/changes/eval1204.htm

                     AJCA-Jersey Genetic Summary:
               http://greenbook.usjersey.com/Home.aspx




                                                 Kátya Castro
          Coordenadora de Processamento e Capacitação do GMS
           www.abspecplan.com.br/gms      GMS@absnet.com.br

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  • 1. Boletim GMS ® Avaliações Genéticas Abril/2012 ... O que há de novo ? Atualmente diferentes fontes de informação são combinadas para produzir a Avaliação Genômica, incluindo: DGV-Direct Genomic Value-Valor Genômico Direto- baseado nos efeitos estimados para cada marcador “SNP” que inclui um efeito poligênico. ■ Avaliações Tradicionais:, PA- Parent Average-Média dos Pais e PTA – Habilidade de Transmissão Prevista-Tipo & Produção. ■ Avaliação Secundária por Grupo, Avaliação estimada do relacionamento de parentesco por Pedigree, entre os animais com avaliação genômica. Neste processamento das Avaliações Genéticas de Abril/2012, os geneticistas do AIPL mudaram a forma como estas fontes de informação são combinadas para nos oferecer Avaliações Genômicas com maior precisão. Alguns pesos anteriormente colocados sobre o DGV – Valor Genômico Direto – foram deslocados para a tradicional PA-Média dos Pais ou para o PTA-Habilidade de Transmissão Prevista ou para a Avaliação Secundária por Grupo de Parentesco, de acordo com o tipo de avaliação disponível de cada indivíduo. Os novos pesos melhoram o relacionamento entre as Avaliações Genômicas de animais jovens Top e animais mais velhos. Isto tem importância relevante porque temos mais informação sobre os animais mais velhos, portanto quanto melhor a correlação entre os dois grupos significa ter melhor acurácia nas avaliações. Antes das avaliações terem sido divulgadas, o AIPL estimou um decréscimo geral de $40 no NM$- Mérito Líquido Vitalício e 20 pontos no JPI nos animais jovens Jersey. O impacto real desta mudança poderá ser observado após a geração de todos os relatórios e rankings.
  • 2. Nos touros jovens holandeses, tais pesos ficaram em 0,99 no DGV, 0,12 no PTA, e −0,11 no SPTA. Isto causa decréscimos na avaliação de animais jovens quando comparados a animais mais velhos. Por exemplo, os PTAs genômicos dos mais altos Touros Jovens Holsteins cairam cerca de 100 lbs em Leite, 4 lbs em Gordura, 3 lbs em Proteína , 0,2 meses em Vida Produtiva, e 0,15 em score final de Tipo, e $20 em NM$. Correlações do novo x GPTA anterior foram acima de 0,998. Ao invés do valor teórico de 1,0, o peso do DGV-Valor Genômico Direto- foi limitado a 0,95 em características de saúde, 0,90 em características de Tipo, e 0,75 em características de parição. Limites nas características de Produção foram de 0,90 nos animais Holstein e 0,80 nos Jersey e Pardo-Suíço. Com estes ajustes a Confiabilidade mudou ligeiramente mas poderia cair mais se os pesos em DGV tiverem maiores reduções futuras. Regressões em algumas características foram abaixo do esperado, e os pesos revisados ajudaram a colocá-las em conformidade com os testes de validação. Em Março, as avaliações genômicas “8K” estavam previstas. As avaliações “8K” são baseadas no genótipo de um novo chip chamado “ GeneSeek Genomic Profiler” . Aproximadamente 1.700 SNPs e marcadores foram adicionados ao chip “Illumina Bovine LD” somando um total em SNP/marcadores de 8.653. Os novos genótipos são rotulados “8K” e juntam se aos genótipos 3K, 6K e 50K. Fontes das informações: AIPL-USDA: http://aipl.arsusda.gov/reference/changes/eval1204.htm AJCA-Jersey Genetic Summary: http://greenbook.usjersey.com/Home.aspx Kátya Castro Coordenadora de Processamento e Capacitação do GMS www.abspecplan.com.br/gms GMS@absnet.com.br