2. 2
Klasifikacija i nomenklatura enzimaKlasifikacija i nomenklatura enzima
• Imena enzima prema istraživaču
• Prema supstratu na koji deluju:
– Ureaza
– Arginaza
– Fosfataza
• Prema ulozi u metabolizmu
– Dijaforaza
– Katalaza
• Trivijalna imena
– Pepsin, tripsin, itd
• International Union of Biochemistry (IUB) 1955. je uspostavila komisiju
za enzime
– Internacionalna enzimska komisija
– International Enzyme Commission (EC)
– International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB)
• Sistemska nomenklatura i klasifikacija
• Osnov je katalizovana reakcija, odražava i karakter reakcije
• http://www. chem.qmw.ac.uk/iubmb/enzyme/accessed may 6.2011.
3. 3
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
• Klasa
• Podklasa
• Pod-podklasa
• Broj enzima klasifikacioni broj
• Podela enzima u 6 rodova
• Enzimski broj EC (enzyme commission) četiri cifre, odvojene
tačkama EC 2.7.3.2.
Prva cifra klasa (rod) enzima
1. Oksidoreduktaze
2. Transferaze
3. Hidrolaze
4. Liaze
5. Izomeraze
6. Ligaze (sintetaze)
4. 4
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Druga cifra podklasa enzima
• Oksidoreduktaze
• funkcionalna grupa u donoru koja podleže oksidaciji
1. alkoholna funkcija
2. aldehidnu ili ketonsku
• Transferaze priroda grupe koja se prenosi
1. grupa sa jednim C-atomom
2. aldehidni ili ketonski ostatak
3. acil grupa
• Hidrolaze
– Tip hemijske veze koja podleže hidrolizi
• Liaze tip veze koja se prekida
• Izomeraze tip izomerizacije
5. 5
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Treća cifra pod-podklasa enzima
• Oksidoreduktaze - tip akceptora koji sudeluje u reakciji
koenzim NAD ili NADP
citohrom
molekulski kiseonik
• Transferaze - tip grupe na koju se prenosi
C-1 grupa
Metil
Karboksil
Četvrta cifra serijski, individualni broj enzima
6. 6
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Klase enzimaKlase enzima
Oksidoreduktaze
Katalizuju razne reakcije oksidoredukcije
AH2 + B → A + BH2
Primeri:
Alkohol dehidrogenaza (alkohol:NAD+ oksidoreduktaza, EC. 1.1.1.1)
Citohrom oksidaza
L- i D-amino oksidaza
Podklase: dehidrogenaze, oksidaze, reduktaze, peroksidaze, katalaze i hidrolaze
Transferaze
Katalizuju prenos grupe izmeñu donora i akceptora
A-X + B → A + B-X
Primeri
Hexokinase (ATP: D-heksoza- 6-fosfotransferaza, EC.2.7.1.1)
Podklase: transaldolaze, transketolaze, aci-, metil-, glukozil- i fosforiltransferaze,
kinaze.
7. 7
Hidrolaze
Katalizuje raskidanje veze sa vodom
A-B + H2O → AH + BOH
Primeri:
Lipaza (triacilglicerol acil hidrolaza, EC. 3.1.1.3)
Holin esteraza, kisela i alkalna fosfatata, ureaza
Podklase: Esteraze, glikozidaze, fosfataze, peptidaze, tiolaze, fosfolipaze,
amidaze, dezaminaze i ribonukleaze
Liaze
Katalizuje uklanjanje ili dodavanje grupa pri čemu dvoguba veza ili ostaje ili
se uklanja(nehidrolitičke i neoksidativne reakcije).
A-B + X-Y → AX + BY
Primeri:
Aldolaza (ketoza 1-fosfat aldehid liaza, EC. 4.1.2.7), fumaraza
Podklase: Dekarboksilaze, aldolaze, hidrataze, dehidrataze, sintaze.
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Klase enzimaKlase enzima
8. 8
Enzimska nomenklaturaEnzimska nomenklatura
Klase enzimaKlase enzima
Izomeraze
Katalizuju izomerizaciju (recemizaciju) optičkih ili geometrijskih izomera.
Intramolekularna premeštanja.
A → A’
Primeri:
Trioza fosfat izomeraza (D-gliceraldehid 3-fosfat ketoizomeraza, EC. 5.3.1.1.),
retinol izomeraza i fosfoheksoza izomeraza.
Racemaze, epimeraze, izomeraze i mutaze.
Ligaze
Katalizuju reakcije sinteze uz utroška energije ATP
A + B + ATP → A-B + ADP
Primeri:
Glutamin sintetaza (L-glutamat amonijum ligaza, EC. 6.3.1.2)
Acetil CoA karboksilaza
Sintetaze i karboksilaze
9. 9
Primer EC broja enzimaPrimer EC broja enzima
Kreatin kinaza
Kreatin + ATP ↔ kreatin-fosfat + ADP
EC 2. 7. 3. 2.
Klasa (Transferaze)
Podklasa (Fosfotransferaze)
Pod-podklasa (Azotna grupa ili akceptor)
Individualni broj