Весной и летом 1943 года в оккупированной немцами Виннице, под наблюдением международной комиссии, в которую входили представители из разных европейских стран, в разных местах города (парке имени Горького, на Литинском шляху, старом кладбище) были раскопаны более 90 могил с 9432 останками людей, расстрелянных как «враги народа». Жертвы лежали со связанными за спиной руками, с кляпами во рту. Среди них было 169 женщин. Эксперты однозначно установили время захоронений — 1937—1938 гг. Трупы лежали в глубоких траншеях. Сверху навалена одежда и личные вещи, которые, случалось, складывали в одну яму, что позволило во время расследования установить фамилии 675 погибших. В подавляющем большинстве это были крестьяне. Хотя попадались рабочие, служащие, священники, учителя, партийные работники, участники гражданской войны и т. д. О «винницких ямах», «кровавом преступлении Москвы в Виннице» появляются публикации в мировой прессе. Результаты экспертиз многочисленных могил и трупов были вскоре опубликованы в Берлине (Massenmord von Vinniza — «Массовые казни в Виннице»). Немцами был также снят 10-минутный документальный фильм. (Раскопка могил, опознание вещей. Лица женщин в темных платках и сельской одежде. Траурная процессия по улицам города.) О раскопках широко оповестили население Виннитчины и всей Украины. Родственники приглашались для опознания «врагов народа», о которых в свое время сообщалось, что они осуждены на 10 лет «без права переписки». Отовсюду шли люди, стояли около массовых захоронений при открытии могил, узнавали своих мужей, родителей, детей по вещам, найденным документам. В конце марта 1944 года сразу после освобождения города органы НКВД начали искать и арестовывать свидетелей раскопок в Виннице.