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ESTABILIDAD DE POLIGALACTURONASA
       DE Aspergillus níger A LA
 ULTRAFILTRACIÓN Y LIOFILIZACIÓN.
 IDENTIFICACIÓN ELECTROFORÉTICA
Memoria del período de investigación de Cursos
 de Doctorado presentada por: Javier Álvarez
                    Díaz
SUSTANCIAS PÉCTICAS




Heteropolisacáridos complejos compuestos principalmente
   de unidades de ácido D-galacturónico, parcialmente
   metoxiladas.
Clasificación:
   •   Pectinas: ácidos poligalacturónicos con grupos metil-
       éster.
   •   Ácidos pécticos: ácidos poligalacturónicos libres de
       grupos metil-éster.
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
         PECTINOLÍTICAS
        ENZIMAS                  ENZIMAS
  DESESTERIFICANTES      DESPOLIMERIZANTES
• Pectinesterasa (PE)   • Polimetilgalacturonasas
                          (PMG)
                        • Poligalacturonasas (PG)
                        • Polimetilgalacturonato
                          liasas (PMGL)
                        • Poligalacturonato liasas
                          (PGL)
POLIGALACTURONASA
ENDOPOLIGALACTURONASA   EXOPOLIGALACTURONASA


•Plantas, bacterias,    •Plantas, hongos,
levaduras y hongos      bacterias, insectos
•pM (36-60 Kda)         •pM (47-68 Kda)

•pH óptimo (4-5,5)      •pH óptimo (4,6)

•pI (3,2-5,4)           •pI (6,2-8,3)
APLICACIONES DE ENZIMAS
     PECTINOLÍTICAS


• Clarificación de zumos de frutas
• Maceración
• Licuefacción
• Conservación de la madera
• Producción de oligogalacturónidos OGAs
JUSTIFICACIÓN


•La producción de PG está afectada por las
condiciones de crecimiento del microorganismo
productor
•Las preparaciones comerciales de enzimas
pécticas   contienen     niveles   reducidos    de
concentración de enzimas. Se necesita el desarrollo
de concentrados con alta actividad
•El seguimiento de PG a lo largo de procesos de
purificación requiere de técnicas de identificación
de la enzima
OBJETIVOS

•Comprobar      como     influyen   distintas
condiciones de crecimiento de A. niger en la
producción de PG
•Evaluar los efectos de la ultrafiltración y la
liofilización sobre la actividad de PG y la
concentración de proteínas
•Optimizar la técnica de revelado de PG con
rojo de rutenio en geles de poliacrilamida
NATIVE-PAGE y SDS-PAGE
ULTRAFILTRACIÓN

•Método de concentración y purificación
enzimática
•Ultrafiltración tangencial o flujo cruzado.
Sistema Minitan (Millipore)
•4 Membranas de polisulfonato, 10.000
NMW
•Muestras concentradas 2 y 10 veces
LIOFILIZACIÓN

•Concentración proteica en forma de polvo
seco
•Congelación a –20 ºC
•Liofilización a –40 ºC, 24 horas.
Liofilizador “CRYODOS” (Telstar)
•Liofilizado resuspendido   en   tampón
acético-acetato pH 4,2
•Muestra concentrada 20 veces
CULTIVO DE A. NIGER

•Cepa Aspergillus niger CECT Nº 2088
•Medio de cultivo Czapex-Dox
•Concentración de esporas inoculadas 6,62 × 105
esporas/ml
•Inductor, pectina de cítrico al 1%
•Incubación:
       •Estática a 30ºC, 72 horas
       •Estática a 30ºC, 96 horas
       •Estatica a 30ºC (72 h) + Agitación (24 h)
ZIMOGRAMA
Método de detección enzimática en geles de poliacrilamida
basado en el revelado de los geles en función de la actividad
enzimática de las enzimas a separar
Revelado de PG con rojo rutenio
Tipos:
•Sustrato incorporado en el gel de separación
•Técnica cup-plate
•Contacto enzima-sustrato      después   de     la   separación
electroforética:
   •Inmersión del gel en una solución de sustrato
   •Transferencia a geles con sustrato incorporado
NATIVE-PAGE
•Geles planos al 10 % de poliacrilamida. Método
de Davis
•El TEMED actúa sobre el PSA formando
radicales libres que inician la polimerización de
los monómeros de acrilamida
•Las cadenas de poliacrilamida         se   unen
mediante la bisacrilamida
•Zimogramas:
   •gel con ácido poligalacturónico
   •gel sin ácido poligalacturónico
SDS - PAGE

