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García Rubio Karla Itzel, Nadia Ivonne Elias
Tinajero , Mónica Guadalupe Jarquin Paulo,
García Alpizar Diana Laura, López Ramírez
Cecilia Alejandra
Técnica de biología molecular utilizada para el
estudio de la expresión génica mediante la
detección de ARN específico en una mezcla compleja
de ARN. Este método revela la identidad, la
cantidad, la actividad y el tamaño del producto del
gen en particular. Permite la identificación de ARN
en tejidos y organismos en diferentes etapas de
diferenciación y morfogénesis y además contribuye
a la identificación de condiciones anormales, de
enfermedad o infección, a nivel molecular.
• Primer procedimiento empleado para analizar
el tamaño molecular y la abundancia de ARN
selectivos en una mezcla de ARN.
• 1977 - Desarrollada por James Alwine, David
Kemp y George Stank en la Universidad de
Stanford.
• Obtuvo su nombre debido a la similitud del
proceso con el método Southern blot.
Los fragmentos de ARN purificados se separan
mediante electroforesis, se transfieren a una
membrana sólida y se exponen a una sonda de
ARN marcada con una sustancia radiactiva,
fluorescente o química que permite visualizar
cuando los fragmentos de ARN hibridan con la
secuencia complementaria de la sonda de ARN.
• Detecta y cuantifica ARN específico
• Es una técnica bien establecida
• Permite el estudio de la estructura del ARN
• Es una técnica laboriosa y tardada
• Requiere sondas específicas
• Menos sensibilidad y menos cuantificación
que otras técnicas
FISH en español se traduce a hibridación fluorescente in situ. Es una
técnica que se utiliza para detectar y localizar una secuencia de ADN
específica en un cromosoma. Con ayuda de una sonda se aplica
fluorocromo, el cual hace que el ADN emita fluorescencia que se
puede observar por medio de un microscopio de epifluorescencia. Los
cromosomas mas comunes a revisar son el 13, 18, 21 y el X y Y.
Los fluorocromos más comunes son:
• DAPI que emite luz azul
• GFP emite luz verde
• Rodamina emite luz roja
Son sondas que contienen
secuencias complementarias
de las secuencias repetidas
que se encuentran en los
centrómeros de los
cromosomas. Permite el
análisis de alteraciones en el
número de cromosomas
Estas sondas se hibridan a
una región particular de un
gen. Hibridan en una región
de ADN concreta del genoma,
dicha región puede
comprender la secuencia de
un gen o una región mayor,
banda cromosómica.
Son un grupo de sondas que
cada una hibrida a una
secuencia diferente a lo largo
de todo un cromosoma. Con
esto se puede marcar todo un
cromosoma generando un
cariotipo espectral.
• Se utiliza sobre células en metafase para detectar
microdeleciones espcíficas.
• Puede identificar ciertos reordenamientos específicos de
algunos tipos de cáncer.
• Se pueden apreciar mejor los cromosomas condensados y
separados
• Determina el número de copias de uno o más
cromosomas.
• Se puede realizar en 24 hrs ya que no requiere
cultivo de células.
• Un ejemplo es el estudio de aneuploidía.
EN LA FORMACIÓN DE LOS
ESPERMATOZOIDES, SE PUEDEN
PRODUCIR ERRORES DURANTE LA
MEIOSIS LO QUE PUEDE DAR
ORIGEN A ESPERMATOZOIDES CON
UN NÚMERO DE CROMOSOMAS
ALTERADO.
se realiza el análisis de un máximo
de 9 de los 23 cromosomas que
conforman el ADN del espermatozoide
y que suelen ser el 13, 15, 16, 17, 18,
21, 22, X e Y.
AUTOFLORECENCIA
• ALGUNOS MICROORGANISMOS PRODUCEN
AUTOFLUORESCENCIA, LA CUAL ENMASCARA LA
SEÑAL QUE EMITE LA PROPIA MUESTRA EN ESTUDIO.
