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V. TAXONOMÍA DE LOS PROCARIOTAS

Tema 41. Técnicas de identificación bacteriana.
Técnicas de identificación bacteriana.


  I. Concepto y tipos de diagnóstico

  II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo
      1. Técnicas de microbiología clásica
      2. Técnicas inmunológicas.
      3. Técnicas de biología molecular
      4. Otras técnicas específicas.

  III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto
Técnicas de identificación bacteriana.

 I. Concepto y tipos de diagnóstico

 II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo
     1. Técnicas de microbiología clásica
     2. Técnicas inmunológicas.
     3. Técnicas de biología molecular
     4. Otras técnicas específicas.

 III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto
I. Concepto y tipos de diagnóstico

DIAGNÓSTICO DIRECTO: se identifican los microorganismos, sus antígenos,
sus metabolitos

DIAGNÓSTICO INDIRECTO: se identifican los anticuerpos frente a los
microorganismos
Diagnóstico directo:

•Se analiza cualquier muestra

Diagnóstico indirecto:

*la muestra estudiada es siempre la sangre
II. Técnicas utilizadas en el
diagnóstico directo.

1. Técnicas de microbiología clásica
2. Técnicas de biología molecular
3. Técnicas inmunológicas
4. Otras técnicas específicas.
1. TÉCNICAS DE MICROBIOLOGÍA CLÁSICA

• Observación macroscópica y
  microscópica
• Enriquecimiento y aislamiento
• Cultivo puro
• Identificación


2. TÉCNICAS INMUNOLÓGICAS: para
  identificar Ag

•   IF: inmunofluorescencia
•   RIA: radioinmunoanálisis
•   ELISA: enzimoinmunoanálisis
•   CIE: contrainmunoelectroforesis
3. TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR

•PCR + SONDAS ESPECÍFICAS


4. OTRAS TÉCNICAS ESPECÍFICAS

•BIOENSAYO: ensayos en animales de
experimentación o en cultivos celulares
•CROMATOGRAFÍA GASEOSA: ácidos
grasos(Mycobacterium)
•TEST DEL ALIENTO (Helicobacter)
II. Técnicas utilizadas en el
diagnóstico directo
1. Técnicas de microbiología clásica


    Etapas:

-Toma de muestra
-Análisis macroscópico
-Microscopía
-Enriquecimiento
-Aislamiento
-Identificación
Toma de muestras: primera etapa

La muestra a tomar y la forma de hacerlo
dependerá del tipo de enfermedad
infecciosa

    •Orina: ITU
    •Heces: infección intestinal
    •Esputo: infección respirartorio inferior
    •Sangre: infección sistemica
    •Secreciones: ETS
    •Otras

 Los recipientes serán estériles
Tosferina: como el
microorganismo es muy lábil el
paciente tose sobre la muestra
Muestras usadas en el diagnóstico directo




 Las muestras de         Dispositivo para tomar una
 heces se toman          muestra de orina
 enrecipientes           directamente en la vegija
 anchos
Toma de
                     muestra del
                     respiratorio
                     inferior y
                     superior




Escobillón estéril
Toma de muestra de sangre




Toma de muestra del LCR
(meningitis)
Examen macroscópico de la muestra:
segunda etapa

Puede orientar el diagnóstico

Esputo: color, presencia de sangre

Orina: turbidez, olor, color

LCR: turbidez


Heces: pus, sangre, restos celulares
Examen microscópico de la muestra: segunda etapa




Según cada caso se recurrirá a una
técnica microscópica (óptica,
fluorescencia, contraste de fase)

y tipo de tinción (Gram, Ziehl-Neelsen)

Muy útil cuando…

La bacteria tiene una morfología muy típica:
Neisseria, Vibrio, Treponema
La bacteria no se puede cultivar
Mycobacterium: tinción de AAR
Ejemplos:




                                  Neisseria: tinción de Gram




          IF


Treponema: contraste de fase
Enriquecimiento: cuarta etapa
(opcional)


•Si la muestra esta diluida

•Si la bacteria que se desea aislar
presenta una característica útil
para su enriquecimiento
Ejemplos


AISLAMIENTO DE VIBRIO
CHOLERAE

-Enriquecimiento selectivo en
agua de peptona alcalina.


