Conférence organisée par l'Institut de l’Elevage et présidée par Didier Boichard, Inra - Rédacteur en chef de Genetics Selection Evolution

1. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
LES ANOMALIES GÉNÉTIQUES : LES DÉTECTER, LES
COMPRENDRE, LES ÉRADIQUER

2. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Introduction
Impact de la sélection génomique sur la diffusion des taureaux d'IA
Testage sur descendance Sélection génomique
Utilisation massive de quelques
taureaux d’élites
Diffusion plus large de taureaux
d’IA
Diffusion progrès génétique + ++
Variabilité génétique - +
Détection d’anomalies génétiques - Si problème déclaré lors de la
période de testage, possibilité
d’éliminer le taureau
- Si problème déclaré après la
période de testage, contribution et
propagation de l’anomalie élevées
- Si problème déclaré, diffusion
stoppée tardivement (carrière
courte mais nombre de
descendants plus ou moins limité)
 La prise en compte de la gestion des anomalies génétiques devient de plus
en plus stratégique dans la conduite des dispositifs de création génétique

3. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
Comment s’organise le dispositif de création
Evolution pour limiter/maîtriser l’émergence d’
anomalies génétiques?
 Les outils développés au travers de la sélection
génomique permettent d'orienter les dispositifs de
création

4. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Dispositif de création Evolution (race Holstein)
3200 femelles génotypées + 25 000 femelles Grand Compte
720 femelles collectées => 1500 TE et 600 OPU
PRODUCTION DE 8 500 EMBRYONS
8 500 poses d’embryons
3000 mâles génotypés 15 000 IA
220 mâles station
100 diffusés + 50 export sur pied
300 embryons
achat extérieur

5. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité
• Stratégie MAT
 Objectif: 25 embryons/donneuse (3-4 TE + OPU/FIV)
 En moyenne, 8 PAT différents/donneuse
• Stratégie PAT
Juin 2013 –
Juin 2014
Nbre de PAT
utilisés
Nbre d’accouplements
programme
% utilisation maximum
HO 172 1 500 TE – 15 000 IA 80 embryons/PAT ou 20 TE/PAT
PR 23 55 TE – 400 IA 20 embryons/PAT ou 4-5 TE/PAT
NO 68 300 TE – 7 000 IA 25 embryons/PAT ou 5-6 TE/PAT
Valorisation des données mutations disponibles sur des anomalies clairement
identifiées (BLAD, CVM, Brachyspina) et haplotypiques (fertilité)

6. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité
• Gestion des accouplements programme
 Mise en place d’un outil d’accouplements pour les techniciens génétiques
 Remontée des généalogies et prise en compte de toutes les informations disponibles
 calcul de la parenté du produit à naître
 Valorisation des données haplotypiques disponibles (fertilité)
• Voyant vert, l’accouplement ne
présente aucun risque.
• Voyant rouge, l’accouplement
présente un risque.

7. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 En termes de gestion de la variabilité, Evolution vise une:
• Utilisation croissante et homogène d’un grand nombre de taureaux génomiques
comme PAT, de haut niveau génétique
• Rotation rapide de ces PAT génomiques
• Diversification des origines paternelles des jeunes PAT
• Restriction de l’utilisation individuelle intensive PAT
• Recrutement des futurs reproducteurs: sélection restrictive sur la voie paternelle
(6-7 fils /PAT maxi)
 Fin du Star Système
 Meilleure gestion de la variabilité génétique!

8. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Maîtrise de l'accroissement de la consanguinité
• Stratégie de diffusion
 Cadre réglementaire: pas de diffusion de mâles porteurs de tares génétiques
 De plus en plus de jeunes taureaux diffusés avec une production de semences plus
faibles  limite la diffusion à grande échelle de nouvelles tares génétiques
• Nouvelle solution biotechnologique: génotypage de l’embryon
 Voie femelle
- Entrée de femelles de haut niveau génétique mais porteuses de tares génétiques en station
de donneuses
- Tri des embryons  conservation des embryons « non porteurs »
 Voie mâle
- Stratégie envisageable, à usage exclusif PAT, pour éviter de se priver de haute valeur
génétique, variable mais porteur de tare

9. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Gestion de l'émergence de nouvelles anomalies
• Echanges avec l'ONAB
 Alertes sur des cas de remontées fiches terrain / statistiques nationales
 Vigilance accrue sur les naissances attendues
 Analyse des données disponibles sur la zone
• Mise en place d’outils de reporting sur les IA et déclaration de
naissance éleveurs de la zone Evolution
 Alerte sur des taux de mortalité supérieurs à la moyenne (dans les jours, mois
suivants la naissance,…)
 Alerte sur des poids de naissance supérieurs à la moyenne
 Difficultés de naissance/vêlage
 …

10. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Sensibilisation du réseau ''terrain"
• Surveillance des cas répertoriés par l’observatoire
 Communication auprès des réseaux inséminateurs, techniciens génétiques (supports
en cours d’élaboration)
 Mise en place de procédures spécifiques en fonction du cas (collecte de phénotypes,
matériel biologique, vigilance,…)
• Remontée de nouveaux cas vers l’ONAB

11. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
 Conclusion
• Gestion de la variabilité génétique / consanguinité permet de
limiter les risques d'apparition et/ou propagation de nouvelles
anomalies
• L’incidence économique varie d’une anomalie à l’autre
 Anomalies (BLAD, CVM): impact économique fort
 Haplotypes de fertilité: impact économique plus limité
• Recherche du bon équilibre entre progrès génétique et variabilité
génétique
• Clé de la réussite: meilleure maîtrise des accouplements!

12. Les conférences
de l’Institut de l’Elevage
Présentation disponible en
téléchargement sur www.idele.fr
Retrouvez aussi l’Institut de l’Elevage sur le stand A6 - hall 4