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CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1
CLARA / Annuaire des plateformes 20142
INFORMATION
Annuaire disponible en version électronique sur www.canceropole-clara.com/ressources
Si vous souhaitez voir figurer votre plateforme dans l’annuaire en ligne, merci de nous
contacter à infos@canceropole-clara.com
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 3
4 ANIPATH - Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire
6 ANIPATH Clermont - Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal
8
CERMEP-imagerie du vivant - Centre d'Etude et de Recherche Multimodal
et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant
10 CICS - Centre Imagerie Cellulaire Santé
12 CIQLE - Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est
14 Clinatec - Une plateforme technologique translationnelle multidisciplinaire
16 EMPLAT - Plateforme de Microscopie Electronique
18 GAIA - Plateforme d'imagerie nucléaire
20 IRMaGe - Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie
22 M4D - Imagerie Cellulaire
24 MEC - Plateforme de Microscopie électronique de la Cellule
26 MiBiop - Microscopie pour la Biophysique
28 MicroCell - Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire
30 NanOpTec - Centre de Nano-Opto-Technologies
32 OPTIMAL - Plateforme d'imagerie optique du petit animal
34 PAVIRMA - Plateforme d'irradiation en Auvergne
36 PIM Lyon Tech - Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech
38 Radiograaff - Radiobiologie au Van de Graaff
40 X-Ray CERVO Lyon-Sud - Plateforme d'irradiation par rayons X
42 Imagerie intégrée multimodalité
Imagerie
tissulaire
Imagerie
cellulaire
Imagerie
in-vivo
Irradiation
CLARA / Annuaire des plateformes 20144
ANIPATH
Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire
DOMAINE D’EXPERTISE
Imagerie cellulaire et tissulaire dédiée à l’étude des modèles
animaux, histologie
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Jean-Yves SCOAZEC
Contact : anipath@univ-lyon1.fr
 Faculté de Médecine Lyon-Est (site Laennec), 7 Rue G.
Paradin, 69372, Lyon cedex 08
@ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/liens/anipath.html
Appartenance : European Mouse Pathology Workgroup
Equipex PHENOCAN
Effectif : 3
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
ANIPATH, née de la volonté commune de Rhône Alpes Genopole et de l'Université
Claude Bernard Lyon 1, est aujourd’hui gérée par l’Université Claude Bernard Lyon 1.
La plate-forme s’est initialement orientée vers le phénotypage et l’étude des animaux
transgéniques, avant de diversifier progressivement son activité à une très large
gamme de modèles animaux.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 5
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
La plate-forme fonctionne selon des standards de qualité professionnels et garantit la
traçabilité des échantillons. Elle dispose d’équipements lui permettant de traiter des
prélèvements cellulaires ou tissulaires, fixés ou congelés (microtome, cryostat,
automate d’IHC). Elle est équipée d'outils d'imagerie tissulaire performants, incluant
des microscopes conventionnels, un microscope à fluorescence, des systèmes de
numérisation d’images et d'analyse morphométrique. Elle peut réaliser à façon des
puces tissulaires (TMA), technique récente d’analyse à haut débit d’échantillons
tissulaires.
PRESTATIONS PROPOSEES
Anipath est dotée d’un plateau technique et d’un personnel qualifié qui lui
permettent de proposer des prestations diversifiées et complémentaires :
- la réalisation de l’ensemble des techniques d’imagerie tissulaire appliquées à
l’animal : histologie, histochimie, immunohistochimie, hybridation in situ
- l’interprétation des résultats, en partenariat avec l'utilisateur, grâce au concours
d'un réseau d'experts dans les différentes disciplines morphologiques
- le conseil technique aux utilisateurs et l’aide à la réalisation de protocoles
d’étude adaptés aux objectifs des chercheurs
CLARA / Annuaire des plateformes 20146
ANIPATH Clermont
Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal
DOMAINE D’EXPERTISE
Analyses anatomo-pathologiques, histologie, immunohistochimie
et imagerie fond clair, fluorescence
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Pierre VAL
Contact : pierre.val@univ-bpclermont.fr
 Campus des Cézeaux, 24 avenue des Landais, 63171, Aubière
@ https://www.gred-clermont.fr/directory/platform/en/anipath
Appartenance : CNRS/INSERM/Université Blaise Pascal
Effectif : 1 AI
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Le plateau technique permet de réaliser le traitement d'échantillons (inclusion
paraffine/OCT), les coupes (paraffine/OCT), les colorations histologiques,
l'immunohistochimie et l'hybridation in situ sur coupes et tissus entiers. La majorité
des process (inclusion, IHC, HIS) est automatisée. Le plateau dispose également de
matériel de microscopie permettant la dissection, l'observation et l'acquisition
d'images en fond clair et fluorescence. Sont traités aujourd'hui des tissus murins, des
plantes et des insectes.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 7
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Processeur de tissus STP120 Microm (déshydratation et passage dans la paraffine).
Automate d'inclusion EC350 Microm (inclusion dans la paraffine). Deux microtomes
HM340E Microm, un cryostat HM560 Microm. Colorateur HMS70. Automates IHC/HIS sur
lames ou tissus entiers Intavis InSitu Pro VSi. Deux loupes binoculaires Leica MZ7.5 avec
caméra Leica DFC500. Microscope Zeiss Axioplan 2 avec caméras couleur et N&B.
Moyens biologiques
Modèles animaux de physiopathologie prostatique,
épididymaire, testiculaire et surrénalienne (souris
transgéniques, KO et KI)
Infrastructures spécifiques
Animalerie agréée OGM (capacité 5000 animaux),
plateau de transgenèse
CONDITIONS D’ACCES
Accès gratuit aux équipes du GReD, facturation pour équipes extérieures
PRESTATIONS PROPOSEES
Le plateau ne fournit pas de prestation. Il assure par contre la formation et
l'encadrement d'utilisateurs potentiels. L'assistant ingénieur est disponible pour
assurer le bon fonctionnement du plateau (approvisionnement, veille
technologique) et la mise au point de protocoles.
© Pierre Val
CLARA / Annuaire des plateformes 20148
CERMEP-imagerie du vivant
Centre d'Etude et de Recherche Multimodal et
Pluridisciplinaire en imagerie du vivant
DOMAINE D’EXPERTISE
Imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et l'animal : TEP,
IRM, MEG . Radio-chimie émetteurs de positons.
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Gérard GIMENEZ
Contact : gimenez@cermep.fr
 59 boulevard pinel, 69677, BRON Cedex
@ www.cermep.fr
Appartenance : FLI ( France Life Imaging )
Labellisation : ISO 9001, IBiSA ( infrastructures Biologie Santé
Agronomie)
Effectif : 28
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Mise en œuvre de protocoles d'imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et
l'animal. Techniques d'imagerie disponibles : TEP (tomographie par émission de
positons), TDM (tomodensitométrie), TEP/IRM simultanée, IRM (résonance magnétique
nucléaire), MEG (magnéto-encéphalographie)
Développement et production de radio-traceurs émetteurs de positons
Développement d'une R&D méthodologique en propre ou en partenariat avec des
unités de recherche
Ouvert sur la communauté scientifique académique et l'industrie
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 9
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Cyclotron IBA 18 Mev Cyclone 18 / 9. Cellules blindées pour la production de radio-
traceurs. Automates de synthèses de radio-traceurs. Système de contrôle qualité des
radio-traceurs : HPLC, CPG
Caméra TEP/CT SIEMENS BIOGRAPH 64 S
IRM 1.5T Siemens Magnetom Sonata. IRM 3T Siemens Magnetom Prisma
MEG CTF 275
MicroIRM BRUKER 7T . MicroTEP/CT Siemens Inveon . MicroCT Skyscan 1076
IRM/TEP Biograph mMR
Infrastructures spécifiques
Animalerie rongeurs, porcs, chats
Laboratoire de production de radio-traceurs
Laboratoire de radio-pharmacie
CONDITIONS D’ACCES
Aucune
PRESTATIONS PROPOSEES
Accompagnement administratif et scientifique au montage de protocole d'imagerie
Développement de méthodes
Réalisation des examens d'imagerie
Accompagnement aux traitements des images.
