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20 individuos sanos

10 H + 10 M
Fosas nasales
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Gastrointestinal
Vagina (M)
454 pyroseq

•16s V1-V3

•16s V3-V5
Triplicados
1140 muestras
SOP HMP
Proyecto Microbioma Humano Argentino
Primera base de datos de población local
Figura 1
Proyecto Microbioma Humano Argentino
Primera base de datos de población local
NasalGarganta
Intestino
Garganta
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MHA
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Existe correlación entre muestras MHA y HMP
Figura 2
Proyecto Microbioma Humano Argentino
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ARG$ HMP$
ABUNDANCIA$RELATIVA$
Otros"
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Familia"Veillonellaceae"
Familia"Porphyromonadaceae"
Familia"Prevotellaceae"
Familia"Rikenellaceae"
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Familia"Ruminococcaceae"
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**20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
Proyecto Microbioma Humano Argentino
Primera base de datos de población local
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Enterotipo 1
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**20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
Proyecto Microbioma Humano Argentino
Primera base de datos de población local
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Proyecto Microbioma Humano Argentino
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**20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
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*Test de Mann-Whitney
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Relativeabundancelogscale
Figura 7
**20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
*Test de Mann-Whitney
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Veillonellaceae_HMP
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Abundanciarelativa(log10)
Relativeabundancelogscale
CarnobacteriaceaeFusobacteriaceae
Gemellaceae
Leptotrichiaceae
PorphyromonadaceaePrevotellaceae
Streptococcaceae
Veillonelaceae
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ARG$ HMP$
ABUNDANCIA$RELATIVA$
Otros"
Familia"Leptotrichiaceae"
Familia"Porphyromonadaceae"
Familia"Fusobacteriaceae"
Familia"Carnobacteriaceae"
Familia"Prevotellaceae"
Familia"Veillonellaceae"
Familia"Gemellaceae"
Familia"Streptococcaceae"
Microbioma Mucosa Bucal referencia
Individuos sanos**
Figura 8
*
**20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
*Test de Mann-Whitney
20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina
Proyecto Microbioma Humano Argentino
Primera base de datos de población local
Comparación zona bucofaringea-nasal MHA
0"
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Mucosa)bucal))))))))))Garganta)))))))))))))))))))Amígdalas )Saliva )Fosas)nasales))))))))))
Otros"
Familia"Veillonellaceae"
Familia"Tissierellaceae"
Familia"Streptococcaceae"
Familia"Staphylococcaceae"
Familia"Sphingomonadaceae"
Familia"Propionibacteriaceae"
Familia"Prevotellaceae"
Familia"Porphyromonadaceae"
Familia"Paraprevotellaceae"
Orden"MLE1H12"
Orden"Clostridiales"
Familia"Neisseriaceae"
Familia"Leptotrichiaceae"
Familia"Gemellaceae"
Familia"Fusobacteriaceae"
Familia"Corynebacteriaceae"
Familia"Carnobacteriaceae"
Familia"AcNnomycetaceae"
Strepto
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Microbioma Humano Argentino (Piloto)

