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KNIME
KONSTANZ INFORMATION
MINER
UNIVERSIDAD POLITECNICA
DE TLAXCALA
DULCE KARINA JIMENEZ
VASQUEZ
INTRODUCCIÓN
Knime es una herramienta que es totalmente gratuita para el desarrollo y
ejecución de técnicas de minería de datos. Knime fue desarrollado
originalmente en el departamento de bioinformática y minería de datos de
la Universidad de Constanza, Alemania. Esta herramienta esta escrita en
Java y su entorno grafico esta desarrollada en Eclipse.
Esta herramienta es un proyecto open source, y esta liberado bajo la
licencia Aladdin Free Public License.
Su uso se basa en el diseño de un flujo de ejecución que plasme las
distintas etapas de un proyecto de minería de datos.
KNIME
Knime es una plataforma modular de exploración de
datos, que permite al usuario crear flujos de datos,
además, permite ejecutar de forma selectiva algunos
de los pasos creados, así como ejecutar todo el flujo
desarrollado. Tras la ejecución, los resultados se
pueden investigar mediante vistas interactivas tanto
de los datos como de los modelos.
REQUERIMIENTOS PARA INSTALAR
*Descargue la versión de Knime adecuada para su sistema operativo
(Windows o Linux, 32 o 64 bits): http://knime.org/download
ESTA HERRAMIENTA TIENE UN
PROCESO DE ANÁLISIS DE
DATOS.
Donde consiste de nodos, conectados a través
de puentes que transportan datos o modelos.
Cada uno procesa la llegada de datos o
modelos donde cada uno de los nodos produce
resultados como salida.
PARTES DE LA
HERRAMIENTA
KMINE
PARTES DE
LA
HERRAMIE
NTA
KNIME
Explorador de
proyectos
Consola de eventos
Visor Macro de
modelos
Ventana editor de
Windows Descripción de los nodos
Repositorio de
Nodos
CONSOLA
En este apartado se muestra los mensajes de warning y error donde
esos mensajes, donde se almacenan en un archivo, que lleva por
nombre knime.log, que se encuentra ubicado en la carpeta .metadata
del proyecto.
DESCRIPCIÓN DE NODOS
*En este apartado de podrá visualizar
toda la información referte a nuestros
nodos seleccionados.
*Si seleccionamos una categoría donde
incluya varios nodos, del apartado de
Repositorio de nodos entonces mostrara
los nodos que forman parte de esa
categoría.
EXPLORADOR DE PROYECTOS
En este apartado se muestra todo los proyectos existentes en el
explorador, al igual permite crear nuevos proyectos, importar
proyectos existentes o exportar nuestro proyecto, etc.
CREAR UN NUEVO PROYECTO
Para poder crear un nuevo proyecto damos
click en el apartado Workflow Proyect Navigator,
después elegimos New KNIME workflow , una
vez hecho lo anterior sale una ventana donde
ponemos el nombre de nuestro nuevo proyecto,
y le damos finalizar y aparecerá una ventana
nueva.
COMO CONSTRUIR UN FLUJO
*Para poder construir un flujo se tiene que arrastrar nodos del
apartado de Repositorios de nodos al apartado de Ventana editor de
Windows y conectándolos entre ellos.
*Una vez que su estado de los nodos este de color verde ya esta listo
para ejecutarlo y de esta manera transportan los datos o modelos
entre los nodos a través de los puertos de entrada y salida.
* Una vez que ya estén colocados los nodos en la Ventana editor de
Windows, tenemos que conectar la entrada de cada nodo con la salida
del nodo predecesor para transportar los datos o modelos.
QUE CONTIENE UN NODO
Los nodos son
básicamente
unidades de
procesamiento de
un workflow
NODO COLOR MANAGER
* Este nodo se utiliza para colorear
los resultados, para que nos ayude a
diferenciar los datos generados a
partir de los datos de entrada.
*Una vez que arrastremos el nodo a
la Ventana editora de Windows para
que este con el flujo todos los datos
de entrada se codifican a un color
especifico, donde este color es
determinado por el nodo color
manager.
CONFIGURACIÓN DE NODOS
*Una vez que arrastramos los nodos a la Ventana de
editor de Windows y estén conectados todos los
nodos, puede que algunos nodos su estado este de
color rojo y estos tienen que ser configurados bando
click derecho sobre este y darle a la opción configurar
y luego aplicar, hasta que todo el flujo quede
totalmente en un estado ejecutado.