Production de radio-traceurs émetteurs de positons
Hébergement d'animaux (rongeurs, porcs)
CLARA / Annuaire des plateformes 201410
CICS
Centre Imagerie Cellulaire Santé
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Philippe VAGO
Contact : pvago@chu-clermontferrand.fr
 Faculté de Médecine, 28 place Henri Dunant, 63000,
Clermont Ferrand
Appartenance : Université d'Auvergne
Réseaux : RCCM, AFC
Effectif : 3 ETP(1 IE, 2 Tech)
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Analyse en Microscopie Electronique en Transmission (MET) et en Microscopie
Electronique à Balayage (MEB) :
Etudes ultrastructurales pour des échantillons biologiques (tissus, cellules, ...)
ou non biologiques (microparticules...)
Immunolocalisation en MET
Analyse en microscopie optique :
Tissus, cellules, micro-organismes
Immunomarquage (marqueurs enzymatiques ou fluorochromes)
Analyse d’images : comptage, colocalisation...
Analyse en cytométrie de flux
Analyse en microdissection laser
Préparation des échantillons pour les études en ME et en histologie
DOMAINE D’EXPERTISE
Microscopie électronique, Microscopie photonique, Cytométrie en
flux, Microdissection laser
THEMATIQUE
      CLARA / Annuaire des plateformes 2014  11
© CICS
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Microscope Electronique en Transmission Hitachi H-7650
Microscope Electronique à Balayage Jeol 6060-Low Vacuum
Microscopes Olympus + caméras (couleur, NB) + logiciel d’analyse d’images Metamorph
Cytomètre en flux BD LSRII
Microdissecteur Laser Arcturus Pixcell II
AFS II, AMW, Ultramicrotome Leica pour la préparation des échantillons en ME.
Automate à déshydratation et station à inclusion Microm Microtech, microtomes et
cryostat Leica pour la préparation des échantillons en histologie
CONDITIONS D’ACCES
Ouvert à tous laboratoires publics ou privés
PRESTATIONS PROPOSEES
Prise en charge complète des projets en microscopies optique et électronique de
la préparation des échantillons au rendu des résultats
Expertise technique dans les domaines d’application
Assistance et formation des utilisateurs
Mise à disposition des équipements du CICS
CLARA / Annuaire des plateformes 201412
CIQLE
Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Ruth RIMOKH
Contact : ruth.rimokh@lyon.unicancer.fr
 Faculté de Médecine Lyon-Est, rue Guillaume Paradin, 69372,
Lyon cedex 08
@ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/plateau31-ciqle.html?
Appartenance : GDR2588, RtMfm, RCCM, RECAMIA
Labellisation : plateforme labellisée Ibisa au titre de membre
fondateur de Lyon Bio-Image
Effectif : 5 ETP (personnels statutaires)
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Le CIQLE est un centre commun de l’Université Claude Bernard de Lyon et une
composante fondatrice de Lyon Bio-Image (Plateforme d'Imagerie Lyonnaise labellisée
Ibisa). Sa mission est de mettre à la disposition des communautés académique et
industrielle des équipements et des personnels permanents pour les assister dans
l’utilisation des appareils, pour préparer leurs échantillons et pour mettre en place
des protocoles dans les domaines de la microscopie électronique, photonique et
traitement d'images. A ces fins, l’UCBL et l’Inserm y affectent des personnels. L’achat
des équipements est co-financé (Inserm, CNRS, HCL, UCBL, SFR, Fondations,
Associations, fonds propres) sous la coordination de la SFR Santé Lyon-Est, qui est une
Unité Mixte de Service labellisée Inserm, CNRS et UCBL. L'entretien des équipements
est assuré par la facturation des prestations.
THEMATIQUE
DOMAINE D’EXPERTISE
Microscopie électronique, microscopie photonique
(vidéomicroscopie, confocal mono et bi-photon, super-résolution
et microinjection cellulaire). Formation, assistance. Expertise et
prestation en traitement d'images
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 13
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Microscopie électronique : MET Jeol 1400 120 kV, avec caméras numériques et
détecteur EDS, robot de cryosubstitution, ultramicrotomes, contrasteur de grille
automatisée, système informatisé de suivi des échantillons (logiciel TRACEMET
développé en interne). Microscopie photonique : confocal LSM 780 Zeiss mono et multi-
photon avec contrôle environnemental, confocal SP5 X laser blanc Leica avec détecteur
hybride, STORM haute-résolution Nikon, stations de vidéomicroscopie (Biostation
Nikon, axiovert 200-M), logiciels de traitement et de reconsctrucion d'image (ImageJ,
Imaris, Amira)
Infrastructures spécifiques
Plateforme installée sur 3 sites : site Laennec 180 m², site Rockefeller 180 m², site
Centre Léon Bérard 30 m²)
CONDITIONS D’ACCES
Ouvert aux structures académiques, universitaires et industrielles. La réservation des
équipements se fait sur le site internet. Les tarifs sont disponibles sur le site internet.
PRESTATIONS PROPOSEES
Microscopie électronique : prestation complète de l'échantillon à l'image en
ultrastructure conventionnelle, immunogold sur cellules, tissus, bactéries, virus,
pseudoparticule. Assistance pour l'acquisition, la lecture et l'interprétation des
images. Microscopie photonique : formation, assistance et expertise dans les
domaines de la microscopie plein champ, confocale et haute-résolution.
Traitement d'image : formation, conseil et mise en place de protocole de
traitements d'images.
CLARA / Annuaire des plateformes 201414
THEMATIQUES
Clinatec
Clinatec: une plateforme technologique translationnelle
multidisciplinaire
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : François BERGER
Contact : francois.berger@chu-grenoble.fr
 CLINATEC CEA LETI 17 rue des Martyrs, 38054, GRENOBLE cedex 09
@ http://issuu.com/co-influence/docs/plaquette-clinatec-ps
Appartenance : Centre Hospitalier Universitaire de GRENOBLE
INSERM UA 01
GDR Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant et Microscopie
fonctionelle du vivant
Labellisation : FLI, IBISA
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
CLINATEC est un centre de recherche technologique translationnel associant le CHU
de Grenoble, l’INSERM, l’UJF et le CEA-LETI. Sa mission est d’accélérer le transfert de
l’innovation technologique au lit du patient dans les meilleures conditions de sécurité.
Sa spécificité est dans son domaine de recherche clinique lié aux pathologies
neurologiques (neurodégénératifs, handicap et cancer) et dans l’utilisation des micro-
nanotechnologies et de l’électronique pour la santé, expliquant sa localisation sur le
campus MINATEC. Clinatec est aussi un hôtel à projet ouvert aux industriels et aux
chercheurs dans d’autres domaines d’activité qui pourraient bénéficier de ses
compétences et de sa plateforme.
