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La relación de la Química con
                           otras disciplinas científicas
                                         y tecnológicas



                                                                                                    Carlos Miranda
I CURSO DE DIVULGACIÓN
LOS AVANCES DE LA QUÍMICA Y SU IMPACTO EN LA SOCIEDAD                                               29 de abril de 2009



                                                        La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas
Química en
                            La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Ciencias Medioambientales




Química en
                            La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Toxicología
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




La Química, “la ciencia central”
                                       BIOLOGÍA
                                      Biología celular
           CIENCIAS DE LAS             Microbiología                           BIOQUÍMICA
                                         Anatomía                           Biología molecular
              PLANTAS                                                          Inmunología
                 Botánica                Fisiología
                                         Genética                             Endocrinología
                Agronomía
                                                                            Ingeniería genética


    CIENCIAS
MEDIOAMBIENTALES                                                                  MEDICINA y CC. SALUD
         Ecología
                                                                                             Farmacología
Estudios de contaminación             QUÍMICA                                                  Nutrición
                                                                                             Química clínica
                                                                                              Radiología
      GEOLOGÍA


                                         FÍSICA                                  QUÍMICA
             ASTRONOMÍA           Física atómica y nuclear                       NUCLEAR
                                     Mecánica cuántica                         Radioquímica
                                       Espectroscopía                         Medicina nuclear
                                   Ciencia de materiales
                                        Biomecánica




Química en Biología:
                                                         La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Secuenciación del ADN

                            Premio Nobel de Química (1980)

             Determinación de la secuencia de bases de los ácidos nucleicos




             Walter GILBERT                                     Frederick SANGER
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Aspectos estructurales de la molécula de ADN
  La molécula de ADN es un “polinucleótido” = polímero de nucleótidos

  ¿Qué es un nucleótido?

  NUCLEÓTIDO =              Pentosa          + Base nitrogenada +                                   Grupos fosfato
                      (Azúcar de 5 át. de C)                                                        (de uno a tres)

                                                            PURINA




                                                            PIRIMIDINA
                                      nucleósido
                                                                                                                           O
                           nucleótido monofosfato
                                                                                                                               NH
                     nucleótido difosfato
                                                                                                                           N     O
              nucleótido trifosfato                                                                                      R
                                                                                                                       Uracilo

                                                         ARN

                                                           La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Aspectos estructurales de la molécula de ADN
                                                    En los seres vivos está constituida por
                                                    dos cadenas antiparalelas, formando la
                                                    conocida “doble hélice”




                                                           Interacciones por enlaces de
                                                                                      =
                                                           hidrogeno por pares A=T y C=G
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Mecanismo de polimerización del ADN
                                                                                                                                      O
     O
                        5’                                                                                                                 O
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                                                                                                                                -O    P
                                               Base                                                                                                                O
-O   P        O-
                                      O                                                                                                                   H             H
                                                                                                                                      O-
     O-                      H             H
                                                                                                                                                     H                      H
                        H                      H                                                                                                          O             H
                             O             H
                                                                                                                                                 O        P        O-
                   O         P        O-
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                                                                Base                                                                                                            O
                             O-
                                                   O                                                                                                                    H            H
                                           H                H
                                                                                                                                                                   H                     H
                                      H                         H                                                                                                       O            H
                                           O                H
                                                                                                                                                               O        P       O-
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                                                                                                                                                                                                       Base
                                                                                                                                                                        O
                                                                                Base                                                                                                      O
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                                                        H               H                               ADN Polimerasa                                                          H                      H
                                                   H                            H                                                                                                    O            H
                                                       : OH             H
                                                        :




                                                                                                                                                                            O        P       O-
                                                        3’
                                                                                                                                                                                                                   Base
                                                                                                                                                                                     O
                   O                  O                 O                                                                                   O                  O                                           O
                                                                                                                                                                                                  H            H
                                                                                                 Base
         -O        P        O         P        O        P           O                                                                 -O    P         O        P        OH
                                                                                         O                                                                                                   H                     H
                                                                                                                                                                                                  OH           H
                   O-                 O-                O-                          H        H
                                                                                                                                            O-                 O-
                                                                            H                    H
                                                                                                                                                                                                  3’
                                                                                    OH       H




     El grupo OH en posición 3’ del anillo de desoxirribosa es fundamental
                para la polimerización de la molécula de ADN


Secuenciar el ADN:
                                                                                                                     La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Planteamiento del problema
                                                                                                                            Grupo OH (3’)
              El nucleótido es el bloque fundamental


              El OH en posición 3’ es el responsable de la polimerización
                                                                                                                                                                            NUCLEÓTIDO




              Hebra de ADN

     ¿Cómo conocer el orden de los nucleótidos?
Secuenciar el ADN:
                                              La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Método de terminación de la cadena
 Se puede separar ADN en función del tamaño
       Electroforesis Poliacrilamida-Urea
           (Resolución: 1 nucleótido)


             ¿Distinta longitud?

