El documento describe la simulación de una electroforesis en gel de agarosa usando el software SnapGene. Los datos utilizados provienen de un artículo científico sobre la identificación de bacterias en una zona afectada por un derrame de petróleo. El resumen describe el procedimiento llevado a cabo, incluyendo la obtención de secuencias de ADN del artículo, la simulación de la electroforesis en SnapGene y el análisis de los resultados.

1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL
INFORME:
‘‘SIMULACIÓN MOLECULAR DE ADN USANDO EL SOFTWARE SNAPGENE”
PRESENTADO POR:
Mayra Geraldine Távara Lira- 2019205133
Docente:
Soto Gonzales, Hebert Hernan
CURSO:
Biotecnología
FECHA DE ENTREGA:
7 de Junio del 2023
Biotecnología
Facultad de ingenierías:
Escuela Profesional
De Ingeniería Ambiental

2. RESUMEN
El presente trabajo abarca el procedimiento realizado de la electroforesis en gel de agarosa
a través del software biotecnológico SnapGene, cabe resaltar que los datos a manipular son
del artículo “Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y análisis de
comunidades bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en Condorcanqui –
Amazonas – Perú”.

3. ÍNDICE
RESUMEN............................................................................................................... 2
1 INTRODUCCIÓN ............................................................................................ 1
2 OBJETIVOS...................................................................................................... 2
2.1 GENERAL................................................................................................... 2
2.2 ESPECÍFICOS............................................................................................. 2
3 MARCO TEÓRICO ......................................................................................... 2
3.1 ELECTROFORESIS ................................................................................... 2
3.2 Secuencia ADN ........................................................................................... 3
3.3 GEL DE AGAROSA................................................................................... 3
3.4 SnapGene..................................................................................................... 3
4 MATERIALES Y MÉTODOS ........................................................................ 4
4.1 MATERIALES............................................................................................ 4
4.2 METODOLOGIA........................................................................................ 4
5 CONCLUSIONES............................................................................................. 8
6 BIBLIOGRAFÍA............................................................................................... 9
7 ANEXOS............................................................................................................ 9
ÍNDICE DE FIGURAS

4. 1
1 INTRODUCCIÓN
En la era de la biología molecular y la genética, la capacidad de comprender y manipular el
ADN es fundamental para avanzar en el campo de la investigación científica y la medicina.
La simulación molecular es una herramienta poderosa que nos permite explorar y
comprender los procesos biológicos a nivel molecular de una manera virtual y controlada.
En este informe, nos centraremos en la simulación molecular de ADN utilizando el software
SnapGene.
SnapGene proporciona herramientas que le permiten planificar, visualizar y documentar
todos sus procedimientos de biología molecular. La herramienta de clonación In-Fusion del
programa simula fusiones de genes de sus fragmentos de ADN seleccionados. Mientras
trabaja, SnapGene resalta los sitios de restricción del ADN, marcando automáticamente los
sitios bloqueados por metilación, y le permite elegir o definir conjuntos de enzimas
personalizados.
SnapGene puede importar y exportar una variedad de formatos de archivos de secuenciación
de ADN comunes, como ApE, Gene Construction Kit, GenBank, DNASTAR Lasergene y
MacVector.
La aplicación le permite explorar grandes secuencias de ADN y navegar rápidamente por
los cromosomas con la ayuda de controles inteligentes de búsqueda y zoom. Mientras realiza
todas estas funciones, SnapGene registra automáticamente cada paso de su proyecto de
clonación, cada vez que edita una secuencia o realiza una simulación, el procedimiento se
registra en un historial gráfico.
SnapGene es una aplicación impresionante para manejar los procedimientos de biología
molecular. Proporciona una serie de útiles herramientas de análisis de secuencias de ADN y
soporta una variedad de formatos de archivo comunes. GSL Biotech SnapGene es un gran
recurso de laboratorio que le ayudará en su visualización y análisis de secuencias de ADN.

5. 2
2 OBJETIVOS
2.1 GENERAL
Es poder realizar la electroforesis en Gel de Agarosa con sus análisis de secuencia de ADN
con el software SnapGene con datos de un artículo científico
2.2 ESPECÍFICOS
 Demostrar la secuencia del ADN usando el Software de SnapGene
 Aprender a usar el Software SnapGene y poder aprender su funcionamiento
 Poder analizar los resultados obtenidos de la electroforesis y del comportamiento de
cada uno
3 MARCO TEÓRICO
3.1 ELECTROFORESIS
La electroforesis es una técnica de laboratorio que se usa para separar moléculas de ADN,
ARN o proteínas en función de su tamaño y carga eléctrica. Se usa una corriente eléctrica
para mover las moléculas a través de un gel o de otra matriz.
La electroforesis es una técnica que se utiliza de forma generalizada en la que,
fundamentalmente, se aplica corriente eléctrica a moléculas biológicas, ya sean ADN,
proteínas o ARN..., y se separan en función de si son más grandes o más pequeñas. Se utiliza
en una gran variedad de aplicaciones... como en medicina forense para determinar la
identidad de las personas que puedan haber participado en un delito, mediante la vinculación
de su patrón de ADN -su patrón de electroforesis- a uno que esté en una base de datos

