11. Human Genome Project 1990년 휴먼게놈프로젝트 시작 2000년 DNA 염기서열 중 97% 해독 2003년 99.99% 정확도의 인간유전체지도 완성 Database : GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/)
22. 유전적거리(Genetic distance) 정의: 2개의유전자좌사이의교차횟수의기대치 단위 : M (morgan) 1M은“1회의생식세포분열에서 1회의교차가일어나는거리” 사람의전염색체에대한유전적거리 남성: 약 28M, 여성: 약 43M 물리적거리(Physical distance) 정의: 염기배열의수 단위: bp (base pair) 사람의전유전체에대한물리적거리 : 3x109 bp
39. Additive polygene model 이산과 연속의 문제를 통합 The correlation between relatives on the supposition of Mendelian inheritance.Trans. Roy. Soc, Edinb, 1918
40. Battle Round 3 E. Pearson R.A. Fisher Neyman-Pearson’s lemma Alternative hypothesis The most powerful test Confidence interval Only null hypothesis Fiducial interval J. Neyman
41. 잘못된 유전학 우생학(eugenics) 유전적으로 뒤떨어진 개인을 배제 - Galton , K. Pearson, R.A Fisher - Adolf Hitler (1931) “유전적 결함이 있는 자손 억제를 위한 법” Lysenko주의 스탈린 시대 유전적으로는 모두 평등하며, 노력에 의해 형질은 변화
52. 게놈 관련 연구의 대상물 유전형질(trait) 유전자형으로 인해 발생하는 결과의 공간 질적형질(qualitative trait) 양적형질(quantitative trait) 발병 비발병 2.1 6.4 9.7 병의 발병유무 검사치 표현형(phenotype)
53. A a B b A or a A a B b B or b 멘델의 법칙 분리의 법칙 우열의 법칙 독립의 법칙 질적표현형(qualitative phenotype) 유전자형A/a A or a 연쇄의 법칙 유전 계승의 법칙 = 멘델의 법칙 + 연쇄의 법칙
54. 우열의 법칙Mendel's law of dominance (1st law) 질적표현형(qualitative phenotype) 양적표현형(quantitative phenotype) AA or Aa aa AA P(D=+|AA)=q+AA P(D=+|Aa)=q+Aa Aa XAA~N(μ1,σ12) P(D=+|aa)=q+aa aa XAa~N(μ1,σ12) Xaa~N(μ2,σ22)
55. 유전계승양식mode of inheritance 유전자형(genotype) 열성(recessive) 우성(dominant) 대립형질 A에 대해 열성 대립형질 A에 대해 우성 유전자형 AAAa aa aa Aa AA Aaaa AA
117. 100 100 GWAS Control Case Power ? ? 후보유전자 연관분석 유의수준:1.38×10-08 Control Case 유의수준:0.01 2nd stage 의 샘플사이즈 2 단계 연관분석2 Stage association study 연구전체의 유의수준:1×10-7
118. 다형 데이터의 품질관리 개체의 Call Rate ( > 0.99 ) SNP의 Call Rate ( > 0.99 ) HWE 적합성 검정 ( p > 1e-5 ) Minor Allele Frequency ( > 0.01 ) 집단의 구조화 탐색
120. 가계정보를 이용한 연관분석 Transmission Disequilibrium Test (TDT) Ott et al. (1992) Hum Hered, 42, 337-346. Spielman et al. (1993) Am J Hum Genet, 52, 506-516. A/T A/T A/A