A Comeje começou como um projeto de oração na casa dos pastores Marcio e Marlene Maldonado em Mogi das Cruzes, SP. Em 2003, membros da Igreja Nova Vida fundaram a Comeje em Macapá, Amapá. Atualmente, a Comeje em Macapá é liderada pelos Bispos Roberto e Socorro Trindade e possui vários ministérios como louvor, casais, dança e teatro.