SlideShare uma empresa Scribd logo
1 de 23
Martin Slav ík, Jan Grégr, Bořivoj Jodas:  Katedra chemie,  TU  v Liberci is  not  still On-line molekulární vizualizace On-line molecular visualization
is  interactive Measure Manipulate www.fp.tul.cz/molvis On-line molecular visualization On-line molekulární vizualizace
Interactive  Please, choose language of my  contribution by voting. ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Molekulární vizualizace zobrazení kompletní struktury rozpoznání vzorů snadná kontrola správnosti modelu
Molekulární vizualizace všechny strukturní informace Interaktivita + porozumění tvarům přímé srovnání s 2D modelem
www.fp.tul.cz/molviz Který vzorec je správnější ? Jak ý tvar má molekula? Jak á je reaktivita? Výhody vizualizace
Výhody vizualizace
[object Object],Postup prakticky 1 ‒ 2/3 1 3 2
Postup prakticky 3/3 3 3
Jak na to? chemická struktura (model) ,[object Object],[object Object],aplikace ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],vizualizace applety wiki blog redakční systém e-learningový systém optimalizace struktury dodatečné výpočty kontrola převod formátů metadata import modelování virtuální světy
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Svobodný software
 
Jmol ‒ nabídka Rozbalovací menu otevře se po kliknutí pravým tlačítkem do okna appletu
Jmol ‒ programovací jazyk select all; wireframe; delay 0.1; spacefill 300; delay 0.1;  rotate x 90; zoom 150; select protein; label Cystein; ssbonds 40; select (carbon)[3][5]; color white; label %P %e; isosurface povrch1 molecular color translucent; measure ALLCONNECTED (oxygen) (carbon)
modifikace uhlíku lcaocartoon create „pz“
Grafit Elektrostatický potenciál červená přebytek  –  náboje  modrá přebytek  +  náboje modifikace uhlíku
Integrace  v e-learningových systémech
Java Molecular Editor  pro Moodle Moodle + HotPotatoes + JME
Jmol filter/ aplikace pro Moodle Moodle + HotPotatoes + JME
Virtuální laboratoř ChemCollective
CAS – počítačový algebraický systém
Inteligentní vědecký kalkulátor KaHAc=1.8e-5  //Ka Acetic KaHOAc=1.8e-5  //Ka Acetic KaHC2H3O2=1.8e-5  //Ka Acetic KaH3AsO4=5.6e-3  //Ka Arsenic1 KspBaCO3=5.1e-9  //Ksp Barium carbonate KspBaCrO4=1.2e-10  //Ksp Barium chromate KspBaF2=1.0e-6  //Ksp Barium fluoride KspBa_OH_2=5e-3  //Ksp Barium hydroxide Ac="CH3CO"  //overrides atom Ac Me="CH3" Et="CH3CH2" // MULTIPLY to convert   ang_from_cm=1e8 amu_from_g=6.0221367e23 mmHg_from_atm=760 Bob Hanson , General Chemistry Toolkit Instantní řešení
Děkujeme za pozornost ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Mais conteúdo relacionado

Mais de Martin Slavík

Mais de Martin Slavík (10)

Učíme přírodní vědy na KCH FP TUL
Učíme přírodní vědy na KCH FP TULUčíme přírodní vědy na KCH FP TUL
Učíme přírodní vědy na KCH FP TUL
 
BOZP v chemické laboratoři TUL: STUDENTI
BOZP v chemické laboratoři TUL: STUDENTIBOZP v chemické laboratoři TUL: STUDENTI
BOZP v chemické laboratoři TUL: STUDENTI
 
Moodle ve vyuce @TUL.cz
Moodle ve vyuce @TUL.czMoodle ve vyuce @TUL.cz
Moodle ve vyuce @TUL.cz
 
Planovani kariery
Planovani karieryPlanovani kariery
Planovani kariery
 
Cool chemistry
Cool chemistryCool chemistry
Cool chemistry
 
Chemické základy moderních materiálů
Chemické  základy moderních  materiálůChemické  základy moderních  materiálů
Chemické základy moderních materiálů
 
Zajímavá chemie: LAMS
Zajímavá chemie: LAMSZajímavá chemie: LAMS
Zajímavá chemie: LAMS
 
Moodle Day Liberec 2010
Moodle Day Liberec 2010Moodle Day Liberec 2010
Moodle Day Liberec 2010
 
Nové trendy ve vysokoškolské výuce chemie
Nové trendy ve vysokoškolské výuce chemieNové trendy ve vysokoškolské výuce chemie
Nové trendy ve vysokoškolské výuce chemie
 
E-learning a jeho možnosti
E-learning a jeho možnostiE-learning a jeho možnosti
E-learning a jeho možnosti
 

Molekularni vizualizace a ICT

Notas do Editor

  1. http://www.umass.edu/molvis/tutorials/hemoglobin/heme.htm
  2. Aktivizace (didaktické hry, rozbor aktuálních informací o chemii z médií, otevřené úlohy – identifikace neznámého vzorku; návrh přípravy a příprava sloučeniny; používání populárně-naučné literatury). Integrace – oborů (koncept UnifiedScience [8] a software Mathematica 6.0 [9] ); zdrojů – pomocí technologie RSS (odebírání dat); dat – pomocí souborů CML (Chemical Markup Language, pro ukázku si stáhněte 600 molekulárních struktur i s vlastnostmi [10] ); Konzistence výuky = soulad reality s tím, co učí učitelé (např. používání kurikulí, stanovení nezbytného minimálního obsahu výuky, který vyžadují učitelé ve všech předmětech – může se jednat např. o odhad vztahu mezi strukturou a vlastnostmi) Podpora kreativity také v použití ICT (např.: zpracování obrazu – mikroskopie, chromatografie; měření na videosekvencích chemických experimentů); Studenti se učí učením ostatních – studenty hodnotíme např. za vytváření výukového obsahu v e-learningovém systému; Učit s ICT (neučíme o technologiích, ale s jejich pomocí); Vizualizace, kdekoli je to možné – používáme volně dostupný applet pro vizualizaci chemických struktur Jmol ; Otevřenost – volně dostupný software, popř. freeware (rychlý vývoj, skvělá cena, snadná možnost lokalizace do rodného jazyka; naprosto srovnatelné s komerčním software), koncepty OpenScience a OpenData (http://blueobelisk.sourceforge.net/); Virtuální přístroje (např. skvělé prostředí Chemistry Collective [13] pro simulaci laboratorních experimentů nebo virtuální plynový chromatograf [14]. Výchova a sociální rozměr – učitel jako živá osobnost, osobní komunikace, spolupráce mezi studenty. Levné pomůcky zhotovitelné svépomocí [11] a počítačem podporovaný experiment Používání ICT ve výuce odráží také stav používání ICT obecně, např. v chemii jako vědě. A ten je neuspokojivý. Většina chemických materiálů je dnes distribuována ve formě PDF (a co hůře DOC) souborů nebo prezentací bez náležitých metadat (popisu obsahu).