THEMATIQUE
DOMAINE D’EXPERTISE
Unité préclinique et clinique pour la validation des dispositifs
médicaux innovants participant au développement sécurisé et
accéléré de solutions technologiques nouvelles au service des
patients, micro-nanosystemes et électronique pour la santé,
biomarqueurs
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 15
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Secteur clinique: IRM diagnostique et per op 1,5 tesla (première IRM interventionnelle
en France), robot chirurgical Medtech, SPECT-CT, MEG, micro-endoscopie confocale
(CellVizio), Fluobeam, microscopie de fluorescence interventionelle
Secteur préclinique (animalerie): IRM wide bore 4.7 T, microscopie et endoscopie
intravitale
Un PACS (Picture Archiving and Communication System) centralise l’ensemble des
données de l’imagerie
Secteur biologie : plateforme Affymetrix, Ion torrent, PCR digital, chaine d’analyse de
spectrométrie de masse, imagerie MS, « sample prep » automatisé
Moyens biologiques
Sérothèque, tumorothèque cerveau et tumeurs cérébrales incluant des ressources
cellulaires et moléculaires associées, plusieurs modeles animaux de gliomes chez
souris, rats, primates et porcs
Infrastructures spécifiques
Bloc opératoire et secteur clinique dédié, animalerie avec bloc opératoire et imagerie
multimodale (IRM, X, optique) intégrée, laboratoire de culture cellulaire L2
COMMENTAIRES
Cette plateforme est animée par une équipe dont les compétences sont dans le domaine de la
neuro-oncologie. Cependant elle fonctionne aussi en hôtel à projet et accueille dès à présent
des projets pour d'autres organes. Les coordinateurs cliniques apportent les compétences
spécifiques et la structure ses compétences méthodologiques.
CONDITIONS D’ACCES
Comité scientifique
PRESTATIONS PROPOSEES
CLINATEC est destiné à la validation de preuves de concept précoces dans le
domaine des micro-nano-systèmes pour la santé particulièrement en cancérologie.
Nous mettons à disposition :
1) un comité de concertation technologique translationnel pour guider le plus tôt
possible le dépôt de dossier de recherche clinique auprès des autorités
réglementaires
2) Une équipe multidisciplinaire médicale et paramédicale, intégrant ingénieurs,
biologistes, mathématiciens
3) une PTF préclinique (modèles gros animaux)
4) une PTF d’imagerie multimodale et interventionnelle
5) une PTF biomarqueur
6) Un secteur clinique dédié à des essais de recherche biomédicale. Son activité
inclut des consultations, de l'hospitalisation de jour et de l'hospitalisation
complète. Après ces premiers essais sur 5 à 10 patients qui sont la spécificité de
clinatec ; le rôle de l'équipe est aussi d'assurer la dissémination de la technologie
dans un environnement hospitalier courant et la formation des personnels de santé.
CLARA / Annuaire des plateformes 201416
DOMAINE D’EXPERTISE
Microscopie électronique, cryo-microscopie électronique,
microscopie électronique cellulaire, contrôle qualité, particules
isolées
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Guy SCHOEHN
Contact : guy.schoehn@ibs.fr
 IBS 71 Avenue des Martyrs CS 10090, 38044, Grenoble Cedex 9
@ http://www.ibs.fr/groupes/groupe-microscopie-electronique-
et/plateforme-de-microscopie/
Appartenance : UMS3518, Partnership for Structural Biology,
INSTRUCT
Labellisation : Certification ISO9001
Effectif : 6
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
La plateforme propose trois types de prestations : contrôle qualité (coloration
négative), cryo-microscopie électronique et microscopie électronique cellulaire. La
plateforme propose également la mise à disposition de ses équipements. Des
collaborations scientifiques peuvent être mises en place pour répondre à des
demandes précises nécessitant des développements spécifiques.
THEMATIQUE
EMPLAT
Plateforme de Microscopie Electronique
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 17
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
La plateforme possède 3 microscopes électronique (FEI Tecnai12 120 kV, FEI Tecnai
F20 200kV FEG, FEI Tecnai POLARA 300 kV FEG). Les deux derniers microscopes
fonctionnent en mode cryo et le Polara sera équipé d'une caméra à détection directe
d'électrons dans les mois qui viennent. Plusieurs instruments associés aux microscopes
sont également disponibles (évaporateur de carbone, appareil de Glow-Discharge, FEI
Vitrobot, scanner d'images haute résolution). Pour la préparation d'échantillons
cellulaires, la plateforme possède un automate de cryo-fixation sous haute pression
(Leica EM-HPM100), un automate de cryo-préparation (Leica EM-AFS2 + Em-FSP), un
(cryo-)ultra-microtome (Leica EM-UC7 + EM-FC7) et un automate d'immuno-marquage
(Leica EM-IGL).
COMMENTAIRES
La plateforme fait partie de l'Unité Mixte de
Service UMS3518 mais est localisée à l'IBS
Pour nous contacter : ibs-plateforme-
em.contact@ibs.fr
CONDITIONS D’ACCES
Les services de la plateforme sont soumis à facturation. Les échantillons doivent respecter le
niveau de sécurité L1 ou L2 et être conformes à la déclaration OGM correspondante.
PRESTATIONS PROPOSEES
Contrôle qualité (vérification de l'homogénéité d'un échantillon, détermination de
l'état d'oligomérisation de certaines protéines, analyse d'images et reconstruction
tridimensionnelle de complexes protéiques). Cryo-microscopie électronique
(technique permettant d'observer des échantillons biologiques dans leur état natif,
analyse d'images et reconstruction tridimensionnelle de complexes protéiques).
Tomographie électronique. Microscopie électronique cellulaire (études
morphologiques cellulaires/bactériennes, localisation de protéines au niveau sub-
cellulaire). La plateforme propose également la mise à disposition de ses
équipements sous certaines conditions.
CLARA / Annuaire des plateformes 201418
GAIA
Plateforme d'imagerie nucléaire
DOMAINE D’EXPERTISE
Oncologie, métabolisme, neuroscience, cardiologie, imagerie
TEP, imagerie SPECT, imagerie CT, échographie
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Catherine GHEZZI
Contact : catherine.ghezzi@chu-grenoble.fr
 CHU Grenoble Rond point de la Chantourne, 38100, Grenoble
@ http://www.imagerie-grenoble.fr/
Appartenance : France Life Imaging
Labellisation : IbiSa
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
GAIA est localisé au sein de l'UMR 1039 qui regroupe le Laboratoire
Radiopharmaceutique Biocliniques (LRB) et la clinique de Médecine Nucléaire du CHU
de Grenoble. Cette unité développe depuis plus de 25 ans des radiopharmaceutiques,
molécules marquées par des atomes radioactifs et utilisées pour le diagnostic et la
thérapie. Les compétences développées sur la plateforme vont du marquage radioactif
de composés aux études précliniques et cliniques.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 19
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Caméra SPECT/CT Bioscan
Caméra PET/CT Bioscan
Caméra Cliniques SPECT et TEP
Echographe Vevo
Autoradiographie
Infrastructures spécifiques
Plateforme animalerie : petits et gros animaux, animalerie agrémentée, microchirurgie
Radiochimie : radio-HPLC, radio-CCM, activimètres, compteurs Gamma et Bêta
CONDITIONS D’ACCES
Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils/expertise, collaborations
de recherche académiques / industrielles
PRESTATIONS PROPOSEES
Radiomarquage de divers composés (molécules organiques, protéines, anticorps,
sucres, peptides, bactéries, ADN, ARN, cellules,…)
Evaluation in vivo de la pharmacocinétique et de la biodistribution d'une molécule
d'intérêt pharmaceutique
Evaluation de l'efficacité thérapeutique de composés d'intérêt (tumeur, ischémie,
métabolisme,...)