•Técnica descrita por Laemli: sistema de tampón
discontinuo Ornstein-Davis
•Agentes desnaturalizantes:
   •SDS los polipéptidos se rodean de cargas – y migran
   en el gel en función del tamaño
   •Ditiotreitol ruptura de puentes disulfuro
•Zimograma
   •Los geles incorporan ácido poligalacturónico al 0,1%
   •Renaturalización de PG con Tritón X-100
ACTIVIDAD PG EN FUNCIÓN DE LAS CONDICIONES DE
           CRECIMIENTO DE A. NIGER


                                     1600


                                     1400


                                     1200
     (ug ácido galacturónico/ml h)




                                     1000
          Actividad enzimática




                                     800


                                     600


                                     400


                                     200


                                       0
                                            72 h estático   96 horas estático   72 h estático+24 h
                                                                                     agitación
ESTABILIDAD DE PG FRENTE A LA
                                ULTRAFILTRACIÓN


                      Actividad Concentración     Actividad    Proteínas
   Muestras                                                                Actividad totale Rendimiento
                     enzimáticaa  proteínasb     específicac    totalesd


Extracto. crudo       1308,346            991    1404,365       495,5       654173,278        100%



Ultrafiltrado * 2      2242,88            1108    2024,26      306,916       621277,76       94,97%



Ultrafiltrado. *10     929,588            3714    250,293        186          46479,4        7,11%




           a
             µg ácido galacturónico ml-1 h-1
           b
             ppm
           c
             Unidades mg-1 de proteína
           d
             mg
           e
            Unidades
Actividad total del extracto crudo y de las                                                        Concentración de proteína para el
          muestras concentradas por ultrafiltración                                                            extracto crudo y las muestras
                                                                                                              concentradas por ultrafiltración



                      700000

                      600000                                                                              4000

                                                                                                          3500
                      500000
                                                                                                          3000
                      400000




                                                                                        Proteínas (ppm)
Actividad total (U)




                                                                                                          2500
                      300000                                                                              2000

                      200000                                                                              1500

                                                                                                          1000
                      100000
                                                                                                           500
                          0
                               Extracto crudo   Ultrafiltrado * 2   Ultrafiltrado *10                        0
                                                                                                                 Extracto crudo   Ultrafiltrado * 2   Ultrafiltrado *10
ESTABILIDAD PG FRENTE A LA
                                     LIOFILIZACIÓN



                        Actividad Concentración Actividad     Proeínas
      Muestras                                                            Actividad total Rendimiento
                       enzimáticaa  proteínasb  específicac    totalesd




    Extracto crudo      1308,346       991       1404,365      495,5       654173,278       100%




    Liofilizado *20     2931,17       15315       191,034     382,875       73279,25       11,20%




a
  µg ácido galacturónico ml-1 h-1
b
  ppm
c
  Unidades mg-1 de proteína
d
  mg
e
 Unidades
Actividad total del extracto crudo y de la                          Valores de concentración de proteína para
 muestra concentrada por liofilización.                             el extracto crudo y la muestra concentrada
                                                                                  por liofilización.



                        700000                                                         18000

                        600000                                                         16000
                                                                                       14000
                        500000
                                                                                       12000




                                                                     Proteínas (ppm)
                        400000                                                         10000
  Actividad total (U)




                                                                                       8000
                        300000
                                                                                       6000
                        200000
                                                                                       4000
                        100000                                                         2000
                                                                                           0
                             0
                                                                                               Extracto crudo   Liofilizado *20
                                 Extracto crudo   Liofilizado *20
IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA NATIVE-PAGE


    Con ácido                    Sin ácido
poligalacturónico            poligalacturónico
IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA SDS-PAGE
       CON ÁCIDO POLIGALACTURÓNICO
PROTOCOLO OPTIMIZADO DE IDENTIFICACIÓN DE PG
    EN GELES DE PAA NATIVE-PAGE CON ÁCIDO
             POLIGALACTURÓNICO



 •Solución de ácido málico 0,1M: 1 hora
 en agitación. Crea un cambio gradual de
 pH
 •Solución de incubación acetato de Na 20
 mM pH 5,5: 40´en agitación
 •Agua destilada: 5´
 •Rojo de rutenio 0,03% en agua: 1 h en
 agitación
PROTOCOLO OPTIMIZADO DE IDENTIFICACIÓN DE PG
     EN GELES DE PAA SDS-PAGE CON ÁCIDO
            POLIGALACTURÓNICO



 •Solución de Triton X-100 al 2,5% en tampón
 acetato de Na 20 mM pH 5,5: 2 horas.
 Renaturalización enzimática
 •Solución de ácido málico 0,1M: 1 h en agitación
 •Solución de incubación acetato de Na 20 mM
 pH 5,5: toda la noche
 •Agua destilada: 5´
 •Rojo de rutenio 0,03% en agua: 1 h en
 agitación
CONCLUSIONES

•La agitación del medio de crecimiento de A.
niger mantiene los niveles de producción de PG
•La ultrafiltración es una técnica adecuada para
concentrar el extracto crudo al 50% sin que se
observe una disminución de la actividad de PG.
La concentración al 10% del volumen original
resultó en una pérdida de actividad enzimática
del 92,9%
CONCLUSIONES


•La incubación de los geles de poliacrilamida,
tanto     en     condiciones  nativas    como
desnaturalizantes con SDS, con ácido málico, es
necesaria para la resolución de las bandas
indicativas de actividad PG.
•El detergente Tritón X-100 provoca una
renaturalización   incompleta   de    la
poligalacturonasa.

