ViroScan3D est une société de services en génomique et micro-génomique dédiée à l'infectiologie.
Nous proposons notre expertise pour vos projets de Recherche de Biomarqueurs et de Pathogènes grâce à des technologies de pointe telles que le séquençage haut débit et les microarrays.
Nous sommes particulièrement spécialisés dans le traitement et l'analyse des échantillons complexes : ARN/ADN dégradés, FFPE, micro-quantité, cellule isolée, échantillon dilué, populations complexes...
ViroSan3D, services de micro-génomique infectieuse
1. Solutions de services et R&D
en Génomique Infectieuse
Discovery & Detection on Demand
2. Les Offres de ViroScan3D
Biomarker 3D
Pour la recherche de biomarqueurs (diagnostiques, pronostiques, toxicité …) par des signatures :
Transcriptomiques (ARNs codants et non codants)
Génomiques (SNP, CNV, InDel)
Epigénomiques (Méthylation, Hydroxyméthylation, Modifications Histones)
Pour la découverte et la détection de biomarqueurs connus, inconnus, ciblés ou à large débit
(nombre d’échantillons / de gènes marqueurs)
Virus & Microorganismes 3D
Pour l’identification ou la détection :
De mutants de résistance thérapeutique, de quasi-espèces
D’agents infectieux, nouveaux ou connus, dans des tissus, fluides biologiques ou des cellules
isolées
Des sites d’insertions de génomes infectieux (InSeq)
Des agents contaminants présents ou suspectés dans des produits thérapeutiques (vaccins,
stocks viraux, etc…), cosmétiques, prélèvements environnementaux (eau, boue, etc…)
Whole Genome Sequencing
Pour l’obtention des séquences nucléotidiques complètes :
De nouveaux génomes (virus, procaryotes, eucaryotes) y compris grands génomes
De métagénomes, de viromes ou de microbiomes
3. Spécialisation dans les échantillons complexes
Echantillons dégradés suite à une étape d’inactivation (chaleur, formol) ou à des méthodes de
conservation particulières (FFPE)
Echantillons en faible quantité (biopsies, cellules en faible quantité, approches cellules
uniques)
Cibles faiblement représentées, diluées dans le génome de l’hôte
Grande diversité d’espèces
Exemple d’identification de virus dilués
dans le génome de l’hôte :
Enrichissement en génome viral
Dupinay et al. 2012, 2013
Parnership with VetAgro Sup Lyon
Exemple d’identification de
biomarqueurs transcriptomique à
partir d’une faible quantité de cellules:
Enrichissement en génome humain
Parnership with VirPath Lyon
4. Un parc technologique de pointe
Un service clé en main de la préparation des échantillons à la validation des données de
l’analyse
Un service personnalisé réalisé avec la technologie la plus adaptée à vos besoins
La possibilité de développer de nouveaux protocoles à façon grâce à notre service de R&D
MULTIPLEX & REAL TIME PCR
Roche lightcycler 32 & 480
Applied 7900 HT
Luminex Magpix,
Flexmap 3D
MICROARRAYS
Affymetrix
Agilent
BEAD ARRAYS
iScan Illumina
NGS SEQUENCING
Illumina HiSeq 2500,
MiSeq & NextSeq 500
STORAGE & SOFWARE
Data storage cluster 40 To
Software : Ingenuity Pathway
Analysis, Partek Genomic
Suite, Custom algorithms
CELL ISOLATION
Acturus Microdissector
C1 Fluidigm
Sample
Preparation
NGS, Microarrays,
PCR
Data Analysis Data Validation
5. Nous contacter
Management
Responsable R&D
Adresse
Catherine Legras – Lachuer, CEO
Tél. : +33 (0) 6 63 43 24 04 | Fax : +33 (0) 4 37 28 76 05
Email : catherine.lachuer@viroscan3d.com
Magali Roche
Tél. : +33 (0) 4 78 77 28 89
Email : magali.roche@viroscan3d.com
Bureaux (adresse de Facturation)
ViroScan3D
11 allée des Acacias
01600 Trévoux
Laboratoires (adresse de Livraison des échantillons)
ViroScan3D-ProfileXpert
Faculté de Médecine et de Pharmacie,
8 avenue Rockefeller, Aile 2C et 3B,
69008 Lyon cedex
Site internet
www.viroscan3d.com