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Filogeografía Jatziri Alejandra Calderón Chávez
¿Qué es? Subdisciplina de la biogeografía histórica. Análisis espacial de los linajes génicos para elucidar patrones y procesos históricos, evolutivos y ecológicos que determinan la distribución de la biota en el planeta.
¿Para qué? Secuencias de colonización, diversificación y extinción de los linajes génicos. Comparación: eventos comunes de vicarianza o dispersión y a identificar causas geológicas, ecológicas o etológicas que pudieran haber influido en ellos.
¿Qué ayudó? DNA Técnicas moleculares.  Teoría de la coalescencia (Kingman, 1982) Bioinformática y herramientas computacionales. ¿Con qué? ,[object Object]
ADNcp y ADNn.,[object Object]
En cada dicotomía hay un polimorfismo (SNPs, longitud de micro y minisatélites, deleciones, inserciones).
DNAmt Molécula circular sin histonas. Se hereda por vía materna. De cientos a miles de mitocondrias con varias copias. Un haplotipo propio. Extenso polimorfismo y alta tasa de mutación.  No presenta recombinación. Herencia casi exclusivamente materna
Haplotipo Combinación de alelos ligados a múltiples loci que se transmiten juntos. Conjunto de genes que determinan un cierto fenotipo. ,[object Object],Hipótesis gráfica de las relaciones filogenéticas y temporales de los organismos, que refleja su historia evolutiva.
Reloj molecular Para evaluar las relaciones evolutivas entre diferentes alelos se estima en cuánto tiempo divergieron dos secuencias homólogas.  20 / 500 = 0.04(100) = 4%
Métodos de análisis de datos Cladístico de datos filogeográficos. - Unidad terminal es un haplotipo - Datos: secuencias de genes - Filogramas - Se superponen a la distribución geográfica a fin de interpretar el proceso evolutivo.
Estadístico de datos filogeográficos Análisis cladístico anidado. Probar y detectar estadísticamente los mecanismos evolutivos responsables de la distribución espacial de los patrones de variación genética observada.
WANg, i.j.,crawford, a.j. y e- Bermiingham. Phylogeographic of thepigmy rain frog (pristimantisridens) acrossthelowlandwetforests of isthmian central america. Molecular phylogenetis and evolution 47(2008): 992-1004
López de Heredia L. U. 2006. Filogeografía de los quercusesclerófilos (Q. ilex, Q. suber , y Q. coccifera) en el Mediterráneo occidental. Tesis doctoral. UPM. Quién posee mayor diversidad genética. Quién es más homogéneo en los marcadores nucleares. Linajes organulares compartidos. Patrón vicariante. Refugios glaciares y colonización. Tiempos.
Contreras-díaz H.G. 2004. Filogeografía del género Pimelia (col., Tenebrionidae) en la isla de gran canaria: implicaciones para su conservación. BOLN. ASOC. Esp. Ent., 28(1-2):217-239
COnclusiones Engloba aspectos temporales (relaciones evolutivas) y espaciales (distribución geográfica). La MUTACIÓN es el puente entre genealogías y datos genéticos.  Árboles de genes producto, ofrecen una estimación a largo plazo del tamaño efectivo de las poblaciones, su tasa de mutación e intensidad de su flujo génico histórico.
referencias Vázquez-Domínguez, E., Castañeda-Rico, S., Garrido-Garduño, T. y T.A. Gutiérrez-García. 2002. Avances metodológicos para el estudio conjunto de la información genética, genealógica y geográfica en análisis evolutivos y de distribución. Revista Chilena de Historia Natural 82: 277-297. Lanteri A.A. y V.A. Confalonieri. 2000. "FIlogeografía: objetivos, métodos y ejemplos," en Morrone JJ y Llorente Bousquets J (eds.) Una Perspectiva Latinoamericana de la Biogeografía. Las Presas de Ciencias, UNAM, México, D.F.  Morando, M.  Árboles genealógicos, teoría de la coalescencia y el análisis de polimorfismos genéticos. Filogeografía estadística. Centro Nacional Patagónico-CONICET

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Filogeografía

  • 2. ¿Qué es? Subdisciplina de la biogeografía histórica. Análisis espacial de los linajes génicos para elucidar patrones y procesos históricos, evolutivos y ecológicos que determinan la distribución de la biota en el planeta.