ES EL CASO DE ALGUNAS ESPECIES BACTERIANAS
COMO SALMONELLA, ARQUEOBACTERIAS.
• LA FLUORESCENCIA TAMBIÉN SE PUEDE ENCONTRAR
EN EL MATERIAL QUE RODEA LAS CÉLULAS
MICROBIANAS; POR EJEMPLO, EN EL TEJIDO DE LAS
PLANTAS, LO CUAL ES UNA FLUORESCENCIA
BIOLÓGICA NATURAL.
• SON ESCASOS LOS ESTUDIOS QUE SE CENTRAN EN
EL ANÁLISIS DE AUTOFLUORESCENCIA Y CÓMO
EVITAR LA INTERFERENCIA CON FISH, SIN
EMBARGO, SE HA ENCONTRADO QUE EL MEDIO DE
CRECIMIENTO, LOS MÉTODOS DE FIJACIÓN Y EL
MEDIO DE MONTAJE INFLUYEN EN LA INTENSIDAD DE
LA SEÑAL.
• FORMAS DE EVITAR LA AUTOFLUORESCENCIA SON
MEDIANTE EL EMPLEO DE FISH CON OTRA TÉCNICA DE
DETECCIÓN, MANIPULANDO EL SISTEMA DE FILTROS
DURANTE LA VISUALIZACIÓN Y SISTEMAS QUE
PERMITAN AMPLIFICAR LA SEÑAL, O MEDIANTE EL
PROCESAMIENTO Y MANEJO DIGITAL DE LOS
ESPECTROS OBTENIDOS EN LA IMAGEN.
1.Observar un patrón particular de expresión genética.
2.Los patrones de expresión obtenidos nos ayudan a conocer las
funciones de los genes.
3.Delecciones o errores en el proceso de transcripción.
4.Sobreexpresión de oncogenes y la desregulación de genes.
5.Conocer la secuencia.
1.Diagnóstico de síndromes por microdeleción
2.FISH en Leucemia Mieloide
3.Diagnóstico en cáncer de pulmón.
4.Fish en cáncer de mama
5.Diagnóstico de melanoma
• Bueno Topete M, & González Cuevas J (2013). Técnicas de hibridación. Salazar
Montes A, & Sandoval Rodríguez A, & Armendáriz Borunda J(Eds.), Biología
molecular. Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de la salud. McGraw Hill.
https://accessmedicina.mhmedical.com/Content.aspx?bookid=1473&sectionid=102
743956
• Rodríguez Martinez, R., & Suescun Otero, G. (2013). Aplicaciones e inconvenientes
de la técnica Hibridación in situ Fluorescente (FISH) en la identificación de
microorganismos. Revista Científica Salud Uninorte, 29(2). Recuperado a partir de
https://rcientificas.uninorte.edu.co/index.php/salud/article/view/3173
• Andrew Cassidy, Julia Jones. Developments in in situ hybridisation. Methods. 2014
Nov;70(1):39-45. doi: 10.1016/j.ymeth.2014.04.006. Epub 2014 Apr 18.
• Arsham MS, Barch, MJ Lawce HJ. (2017). The AGT Cytogenetics Laboratory Manual.
4th Edition. Wiley-Blackwell.
• Boye Schnack Nielsen · Julia Jones. Practical Application of Fluorescent In Situ
Hybridization Techniques in Clinical Diagnostic Laboratories. PART II METHODS
FOR DNA ISH. 5th edition. Humana Press.
• Ryan Bishop. Applications of fluorescence in situ hybridization (FISH) in detecting
genetic aberrations of medical significance Bioscience Horizons. Volume 3. Number
1. March 2010.
• Zubair Ahmed Ratan, Sojib Bin Zaman et al. Application of Fluorescence In Situ
Hybridization (FISH) Technique for the Detection of Genetic Aberration in Medical
Science. Cureus. 2017 Jun 9;9(6):e1325. doi: 10.7759/cureus.1325.