                      Sí
    Parando la elongación de la cadena


                   ¿Cómo?


   Neutralizando el punto de crecimiento




Secuenciar el ADN:
                                              La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Didesoxinucleótidos trifosfatados

  DESOXINUCLEÓTIDOS (dNTP) vs DIDESOXINUCLEÓTIDOS (ddNTP)




              dATP                                                 ddATP


         Ausencia del grupo OH en posición 3’ del anillo de ribosa

                  No se puede formar el enlace fosfodiéster

                 Terminación química de la cadena de ADN
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Identificación de los fragmentos

                                  muestra ADN           dTTP
                                                 dCTP                 dATP
                                  polimerasa              dGTP




   ddGTP                             ddTTP                 ddCTP                                        ddATP




                                                           La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Identificación de los fragmentos

                                                MARCAJE

   Fósforo radiactivo (32P y 33P)



             grandes                            3’

                                                           SOLUCIÓN:
              TAMAÑO FRAGMENTOS




                                                           5’aAAATCAATTCTGTGAAC
                                                           GATAATCCAGTCATTGATG
                                                           TTGCCAGAGACAAAGCT 3'




           pequeños                             5’
Marcaje de los
                                                                                   La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




nucleótidos de terminación
  Marcaje con colorantes fluorescentes



                       Bodipy-FL-510                                          R6G
        [λabs (max) = 502 nm; λem (max) = 510 nm]                             [λabs (max) = 525 nm; λem (max) = 550 nm]


                                                                 CH3


                                                 N   N
                                                   B
                                 R         CH CH F   F
                                                             S
        Bodipy-650                                                                                                   ROX
        [λabs (max) = 630 nm; λem (max) = 650 nm]                              [λabs (max) = 575 nm; λem (max) = 602 nm]




                                                                       VENTAJAS:
                                         • Una sola reacción de secuenciación
                                         • Fácil automatización



Marcaje de los
                                                                                   La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




nucleótidos de terminación
  Separación de fragmentos por electroforesis capilar

               ATTGC A


                                         Capilar
                                                   Pol.
                                                   líquido
                         …..

                           Laser                                       -
              Prisma
                                                      Reacción
                               Ventana                Secuencia
 Detectores
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Proyecto GENOMA HUMANO
                             Febrero de 2001




     Science 291,1304-1351                                     Nature 409, 856-859
     (16 February 2001)                                         (15 February 2001)




                                          La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Química en Medicina
Química y Medicina:
                                                La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Contrastes radiológicos
                                  RADIOGRAFÍA



                            CONTRASTES RADIOLÓGICOS




    Sustancia susceptible    de    ser   empleada           en        exámenes                 médicos
    de rayos X

    Distinguen tejidos blandos por diferencia de opacidad frente a rayos X




Química y Medicina:
                                                La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Contrastes radiológicos
                              Contrastes densos

    Basados en compuestos químicos que contienen átomos pesados

    Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X
                                                                                                      Placa fotosensible
    FUENTE RAYOS X
Química y Medicina:
                                                         La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Contrastes radiológicos
                                          Contrastes densos

                     Sulfato de Bario                                 Compuestos de yodo




                                                        Iohexol




Química y Medicina:
                                                         La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Contrastes radiológicos
                                          Contrastes densos

    Basados en compuestos químicos que contienen átomos pesados

    Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X
                                                                                                               Placa fotosensible
    FUENTE RAYOS X




                                        Contrastes hipodensos

    Basado en el uso de un gas o de aire

    Presentan una menor opacidad
Química y Medicina:
                                                          La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Medicina Nuclear
    Empleo de isótopos radioactivos para dianóstico clínico y tratamiento de
    enfermedades:    • Algunos tipos de cáncer
                             • Enfermedades cardiovasculares
                             • Desórdenes neurológicos…