Etude de phénommènes biologiques chez l'animal en utilisant des radiotraceurs
existants (suivi de croissance tumorale, mesures de perfusion cérébrale ou
cardiaque, ou encore études métaboliques)
Validation de modèles animaux
CLARA / Annuaire des plateformes 201420
IRMaGe
Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie
DOMAINE D’EXPERTISE
IRM, neuroimagerie, explorations fonctionnelles (EEG, TMS, NIRS)
et métaboliques, imagerie fonctionnelle de la vascularisation
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Chantal REMY
Contact : chantal.remy@ujf-grenoble.fr
 Bâtiment Edmond J. Safra, Université Joseph Fourier - Site
Santé, Chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche
@ https://irmage.ujf-grenoble.fr/accueil?destination=node/850
Appartenance : France Life Imaging
Labellisation : IbiSa
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Spécialisée en neuroimagerie et explorations fonctionnelles associées, IRMaGe est le
partenaire idéal pour accompagner des projets de recherche sur petit animal et
primate non humain, des projets de recherche à visée clinique ou cognitive, mais
également pour le développement méthodologique d'imagerie et de spectroscopie
RMN ou neurophysiologie.
Dans le contexte de la cancérologie, peuvent être réalisés, pour des études
pharmacologiques, des suivis longitudinaux du volume tumoral, des œdèmes, du
métabolisme, de la vascularisation et de l'angiogenèse sur des modèles orthotopiques
ou sous-cutanés (rat ou souris) ou chez l'homme.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 21
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
3 IRMs petit animal : 4,7 T, 7,0 T et 9,4 T (rat, souris) - monitoring physiologique
2 IRMs corps entier : 3T
3 EEGs (électro-encéphalographie) haute résolution, compatibles TMS et IRM
TMS (stimulation magnétique transcrânienne) neuronaviguée et robotisée
Appareil de spectroscopie proche infra-rouge (NIRS)
Enregistrements multi-unitaires
Coordination possible pour imagerie multimodale (IRM, optique, nucléaire)
Moyens biologiques
Modèles de tumeurs cérébrales
Infrastructures spécifiques
Accès à une plateforme d'animalerie : souris, rats, primates
Animalerie agréée ISO9001
Salles de microchirurgie
COMMENTAIRES
Lemasson B et al., NMR in Biomedicine 2011; 24:473-482.
Lux F et al., Angewandte Chemie int Ed Engl, 2011, 50: 12299 –12303.
Coquery N et al., PLoS ONE, 2012; 7:e40567
Lemasson B et al, Radiology. 2012; 265:743-752.
Bouchet et al., Radiother Oncol. 2013; 108:143-148.
CONDITIONS D’ACCES
Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils, collaborations de
recherche académiques / industrielles
PRESTATIONS PROPOSEES
Développement méthodologiques (animal, homme)
Phénotypage de souris transgéniques
Suivi de l'évolution de pathologies (animal, homme)
Études pharmacologiques (animal, homme)
Evaluation de l'efficacité de nouveaux traitements (animal, homme)
Imagerie cellulaire et moléculaire (animal)
Évaluation de nouveaux agents de contraste (animal)
Recherche cognitive (homme)
Exploration fonctionnelles cérébrales (homme)
Evaluation de la compatibilité RMN de matériaux
Etude d'échantillons tissulaires à haute résolution
CLARA / Annuaire des plateformes 201422
M4D
Imagerie Cellulaire
DOMAINE D’EXPERTISE
Vidéo microscopie, microscopie confocale, cytométrie en flux
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Jean-Philippe KLEMAN
Contact : jean-philippe.kleman@ibs.fr
 IBS UMR 5075 (CNRS CEA UJF)- Campus EPN - 71 avenue des
Martyrs, 38044, Grenoble Cedex 9
@ http://www.ibs.fr/plates-formes/autres-instruments-et/imagerie-
cellulaire/
Appartenance : Integrated Structural Biology - Grenoble UMS 3518
(CNRS CEA UJF EMBL)
French Integrated Structural Biology network (FrisBi) - IBISA
Plateforme de Biologie Structurale - Grenoble
Labellisation : ISO 9001:2008 LRQA du 3 juillet 2011
Effectif : 3 permanents
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
La plate-forme accueille les utilisateurs dans un environnement de niveau L2 (pièce
de culture dédiée). Nous mettons à disposition nos microscopes (vidéomicroscope et
confocal à roue de Nipkow - Olympus Perkin-Elmer et Andor) optimisés pour l'étude de
cellules vivantes. Nous sommes également équipés d'un cytomètre en flux (Miltenyi
Biotech) capable de mesurer les fluorescences de 8 canaux simultanément,
compatibles avec l'étude des protéines fluorescentes (Ex. 405, 488 et 561nm).
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 23
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Vidéo-microscope inversé à épifluorescence motorisé, chambre d'incubation, Z-piezo,
4 canaux fluo, DIC, 20X 40X et 60X, acquisition CCD
Microscope confocal inversé motorisé à roue de Nipkow, chambre d'incubation, CO2,
Z-piezo, 6 canaux fluo, DIC, 20X 40X 60X et 100X, acquisition dual EMCCD, module
FRAP/PA
Cytomètre en flux : 3 lasers, 8 canaux fluo, échantillonneur robotisé
Infrastructures spécifiques
Pièce de culture L2 dédiée
Ordinateurs permettant le traitement des données
Légende : acquisition confocale (60x NA
1,42; EMCCD iXon Ultra - Andor;
Z=44x0,28µm) cellules NIH-3T3 exprimant
HA-Survivine (Rouge) et transfectées par
une construction GFP du transporteur
membranaire AIT (vert). ADN (Bleu, DAPI).
© F. Lacroix – IBS
CONDITIONS D’ACCES
Formation obligatoire et inscription sur le calendrier des réservations
PRESTATIONS PROPOSEES
Nos instruments sont mis à disposition des utilisateurs après une formation
obligatoire dispensée par nos soins sur l'instrument concerné. Les utilisateurs sont
également formés pour l'utilisation des logiciels d'acquisition et de traitement des
données. Des ordinateurs pour le traitement sont mis à disposition. L'accès est
possible après réservation du matériel (calendrier).