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Northern blot & fish, biología molecular y genetica

  • 1. García Rubio Karla Itzel, Nadia Ivonne Elias Tinajero , Mónica Guadalupe Jarquin Paulo, García Alpizar Diana Laura, López Ramírez Cecilia Alejandra
  • 2.
  • 3. Técnica de biología molecular utilizada para el estudio de la expresión génica mediante la detección de ARN específico en una mezcla compleja de ARN. Este método revela la identidad, la cantidad, la actividad y el tamaño del producto del gen en particular. Permite la identificación de ARN en tejidos y organismos en diferentes etapas de diferenciación y morfogénesis y además contribuye a la identificación de condiciones anormales, de enfermedad o infección, a nivel molecular.
  • 4. • Primer procedimiento empleado para analizar el tamaño molecular y la abundancia de ARN selectivos en una mezcla de ARN. • 1977 - Desarrollada por James Alwine, David Kemp y George Stank en la Universidad de Stanford. • Obtuvo su nombre debido a la similitud del proceso con el método Southern blot. Los fragmentos de ARN purificados se separan mediante electroforesis, se transfieren a una membrana sólida y se exponen a una sonda de ARN marcada con una sustancia radiactiva, fluorescente o química que permite visualizar cuando los fragmentos de ARN hibridan con la secuencia complementaria de la sonda de ARN.
  • 5. • Detecta y cuantifica ARN específico • Es una técnica bien establecida • Permite el estudio de la estructura del ARN • Es una técnica laboriosa y tardada • Requiere sondas específicas • Menos sensibilidad y menos cuantificación que otras técnicas
  • 6.
  • 7.
  • 8. FISH en español se traduce a hibridación fluorescente in situ. Es una técnica que se utiliza para detectar y localizar una secuencia de ADN específica en un cromosoma. Con ayuda de una sonda se aplica fluorocromo, el cual hace que el ADN emita fluorescencia que se puede observar por medio de un microscopio de epifluorescencia. Los cromosomas mas comunes a revisar son el 13, 18, 21 y el X y Y. Los fluorocromos más comunes son: • DAPI que emite luz azul • GFP emite luz verde • Rodamina emite luz roja
  • 9. Son sondas que contienen secuencias complementarias de las secuencias repetidas que se encuentran en los centrómeros de los cromosomas. Permite el análisis de alteraciones en el número de cromosomas Estas sondas se hibridan a una región particular de un gen. Hibridan en una región de ADN concreta del genoma, dicha región puede comprender la secuencia de un gen o una región mayor, banda cromosómica. Son un grupo de sondas que cada una hibrida a una secuencia diferente a lo largo de todo un cromosoma. Con esto se puede marcar todo un cromosoma generando un cariotipo espectral.
  • 10. • Se utiliza sobre células en metafase para detectar microdeleciones espcíficas. • Puede identificar ciertos reordenamientos específicos de algunos tipos de cáncer. • Se pueden apreciar mejor los cromosomas condensados y separados • Determina el número de copias de uno o más cromosomas. • Se puede realizar en 24 hrs ya que no requiere cultivo de células. • Un ejemplo es el estudio de aneuploidía.
  • 11.
  • 12.
  • 13. EN LA FORMACIÓN DE LOS ESPERMATOZOIDES, SE PUEDEN PRODUCIR ERRORES DURANTE LA MEIOSIS LO QUE PUEDE DAR ORIGEN A ESPERMATOZOIDES CON UN NÚMERO DE CROMOSOMAS ALTERADO. se realiza el análisis de un máximo de 9 de los 23 cromosomas que conforman el ADN del espermatozoide y que suelen ser el 13, 15, 16, 17, 18, 21, 22, X e Y.
