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Tema 12
El cromosoma eucariótico




                           1
El cromosoma eucariótico
 Haga clic para modificar el estilo
Relación existente entre el DNA, las histonas y la
cromatina de título del patrón
• Haga empaquetamiento del el estilo de texto
Niveles declic para modificar DNA en los cromosomas
   del patrón
Diferencias entre eucromatina y heterocromatina
   – Segundo nivel
Bandeos Tercer nivel
      • cromosómicos y su relación con la
compactación del DNA
         –  Cuarto nivel
              » Quinto nivel
Función y estructura de centrómeros y telómeros

El paisaje genómico: la complejidad de las secuencias del
DNA eucariótico

                                                       2
La célula eucariota
    Haga clic para modificar el estilo
En un principio, el material genético se identifico como una masa densa y
                    de título del patrón
granular denominada cromatina: reacción con ciertas tinciones – Material
oscuro, coloreado.
   • Haga clic para modificar el estilo de texto
     del patrón
       – Segundo nivel
           • Tercer nivel
               – Cuarto nivel
                  » Quinto nivel




                                                                     3
La célula eucariota
  Haga clic para modificar el estilo
Durante la división celular la cromatina se compacta en unidades
        de título del patrón
discretas, los cromosomas.

El ciclo celular consta, básicamente, de dos fases:
 • Haga clic para modificar el estilo de texto
       Interfase                  Mitosis
   del patrón
      – Segundo nivel
          • Tercer nivel
               – Cuarto nivel
   Actividad celular » Quinto nivel
                     sintética
               y                               Huso acromático
        núcleo discreto               Cada célula hija posee dos copias de
                                               cada cromosoma
                                                  (homólogos)


                                                                        4
Empaquetamiento del DNA
 Hagacaracterísticas comunes de la organización del material
Una de las
            clic para modificar el estilo
               de título del patrón
genético es su alto grado de compactación: masa compacta que
ocupa un espacio bien delimitado.
• Haga clic para modificar el estilo de texto
El genoma humano tiene unas 3.000 megabases (1-2m) y un
    del patrón
núcleo ocupa unas 6µm.
   – Segundo nivel
       • Tercer nivel
           – Cuarto nivel
              » Quinto nivel




                                                           5
Empaquetamiento del DNA
       Haga clic para modificar el estilo
    Doble hélice
                 de título del patrón
    Nucleosoma (Octámero de Histonas)
        • Haga clic para modificar el estilo de texto
           del patrón
    Solenoide (Histona H1)

              – Segundo nivel
                    • Tercer nivel
                      – Cuarto nivel
            Composición del Cromosoma
                  (Cromatina)
                                  » Quinto nivel
   Proteínas : básicas -> histonas
                     ácidas -> no histonas (~30%)
   DNA
   RNA (1%)
Tasa de empaquetamiento: 1:50.000-100.000                 6
Empaquetamiento del DNA
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                                                7
Empaquetamiento del DNA
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                                                8
Empaquetamiento del DNA
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                            Existe una matriz proteica que forma el
                            esqueleto del cromosoma.
                                                               9
Empaquetamiento del DNA
 Haga clic para modificar el estilo
Las fibras de DNA se unen al esqueleto en sitios específicos
  denominados MARs (o SARs) del patrón
               de título
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
    – Segundo nivel
       • Tercer nivel
           – Cuarto nivel
              » Quinto nivel




                                                           10
El cariotipo humano y de ratón
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel


                            Bandas cromosómicas (Bandas G)

                            Los genes tienden a localizarse en las
                            regiones entre bandas (>%G-C)
                                                                11
Centrómero y telómero
   Haga clic para modificar el estilo
Centrómero           Telómero
           de título del patrón
Elemento de DNA responsable de la
segregación en mitosis y meiosis (no
                                       Elemento de DNA que sella los extremos de los
                                       cromosomas y les confiere estabilidad.
distingue entre cromosomas).
    • Haga clic para modificar el estilo de texto
                                       Integridad estructural
Está compuesto de proteínas de unión a Asegura la replicación de los extremos del
        del patrón
los microtúbulos y puede poseer gran
cantidad de DNA repetitivo
                                       cromosoma

         – Segundo nivel                    Papel en el apareamiento cromosómico y
                                            la arquitectura tridimensional del núcleo
              • Tercer nivel                Envejecimiento celular y cáncer
                   – Cuarto nivel
                      » Quinto nivel