CLARA / Annuaire des plateformes 201424
MEC
Plateforme de Microscopie Electronique de la Cellule
DOMAINE D’EXPERTISE
Neurosciences, oncologie, vascularisation, spermatozoides,
ovaires
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Karin PERNET-GALLAY
Contact : karin.pernet-gallay@ujf-grenoble.fr
 Grenoble Institut des Neurosciences
chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche
@ neurosciences.ujf-grenoble.fr/
Appartenance : INSERM U836
Université Jopseph Fourier
Labellisation : plateforme Ibisa
Effectif : 2
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Inclusion Epon pour études morphololgiques
Immunomarquage à l'or sur des cryosections pour l'immunolocalisation de protéines
THEMATIQUES
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 25
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX)
Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica)
Appareil de congélation haute Pression (HPM100, Leica)
Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica)
Infrastructures spécifiques
Laboratoire pour l'inclusion
Local pour la coupe et la préparation cryo des échantillons
Pièce pour le microscope électronique
CONDITIONS D’ACCES
Facturation à l'heure
PRESTATIONS PROPOSEES
Mise à disposition
Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX)
Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica)
Appareil de congélation haute pression (HPM100, Leica)
Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica)
Mesures morphométriques (iTEM, Olympus)
Inclusion Epon pour analyse morphologique
Méthode de Tokuyasu pour immunomarquage
CLARA / Annuaire des plateformes 201426
MiBiop
Microscopie pour la Biophysique
DOMAINE D’EXPERTISE
Microscopie à forces de traction, imagerie ultra-sensible en milieu
diffusant, mesure de mobilité moléculaire, optique adaptative,
microscopie à force atomique, biophysique
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Antoine DELON
Contact : antoine.delon@ujf-grenoble.fr
 140, rue de la physique - Université Joseph Fourier -
Domaine universitaire, 38402, Saint Martin d'Hères Cedex 9
Appartenance : Laboratoire Interdisciplinaire de Physique (LIPhy)
UJF (Université de Grenoble 1) et CNRS
GDR 2588 (Microscopie fonvtionnelle du vivant)
Effectif : Environ 110 pers. (non permanents compris)
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Le plateau MiBiop est un lieu de développement instrumental et méthodologique, qui
met à disposition de ses utilisateurs des instruments de microscopie uniques par leurs
performances en termes de sensibilité, de fonctionnalité et de précision. Ce sont en
général des prototypes qu’on ne retrouve pas sur une autre plate-forme. Développés
au laboratoire par des chercheurs, ils répondent aux besoins des chercheurs : super-
résolution, microscopie à force de traction, microscopie à corrélation de fluorescence,
optique adaptative, microscopie non linéaire, microscopie à force atomique.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 27
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Microscope bi-photonique droit de très grande étendues spectrale (680 – 1080 nm)
Microscope FCS et multi-FCS (488 et 637 nm)
Microscopes pour multi-FRAP, photoactivation/photoinactivation
Microscope confocal pour l'optique adaptative (561 nm)
Microscope pour la mesure de forces de traction
Microscope à force atomique couplé à un microscope inversé (en milieu liquide)
Microscopie ultra-sensible d’objets en milieux diffusants par rétro-diffusion à 1080 nm
Spectrofluorimètre Jobin-Yvon en absorption (250 – 1000 nm) et fluorescence (290 –
850 nm)
Micro-fabrication
CONDITIONS D’ACCES
Compte-tenu de l'axe développement de la plate-forme, nous privilégions les "prestations"
sous forme collaborative.
PRESTATIONS PROPOSEES
Imagerie ultra-sensible en milieu fortement diffusant
Optique adaptative
Imagerie profonde de tissus biologiques
Mesures de forces exercées par des cellules sur des substrats microstructurés
Mesure de mobilité et d’interactions moléculaires dans des cellules vivantes
Microscopie à force atomique ; mesure de l’adhérence et de la rhéologie
cellulaire
CLARA / Annuaire des plateformes 201428
MicroCell
Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire
DOMAINE D’EXPERTISE
Prestations et développement des applications innovantes en
microscopie de fluorescence, détection des mobilités et des
complexes moléculaires, cytomtrie de flux et tri cellulaire
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Alexei GRICHINE
Contact : alexei.grichine@ujf-grenoble.fr
 IAB, CRI-U823, Domaine de la Merci, Rond point de la
Chantourne, 38706, La Tronche
@ http://www-iab.ujf-grenoble.fr/plf_d.php?b=2&c=23&i=9
Appartenance : GDR 2588, RTmfm
Labellisation : GIS IBiSA, Imagerie Sciences du Vivant - In Vitro
(ISdV)
Effectif : 5
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Le plateau Micro-Cell IAB fait partie de la plate-forme grenobloise Imagerie Sciences
du Vivant (ISdV) de l’Université Joseph Fourier, labellisée par le GIS IBiSA. Il est
localisé au sein de l’Institut Albert Bonniot (IAB), Centre de Recherche Inserm/UJF
(U823). Les techniques de microscopie de fluorescence dans la cellule vivante sont le
cœur de métier de ce plateau. Nos points forts : microscopie confocale et
biphotonique, spectroscopie de fluorescence, développements technologiques et
méthodologiques, équipements de pointe, microscopies sur cellules vivantes.
MicroCell offre : prestations de services, mise à disposition d’équipements, formations
théoriques et pratiques, collaborations de recherche académique / industrielle.
THEMATIQUES
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 29
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Equipements d’imagerie
4 stations confocales (dont 2 spectrales) (LSM710, 510, Andromeda)
2 modules de spectroscopie à corrélation (Confocor2 ,3)
2 systèmes biphotoniques et FLIM (SPC830)
4 vidéomicroscopes inversés, motorisées
2 modules TIRF et FRAP
5 microscopes droits, motorisés
Equipements de cytometrie
2 analyseurs (LSR2, Accuri), 1 trieur (BD FACS Aria)
5 postes informatiques dédiés à l’analyse
Logiciels d’acquisition et d’analyse : MetaMorph, ZEN, AxioVision,
Volocity, SPCImage, SimFCS, Origin, DIVA
Equipements complémentaires accessibles : spectrophotomètre, spectrofluorimètres,
équipements de métrologie
Infrastructures spécifiques
100 m2
de surface dédiée à l'imagerie de fluorescence à bas niveau de lumière et
température stabilisée, équipement de culture cellulaire, salle d'analyse et traitement
des données
© IAB CRI U823, équipe 1
CONDITIONS D’ACCES
Tout laboratoire académique ou privé, accès via Floralis/UJF : Valentine PANEL - 04 56 00 60
42, responsable scientifique : Dr. Yves USSON - 04 56 52 00 74, responsable technique : Dr.
Alexeï GRICHINE - 04 76 54 94 89
PRESTATIONS PROPOSEES
Imagerie cellulaire multiparamétrique : migration cellulaire, localisation
subcellulaire, interactions in situ, dynamique moléculaire, photomanipulations
Microscopie confocale (3D, spectrale, ultrarapide, FRAP, FLIP, FRET,
photoactivation, anisotropie, imagerie en comptage de photons)
Spectroscopie à corrélation de fluorescence (FCS, FCCS, RICS)
Microscopie biphotonique (2PE, SHG, NIR-NIR, Spectroscopie d’excitation 2P)
Microscopie de fluorescence à onde évanescente TIRF et photo(in-)activation (CALI,
PA)
Optogénétique et photomanipulations multidimentionnelles en cellule vivante
Imagerie en durée de vie de fluorescence (TCSPC-FLIM, FAD)
Microscopie à épifluorescence et contrastes transmises, vidéomicroscopie
Imagerie 3D par illumination structurée
Traitement et analyse d’images et données spectrales
CLARA / Annuaire des plateformes 201430
NanOpTec
Centre de Nano-Opto-Technologies
DOMAINE D’EXPERTISE
Imagerie et spectroscopie de nanomatériaux et de milieux
biologiques (nanoparticules métalliques, nanoparticules
diélectriques dopées par des terres rares, molécules et
biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…)
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Pierre-François BREVET
Contact : pierre-francois.brevet@univ-lyon1.fr
 Centre NanOpTec, Dép. de Physique, 14 rue Enrico Fermi, Bât.