6. 3
3.2 Secuencia ADN
La secuenciación del ADN se refiere a la técnica general de laboratorio para determinar la
secuencia exacta de nucleótidos, o bases de una molécula de ADN. La secuencia de las bases
(a la que se suele hacer referencia por la primera letra de su nombre químico: A, T, C y G)
codifica la información biológica que las células usan para desarrollarse y funcionar.
Establecer la secuencia de ADN es clave para comprender la función de los genes y otras
partes del genoma. En la actualidad hay varios métodos diferentes para la secuenciación del
ADN, cada uno con sus propias características, y el desarrollo de otros métodos es un área
activa de investigación en materia de genómica.
3.3 GEL DE AGAROSA
La electroforesis en gel es una técnica utilizada para separar fragmentos de ADN (u otras
macromoléculas, como ARN y proteínas) por su tamaño y carga. La electroforesis consiste
en aplicar una corriente a través de un gel que contiene las moléculas de interés. Con base
en su tamaño y carga, las moléculas se desplazarán por el gel en diferentes direcciones o a
distintas velocidades, con lo que se separan unas de otras.
3.4 SnapGene
SnapGene Es un software de clonación que ayudas en planear y simulando manipulaciones
de ADN.
Las secuencias de ADN de documentos de programa y se parece a SnapGene Espectador,
excepto aquel SnapGene viene con más adelantado consta y está diseñado para Ventanas y
OS X.

7. 4
4 MATERIALES Y MÉTODOS
4.1 MATERIALES
 Laptop
 NCBI
 Snapgene
4.2 METODOLOGIA
Para comenzar utilizaremos los datos proporcionados en el artículo científico
“Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y análisis de comunidades

8. 5
bacterianas de zona impactada por derrame de petróleo en Condorcanqui - Amazonas - Perú”
y entramos a la página NCBI (National Center for Biotechnology Information) y buscamos
los códigos de la tabla anterior
Ingresando en el primer resultado ,se nos mostrará una ventana con su código general,
seleccionamos la opción SEND TO y se nos mostrará una ventana en la cual podremos
seleccionar el archivo en formato FASTA y para guardarlo damos en CREATE FILE

9. 6
Una vez guardado el archivo repetimos el proceso para todos los códigos mostrados
en la tabla de datos , y los guardamos en una carpeta
Luego lo que hacemos es abrimos el software SnapGene y seleccionamos la opción
FILE>OPEN FILES y seleccionamos los archivos que guardamos para luego volver a
guardarlos con la opción FILES > SAVE AS y guardamos en formato SnapGene ADN

10. 7
Luego elegimos la opcion TOOLS , ahi se nos abrira una ventana y seleccionamos la opción
SIMULATE AGAROSE GEL
Y por último para finalizar realizamos lo mismo con los demás secuencias y se nos mostrará
la simulación de Gel Agarosa

11. 8
5 CONCLUSIONES
 En el proceso de aprendizaje del software SnapGene, hemos adquirido una
comprensión sólida de su funcionamiento básico y sus características
principales. Hemos aprendido a diseñar y editar secuencias de ADN.
 Se obtuvo más conocimientos adquiridos sobre la secuencia de ADN y
utilizar el software SnapGene, tambien fuimos capaces de realizar un análisis
exhaustivo de la secuencia genética y comprender mejor su estructura y
función.
 Se puede ver que el desarrollo de la electroforesis en gel de agarosa fue
óptimo porque se ha comprobado que según la cantidad de nucleótidos
mostrados a través del software SnapGene que fueron de los mismos que los
datos del artículo elegido en el curso de biotecnología.

12. 9
6 BIBLIOGRAFÍA
 Geater, J. (s/f). ¿Qué Es SnapGene? (de GSL Biotech LLC). Solvusoft.com.
Recuperado el 6 de junio de 2023, de https://www.solvusoft.com/es/file-
extensions/software/gsl-biotech-llc/snapgene/
 GSL Biotech SnapGene. (s/f). Abrirarchivos.info. Recuperado el 6 de junio
de 2023, de https://abrirarchivos.info/software/gsl_biotech/snapgene
 Electroforesis. (s/f). Genome.gov. Recuperado el 6 de junio de 2023, de
https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Electroforesis
 Secuenciación de ADN. (s/f). Genome.gov. Recuperado el 6 de junio de 2023,
de https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Secuenciacion-del-ADN
7 ANEXOS
Figura 1 Resultados de SnapGene