    Henri Danlos (físico frances) en 1901 empleó radio para tratar
    heridas de piel producidas en enfermos de tuberculosis

                               Radioisótopos más empleados

   Radioisótopo    Símbolo           Radiación     Vida media                          Uso
                     3
   Tritio            1H                 β           12.32 años             Trazador bioquímico
                    24
   Sodio-24         11 Na               β           14.95 horas            Circulación sanguínea
                    32
   Fósforo-32       15 P                β            14.28 días            Terapia anti-leucemia
                    60
   Cobalto-60       27 Co              β, γ          5.27 años             Terapia cancerosa
                    74
   Arsénico-74      33 As               β+            17.8 días            Localización tumores cerebrales
                   99m
   Tecnecio-99       43 Tc               γ           6.01 horas            Escáner cerebral
                    131
   Yodo-131          53 I               β             8.04 días            Terapia tiroidea



                                                          La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Tomografía por emisión de positrones
   Técnica de análisis en tiempo real no invasiva

                       Imagen típica PET cerebral




                                                         En combinación con TAC
                                                         (tomografía axial computerizada)


                                                              Información y diagnósticos
                                                                    MUY PRECISOS


                                                 imagen de PET TAC cuerpo entero
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




PET: Radiotrazadores

  Administrado por vía intravenosa,
                                                                                   imagen PET TAC de cuerpo entero
  vía oral o vía respiratoria

  Se acumula en los órganos con
  afinidad por el radiotrazador

  Emisión de radiación gamma en los
  órganos donde se localiza




             Medición de la
     ACTIVIDAD METABÓLICA




                                                                           La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




PET: Radionucléidos
  Isótopos de vida media corta:
                                                                     100

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                                                                      80
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                                                   % radiactividad




          11C, ~20 minutos                                            70

                                                                      60

          13N, ~10 minutos                                            50

                                                                      40

          15O, ~2 minutos                                             30

                                                                      20

          18F, ~110 minutos                                           10

                                                                       0
                                                                           0   1   2   3   4   5    6   7   8
                                                                                   nº de periodos




  Se incorporan en moléculas que sabemos como utiliza nuestro cuerpo


  Desintegración por emisión de positrones
                                                                                                                             β+ = e+
    11            11
     6C            5B   +   β+   + νe + 0.45 MeV
    13            13
     7N            6C   + β+ + νe + 2.22 MeV
    15            15
     8O            7N   + β+ + νe + 2.85 MeV
    18            18
     9F            8O   + β+ + νe + 1.66 MeV
La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




PET: Radiotrazadores
                               FLUORDESOXIGLUCOSA (FDG)

   2-[18F]Fluor-2-desoxi-D-glucosa


             Tatsuo Ido
             (años 70)




                                              OTROS
    Metabolismo                                                          Angiogénesis
    •   18F-Fluorotimidina                                                 • 15O-Agua
    •   11C-Timidina                                                       • 18F-Fluoromisonidazol
    •   11C-Aminoácidos                                                    • 15O-Oxígeno
    •   11C-Glucosa
                                   CH2
    •   15O-Oxígeno                N
                             H3C         OH
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Química y Astrofísica:
                                                      La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




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                                     62 años luz




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Química y Astrofísica
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La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas




Materiales de alta tecnología




Materiales:
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Química, Física e Ingenieria
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                                                                    Construcción
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Química e Ingeniería
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LA RELACION DE LA QUIMICA CON OTRAS DISCIPLINAS CIENTIFICAS Y TECNOLOGICAS