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Exposición

  • 1. ESTABILIDAD DE POLIGALACTURONASA DE Aspergillus níger A LA ULTRAFILTRACIÓN Y LIOFILIZACIÓN. IDENTIFICACIÓN ELECTROFORÉTICA Memoria del período de investigación de Cursos de Doctorado presentada por: Javier Álvarez Díaz
  • 2. SUSTANCIAS PÉCTICAS Heteropolisacáridos complejos compuestos principalmente de unidades de ácido D-galacturónico, parcialmente metoxiladas. Clasificación: • Pectinas: ácidos poligalacturónicos con grupos metil- éster. • Ácidos pécticos: ácidos poligalacturónicos libres de grupos metil-éster.
  • 3. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS PECTINOLÍTICAS ENZIMAS ENZIMAS DESESTERIFICANTES DESPOLIMERIZANTES • Pectinesterasa (PE) • Polimetilgalacturonasas (PMG) • Poligalacturonasas (PG) • Polimetilgalacturonato liasas (PMGL) • Poligalacturonato liasas (PGL)
  • 5. ENDOPOLIGALACTURONASA EXOPOLIGALACTURONASA •Plantas, bacterias, •Plantas, hongos, levaduras y hongos bacterias, insectos •pM (36-60 Kda) •pM (47-68 Kda) •pH óptimo (4-5,5) •pH óptimo (4,6) •pI (3,2-5,4) •pI (6,2-8,3)
  • 6. APLICACIONES DE ENZIMAS PECTINOLÍTICAS • Clarificación de zumos de frutas • Maceración • Licuefacción • Conservación de la madera • Producción de oligogalacturónidos OGAs
  • 7. JUSTIFICACIÓN •La producción de PG está afectada por las condiciones de crecimiento del microorganismo productor •Las preparaciones comerciales de enzimas pécticas contienen niveles reducidos de concentración de enzimas. Se necesita el desarrollo de concentrados con alta actividad •El seguimiento de PG a lo largo de procesos de purificación requiere de técnicas de identificación de la enzima
  • 8. OBJETIVOS •Comprobar como influyen distintas condiciones de crecimiento de A. niger en la producción de PG •Evaluar los efectos de la ultrafiltración y la liofilización sobre la actividad de PG y la concentración de proteínas •Optimizar la técnica de revelado de PG con rojo de rutenio en geles de poliacrilamida NATIVE-PAGE y SDS-PAGE
  • 9. ULTRAFILTRACIÓN •Método de concentración y purificación enzimática •Ultrafiltración tangencial o flujo cruzado. Sistema Minitan (Millipore) •4 Membranas de polisulfonato, 10.000 NMW •Muestras concentradas 2 y 10 veces
  • 10. LIOFILIZACIÓN •Concentración proteica en forma de polvo seco •Congelación a –20 ºC •Liofilización a –40 ºC, 24 horas. Liofilizador “CRYODOS” (Telstar) •Liofilizado resuspendido en tampón acético-acetato pH 4,2 •Muestra concentrada 20 veces
  • 11. CULTIVO DE A. NIGER •Cepa Aspergillus niger CECT Nº 2088 •Medio de cultivo Czapex-Dox •Concentración de esporas inoculadas 6,62 × 105 esporas/ml •Inductor, pectina de cítrico al 1% •Incubación: •Estática a 30ºC, 72 horas •Estática a 30ºC, 96 horas •Estatica a 30ºC (72 h) + Agitación (24 h)
  • 12. ZIMOGRAMA Método de detección enzimática en geles de poliacrilamida basado en el revelado de los geles en función de la actividad enzimática de las enzimas a separar Revelado de PG con rojo rutenio Tipos: •Sustrato incorporado en el gel de separación •Técnica cup-plate •Contacto enzima-sustrato después de la separación electroforética: •Inmersión del gel en una solución de sustrato •Transferencia a geles con sustrato incorporado
  • 13. NATIVE-PAGE •Geles planos al 10 % de poliacrilamida. Método de Davis •El TEMED actúa sobre el PSA formando radicales libres que inician la polimerización de los monómeros de acrilamida •Las cadenas de poliacrilamida se unen mediante la bisacrilamida •Zimogramas: •gel con ácido poligalacturónico •gel sin ácido poligalacturónico
