Desafios matemáticos e computacionais 
da neurociência 
Michelle Miranda Evandro Rocha 
Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática 
CEPID NeuroMat 
11 de Outubro de 2014
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
NeuroMat - neuromat.numec.prp.usp.br 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Por que estudar o cérebro? 
I É o órgão mais complexo do corpo humano 
I Tem um papel fundamental na memória, aprendizado, 
concentração, linguagem,... 
I Pouco se sabe sobre: Alzheimer’s, Déficit de Atenção, 
Autismo,... 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Perguntas 
I O cérebro de uma criança com déficit de atenção processa 
informação da mesma forma do cerebro de uma crianca 
normal? 
I O cérebro de alguem que sofreu um acidente e perdeu 
conexões sensitivas e motoras processa uma estímulo externo 
da mesma forma de uma pessoa que não sofreu um acidente? 
I Será que o cérebro de alguem com alzheimer é estruturamente 
igual ao cérebro de uma pessoa normal? 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Como responder à essas perguntas? 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Desafios matemáticos da neurociência 
I Pessoas diferentes processam informação de forma diferente 
I Como encontrar modelos que levam em consideração essas 
diferenças? 
I Volume e complexidade das informações 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Um exemplo - Transtorno do Déficit de Atenção 
I Afeta entre 3-5% de crianças 
I Sintomas: desatenção, inquietude e hiperatividade 
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Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Como são os dados? ADHD-Consortium 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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Mais desafios 
I Entender como esses números em cada voxel estão associados 
com o déficit de atenção 
I Como modelar o cérebro como um todo? 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Por que é importante responder essas perguntas? 
I Melhor entendimento de como 
essas condições afetam o cérebro 
pode contribuir para tratamentos 
que minimizam as diferenças 
I Estudo nessa direção impactam a 
qualidade de vida das pessoas 
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Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
Desafios computacionais da neurociência 
Problema 
I Repositórios de dados científicos para a área de 
neurociência ainda são raros 
I E os que existem utilizam muitos termos diferentes 
Um exemplo 
I Instituto de Neurologia Deolindo Couto - INDC/UFRJ 
I Recuperação de pacientes com lesão do plexo braquial, 
muito comum entre motociclistas que sofreram quedas 
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Introdução Desafios Matemáticos Desafios Computacionais 
NeuroMat 
Um dos principais objetivos do NeuroMat é contribuir na mudança 
desse cenário 
Propostas 
I Modelar e criar banco de dados para a área de neurociência 
I Manter e compartilhar dados científicos 
I Criar ferramentas de software para acessar dados científicos 
I O que é software? 
I Propósito de um software? 
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NeuroMat - Banco de Dados e Portal Web 
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Ciência Aberta 
Movimento Ciência Aberta 
I Recomenda que ferramentas e dados utilizados pelos 
cientistas sejam disponibilizados publicamente para ampliar 
seus benefícios a toda a sociedade 
I Defendida por grandes agências de pesquisa no mundo, 
como NSF (Fundação Nacional da Ciência dos EUA) e 
FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de 
São Paulo) 
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Desafios computacionais do NeuroMat 
I Armazenamento de experimentos que são realizados de formas 
diferentes 
I Armazenamento físico eficiente 
I Grande volume de dados 
I Busca rápida por informações 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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Padronização 
Por que padronizar dos diversos formatos de armazenamento dos 
experimentos em neurociência? 
I Facilitar a manutenção, recuperação, compartilhamento e 
reúso dos dados 
I Tornar possível a reprodução dos experimentos e a 
comparação entre estudos 
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Quais são os dados 
I Informações sobre os experimentos 
I Dados brutos 
I Dados derivados, gerados a partir dos dados brutos 
I Informações sobre o Laboratório de Pesquisa 
I Onde os dados foram coletados? 
I Quem foi o responsável pela coleta dos dados? 
I Quando foi coletado? 
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Como os dados se relacionam - 1 
neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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Como os dados se relacionam - 2 
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Como os dados se relacionam - 3 
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Primeira fase do projeto 
I Objetivo: atender às demandas sistêmicas do Instituto de 
Neurologia Deolindo Couto (INDC-UFRJ) 
I Desenvolvimento de Sistema Web para gerenciamento de 
dados clínicos e de experimentos. 
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Funcionalidade - Cadastro de pacientes 
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Funcionalidade - Avaliação médica 
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Funcionalidade - Preenchimento de questionário 
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NeuroMat 
Para saber mais 
Site e 
Newsletter http://neuromat.numec.prp.usp.br/ 
Wikipedia http://pt.wikipedia.org/wiki/NeuroMat 
Facebook https://www.facebook.com/neuromathematics 
Github https://github.com/neuromat 
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Obrigado! 
