Comunicación y uso de la literatura científica en biomedicina
1. Comunicación y uso de la literatura científica en biomedicina II Seminario EC3 sobre evaluación y comunicación de la ciencia Alberto Labarga [email_address] http://ec3.ugr.es/seminario2009/
2. La generación de información es un aspecto clave de la investigación biomédica
3.
4. No sólo es importante la cantidad sino la complejidad de las interacciones
5. Applied Biosystems ABI 3730XL Illumina / Solexa Genetic Analyzer Applied Biosystems SOLiD Roche / 454 Genome Sequencer 1 Mb/day 100 Mb/run 3000 Mb/run La tecnología ha aumentado recientemente esta capacidad de generación de datos
6. Lo que se traduce en un incremento en la producción científica PubMed statistics http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez >17 million citations >400,000 added/year ~70 million searches/month PubMedCentral statistics http://www.pubmedcentral.nih.gov > 500 journals >2 million full text papers ~20 million retrievals/month
11. A contest created to improve the way scientific information is communicated and used . The contest invites members of the scientific community to describe and prototype a tool to improve the interpretation and identification of meaning in (online) journals and text databases relating to the life sciences.
12. hay tres formas básicas de explicitar el conocimiento almacenado en las publicaciones científicas
47. For a given annotation you can define links and ways to retrieve information. Links will be shown in the tag popup so you can visit the site Retrieval links will be used to download information in a given format, for example, all protein sequences mentioned in the text. Links uniprot: http://www.uniprot.org/uniprot/$ID$ genecards: http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id=$ID$ Add new Retrieve uniprot: http://www.uniprot.org/uniprot/$ID$.txt uniprotXML : http://www.uniprot.org/uniprot/$ID$.xml fasta: http://www.uniprot.org/uniprot/$ID$.fasta Add new fasta Download ALP Antileukoproteinase Secretory leukocyte protease inhibitor WAP4 HUSI-1 BLPI