DESPUÉS
-Aislamiento en TCBS
(tiosulfato, citrato, bilis y
sacarosa)
-Sensibilidad al O/129.
Staphylococcus aureus: puede crecer en
presencia de sales

Enriquecimiento con NaCl 10% (TSB;
Giolitti Cantoni)
DESPUES: Medios selectivos para Staphylococcus aureus
 Baird-Parker (telurito)




                                  Manitol salado
Aislamiento: quinta etapa

   Se utilizan

   Medios ordinarios
   Medios enriquecidos
   Medios selectivos
   Medios diferenciales
   Medios de enriquecimiento


Su tipo depende del análisis y juega un
papel decisivo el buen criterio del analista
Aislamiento                                      Medios TCBS para Escherichia coli




Medios selectivos y diferenciales para las enterobacterias   Medio ordinario
A veces es aconsejable usar
incubación en bajas
tensiones de oxígeno para
favorecer el aislamiento o
actividad de determinadas
bacterias


Ej: crecimiento y hemolisis
de Streptococcus
Identificación: sexta etapa, utilizando


pruebas hechas en el laboratorio o
miniaturas comercializadas
Ejemplos
                  Pruebas Bioquímicas, fisiológicas y nutricionales



  Betahemolisis
                                         Sistema API




  DNAsa
Sistema API
Antibiograma: séptima etapa


•No siempre se realiza

•No es una técnica de identificación

•Para seleccionar los antimicrobianos a
ensayar debería tenerse ya el
microorganismo identificado
ANTIBIOGRAMA: Técnica de Müeller-Hinton




                         Disco impregnado de antibiótico
II. Técnicas utilizadas en el
   diagnóstico directo.

1.Técnicas de microbiología clásica
2.Técnicas de biología molecular
3. Técnicas inmunológicas.
4. Otras técnicas específicas.
Hibridación con sondas específicas marcadas
AMPLIFICACIÓN DEL DNA DE LA MUESTRA POR PCR
Técnicas de identificación bacteriana.
   I. Concepto y tipos de diagnóstico

   II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo
       1. Técnicas de microbiología clásica
       2. Técnicas de biología molecular
                                             Tecnicas
                                             Inmunológicas
       2. Técnicas inmunológicas.            Directas
      4. Otras técnicas específicas.

   III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto



     Tecnicas inmunológicas indirectas
TECNICAS INMUNOLÓGICAS EN EL DIAGNOSTICO DIRECTO

•Se investigan los microorganismos mediante sus antígenos.
•La muestras pueden ser diversas
•Reactivo: el Ab


TECNICAS INMUNOLÓGICAS EN EL DIAGNOSTICO
INDIRECTO (serología)

•Se investigan los anticuerpos formados frente a un
microorganismo.
•La muestra es el suero
•Reactivo: el Ag
Existen ya pruebas comercializadas para identificar
a los microorganismos patógenos más importantes
1. Reacciones de precipitación: medio sólido


                               Cuando el Ag
                               y el Ab se
                               mezclan en
                               las
                               proporciones
                               adecuadas
                               se forma un
                               precipitado
Inmunodifusión (precipitación)      Ag

                                 Un suero
                                 que puede
                                 tener Ab




 Anillo de precipitación
Inmunoelectroforesis: inmunodifusion + electroforesis




1. electroforesis: las mezcla de
   Ag se separa
2. Se enfrentan al anticuerpo
3. Si son específicos precipitan
   juntos
Reacciones de aglutinación:
     Medio líquido: se hacen en tubos o en placas
     de microtitulación. Diagnóstico indirecto




                      Distintas muestras




 Muestra positiva
                                       La concentración de Ab va disminuyendo

ASLO (anti-estreptolisina O): Se buscan Ab frente a la
estreptolisina O de Streptococcus pyogenes (diagnóstico
de la fiebre reumática)
Aglutinación en medio líquido
Aglutinación en látex para Staphylococcus
aureus
Se mezcla un colonia con Ab específicos contra la
proteína A
Se observa la aparición o no de grumos
Inhibición de la hemaglutinación




Al bloquear el microorganismo con sus Ab específicos
(presentes en el suero del enfermo) no se da la
hemaglutinación
Fijación del Complemento




-Ab +Ab           El C se une
                  sólo si Ag y
                  Ab han
                  reaccionado