G. Lippmann, UCBL La DOUA, 69622, Villeurbanne
@ http://nanoptec.univ-lyon1.fr/
Appartenance : ORA - Pôle Optique Rhône-Alpes
RTmfm - Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle
LBI associé - Lyon Bio -Image
Effectif : environ 70, majoritairement des permanents de l'Institut
Lumière Matière (ILM)
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Les activité de la plateforme NanOpTec s’articulent autour de l'imagerie et la
spectroscopie de nanomatériaux et de milieux biologiques (nanoparticules
métalliques, nanoparticules diélectriques dopées par des terres rares, molécules et
biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…), notamment à l’échelle du nano-
objet unique ce qui constitue l’originalité des approches menées au Centre. Ces études
nécessitent en particulier le développement de nouvelles méthodes de microscopie
optique linéaire et non linéaire.
THEMATIQUES
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 31
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
AFM
Dispositifs de spectroscopie de nanoparticules uniques (absorption et diffusion)
Dispositif de spectroscopie SHG aux interfaces et de particules piégées
Microscope confocal achromatique
Microscope confocal multiphotonique (visible, biphoton, SHG, THG)
Microscope confocal SHG
Moyens biologiques
Les utilisateurs du centre NanOpTec apportent
leur propres échantillons (agrégats cellulaires,
tissus biologiques, ADN…).
CONDITIONS D’ACCES
Si vous souhaitez réaliser des mesures au Centre NanOpTec, la procédure consiste à en faire
la demande à son directeur.
PRESTATIONS PROPOSEES
Les activités de la plateforme s’appuient sur les équipes de recherche des
laboratoires fondateurs. Le Centre est aussi ouvert aux collaborations internes à
l’établissement et plus largement aux collaborations extérieures.
CLARA / Annuaire des plateformes 201432
OPTIMAL
Plateforme d'imagerie optique du petit animal
DOMAINE D’EXPERTISE
Oncologie, thérapie ciblée du cancer, drug delivery,
nanoparticules, angiogénèse
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Véronique JOSSERAND
Contact : veronique.josserand@ujf-grenoble.fr
 Institut Albert Bonniot, BP170 La Tronche
38042 Grenoble cedex 9
@ http://www.imagerie-grenoble.fr/
Appartenance : France Life Imaging
Labellisation : IbiSa
Effectif : 4
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Au sein de l’équipe «Thérapie ciblée, diagnostic précoce et imagerie du cancer»
dirigée par le Dr Jean-Luc Coll de l’INSERM U823, l’équipe OPTIMAL s’est développée
sous la direction du Dr Véronique Josserand pour promouvoir l’innovation
technologique et méthodologique dans le domaine de l’imagerie optique du petit
animal.
OPTIMAL permet à l'ensemble des chercheurs du monde académique ou industriel
d'avoir accès à des méthodes d'imagerie sophistiquées, sous la forme de projet
collaboratifs ou de prestations de service prises en charge par du personnel hautement
spécialisé.
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 33
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Imagerie de bioluminescence in vivo
Imagerie de fluorescence 2D in vivo en temps réel aux longueurs d’ondes de 480 à 800 nm
Imagerie FRET in vivo, imagerie de fluorescence 3D in vivo
Imagerie de fluorescence macroscopique à capacité de zoom de 1 à 1600x aux longueurs
d’ondes de 360 à 750 nm
Systèmes portatifs d’imagerie de fluorescence pour l’imagerie per opératoire des petits
et gros animaux
Imagerie microCT à haute résolution (<14 µm)
Tous nos instruments sont équipés de systèmes d’anesthésie gazeuse et de maintien de
température
CONDITIONS D’ACCES
Prestations de services personnalisées, mise à disposition d'équipements, conseils,
collaborations de recherche académiques / industrielles
PRESTATIONS PROPOSEES
Etudes pharmacocinétiques de biodistribution in vivo
Nombreuses lignées cancéreuses bioluminescentes
Développement à façon de lignées cancéreuses bioluminescentes
Nombreux modèles in vivo pour l’oncologie
Evaluation de l’efficacité thérapeutique de candidats anticancéreux
Imagerie de l’angiogénèse in vivo
Imagerie per opératoire en fluorescence temps réel
Evaluation de vecteurs pour la thérapie génique in vivo
Suivi d’infections bactériennes, virales ou fongiques in vivo
Moyens biologiques
Nombreuses lignées cellulaires cancéreuses murines ou
humaines exprimant la luciférase de façon stable.
Nombreux modèles animaux de cancers murins ou humains
implantés en sous cutané ou sur leur site naturel
(orthotopique) ou sur leur site métastatique
Infrastructures spécifiques
Animalerie agréée pour l'hébergement des souris (y compris
nudes et transgéniques) et des rats
Laboratoire de culture cellulaire
CLARA / Annuaire des plateformes 201434
PAVIRMA
Plateforme d'irradiation en Auvergne
DOMAINE D’EXPERTISE
Irradiateur X de petits echantillons pour de la recherche
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Serge ALZIARI
Contact : serge.alziari@univ-bpclermont.fr
 Campus des Cezeaux, 24 avenue des Landais, 63170, AUBIERE
@ http://start.univ-bpclermont.fr/rubrique17.html
Appartenance : UBP-START (structure de l’Université Blaise
Pascal)
Labellisation : ASN
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Equipé d’un irradiateur X (opérationnel) et d’un générateur neutron (en cours), il
permet de réaliser des irradiations de matériel biologique (cellules eucaryotes,
bactéries, petits animaux, végétaux, autres préparations biologiques…) et non
biologique (polymères, composants électroniques…).
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 35
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Dans sa première phase (Pavirma 1), elle est équipée d'un irradiateur à rayon X de
320KV, autoprotégé et pouvant délivrer jusqu'à 5KGy, avec un débit de dose max de
13Gy/min. La chambre d'irradiation (102x86x75cm) permet d'irradier des échantillons
de grande taille ou de petits animaux.
Moyens biologiques
Un "laboratoire de biologie", comprenant une hotte à flux laminaire, un incubateur à
CO2, une centrifugeuse, un bloc froid, deux microscopes (dont un inversé à contraste
de phase) et une paillasse équipée, complète l'équipement de cette plateforme.
CONDITIONS D’ACCES
Accès libre sur demande aupres du responsable de la plateforme
PRESTATIONS PROPOSEES
Irradiations X tariffées à l'heure, le prix de l'heure d'irradiation dépend de
l'appartenance du demandeur (EPST, Université, PME..)
CLARA / Annuaire des plateformes 201436
PIM Lyon Tech
Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech
DOMAINE D’EXPERTISE
IRM, optique, ultra-sons
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Denis GRENIER
Contact : denis.grenier@creatis.insa-lyon.fr
 Domaine scientifique de la Doua - CREATIS- 7 avenue Jean
Capelle, 69621, VILLEURBANNE
@ http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/
Appartenance : France Life Imaging
Labex PRIMES, Labex CELYA
Effectif : 4 ingénieurs, 1 technicien
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
PIM Lyon Tech est une plate-forme préclinique qui couvre un large domaine
d'applications :
- Tests non invasifs ex vivo ou in vivo
- Développements méthodologiques : imagerie et spectroscopie par résonance
magnétique, imagerie ultrasonore, imagerie optique
- Elastographie
- Imagerie haute résolution
- Imagerie anatomique, fonctionnelle
- Etudes de pathologies sur modèles animaux avec le suivi longitudinal associé
- Tests de compatibilité IRM de matériaux
THEMATIQUES
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 37
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
IRM : 4,7 T dédié au petit animal
US : 3 échographes
Optique : laser pulsé et échographe (photoacoustique), endoscope fibré, endoscope
rigide, spectromètre multicanaux, endomicroscope confocal fibré Cell-Vizio (MKT®)
Anesthésie gazeuse
Monitoring petit animal
Infrastructures spécifiques
Agrément pour l'utilisation d'animaux à des fins scientifiques : numéro A 69 266 1401
PRESTATIONS PROPOSEES
PIM Lyon Tech propose la réalisation de prestations d'imagerie en adéquation avec
la demande : organisation du protocole expérimental, acquisition et analyse des
résultats.