                                                                               12
El Telómero
Haga clic para modificar el estilo
      de título delextremos cromosómicos
                      patrón
                   El problema de la replicación de los


• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
         – Cuarto nivel
            » Quinto nivel




                                                   13
El Telómero
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                                                14
El Telómero
Haga clic para modificar el estilo
      de Estructura deldel telomérico
          título tapón patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                                                15
El Telómero
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel


                      Síndrome de Werner


                                                                   16
           Mutación en el gen WRN, que codifica una helicasa que
13 / 11 / 2008
                                                    Los números del genoma humano
      Haga clic genes estimado 20.000-25.000
          Total de para modificar el estilo

              de título del patrón
Genes identificados                                             19073

     • Haga clic para modificar el estilo de texto
                                                                                                 Genes mitocondriales        37
        Genes secuencia conocida                                     12527
        Descripción fenotípica                                         374

       del patrón
        Otros                                                           6172



                                          – Segundo nivel localización física
                                                 Genes con                                               11419

                                             • Tercer nivel
                                             1097
                                                  717

                                                         617
                                                   – Cuarto 429 532 683
                                                            nivel
        Genes localizados por cromosoma




                                                                                     508
                                                                                           406    427     413   717   601
                                                      » Quinto nivel


                                                                                                                641
                                             206   356   328
                                                               443     664     160   727   277     139    286           45


                                                                                                                                  17
Características de los genes humanos que codifican proteínas.

 Haga clic paraMediana Promedio elTamaño muestra
Característica
                        modificar estilo
               de título del patrón
Tamaño exones               122 bp       145 bp         43.317
• Haga clic para modificar el estilo de texto
Número exones        7         8.8        3.501
  del patrón
Tamaño intrones            1.023 bp     3.365 bp        27.238
    – Segundo nivel
3’ UTR                      400 bp       770 bp     689 (crom. 22)
         • Tercer nivel
5’ UTR      – Cuarto nivel    240         300       463 (crom. 22)
               » Quinto nivel
Secuencia codificadora     1.100 bp     1.340 bp        1.804

(CDS)                       367 aa       447 aa

Extensión genómica           14 kb        27 kb         1.804

                                                                  18
Los genes humanos varían enormemente
           en tamaño y cantidad de exones
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
     • Tercer nivel
        – Cuarto nivel
           » Quinto nivel




                                                19
La densidad de genes no es homogénea
Haga clic para modificar el estilo
      de título del patrón
  Región del HLA de tipo III en el cromosoma 6p21.3



• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
  – Segundo nivel
        • Tercer nivel
               – Cuarto nivel
  Gen de la distrofina en el cromosoma Xp21
                  » Quinto nivel




                                                      20
La densidad génica se correlaciona con el bandeo cromosómico

      Haga clic para modificar el estilo
            de título del patrón
                                                                                     Xp21
     • Haga clic para modificar el estilo de texto
                                     6p21.3


       del patrón
         – Segundo nivel
              • Tercer nivel BANDAS                 G
                   – Cuarto
                   Claras nivel               oscuras
                      » en GC
Comparativamente ricas Quinto nivel          Comparativamente ricas en AT
Sensibles a la DNAsa                         Insensibles a la DNAsa
Condensación tardía en el ciclo celular      Condensación temprana en el ciclo celular
Replicación temprana                         Replicación tardía
Alta densidad génica                         Baja densidad génica
Pobres en secuencias repetidas               Ricas en secuencias repetidas
                                                                                21
Aunque es raro, existen genes solapados y anidados
Haga clic para modificar el estilo
 A) Región del HLA de tipo III en el cromosoma 6p21.3


      de título del patrón
• Haga clic para modificar el estilo de texto
  del patrón
     – Segundo nivel
  B) Intrón 26 del gen de la neurofibromatosis tipo 1
            • Tercer nivel
                   – Cuarto nivel
                      » Quinto nivel




                                                        22
El tamaño de los genomas
    Haga buena correlaciónmodificar el estilo
No existe una
              clic para entre
                de título del patrón
el tamaño del genoma y complejidad
genética
   • Haga clic para modificar el estilo de texto
Existe una tamaño mínimo del genoma
     del patrón
necesario    para   incrementar   la
complejidad
      – Segundo nivel
          • Tercer nivel
              – Cuarto nivel
                 » Quinto nivel