              Como el C está libre produce la lisis de los hematíes que a
              su vez han reaccionado con su Ab; en el tubo de la derecha
              no es posible porque el C se ha consumido en la otra
              reacción
4. Inmunofluorescencia (IF, IFD)
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Indirecta (IFI)
Bacteria (Legionella) teñida con anticuerpos
fluorescentes y vista al microscopio de luz UV
6. Enzimoinmunoanálisis
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  • 1. V. TAXONOMÍA DE LOS PROCARIOTAS Tema 41. Técnicas de identificación bacteriana.
  • 2. Técnicas de identificación bacteriana. I. Concepto y tipos de diagnóstico II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo 1. Técnicas de microbiología clásica 2. Técnicas inmunológicas. 3. Técnicas de biología molecular 4. Otras técnicas específicas. III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto
  • 3. Técnicas de identificación bacteriana. I. Concepto y tipos de diagnóstico II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo 1. Técnicas de microbiología clásica 2. Técnicas inmunológicas. 3. Técnicas de biología molecular 4. Otras técnicas específicas. III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto
  • 4. I. Concepto y tipos de diagnóstico DIAGNÓSTICO DIRECTO: se identifican los microorganismos, sus antígenos, sus metabolitos DIAGNÓSTICO INDIRECTO: se identifican los anticuerpos frente a los microorganismos
  • 5. Diagnóstico directo: •Se analiza cualquier muestra Diagnóstico indirecto: *la muestra estudiada es siempre la sangre
  • 6. II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo. 1. Técnicas de microbiología clásica 2. Técnicas de biología molecular 3. Técnicas inmunológicas 4. Otras técnicas específicas.
  • 7. 1. TÉCNICAS DE MICROBIOLOGÍA CLÁSICA • Observación macroscópica y microscópica • Enriquecimiento y aislamiento • Cultivo puro • Identificación 2. TÉCNICAS INMUNOLÓGICAS: para identificar Ag • IF: inmunofluorescencia • RIA: radioinmunoanálisis • ELISA: enzimoinmunoanálisis • CIE: contrainmunoelectroforesis
  • 8. 3. TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR •PCR + SONDAS ESPECÍFICAS 4. OTRAS TÉCNICAS ESPECÍFICAS •BIOENSAYO: ensayos en animales de experimentación o en cultivos celulares •CROMATOGRAFÍA GASEOSA: ácidos grasos(Mycobacterium) •TEST DEL ALIENTO (Helicobacter)
  • 9. II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo 1. Técnicas de microbiología clásica Etapas: -Toma de muestra -Análisis macroscópico -Microscopía -Enriquecimiento -Aislamiento -Identificación
  • 10. Toma de muestras: primera etapa La muestra a tomar y la forma de hacerlo dependerá del tipo de enfermedad infecciosa •Orina: ITU •Heces: infección intestinal •Esputo: infección respirartorio inferior •Sangre: infección sistemica •Secreciones: ETS •Otras Los recipientes serán estériles
  • 11. Tosferina: como el microorganismo es muy lábil el paciente tose sobre la muestra
  • 12. Muestras usadas en el diagnóstico directo Las muestras de Dispositivo para tomar una heces se toman muestra de orina enrecipientes directamente en la vegija anchos
  • 13. Toma de muestra del respiratorio inferior y superior Escobillón estéril
  • 14. Toma de muestra de sangre Toma de muestra del LCR (meningitis)
  • 15. Examen macroscópico de la muestra: segunda etapa Puede orientar el diagnóstico Esputo: color, presencia de sangre Orina: turbidez, olor, color LCR: turbidez Heces: pus, sangre, restos celulares
  • 16. Examen microscópico de la muestra: segunda etapa Según cada caso se recurrirá a una técnica microscópica (óptica, fluorescencia, contraste de fase) y tipo de tinción (Gram, Ziehl-Neelsen) Muy útil cuando… La bacteria tiene una morfología muy típica: Neisseria, Vibrio, Treponema La bacteria no se puede cultivar
  • 17. Mycobacterium: tinción de AAR Ejemplos: Neisseria: tinción de Gram IF Treponema: contraste de fase
  • 18. Enriquecimiento: cuarta etapa (opcional) •Si la muestra esta diluida •Si la bacteria que se desea aislar presenta una característica útil para su enriquecimiento