  • 1. 20 individuos sanos 10 H + 10 M Fosas nasales bucofaringeo (4 sitios) Piel (2 sitios) Gastrointestinal Vagina (M) 454 pyroseq •16s V1-V3 •16s V3-V5 Triplicados 1140 muestras SOP HMP Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Figura 1
  • 2. Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local NasalGarganta Intestino Garganta Nasal Intestino MHA MHA Existe correlación entre muestras MHA y HMP Figura 2 Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Figura 2
  • 3. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Orden"Clostridiales" Familia"Veillonellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Rikenellaceae" Familia"Lachnospiraceae" Familia"Ruminococcaceae" Familia"Bacteroidaceae" **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Bacteroidaceae Prevotellaceae Ruminococcaceae Enterotipo 1 (Diferencias en las medianas) Microbioma intestinal referencia Individuos sanos** ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP Order_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP Order_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP rder_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● Bacteroidaceae_CIBIC Bacteroidaceae_HMP Lachnospiraceae_CIBIC Lachnospiraceae_HMP rder_Clostridiales_CIBIC Order_Clostridiales_HMP phyromonadaceae_CIBIC rphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Rikenellaceae_CIBIC Rikenellaceae_HMP Ruminococcaceae_CIBIC Ruminococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP BIC MP 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 Abundanciarelativa 0.8 ARG HMP Figura 3 * * * *Test de Mann-Whitney
  • 4. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Ac<nomycetaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ActinomicetaceaeCarnobacteriaceaeFusobacteriaceae Gemellaceae PrevotellaceaeStreptococacceae ARG HMP * * ** Microbioma Garganta referencia Individuos sanos** ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● Actinomycetaceae_CIBIC Actinomycetaceae_HMP Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale Paraprevotellaceae Veillonaceae Figura 4 *Test de Mann-Whitney
  • 5. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Sphingomonadaceae" Familia"Neisseriaceae" Familia"Gemellales" Familia"Tissierellaceae" Familia"Streptococcaceae" Familia"Propionibacteriaceae" Familia"Staphylococcaceae" Familia"Corynebacteriaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local * * * Corynebacteriaceae Gemellales Neisseriaceae Propionibacteriaceae Sphingomonadaceae StaphylococcaceaeStreptococacceae ARG HMP Microbioma Nasal referencia Individuos sanos** ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Corynebacteriaceae_CIBIC Corynebacteriaceae_HMP Neisseriaceae_CIBIC Neisseriaceae_HMP Order_Gemellales_CIBIC Order_Gemellales_HMP Propionibacteriaceae_CIBIC Propionibacteriaceae_HMP Sphingomonadaceae_CIBIC Sphingomonadaceae_HMP Staphylococcaceae_CIBIC Staphylococcaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Tissierellaceae_CIBIC Tissierellaceae_HMP 0.001 0.005 0.010 0.050 0.100 0.500 1.000 Abundanciarelativa(log10) Tissierellaceae * Relativeabundancelogscale Figura 5 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  • 6. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Gemellaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Ac>nomycetaceae" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP Actinomicetaceae CarnobacteriaceaeGemellaceae Leptotrichinaceae ParaprevotellaceaePrevotellaceaeStreptococcaceae Veillonaceae * * * * Microbioma Amigdala referencia Individuos sanos** ● ● ●● ● ●● ● ● ● ●● ● ● ● ● ●●● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● Actinomycetaceae_CIBIC Actinomycetaceae_HMP Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Leptotrichiaceae_CIBIC Leptotrichiaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale Figura 6 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina * *Test de Mann-Whitney
  • 7. 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Neisseriaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Streptococcaceae" Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP Microbioma Saliva referencia Individuos sanos** ● ● ● ●●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● ●● ● ● ● ● ● ● ●● ● ●● ● ● ● ● Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Neisseriaceae_CIBIC Neisseriaceae_HMP Paraprevotellaceae_CIBIC Paraprevotellaceae_HMP Porphyromonadaceae_CIBIC Porphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Carnobacteriaceae Fusobacteriaceae NeissereaceaeParaprevotellaceae PorphyromonadaceaePrevotellaceae Streptococcaceae Veillonelaceae * * * * Relativeabundancelogscale Figura 7 **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  • 8. Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local ARG HMP ● ● ● ●● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ● ●● Carnobacteriaceae_CIBIC Carnobacteriaceae_HMP Fusobacteriaceae_CIBIC Fusobacteriaceae_HMP Gemellaceae_CIBIC Gemellaceae_HMP Leptotrichiaceae_CIBIC Leptotrichiaceae_HMP Porphyromonadaceae_CIBIC Porphyromonadaceae_HMP Prevotellaceae_CIBIC Prevotellaceae_HMP Streptococcaceae_CIBIC Streptococcaceae_HMP Veillonellaceae_CIBIC Veillonellaceae_HMP 1e−04 1e−03 1e−02 1e−01 1e+00 Abundanciarelativa(log10) Relativeabundancelogscale CarnobacteriaceaeFusobacteriaceae Gemellaceae Leptotrichiaceae PorphyromonadaceaePrevotellaceae Streptococcaceae Veillonelaceae * * 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" ARG$ HMP$ ABUNDANCIA$RELATIVA$ Otros" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Veillonellaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Streptococcaceae" Microbioma Mucosa Bucal referencia Individuos sanos** Figura 8 * **20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina *Test de Mann-Whitney
  • 9. 20 individuos sanos muestreados en Rosario en 2013, representativos de una urbe grande Argentina Proyecto Microbioma Humano Argentino Primera base de datos de población local Comparación zona bucofaringea-nasal MHA 0" 0.1" 0.2" 0.3" 0.4" 0.5" 0.6" 0.7" 0.8" 0.9" 1" Abundancia)rela-va) Mucosa)bucal))))))))))Garganta)))))))))))))))))))Amígdalas )Saliva )Fosas)nasales)))))))))) Otros" Familia"Veillonellaceae" Familia"Tissierellaceae" Familia"Streptococcaceae" Familia"Staphylococcaceae" Familia"Sphingomonadaceae" Familia"Propionibacteriaceae" Familia"Prevotellaceae" Familia"Porphyromonadaceae" Familia"Paraprevotellaceae" Orden"MLE1H12" Orden"Clostridiales" Familia"Neisseriaceae" Familia"Leptotrichiaceae" Familia"Gemellaceae" Familia"Fusobacteriaceae" Familia"Corynebacteriaceae" Familia"Carnobacteriaceae" Familia"AcNnomycetaceae" Strepto * * * *aparecen en nasal Ausentes en Buco * * * * * *Ausentes en nasal Figura 9