                                  Se detecta una gran variación en el
                                  tamaño del genoma dentro de un
                                  mismo phylum

                                                                23
Secuencias de DNA repetitivas
  Haga clic para modificar el estilo
              de título del patrón
Generalmente, los genes son
codificados por secuencias únicas
  • Haga clic para modificar el estilo de texto
de DNA
    del patrón
Los genomas más grandes dentro
de un – Segundo nivel
      mismo phylum no contienen
necesariamente más genes
         • Tercer nivel
              – Cuarto nivel
Una gran parte del ADN repetitivo
                 » los elementos
puede proceder de Quinto nivel
transponibles




                                                  24
Contenido en repeticiones del genoma humano
Haga clic para modificar el estilo
    Derivados de elementos transponibles
 


 
      de título del patrón
     Pseudogenes procesados
     Repeticiones de secuencias sencillas

• Duplicaciones segmentales 10-300 kb
 
   Haga clic para modificar el estilo de texto
  Bloques de secuencias repetidas en tándem (centrómeros, telómeros,...)
   del patrón
 



                              Derivados de trasposones
       – Segundo nivel
            • Tercer nivel
                 – Cuarto nivel
                    » Quinto nivel




                                                                           25
Contenido en repeticiones del genoma humano
 Haga clic para modificar el estilo
Elementos de títulomelanogaster C. elegans A. thaliana
          H. sapiens D. del patrón

• Haga clic para modificar el estilo de texto
LINE/SINE   33.40%  0.70%         0.40%       0.50%
   del patrón
   –
  LTRSegundo nivel
           8.10%              1.50%    0.00%      4.80%
         • Tercer nivel
  DNA           2.80%          0.70%   5.30%      5.10%
            – Cuarto nivel
                » Quinto nivel
 Total         44.40%          3.10%   6.50%   10.50%




                                                   26
ORGANIZACION
                                                      GENOMA
 GENERAL DEL

     Haga clic para modificar el estilo
                                                      NUCLEAR
GENOMA HUMANO



           de título del patrón
       GENOMA                 genes y secuencias
                                                                     ADN extragénico
    MITOCONDRIAL                 relacionadas
                                                                         75%
                                      25%



    • Haga clic para modificar el estilo de texto
         Codificante
           2.5%
                                   No codificante
                                      22.5%
                                                                Moderada o altamente
                                                                     Repetido
                                                                                                  Secs. únicas o
                                                                                              bajo número de copias
                                                                       30%                            45%
      del patrón                                                                   Repetidos en tándem
35000 genes               500 RNA                    Repetidos dispersos
          – Segundo nivel
  proteínas              funcionales                        12%
                                                                                       o agrupados
                                                                                           18%


 4 genes rRNA
                  • Tercer nivel                                                                         Satélite
                       – Cuarto nivel
   >40 tRNA
                          » Quinto nivel (SINEs)
                                      Cortos                               Largos (LINEs)
                                                                                                     Minisatélites



  >500 otros                                                                                         Microsatélite
RNA funcionales


      Intrones, secuencias                                      Fragmentos
                                       Pseudogenes
          no traducidas                                           génicos
                                                                                                                27