La plate-forme est équipée de matériels dédiés à l'expérimentation sur le petit
animal.
Les ingénieurs de la plate-forme sont habilités à expérimenter sur le petit animal.
La plate-forme dispose aussi d'un cluster de calcul et d'un accès à la grille de calcul
EGEE pour faciliter le traitement massif des donnés acquises.
CLARA / Annuaire des plateformes 201438
Radiograaff
Radiobiologie au Van de Graaff
DOMAINE D’EXPERTISE
Radiobiologie
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Michaël BEUVE
Contact : michael.beuve@univ-lyon1.fr
 IPNL, Campus de la Doua 4 Enrico Fermi, 69622, Villeurbanne
Appartenance :
Plateforme du LabEx PRIMES, de l'infrastructure nationale France
Hadron, du GdR MI2B / réseau RESPlaNDir
(http://www.mi2b.fr/spip.php?article30)
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Irradiation avec des protons de 3 MeV avec contrôle dosimétrique pour les études de
la réponse de cellules biologiques, de détecteurs, de films radiosensibles...
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 39
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Dose uniforme sur un disque de 2 cm de diamètre à +/- 3%, dose absolue à mieux que
+/- 5%, débit de dose < 10Gy/min
Enceinte thermostatée, porte échantillion automatisé
Laboratoire de cultures cellulaires avec materiel standard (PSM, surpression,
incubateurs, congélateurs, hotte chimique, microscope, compteur cellulaire...)
CONDITIONS D’ACCES
Tarifs selon prestation, signature d'une charte précisant les conditions d'accès
PRESTATIONS PROPOSEES
Irradiation de cellules en monocouche, de détecteurs, de films...
Accès à un laboratoire de cultures cellulaires
CLARA / Annuaire des plateformes 201440
X-Ray CERVO Lyon-Sud
Plateforme d'irradiation par rayons X
DOMAINE D’EXPERTISE
Radiobiologie, irradiations photoniques cellulaires et du petit
animal
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Claire RODRIGUEZ-LAFRASSE
Contact : claire.rodriguez@univ-lyon1.fr
 Plateforme CERVO - Faculté de Médecine Lyon-Sud, 69921,
Oullins cedex
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
L'irradiateur XRad 320 (PXI) est sous la responsabilité du Laboratoire de Radiobiologie
Cellulaire et Moléculaire (équipe 4 de l'EMR3738 - Pr C. Rodriguez-Lafrasse) qui
s'intéresse aux mécanismes de la radiorésistance tumorale et développe des
traitements adjuvants radiosensibilisants. Les irradiations photoïques sont réalisées
sur lignées cellulaires en culture et petit animal (souris, rats).
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 41
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Irradiateur XRad 320 (PXI)
Infrastructures spécifiques
Plateforme technologique CERVO Lyon-Sud
CONDITIONS D’ACCES
Contacter C. Rodriguez-Lafrasse par e-mail
PRESTATIONS PROPOSEES
Irradiations cellulaires et du petit animal
CLARA / Annuaire des plateformes 201442
Imagerie intégrée multimodalité
DOMAINE D’EXPERTISE
Cancérologie, radiopharmaceutique, ciblage, imagerie TEP petit
animal, imagerie TDM petit animal, scintigraphie, imagerie de
bioluminescence, imagerie de fluorescence, autoradiographie
digitale quantitative corps entier
INFORMATIONS GENERALES
Responsable de la plateforme : Elisabeth MIOT-NOIRAULT
Contact : elisabeth.noirault@inserm.fr
 UMR 990 INSERM/UdA, 63005, clermont Ferrand cédex
@ http://www.clermont-universite.fr/PLATE-FORME-D-IMAGERIE
Appartenance : INSERM/Université d'Auvergne
Effectif : 2 ETP
DESCRIPTION DE L’ACTIVITE
Les champs d'application concernent:
(i) les études scanner X de caractérisation anatomique et structurale (ex: mesure de
densité minérale osseuse), avec ou sans injection d'agent de contraste,
(ii) les études de biodistribution et pharamcocinétique de substances d'intérêt
(absorption, distribution, métabolisme, excrétion) tant in vivo qu'ex vivo apres
marquage radioactif ou fluorescent
(iii) le suivi longitudinal de pathologies évolutifs et de leur réponse à la thérapie, au
moyen de traceurs pertinents (croissance tumorale, prolifération, activité
métabolique glucidique, inflammation, remaniement osseux, cartilage, hypoxie,
MMP,...)
THEMATIQUE
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 43
EQUIPEMENTS DEDIES
Moyens techniques
Les équipements d'imagerie sont les suivants: (i) un système autoradiographique
quantitatif digital permettant l'analyse corps entier rat et souris (betaImager,
Biospace), (ii) deux têtes de détection de gamma camera permettant l'imagerie
scintigraphique gamma, plane et tomographique (gammaImager, Biospace), (iii) un
scanner X petit animal (Explore CT120, GE Healthcare), (iv) un imageur TEP petit animal
(ExploreVista, GE Healthcare), (v) un equipement d'imagerie optique permettant
l'imagerie 2D et 3D en bioluminescence et fluorescence in vivo (IvisSpectrum, Perkin
Elmer).
CONDITIONS D’ACCES
Les équipements sont ouverts à la communauté scientifique académique et aux sociétés
privées, sous forme de collaboration ou de prestations de services.
PRESTATIONS PROPOSEES
Située à l'UMR 990 iNSERM/UdA, le plateau d'imagerie intégrée multimodalité in
vivo a pour objectif d'offrir à la communauté scientifique des études "multi-
échelles", pouvant aller de la caractérisation tissulaire de l'échantillon, à
l'exploration fonctionnelle in vivo chez le petit animal. Les équipements de haute
technologie du plateau permettent de proposer, tant des approches structurales et
anatomiques à haute résolution (50 µm in vivo pour le scanner), que fonctionnelles
après administration de composés radiomarqués, fluorescents ou bien encore de
cellules bioluminescentes.
Moyens biologiques
Notre unité possède l'expertise nécessaire pour le développement de
modèles expérimentaux en cancérologie, tant in vitro (culture en 2 ou
3 dimensions telle que sphéroïdes), qu'in vivo (modèles de xénogreffes
ou orthotopiques). Les modèles qui sont développés en routine sont
principalement: le mélanome, le chondrosarcome, l'ostéosarcome, les
tumeurs mammaires, de colons, de prostate, de lymphome…
Infrastructures spécifiques
Notre unité dispose des infrastructures nécessaires à l'hébergement des
animaux (animalerie agrée), l'hébergement temporaire des animaux
pendant la durée de leur examen (armoires ventilées dédiées), y
compris pour les animaux ayant reçu une administration de traceur
radioactif (armoire ventilées plombées), les équipements nécessaires
au radiomarquage (enceintes blindées, automates de radiosynthèse),
les locaux nécessaires à la culture cellulaire et aux études de
pharmacologie.