ALGUNAS
EMPRESAS
QUE
UTILIZAN
LA
HERRAMIE
NTA KNIME
EMPRESAS QUE UTILIZAN LA
HARRAMIENTA DE KNIME EN DONDE UTILIZAN LA HERREMIENTA KNIME
Schrödinger
Knime complementa capacidades existentes, proporcionando la
industria de ciencias biológicas con acceso a muchas herramientas
cheminformatics importantes, incluidas las herramientas que se utilizan
para visualizar y transformar las estructuras moleculares, calcular
propiedades moleculares, y la búsqueda de grupos funcionales; también
proporciona opciones de soporte para la plataforma en sí Knime.
Infocom Corparation
Ofrece una amplia gama de servicios y soluciones para el mercado de
ciencias. La cual utiliza minería de datos, análisis estadístico, y el
análisis del genoma. Para ello el uso con la plataforma de flujo de
trabajo de código abierto Knime. En febrero de 2008 faculta a los
investigadores trabajar con datos de la estructura química utilizando
herramientas de software de ChemAxon y la plataforma Knime
.
Tripos chemistry extensions
Tripos introduce inteligencia química a la plataforma Knime,
proporcionando a los investigadores con la manipulación química
estructura, visualización y otras características de análisis importantes.
Como complemento de las capacidades Knime existentes facilita el
acceso a muchos quimioinformática importantes y herramientas de
modelado, el paquete Tripos Extensiones Química permite a los usuarios
Knime a leer, escribir y las estructuras químicas de proceso, para
realizar tareas básicas y avanzadas como computar propiedades
moleculares y la búsqueda de grupos funcionales, y para visualizar,
transformar e interpretar las estructuras moleculares.
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EMPRESAS
QUE
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El software Symyx, utiliza herramientas como Knime y servicios de
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Symyx Chemistry Extensions Knime mejora el código abierto. Permite a las organizaciones de I + D
para ofrecer a bajo costo, extensiones y servicios químicos ágiles apoyo
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Knime

  • 1. KNIME KONSTANZ INFORMATION MINER UNIVERSIDAD POLITECNICA DE TLAXCALA DULCE KARINA JIMENEZ VASQUEZ
  • 2. INTRODUCCIÓN Knime es una herramienta que es totalmente gratuita para el desarrollo y ejecución de técnicas de minería de datos. Knime fue desarrollado originalmente en el departamento de bioinformática y minería de datos de la Universidad de Constanza, Alemania. Esta herramienta esta escrita en Java y su entorno grafico esta desarrollada en Eclipse. Esta herramienta es un proyecto open source, y esta liberado bajo la licencia Aladdin Free Public License. Su uso se basa en el diseño de un flujo de ejecución que plasme las distintas etapas de un proyecto de minería de datos.
  • 3. KNIME Knime es una plataforma modular de exploración de datos, que permite al usuario crear flujos de datos, además, permite ejecutar de forma selectiva algunos de los pasos creados, así como ejecutar todo el flujo desarrollado. Tras la ejecución, los resultados se pueden investigar mediante vistas interactivas tanto de los datos como de los modelos.
  • 4. REQUERIMIENTOS PARA INSTALAR *Descargue la versión de Knime adecuada para su sistema operativo (Windows o Linux, 32 o 64 bits): http://knime.org/download
  • 5. ESTA HERRAMIENTA TIENE UN PROCESO DE ANÁLISIS DE DATOS. Donde consiste de nodos, conectados a través de puentes que transportan datos o modelos. Cada uno procesa la llegada de datos o modelos donde cada uno de los nodos produce resultados como salida.
  • 7. PARTES DE LA HERRAMIE NTA KNIME Explorador de proyectos Consola de eventos Visor Macro de modelos Ventana editor de Windows Descripción de los nodos Repositorio de Nodos
  • 8. CONSOLA En este apartado se muestra los mensajes de warning y error donde esos mensajes, donde se almacenan en un archivo, que lleva por nombre knime.log, que se encuentra ubicado en la carpeta .metadata del proyecto.
  • 9. DESCRIPCIÓN DE NODOS *En este apartado de podrá visualizar toda la información referte a nuestros nodos seleccionados. *Si seleccionamos una categoría donde incluya varios nodos, del apartado de Repositorio de nodos entonces mostrara los nodos que forman parte de esa categoría.
  • 10. EXPLORADOR DE PROYECTOS En este apartado se muestra todo los proyectos existentes en el explorador, al igual permite crear nuevos proyectos, importar proyectos existentes o exportar nuestro proyecto, etc.