  • 3.
  • 4. ¿Para qué? Secuencias de colonización, diversificación y extinción de los linajes génicos. Comparación: eventos comunes de vicarianza o dispersión y a identificar causas geológicas, ecológicas o etológicas que pudieran haber influido en ellos.
  • 5.
  • 6.
  • 7.
  • 8. En cada dicotomía hay un polimorfismo (SNPs, longitud de micro y minisatélites, deleciones, inserciones).
  • 9. DNAmt Molécula circular sin histonas. Se hereda por vía materna. De cientos a miles de mitocondrias con varias copias. Un haplotipo propio. Extenso polimorfismo y alta tasa de mutación. No presenta recombinación. Herencia casi exclusivamente materna
  • 10.
  • 11. Reloj molecular Para evaluar las relaciones evolutivas entre diferentes alelos se estima en cuánto tiempo divergieron dos secuencias homólogas. 20 / 500 = 0.04(100) = 4%
  • 12. Métodos de análisis de datos Cladístico de datos filogeográficos. - Unidad terminal es un haplotipo - Datos: secuencias de genes - Filogramas - Se superponen a la distribución geográfica a fin de interpretar el proceso evolutivo.
  • 13.
  • 14. Estadístico de datos filogeográficos Análisis cladístico anidado. Probar y detectar estadísticamente los mecanismos evolutivos responsables de la distribución espacial de los patrones de variación genética observada.
  • 15. WANg, i.j.,crawford, a.j. y e- Bermiingham. Phylogeographic of thepigmy rain frog (pristimantisridens) acrossthelowlandwetforests of isthmian central america. Molecular phylogenetis and evolution 47(2008): 992-1004
  • 16.
  • 17. López de Heredia L. U. 2006. Filogeografía de los quercusesclerófilos (Q. ilex, Q. suber , y Q. coccifera) en el Mediterráneo occidental. Tesis doctoral. UPM. Quién posee mayor diversidad genética. Quién es más homogéneo en los marcadores nucleares. Linajes organulares compartidos. Patrón vicariante. Refugios glaciares y colonización. Tiempos.
  • 18. Contreras-díaz H.G. 2004. Filogeografía del género Pimelia (col., Tenebrionidae) en la isla de gran canaria: implicaciones para su conservación. BOLN. ASOC. Esp. Ent., 28(1-2):217-239
  • 19. COnclusiones Engloba aspectos temporales (relaciones evolutivas) y espaciales (distribución geográfica). La MUTACIÓN es el puente entre genealogías y datos genéticos. Árboles de genes producto, ofrecen una estimación a largo plazo del tamaño efectivo de las poblaciones, su tasa de mutación e intensidad de su flujo génico histórico.
  • 20.
  • 21.
  • 22. referencias Vázquez-Domínguez, E., Castañeda-Rico, S., Garrido-Garduño, T. y T.A. Gutiérrez-García. 2002. Avances metodológicos para el estudio conjunto de la información genética, genealógica y geográfica en análisis evolutivos y de distribución. Revista Chilena de Historia Natural 82: 277-297. Lanteri A.A. y V.A. Confalonieri. 2000. "FIlogeografía: objetivos, métodos y ejemplos," en Morrone JJ y Llorente Bousquets J (eds.) Una Perspectiva Latinoamericana de la Biogeografía. Las Presas de Ciencias, UNAM, México, D.F.  Morando, M. Árboles genealógicos, teoría de la coalescencia y el análisis de polimorfismos genéticos. Filogeografía estadística. Centro Nacional Patagónico-CONICET