A estrutura da organização Brasil Junior é composta por três níveis: nacional, estadual e universitário, com cada nível representando diferentes empresas juniores no país e em cada estado e universidade.

1. 
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2. •
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3. •
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4. Nível
Brasil Junior
Nacional
Nível Estadual Rio Junior Federações
estaduais
Empresas
Em cada Juniores de
Empresas
UFRJunior Juniores de
Universidade outras
Universidades
Outros Estados
Todas as outras Empresas
Juniores da UFRJ

5. •
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