  • 11. CREAR UN NUEVO PROYECTO Para poder crear un nuevo proyecto damos click en el apartado Workflow Proyect Navigator, después elegimos New KNIME workflow , una vez hecho lo anterior sale una ventana donde ponemos el nombre de nuestro nuevo proyecto, y le damos finalizar y aparecerá una ventana nueva.
  • 12. COMO CONSTRUIR UN FLUJO *Para poder construir un flujo se tiene que arrastrar nodos del apartado de Repositorios de nodos al apartado de Ventana editor de Windows y conectándolos entre ellos. *Una vez que su estado de los nodos este de color verde ya esta listo para ejecutarlo y de esta manera transportan los datos o modelos entre los nodos a través de los puertos de entrada y salida. * Una vez que ya estén colocados los nodos en la Ventana editor de Windows, tenemos que conectar la entrada de cada nodo con la salida del nodo predecesor para transportar los datos o modelos.
  • 13. QUE CONTIENE UN NODO Los nodos son básicamente unidades de procesamiento de un workflow
  • 14. NODO COLOR MANAGER * Este nodo se utiliza para colorear los resultados, para que nos ayude a diferenciar los datos generados a partir de los datos de entrada. *Una vez que arrastremos el nodo a la Ventana editora de Windows para que este con el flujo todos los datos de entrada se codifican a un color especifico, donde este color es determinado por el nodo color manager.
  • 15. CONFIGURACIÓN DE NODOS *Una vez que arrastramos los nodos a la Ventana de editor de Windows y estén conectados todos los nodos, puede que algunos nodos su estado este de color rojo y estos tienen que ser configurados bando click derecho sobre este y darle a la opción configurar y luego aplicar, hasta que todo el flujo quede totalmente en un estado ejecutado.
  • 16. ALGUNAS EMPRESAS QUE UTILIZAN LA HERRAMIE NTA KNIME EMPRESAS QUE UTILIZAN LA HARRAMIENTA DE KNIME EN DONDE UTILIZAN LA HERREMIENTA KNIME Schrödinger Knime complementa capacidades existentes, proporcionando la industria de ciencias biológicas con acceso a muchas herramientas cheminformatics importantes, incluidas las herramientas que se utilizan para visualizar y transformar las estructuras moleculares, calcular propiedades moleculares, y la búsqueda de grupos funcionales; también proporciona opciones de soporte para la plataforma en sí Knime. Infocom Corparation Ofrece una amplia gama de servicios y soluciones para el mercado de ciencias. La cual utiliza minería de datos, análisis estadístico, y el análisis del genoma. Para ello el uso con la plataforma de flujo de trabajo de código abierto Knime. En febrero de 2008 faculta a los investigadores trabajar con datos de la estructura química utilizando herramientas de software de ChemAxon y la plataforma Knime . Tripos chemistry extensions Tripos introduce inteligencia química a la plataforma Knime, proporcionando a los investigadores con la manipulación química estructura, visualización y otras características de análisis importantes. Como complemento de las capacidades Knime existentes facilita el acceso a muchos quimioinformática importantes y herramientas de modelado, el paquete Tripos Extensiones Química permite a los usuarios Knime a leer, escribir y las estructuras químicas de proceso, para realizar tareas básicas y avanzadas como computar propiedades moleculares y la búsqueda de grupos funcionales, y para visualizar, transformar e interpretar las estructuras moleculares.
  • 17. ALGUNAS EMPRESAS QUE UTILIZAN LA HERRAMIEN TA KNIME EMPRESAS QUE UTILIZAN LA HARRAMIENTA DE KNIME EN DONDE UTILIZAN LA HERREMIENTA KNIME Symyx Technologies, Inc El software Symyx, utiliza herramientas como Knime y servicios de investigación que permiten a los científicos a diseñar, ejecutar, analizar y reportar los resultados experimentales más rápido, más fácil y menos costoso. Symyx Chemistry Extensions Knime mejora el código abierto. Permite a las organizaciones de I + D para ofrecer a bajo costo, extensiones y servicios químicos ágiles apoyo flujos de trabajo científico. Wega Informatik AG Es una empresa de servicios de TI donde sus principales áreas de negocio son consultoría y desarrollo de software a medida específica para las empresas internacionales, principalmente los departamentos de ciencias biológicas donde ofrece mantenimiento y soporte para productos Knime así como el desarrollo personalizado basado en Knime.