  • 14. SDS - PAGE •Técnica descrita por Laemli: sistema de tampón discontinuo Ornstein-Davis •Agentes desnaturalizantes: •SDS los polipéptidos se rodean de cargas – y migran en el gel en función del tamaño •Ditiotreitol ruptura de puentes disulfuro •Zimograma •Los geles incorporan ácido poligalacturónico al 0,1% •Renaturalización de PG con Tritón X-100
  • 15. ACTIVIDAD PG EN FUNCIÓN DE LAS CONDICIONES DE CRECIMIENTO DE A. NIGER 1600 1400 1200 (ug ácido galacturónico/ml h) 1000 Actividad enzimática 800 600 400 200 0 72 h estático 96 horas estático 72 h estático+24 h agitación
  • 16. ESTABILIDAD DE PG FRENTE A LA ULTRAFILTRACIÓN Actividad Concentración Actividad Proteínas Muestras Actividad totale Rendimiento enzimáticaa proteínasb específicac totalesd Extracto. crudo 1308,346 991 1404,365 495,5 654173,278 100% Ultrafiltrado * 2 2242,88 1108 2024,26 306,916 621277,76 94,97% Ultrafiltrado. *10 929,588 3714 250,293 186 46479,4 7,11% a µg ácido galacturónico ml-1 h-1 b ppm c Unidades mg-1 de proteína d mg e Unidades
  • 17. Actividad total del extracto crudo y de las Concentración de proteína para el muestras concentradas por ultrafiltración extracto crudo y las muestras concentradas por ultrafiltración 700000 600000 4000 3500 500000 3000 400000 Proteínas (ppm) Actividad total (U) 2500 300000 2000 200000 1500 1000 100000 500 0 Extracto crudo Ultrafiltrado * 2 Ultrafiltrado *10 0 Extracto crudo Ultrafiltrado * 2 Ultrafiltrado *10
  • 18. ESTABILIDAD PG FRENTE A LA LIOFILIZACIÓN Actividad Concentración Actividad Proeínas Muestras Actividad total Rendimiento enzimáticaa proteínasb específicac totalesd Extracto crudo 1308,346 991 1404,365 495,5 654173,278 100% Liofilizado *20 2931,17 15315 191,034 382,875 73279,25 11,20% a µg ácido galacturónico ml-1 h-1 b ppm c Unidades mg-1 de proteína d mg e Unidades
  • 19. Actividad total del extracto crudo y de la Valores de concentración de proteína para muestra concentrada por liofilización. el extracto crudo y la muestra concentrada por liofilización. 700000 18000 600000 16000 14000 500000 12000 Proteínas (ppm) 400000 10000 Actividad total (U) 8000 300000 6000 200000 4000 100000 2000 0 0 Extracto crudo Liofilizado *20 Extracto crudo Liofilizado *20
  • 20. IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA NATIVE-PAGE Con ácido Sin ácido poligalacturónico poligalacturónico
  • 21. IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA SDS-PAGE CON ÁCIDO POLIGALACTURÓNICO
  • 22. PROTOCOLO OPTIMIZADO DE IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA NATIVE-PAGE CON ÁCIDO POLIGALACTURÓNICO •Solución de ácido málico 0,1M: 1 hora en agitación. Crea un cambio gradual de pH •Solución de incubación acetato de Na 20 mM pH 5,5: 40´en agitación •Agua destilada: 5´ •Rojo de rutenio 0,03% en agua: 1 h en agitación
  • 23. PROTOCOLO OPTIMIZADO DE IDENTIFICACIÓN DE PG EN GELES DE PAA SDS-PAGE CON ÁCIDO POLIGALACTURÓNICO •Solución de Triton X-100 al 2,5% en tampón acetato de Na 20 mM pH 5,5: 2 horas. Renaturalización enzimática •Solución de ácido málico 0,1M: 1 h en agitación •Solución de incubación acetato de Na 20 mM pH 5,5: toda la noche •Agua destilada: 5´ •Rojo de rutenio 0,03% en agua: 1 h en agitación
  • 24. CONCLUSIONES •La agitación del medio de crecimiento de A. niger mantiene los niveles de producción de PG •La ultrafiltración es una técnica adecuada para concentrar el extracto crudo al 50% sin que se observe una disminución de la actividad de PG. La concentración al 10% del volumen original resultó en una pérdida de actividad enzimática del 92,9%
  • 25. CONCLUSIONES •La incubación de los geles de poliacrilamida, tanto en condiciones nativas como desnaturalizantes con SDS, con ácido málico, es necesaria para la resolución de las bandas indicativas de actividad PG. •El detergente Tritón X-100 provoca una renaturalización incompleta de la poligalacturonasa.