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Desafios matemáticos e computacionais da neurociência

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    Desafios matemáticos ecomputacionais da neurociência Michelle Miranda Evandro Rocha Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática CEPID NeuroMat 11 de Outubro de 2014
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais NeuroMat - neuromat.numec.prp.usp.br neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Por que estudar o cérebro? I É o órgão mais complexo do corpo humano I Tem um papel fundamental na memória, aprendizado, concentração, linguagem,... I Pouco se sabe sobre: Alzheimer’s, Déficit de Atenção, Autismo,... neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Perguntas I O cérebro de uma criança com déficit de atenção processa informação da mesma forma do cerebro de uma crianca normal? I O cérebro de alguem que sofreu um acidente e perdeu conexões sensitivas e motoras processa uma estímulo externo da mesma forma de uma pessoa que não sofreu um acidente? I Será que o cérebro de alguem com alzheimer é estruturamente igual ao cérebro de uma pessoa normal? neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Como responder à essas perguntas? neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Desafios matemáticos da neurociência I Pessoas diferentes processam informação de forma diferente I Como encontrar modelos que levam em consideração essas diferenças? I Volume e complexidade das informações neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Um exemplo - Transtorno do Déficit de Atenção I Afeta entre 3-5% de crianças I Sintomas: desatenção, inquietude e hiperatividade neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Como são os dados? ADHD-Consortium neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Mais desafios I Entender como esses números em cada voxel estão associados com o déficit de atenção I Como modelar o cérebro como um todo? neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Por que é importante responder essas perguntas? I Melhor entendimento de como essas condições afetam o cérebro pode contribuir para tratamentos que minimizam as diferenças I Estudo nessa direção impactam a qualidade de vida das pessoas neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Desafios computacionais da neurociência Problema I Repositórios de dados científicos para a área de neurociência ainda são raros I E os que existem utilizam muitos termos diferentes Um exemplo I Instituto de Neurologia Deolindo Couto - INDC/UFRJ I Recuperação de pacientes com lesão do plexo braquial, muito comum entre motociclistas que sofreram quedas neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais NeuroMat Um dos principais objetivos do NeuroMat é contribuir na mudança desse cenário Propostas I Modelar e criar banco de dados para a área de neurociência I Manter e compartilhar dados científicos I Criar ferramentas de software para acessar dados científicos I O que é software? I Propósito de um software? neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais NeuroMat - Banco de Dados e Portal Web neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Ciência Aberta Movimento Ciência Aberta I Recomenda que ferramentas e dados utilizados pelos cientistas sejam disponibilizados publicamente para ampliar seus benefícios a toda a sociedade I Defendida por grandes agências de pesquisa no mundo, como NSF (Fundação Nacional da Ciência dos EUA) e FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo) neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Desafios computacionais do NeuroMat I Armazenamento de experimentos que são realizados de formas diferentes I Armazenamento físico eficiente I Grande volume de dados I Busca rápida por informações neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Padronização Por que padronizar dos diversos formatos de armazenamento dos experimentos em neurociência? I Facilitar a manutenção, recuperação, compartilhamento e reúso dos dados I Tornar possível a reprodução dos experimentos e a comparação entre estudos neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Quais são os dados I Informações sobre os experimentos I Dados brutos I Dados derivados, gerados a partir dos dados brutos I Informações sobre o Laboratório de Pesquisa I Onde os dados foram coletados? I Quem foi o responsável pela coleta dos dados? I Quando foi coletado? neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Como os dados se relacionam - 1 neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Como os dados se relacionam - 2 neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Como os dados se relacionam - 3 neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Primeira fase do projeto I Objetivo: atender às demandas sistêmicas do Instituto de Neurologia Deolindo Couto (INDC-UFRJ) I Desenvolvimento de Sistema Web para gerenciamento de dados clínicos e de experimentos. neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Funcionalidade - Cadastro de pacientes neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Funcionalidade - Avaliação médica neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Funcionalidade - Preenchimento de questionário neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais NeuroMat Para saber mais Site e Newsletter http://neuromat.numec.prp.usp.br/ Wikipedia http://pt.wikipedia.org/wiki/NeuroMat Facebook https://www.facebook.com/neuromathematics Github https://github.com/neuromat neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat
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    Introdução Desafios MatemáticosDesafios Computacionais Obrigado! neuromat.numec.prp.usp.br Desafios do NeuroMat