  • 19. Ejemplos AISLAMIENTO DE VIBRIO CHOLERAE -Enriquecimiento selectivo en agua de peptona alcalina. DESPUÉS -Aislamiento en TCBS (tiosulfato, citrato, bilis y sacarosa) -Sensibilidad al O/129.
  • 20. Staphylococcus aureus: puede crecer en presencia de sales Enriquecimiento con NaCl 10% (TSB; Giolitti Cantoni)
  • 21. DESPUES: Medios selectivos para Staphylococcus aureus Baird-Parker (telurito) Manitol salado
  • 22. Aislamiento: quinta etapa Se utilizan Medios ordinarios Medios enriquecidos Medios selectivos Medios diferenciales Medios de enriquecimiento Su tipo depende del análisis y juega un papel decisivo el buen criterio del analista
  • 23. Aislamiento Medios TCBS para Escherichia coli Medios selectivos y diferenciales para las enterobacterias Medio ordinario
  • 24. A veces es aconsejable usar incubación en bajas tensiones de oxígeno para favorecer el aislamiento o actividad de determinadas bacterias Ej: crecimiento y hemolisis de Streptococcus
  • 25. Identificación: sexta etapa, utilizando pruebas hechas en el laboratorio o miniaturas comercializadas
  • 26. Ejemplos Pruebas Bioquímicas, fisiológicas y nutricionales Betahemolisis Sistema API DNAsa
  • 28. Antibiograma: séptima etapa •No siempre se realiza •No es una técnica de identificación •Para seleccionar los antimicrobianos a ensayar debería tenerse ya el microorganismo identificado
  • 29. ANTIBIOGRAMA: Técnica de Müeller-Hinton Disco impregnado de antibiótico
  • 30. II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo. 1.Técnicas de microbiología clásica 2.Técnicas de biología molecular 3. Técnicas inmunológicas. 4. Otras técnicas específicas.
  • 31. Hibridación con sondas específicas marcadas
  • 32. AMPLIFICACIÓN DEL DNA DE LA MUESTRA POR PCR
  • 33. Técnicas de identificación bacteriana. I. Concepto y tipos de diagnóstico II. Técnicas utilizadas en el diagnóstico directo 1. Técnicas de microbiología clásica 2. Técnicas de biología molecular Tecnicas Inmunológicas 2. Técnicas inmunológicas. Directas 4. Otras técnicas específicas. III. Técnicas utilizadas en el diagnóstico indirecto Tecnicas inmunológicas indirectas
  • 34. TECNICAS INMUNOLÓGICAS EN EL DIAGNOSTICO DIRECTO •Se investigan los microorganismos mediante sus antígenos. •La muestras pueden ser diversas •Reactivo: el Ab TECNICAS INMUNOLÓGICAS EN EL DIAGNOSTICO INDIRECTO (serología) •Se investigan los anticuerpos formados frente a un microorganismo. •La muestra es el suero •Reactivo: el Ag
  • 35. Existen ya pruebas comercializadas para identificar a los microorganismos patógenos más importantes
  • 36. 1. Reacciones de precipitación: medio sólido Cuando el Ag y el Ab se mezclan en las proporciones adecuadas se forma un precipitado
  • 37. Inmunodifusión (precipitación) Ag Un suero que puede tener Ab Anillo de precipitación
  • 38. Inmunoelectroforesis: inmunodifusion + electroforesis 1. electroforesis: las mezcla de Ag se separa 2. Se enfrentan al anticuerpo 3. Si son específicos precipitan juntos
  • 39. Reacciones de aglutinación: Medio líquido: se hacen en tubos o en placas de microtitulación. Diagnóstico indirecto Distintas muestras Muestra positiva La concentración de Ab va disminuyendo ASLO (anti-estreptolisina O): Se buscan Ab frente a la estreptolisina O de Streptococcus pyogenes (diagnóstico de la fiebre reumática)
  • 41. Aglutinación en látex para Staphylococcus aureus Se mezcla un colonia con Ab específicos contra la proteína A Se observa la aparición o no de grumos
  • 42.
  • 43. Inhibición de la hemaglutinación Al bloquear el microorganismo con sus Ab específicos (presentes en el suero del enfermo) no se da la hemaglutinación
  • 44.
  • 45. Fijación del Complemento -Ab +Ab El C se une sólo si Ag y Ab han reaccionado Como el C está libre produce la lisis de los hematíes que a su vez han reaccionado con su Ab; en el tubo de la derecha no es posible porque el C se ha consumido en la otra reacción
  • 48.
  • 49.
  • 50. Bacteria (Legionella) teñida con anticuerpos fluorescentes y vista al microscopio de luz UV
  • 52.