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Tema12

  • 1. Tema 12 El cromosoma eucariótico 1
  • 2. El cromosoma eucariótico Haga clic para modificar el estilo Relación existente entre el DNA, las histonas y la cromatina de título del patrón • Haga empaquetamiento del el estilo de texto Niveles declic para modificar DNA en los cromosomas del patrón Diferencias entre eucromatina y heterocromatina – Segundo nivel Bandeos Tercer nivel • cromosómicos y su relación con la compactación del DNA – Cuarto nivel » Quinto nivel Función y estructura de centrómeros y telómeros El paisaje genómico: la complejidad de las secuencias del DNA eucariótico 2
  • 3. La célula eucariota Haga clic para modificar el estilo En un principio, el material genético se identifico como una masa densa y de título del patrón granular denominada cromatina: reacción con ciertas tinciones – Material oscuro, coloreado. • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 3
  • 4. La célula eucariota Haga clic para modificar el estilo Durante la división celular la cromatina se compacta en unidades de título del patrón discretas, los cromosomas. El ciclo celular consta, básicamente, de dos fases: • Haga clic para modificar el estilo de texto Interfase Mitosis del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel Actividad celular » Quinto nivel sintética y Huso acromático núcleo discreto Cada célula hija posee dos copias de cada cromosoma (homólogos) 4
  • 5. Empaquetamiento del DNA Hagacaracterísticas comunes de la organización del material Una de las clic para modificar el estilo de título del patrón genético es su alto grado de compactación: masa compacta que ocupa un espacio bien delimitado. • Haga clic para modificar el estilo de texto El genoma humano tiene unas 3.000 megabases (1-2m) y un del patrón núcleo ocupa unas 6µm. – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 5
  • 6. Empaquetamiento del DNA Haga clic para modificar el estilo Doble hélice de título del patrón Nucleosoma (Octámero de Histonas) • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón Solenoide (Histona H1) – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel Composición del Cromosoma (Cromatina) » Quinto nivel  Proteínas : básicas -> histonas ácidas -> no histonas (~30%)  DNA  RNA (1%) Tasa de empaquetamiento: 1:50.000-100.000 6
  • 7. Empaquetamiento del DNA Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 7
  • 8. Empaquetamiento del DNA Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 8
  • 9. Empaquetamiento del DNA Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel Existe una matriz proteica que forma el esqueleto del cromosoma. 9
  • 10. Empaquetamiento del DNA Haga clic para modificar el estilo Las fibras de DNA se unen al esqueleto en sitios específicos denominados MARs (o SARs) del patrón de título • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 10
  • 11. El cariotipo humano y de ratón Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel Bandas cromosómicas (Bandas G) Los genes tienden a localizarse en las regiones entre bandas (>%G-C) 11
  • 12. Centrómero y telómero Haga clic para modificar el estilo Centrómero Telómero de título del patrón Elemento de DNA responsable de la segregación en mitosis y meiosis (no Elemento de DNA que sella los extremos de los cromosomas y les confiere estabilidad. distingue entre cromosomas). • Haga clic para modificar el estilo de texto Integridad estructural Está compuesto de proteínas de unión a Asegura la replicación de los extremos del del patrón los microtúbulos y puede poseer gran cantidad de DNA repetitivo cromosoma – Segundo nivel Papel en el apareamiento cromosómico y la arquitectura tridimensional del núcleo • Tercer nivel Envejecimiento celular y cáncer – Cuarto nivel » Quinto nivel 12
  • 13. El Telómero Haga clic para modificar el estilo de título delextremos cromosómicos patrón El problema de la replicación de los • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 13
  • 14. El Telómero Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 14
  • 15. El Telómero Haga clic para modificar el estilo de Estructura deldel telomérico título tapón patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 15
  • 16. El Telómero Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel Síndrome de Werner 16 Mutación en el gen WRN, que codifica una helicasa que
  • 17. 13 / 11 / 2008 Los números del genoma humano Haga clic genes estimado 20.000-25.000 Total de para modificar el estilo de título del patrón Genes identificados 19073 • Haga clic para modificar el estilo de texto Genes mitocondriales 37 Genes secuencia conocida 12527 Descripción fenotípica 374 del patrón Otros 6172 – Segundo nivel localización física Genes con 11419 • Tercer nivel 1097 717 617 – Cuarto 429 532 683 nivel Genes localizados por cromosoma 508 406 427 413 717 601 » Quinto nivel 641 206 356 328 443 664 160 727 277 139 286 45 17