  • 14. AUTOFLORECENCIA • ALGUNOS MICROORGANISMOS PRODUCEN AUTOFLUORESCENCIA, LA CUAL ENMASCARA LA SEÑAL QUE EMITE LA PROPIA MUESTRA EN ESTUDIO. ES EL CASO DE ALGUNAS ESPECIES BACTERIANAS COMO SALMONELLA, ARQUEOBACTERIAS. • LA FLUORESCENCIA TAMBIÉN SE PUEDE ENCONTRAR EN EL MATERIAL QUE RODEA LAS CÉLULAS MICROBIANAS; POR EJEMPLO, EN EL TEJIDO DE LAS PLANTAS, LO CUAL ES UNA FLUORESCENCIA BIOLÓGICA NATURAL. • SON ESCASOS LOS ESTUDIOS QUE SE CENTRAN EN EL ANÁLISIS DE AUTOFLUORESCENCIA Y CÓMO EVITAR LA INTERFERENCIA CON FISH, SIN EMBARGO, SE HA ENCONTRADO QUE EL MEDIO DE CRECIMIENTO, LOS MÉTODOS DE FIJACIÓN Y EL MEDIO DE MONTAJE INFLUYEN EN LA INTENSIDAD DE LA SEÑAL. • FORMAS DE EVITAR LA AUTOFLUORESCENCIA SON MEDIANTE EL EMPLEO DE FISH CON OTRA TÉCNICA DE DETECCIÓN, MANIPULANDO EL SISTEMA DE FILTROS DURANTE LA VISUALIZACIÓN Y SISTEMAS QUE PERMITAN AMPLIFICAR LA SEÑAL, O MEDIANTE EL PROCESAMIENTO Y MANEJO DIGITAL DE LOS ESPECTROS OBTENIDOS EN LA IMAGEN.
  • 15.
  • 16. 1.Observar un patrón particular de expresión genética. 2.Los patrones de expresión obtenidos nos ayudan a conocer las funciones de los genes. 3.Delecciones o errores en el proceso de transcripción. 4.Sobreexpresión de oncogenes y la desregulación de genes. 5.Conocer la secuencia.
  • 17. 1.Diagnóstico de síndromes por microdeleción 2.FISH en Leucemia Mieloide 3.Diagnóstico en cáncer de pulmón. 4.Fish en cáncer de mama 5.Diagnóstico de melanoma
  • 18.
  • 19. • Bueno Topete M, & González Cuevas J (2013). Técnicas de hibridación. Salazar Montes A, & Sandoval Rodríguez A, & Armendáriz Borunda J(Eds.), Biología molecular. Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de la salud. McGraw Hill. https://accessmedicina.mhmedical.com/Content.aspx?bookid=1473&sectionid=102 743956 • Rodríguez Martinez, R., & Suescun Otero, G. (2013). Aplicaciones e inconvenientes de la técnica Hibridación in situ Fluorescente (FISH) en la identificación de microorganismos. Revista Científica Salud Uninorte, 29(2). Recuperado a partir de https://rcientificas.uninorte.edu.co/index.php/salud/article/view/3173 • Andrew Cassidy, Julia Jones. Developments in in situ hybridisation. Methods. 2014 Nov;70(1):39-45. doi: 10.1016/j.ymeth.2014.04.006. Epub 2014 Apr 18. • Arsham MS, Barch, MJ Lawce HJ. (2017). The AGT Cytogenetics Laboratory Manual. 4th Edition. Wiley-Blackwell. • Boye Schnack Nielsen · Julia Jones. Practical Application of Fluorescent In Situ Hybridization Techniques in Clinical Diagnostic Laboratories. PART II METHODS FOR DNA ISH. 5th edition. Humana Press. • Ryan Bishop. Applications of fluorescence in situ hybridization (FISH) in detecting genetic aberrations of medical significance Bioscience Horizons. Volume 3. Number 1. March 2010. • Zubair Ahmed Ratan, Sojib Bin Zaman et al. Application of Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) Technique for the Detection of Genetic Aberration in Medical Science. Cureus. 2017 Jun 9;9(6):e1325. doi: 10.7759/cureus.1325.