  • 1. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Carlos Miranda I CURSO DE DIVULGACIÓN LOS AVANCES DE LA QUÍMICA Y SU IMPACTO EN LA SOCIEDAD 29 de abril de 2009 La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas
  • 2. Química en La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Ciencias Medioambientales Química en La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Toxicología
  • 3. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas La Química, “la ciencia central” BIOLOGÍA Biología celular CIENCIAS DE LAS Microbiología BIOQUÍMICA Anatomía Biología molecular PLANTAS Inmunología Botánica Fisiología Genética Endocrinología Agronomía Ingeniería genética CIENCIAS MEDIOAMBIENTALES MEDICINA y CC. SALUD Ecología Farmacología Estudios de contaminación QUÍMICA Nutrición Química clínica Radiología GEOLOGÍA FÍSICA QUÍMICA ASTRONOMÍA Física atómica y nuclear NUCLEAR Mecánica cuántica Radioquímica Espectroscopía Medicina nuclear Ciencia de materiales Biomecánica Química en Biología: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Secuenciación del ADN Premio Nobel de Química (1980) Determinación de la secuencia de bases de los ácidos nucleicos Walter GILBERT Frederick SANGER
  • 4. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Aspectos estructurales de la molécula de ADN La molécula de ADN es un “polinucleótido” = polímero de nucleótidos ¿Qué es un nucleótido? NUCLEÓTIDO = Pentosa + Base nitrogenada + Grupos fosfato (Azúcar de 5 át. de C) (de uno a tres) PURINA PIRIMIDINA nucleósido O nucleótido monofosfato NH nucleótido difosfato N O nucleótido trifosfato R Uracilo ARN La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Aspectos estructurales de la molécula de ADN En los seres vivos está constituida por dos cadenas antiparalelas, formando la conocida “doble hélice” Interacciones por enlaces de = hidrogeno por pares A=T y C=G
  • 5. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Mecanismo de polimerización del ADN O O 5’ O 5’ Base -O P Base O -O P O- O H H O- O- H H H H H H O H O H O P O- O P O- Base O- Base O O- O H H H H H H H H O H O H O P O- O P O- Base O Base O O O H H H H ADN Polimerasa H H H H O H : OH H : O P O- 3’ Base O O O O O O O H H Base -O P O P O P O -O P O P OH O H H OH H O- O- O- H H O- O- H H 3’ OH H El grupo OH en posición 3’ del anillo de desoxirribosa es fundamental para la polimerización de la molécula de ADN Secuenciar el ADN: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Planteamiento del problema Grupo OH (3’) El nucleótido es el bloque fundamental El OH en posición 3’ es el responsable de la polimerización NUCLEÓTIDO Hebra de ADN ¿Cómo conocer el orden de los nucleótidos?
  • 6. Secuenciar el ADN: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Método de terminación de la cadena Se puede separar ADN en función del tamaño Electroforesis Poliacrilamida-Urea (Resolución: 1 nucleótido) ¿Distinta longitud? Sí Parando la elongación de la cadena ¿Cómo? Neutralizando el punto de crecimiento Secuenciar el ADN: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Didesoxinucleótidos trifosfatados DESOXINUCLEÓTIDOS (dNTP) vs DIDESOXINUCLEÓTIDOS (ddNTP) dATP ddATP Ausencia del grupo OH en posición 3’ del anillo de ribosa No se puede formar el enlace fosfodiéster Terminación química de la cadena de ADN
  • 7. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Identificación de los fragmentos muestra ADN dTTP dCTP dATP polimerasa dGTP ddGTP ddTTP ddCTP ddATP La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Identificación de los fragmentos MARCAJE Fósforo radiactivo (32P y 33P) grandes 3’ SOLUCIÓN: TAMAÑO FRAGMENTOS 5’aAAATCAATTCTGTGAAC GATAATCCAGTCATTGATG TTGCCAGAGACAAAGCT 3' pequeños 5’
  • 8. Marcaje de los La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas nucleótidos de terminación Marcaje con colorantes fluorescentes Bodipy-FL-510 R6G [λabs (max) = 502 nm; λem (max) = 510 nm] [λabs (max) = 525 nm; λem (max) = 550 nm] CH3 N N B R CH CH F F S Bodipy-650 ROX [λabs (max) = 630 nm; λem (max) = 650 nm] [λabs (max) = 575 nm; λem (max) = 602 nm] VENTAJAS: • Una sola reacción de secuenciación • Fácil automatización Marcaje de los La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas nucleótidos de terminación Separación de fragmentos por electroforesis capilar ATTGC A Capilar Pol. líquido ….. Laser - Prisma Reacción Ventana Secuencia Detectores
  • 9. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Proyecto GENOMA HUMANO Febrero de 2001 Science 291,1304-1351 Nature 409, 856-859 (16 February 2001) (15 February 2001) La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Química en Medicina
