ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO Psychotria L. (Rubiaceae)
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Este documento presenta un análisis filogenético de 14 especies del género Psychotria utilizando el gen rbCL. Los resultados de los análisis de parsimonia y bayesiano sugieren que las especies de Psychotria constituyen un grupo monofilético. Sin embargo, el análisis de máxima verosimilitud no apoya esta hipótesis, mostrando que las especies no están suficientemente relacionadas por un ancestro común. El documento también discute posibles errores en la identificación del outgroup Cinchona macrocalyx.
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ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO Psychotria L. (Rubiaceae)
- 1. ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO Psychotria L. (Rubiaceae) Jorge Caranqui, Luis Espinoza, Edison Lomas, Ángeles Simbaña
- 2. INTRODUCCIÓN Familia Rubiaceae: Origen etimológico: Rubia L. latín “ruber”= “rojo” refiere al colorante rojo que se extrae de la especie asiática Rubia tinctorum. Presenta hierbas, arbustos o árboles u ocasionalmente trepadoras, no presentan látex, si presentan iridoides, alcaloides y resinas.
- 3. POSICIÓN FILOGENÉTICA De acuerdo al APG (Angiosperm Phylogenic Group), Rubiaceae es el grupo hermano del resto de familias de Gentianales y se distingue por la presencia de ovario ínfero y estipulas interpeciolares. Anteriormente la Familia estaba en el Orden Rubiales dentro del S. Clasificación de Cronquist.
- 5. DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA Trópicos, Subtrópicos y en las Zonas templadas. 10.000 spp. y 500-700 (Taylor 2001b) Ecuador: 499 spp. y 78 géneros (Taylor 1999) se distribuyen desde las tierras bajas, Bosques montanos y los Páramos.
- 6. PROBLEMA Anteriormente los sistemas de clasificación se basaban en características morfológicas que conllevan al problema de confundir caracteres sinapomórficos de homoplásicos.
- 7. HIPOTESIS Las 14 especies en estudio del genéro Psychotria, son un grupo monofilético
- 8. PREGUNTAS ¿ Los modelos realizados nos darán patrones similares en las relaciones filogenéticas entre las 14 especies de Psychotria ?
- 9. MATERIALES Y MÉTODOS Familia Rubiaceae In-group: Género Psychotria:14 especies Out-group: Especies: Cinchona macrocalyx Palicourea lasiorrachis
- 10. MATERIALES Y MÉTODOS Obtención de datos (genes-nucleótidos): NCBI EMBL-EBI DBGET
- 11. Gen rbCL (ribulose-bisphosphate carboxylase ) Este gen es el mas comúnmente estudiado en las plantas, ya que tiene un tamaño más o menos largo (1428 pares de bases). Puede ser alineado fácilmente, por lo que es un gen muy utilizado en sistemática. Debido a que la proteína codificada por él es muy importante para las plantas, éste es un gen que no presenta cambios o mutaciones muy frecuentes.
- 12. Análisis Alineamiento: Clustalx, BioEdit Winclade: Parsimonia PAUP: Distancia, Máxima Verosimilitud Mr. Bayes: Bayesiano
- 13. RESULTADOS
- 14. L= 194 CI= 0.59 RI= 0.70 PARSIMONIA 100 67 70 95 85 95 84 Palicourea lasiorrachis Psychotria poeppigiana Psychotria bremekampiana Psychotria leptothyrsa Psychotria borucaza Psychotria ipecacuanha Psychotria micrococca Psychotria mariniana Psychotria peteri Psychotria holtzii Psychotria kirkii Psychotria nervosa Psychotria micralabastra Psychotria ramuensis Psychotria graciliflora Cinchona macrocalyx
- 15. Palicourea lasiorrachis Psychotria poeppigiana Psychotria bremekampiana Psychotria leptothyrsa Psychotria borucaza Psychotria ipecacuanha Psychotria graciliflora Psychotria micrococca Cinchona macrocalyx Psychotria mariniana Psychotria micralabastra Psychotria ramuensis Psychotria nervosa Psychotria peteri Psychotria holtzii Psychotria kirkii Sinapomorfia Homoplasia PARSIMONIA
- 16. P. holtzii P. kirkii P. peteri P. nervosa P. graciliflora P. micralabastra P. ramuensis P. mariniana 0.003 0.001 P. micrococca Cinchona macrocalyx 0.001 P. borucaza P. ipecacuanha P. leptothyrsa 0.002 0.004 P. bremekampiana Palicourea lasiorrachis P. poeppigiana 0.005 substitutions/site 0.002 0.011 0.005 0.012 0.002 0.001 0.005 0.005 0.005 0.054 0.001 0.005 0.001 0.009 0.005 0.067 0.005 0.010 0.004 0.012 0.018 0.012 0.010 0.012 DISTANCIAS
- 17. MAXIMA VEROSIMILITUD P. graciliflora Cinchona macrocalyx P. holtzii P. kirkii P. peteri P. nervosa P. micralabastra P. ramuensis P. mariniana 95 P. micrococca 88 P. borucaza P. ipecacuanha P. bremekampiana 83 P. bremekampiana Palicourea lasiorrachis P. peteri
- 18. Psychotria graciliflora Cinchona macrocalyx Palicourea lasiorrachis Psychotria poeppigiana Psychotria bremekampiana Psychotria borucaza Psychotria ipecacuanha 0.98 Psychotria leptothyrsa 0.67 Psychotria holtzii Psychotria kirkii 0.99 Psychotria peteri 0.72 Psychotria nervosa 0.90 0.76 Psychotria micralabastra Psychotria ramuensis 1.00 Psychotria mariniana 1.00 Psychotria micrococca 0.98 0.82 0.98 0.83 0.01 BAYESIANO
- 19. DISCUSIÓN En todos los modelos realizados Cinchona macrocalyx fue utilizada como Outgroup, sin embargo ya en los cladogramas apareció siempre incluido en el Ingroup; esto puede deberse a un error en la identificación de la especie, o por otra parte podría ser que no existen diferencias genéticas marcadas.
- 20. Al parecer las especies de Psychotria en estudio, constituyen un grupo monofilético, según los resultados del modelo de Parsimonia. El modelo de máxima verosimilitud, demostró que estas especies de Psychotria no están suficientemente relacionados por un ancestro común.
- 21. GRACIAS