  • 18. Características de los genes humanos que codifican proteínas. Haga clic paraMediana Promedio elTamaño muestra Característica modificar estilo de título del patrón Tamaño exones 122 bp 145 bp 43.317 • Haga clic para modificar el estilo de texto Número exones 7 8.8 3.501 del patrón Tamaño intrones 1.023 bp 3.365 bp 27.238 – Segundo nivel 3’ UTR 400 bp 770 bp 689 (crom. 22) • Tercer nivel 5’ UTR – Cuarto nivel 240 300 463 (crom. 22) » Quinto nivel Secuencia codificadora 1.100 bp 1.340 bp 1.804 (CDS) 367 aa 447 aa Extensión genómica 14 kb 27 kb 1.804 18
  • 19. Los genes humanos varían enormemente en tamaño y cantidad de exones Haga clic para modificar el estilo de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 19
  • 20. La densidad de genes no es homogénea Haga clic para modificar el estilo de título del patrón Región del HLA de tipo III en el cromosoma 6p21.3 • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel Gen de la distrofina en el cromosoma Xp21 » Quinto nivel 20
  • 21. La densidad génica se correlaciona con el bandeo cromosómico Haga clic para modificar el estilo de título del patrón Xp21 • Haga clic para modificar el estilo de texto 6p21.3 del patrón – Segundo nivel • Tercer nivel BANDAS G – Cuarto Claras nivel oscuras » en GC Comparativamente ricas Quinto nivel Comparativamente ricas en AT Sensibles a la DNAsa Insensibles a la DNAsa Condensación tardía en el ciclo celular Condensación temprana en el ciclo celular Replicación temprana Replicación tardía Alta densidad génica Baja densidad génica Pobres en secuencias repetidas Ricas en secuencias repetidas 21
  • 22. Aunque es raro, existen genes solapados y anidados Haga clic para modificar el estilo A) Región del HLA de tipo III en el cromosoma 6p21.3 de título del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto del patrón – Segundo nivel B) Intrón 26 del gen de la neurofibromatosis tipo 1 • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 22
  • 23. El tamaño de los genomas Haga buena correlaciónmodificar el estilo No existe una clic para entre de título del patrón el tamaño del genoma y complejidad genética • Haga clic para modificar el estilo de texto Existe una tamaño mínimo del genoma del patrón necesario para incrementar la complejidad – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel Se detecta una gran variación en el tamaño del genoma dentro de un mismo phylum 23
  • 24. Secuencias de DNA repetitivas Haga clic para modificar el estilo de título del patrón Generalmente, los genes son codificados por secuencias únicas • Haga clic para modificar el estilo de texto de DNA del patrón Los genomas más grandes dentro de un – Segundo nivel mismo phylum no contienen necesariamente más genes • Tercer nivel – Cuarto nivel Una gran parte del ADN repetitivo » los elementos puede proceder de Quinto nivel transponibles 24
  • 25. Contenido en repeticiones del genoma humano Haga clic para modificar el estilo  Derivados de elementos transponibles   de título del patrón Pseudogenes procesados Repeticiones de secuencias sencillas • Duplicaciones segmentales 10-300 kb  Haga clic para modificar el estilo de texto Bloques de secuencias repetidas en tándem (centrómeros, telómeros,...) del patrón  Derivados de trasposones – Segundo nivel • Tercer nivel – Cuarto nivel » Quinto nivel 25
  • 26. Contenido en repeticiones del genoma humano Haga clic para modificar el estilo Elementos de títulomelanogaster C. elegans A. thaliana H. sapiens D. del patrón • Haga clic para modificar el estilo de texto LINE/SINE 33.40% 0.70% 0.40% 0.50% del patrón – LTRSegundo nivel 8.10% 1.50% 0.00% 4.80% • Tercer nivel DNA 2.80% 0.70% 5.30% 5.10% – Cuarto nivel » Quinto nivel Total 44.40% 3.10% 6.50% 10.50% 26
  • 27. ORGANIZACION GENOMA GENERAL DEL Haga clic para modificar el estilo NUCLEAR GENOMA HUMANO de título del patrón GENOMA genes y secuencias ADN extragénico MITOCONDRIAL relacionadas 75% 25% • Haga clic para modificar el estilo de texto Codificante 2.5% No codificante 22.5% Moderada o altamente Repetido Secs. únicas o bajo número de copias 30% 45% del patrón Repetidos en tándem 35000 genes 500 RNA Repetidos dispersos – Segundo nivel proteínas funcionales 12% o agrupados 18% 4 genes rRNA • Tercer nivel Satélite – Cuarto nivel >40 tRNA » Quinto nivel (SINEs) Cortos Largos (LINEs) Minisatélites >500 otros Microsatélite RNA funcionales Intrones, secuencias Fragmentos Pseudogenes no traducidas génicos 27

Notas do Editor

  1. DNA Nucleosoma Fibra cromatina (Solenoide) Andamio (Scaffold) Bucles de cromatina Cromátida
  2. Genes humanos identificados Conceptos clave Se han identificado apenas un tercio del total de genes Se han ubicado precisamente apenas un 15 % La densidad de genes no es homogénea en todos los cromosomas: hay cromosomas pequeños (19) con muchos genes y grandes (4) con poca carga gènica.