  • 10. Química y Medicina: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Contrastes radiológicos RADIOGRAFÍA CONTRASTES RADIOLÓGICOS Sustancia susceptible de ser empleada en exámenes médicos de rayos X Distinguen tejidos blandos por diferencia de opacidad frente a rayos X Química y Medicina: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Contrastes radiológicos Contrastes densos Basados en compuestos químicos que contienen átomos pesados Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X Placa fotosensible FUENTE RAYOS X
  • 11. Química y Medicina: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Contrastes radiológicos Contrastes densos Sulfato de Bario Compuestos de yodo Iohexol Química y Medicina: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Contrastes radiológicos Contrastes densos Basados en compuestos químicos que contienen átomos pesados Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X Placa fotosensible FUENTE RAYOS X Contrastes hipodensos Basado en el uso de un gas o de aire Presentan una menor opacidad
  • 12. Química y Medicina: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Medicina Nuclear Empleo de isótopos radioactivos para dianóstico clínico y tratamiento de enfermedades: • Algunos tipos de cáncer • Enfermedades cardiovasculares • Desórdenes neurológicos… Henri Danlos (físico frances) en 1901 empleó radio para tratar heridas de piel producidas en enfermos de tuberculosis Radioisótopos más empleados Radioisótopo Símbolo Radiación Vida media Uso 3 Tritio 1H β 12.32 años Trazador bioquímico 24 Sodio-24 11 Na β 14.95 horas Circulación sanguínea 32 Fósforo-32 15 P β 14.28 días Terapia anti-leucemia 60 Cobalto-60 27 Co β, γ 5.27 años Terapia cancerosa 74 Arsénico-74 33 As β+ 17.8 días Localización tumores cerebrales 99m Tecnecio-99 43 Tc γ 6.01 horas Escáner cerebral 131 Yodo-131 53 I β 8.04 días Terapia tiroidea La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Tomografía por emisión de positrones Técnica de análisis en tiempo real no invasiva Imagen típica PET cerebral En combinación con TAC (tomografía axial computerizada) Información y diagnósticos MUY PRECISOS imagen de PET TAC cuerpo entero
  • 13. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas PET: Radiotrazadores Administrado por vía intravenosa, imagen PET TAC de cuerpo entero vía oral o vía respiratoria Se acumula en los órganos con afinidad por el radiotrazador Emisión de radiación gamma en los órganos donde se localiza Medición de la ACTIVIDAD METABÓLICA La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas PET: Radionucléidos Isótopos de vida media corta: 100 90 Periodo de 80 semidesintegración % radiactividad 11C, ~20 minutos 70 60 13N, ~10 minutos 50 40 15O, ~2 minutos 30 20 18F, ~110 minutos 10 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 nº de periodos Se incorporan en moléculas que sabemos como utiliza nuestro cuerpo Desintegración por emisión de positrones β+ = e+ 11 11 6C 5B + β+ + νe + 0.45 MeV 13 13 7N 6C + β+ + νe + 2.22 MeV 15 15 8O 7N + β+ + νe + 2.85 MeV 18 18 9F 8O + β+ + νe + 1.66 MeV
  • 14. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas PET: Radiotrazadores FLUORDESOXIGLUCOSA (FDG) 2-[18F]Fluor-2-desoxi-D-glucosa Tatsuo Ido (años 70) OTROS Metabolismo Angiogénesis • 18F-Fluorotimidina • 15O-Agua • 11C-Timidina • 18F-Fluoromisonidazol • 11C-Aminoácidos • 15O-Oxígeno • 11C-Glucosa CH2 • 15O-Oxígeno N H3C OH CH3 Química y Astrofísica: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Detección de moléculas Espectros de emisión y absorción de planetas y estrellas Espectro IR de las moléculas (vibraciones)
  • 15. Astrofísica: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Detección de moléculas por IR Detección de agua en el planeta HD189733b 62 años luz Orbita inclinada alineada con la orbita terrestre La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Química y Astrofísica Aislamiento del espectro IR del planeta Resultado
  • 16. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Materiales de alta tecnología Materiales: La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Química, Física e Ingenieria Materiales compuestos (COMPOSITES) Fibra de vidrio Fibra de Carbono PROPIEDADES Elevada resistencia Bajo peso Aplicaciones en Muy duraderos Ingeniería y Construcción Alternativa al hormigón armado y el acero
  • 17. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Construcciones novedosas San Diego (EE.UU.) Friedberg (Alemania) Asturias (España) La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas Química e Ingeniería Madrid (M-111)
  • 18. La relación de la Química con otras disciplinas científicas y tecnológicas INGENIERÍA QUÍMICA BIOLOGÍA GEOLOGÍA FÍSICA