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1
www.canceropole-clara.com
CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1
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Annuaire des Plateformes Imagerie et Irradiation Rhône-Alpes Auvergne - CLARA

  • 1. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1
  • 2. CLARA / Annuaire des plateformes 20142 INFORMATION Annuaire disponible en version électronique sur www.canceropole-clara.com/ressources Si vous souhaitez voir figurer votre plateforme dans l’annuaire en ligne, merci de nous contacter à infos@canceropole-clara.com
  • 3. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 3 4 ANIPATH - Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire 6 ANIPATH Clermont - Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal 8 CERMEP-imagerie du vivant - Centre d'Etude et de Recherche Multimodal et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant 10 CICS - Centre Imagerie Cellulaire Santé 12 CIQLE - Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est 14 Clinatec - Une plateforme technologique translationnelle multidisciplinaire 16 EMPLAT - Plateforme de Microscopie Electronique 18 GAIA - Plateforme d'imagerie nucléaire 20 IRMaGe - Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie 22 M4D - Imagerie Cellulaire 24 MEC - Plateforme de Microscopie électronique de la Cellule 26 MiBiop - Microscopie pour la Biophysique 28 MicroCell - Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire 30 NanOpTec - Centre de Nano-Opto-Technologies 32 OPTIMAL - Plateforme d'imagerie optique du petit animal 34 PAVIRMA - Plateforme d'irradiation en Auvergne 36 PIM Lyon Tech - Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech 38 Radiograaff - Radiobiologie au Van de Graaff 40 X-Ray CERVO Lyon-Sud - Plateforme d'irradiation par rayons X 42 Imagerie intégrée multimodalité Imagerie tissulaire Imagerie cellulaire Imagerie in-vivo Irradiation
  • 4. CLARA / Annuaire des plateformes 20144 ANIPATH Centre d’Histopathologie du Petit Animal de laboratoire DOMAINE D’EXPERTISE Imagerie cellulaire et tissulaire dédiée à l’étude des modèles animaux, histologie INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Jean-Yves SCOAZEC Contact : anipath@univ-lyon1.fr  Faculté de Médecine Lyon-Est (site Laennec), 7 Rue G. Paradin, 69372, Lyon cedex 08 @ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/liens/anipath.html Appartenance : European Mouse Pathology Workgroup Equipex PHENOCAN Effectif : 3 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE ANIPATH, née de la volonté commune de Rhône Alpes Genopole et de l'Université Claude Bernard Lyon 1, est aujourd’hui gérée par l’Université Claude Bernard Lyon 1. La plate-forme s’est initialement orientée vers le phénotypage et l’étude des animaux transgéniques, avant de diversifier progressivement son activité à une très large gamme de modèles animaux. THEMATIQUE
  • 5. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 5 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques La plate-forme fonctionne selon des standards de qualité professionnels et garantit la traçabilité des échantillons. Elle dispose d’équipements lui permettant de traiter des prélèvements cellulaires ou tissulaires, fixés ou congelés (microtome, cryostat, automate d’IHC). Elle est équipée d'outils d'imagerie tissulaire performants, incluant des microscopes conventionnels, un microscope à fluorescence, des systèmes de numérisation d’images et d'analyse morphométrique. Elle peut réaliser à façon des puces tissulaires (TMA), technique récente d’analyse à haut débit d’échantillons tissulaires. PRESTATIONS PROPOSEES Anipath est dotée d’un plateau technique et d’un personnel qualifié qui lui permettent de proposer des prestations diversifiées et complémentaires : - la réalisation de l’ensemble des techniques d’imagerie tissulaire appliquées à l’animal : histologie, histochimie, immunohistochimie, hybridation in situ - l’interprétation des résultats, en partenariat avec l'utilisateur, grâce au concours d'un réseau d'experts dans les différentes disciplines morphologiques - le conseil technique aux utilisateurs et l’aide à la réalisation de protocoles d’étude adaptés aux objectifs des chercheurs
  • 6. CLARA / Annuaire des plateformes 20146 ANIPATH Clermont Plateforme d'anatomo-pathologie du petit animal DOMAINE D’EXPERTISE Analyses anatomo-pathologiques, histologie, immunohistochimie et imagerie fond clair, fluorescence INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Pierre VAL Contact : pierre.val@univ-bpclermont.fr  Campus des Cézeaux, 24 avenue des Landais, 63171, Aubière @ https://www.gred-clermont.fr/directory/platform/en/anipath Appartenance : CNRS/INSERM/Université Blaise Pascal Effectif : 1 AI DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Le plateau technique permet de réaliser le traitement d'échantillons (inclusion paraffine/OCT), les coupes (paraffine/OCT), les colorations histologiques, l'immunohistochimie et l'hybridation in situ sur coupes et tissus entiers. La majorité des process (inclusion, IHC, HIS) est automatisée. Le plateau dispose également de matériel de microscopie permettant la dissection, l'observation et l'acquisition d'images en fond clair et fluorescence. Sont traités aujourd'hui des tissus murins, des plantes et des insectes. THEMATIQUE
  • 7. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 7 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Processeur de tissus STP120 Microm (déshydratation et passage dans la paraffine). Automate d'inclusion EC350 Microm (inclusion dans la paraffine). Deux microtomes HM340E Microm, un cryostat HM560 Microm. Colorateur HMS70. Automates IHC/HIS sur lames ou tissus entiers Intavis InSitu Pro VSi. Deux loupes binoculaires Leica MZ7.5 avec caméra Leica DFC500. Microscope Zeiss Axioplan 2 avec caméras couleur et N&B. Moyens biologiques Modèles animaux de physiopathologie prostatique, épididymaire, testiculaire et surrénalienne (souris transgéniques, KO et KI) Infrastructures spécifiques Animalerie agréée OGM (capacité 5000 animaux), plateau de transgenèse CONDITIONS D’ACCES Accès gratuit aux équipes du GReD, facturation pour équipes extérieures PRESTATIONS PROPOSEES Le plateau ne fournit pas de prestation. Il assure par contre la formation et l'encadrement d'utilisateurs potentiels. L'assistant ingénieur est disponible pour assurer le bon fonctionnement du plateau (approvisionnement, veille technologique) et la mise au point de protocoles. © Pierre Val
  • 8. CLARA / Annuaire des plateformes 20148 CERMEP-imagerie du vivant Centre d'Etude et de Recherche Multimodal et Pluridisciplinaire en imagerie du vivant DOMAINE D’EXPERTISE Imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et l'animal : TEP, IRM, MEG . Radio-chimie émetteurs de positons. INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Gérard GIMENEZ Contact : gimenez@cermep.fr  59 boulevard pinel, 69677, BRON Cedex @ www.cermep.fr Appartenance : FLI ( France Life Imaging ) Labellisation : ISO 9001, IBiSA ( infrastructures Biologie Santé Agronomie) Effectif : 28 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Mise en œuvre de protocoles d'imagerie in-vivo pour la recherche sur l'homme et l'animal. Techniques d'imagerie disponibles : TEP (tomographie par émission de positons), TDM (tomodensitométrie), TEP/IRM simultanée, IRM (résonance magnétique nucléaire), MEG (magnéto-encéphalographie) Développement et production de radio-traceurs émetteurs de positons Développement d'une R&D méthodologique en propre ou en partenariat avec des unités de recherche Ouvert sur la communauté scientifique académique et l'industrie THEMATIQUE
  • 9. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 9 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Cyclotron IBA 18 Mev Cyclone 18 / 9. Cellules blindées pour la production de radio- traceurs. Automates de synthèses de radio-traceurs. Système de contrôle qualité des radio-traceurs : HPLC, CPG Caméra TEP/CT SIEMENS BIOGRAPH 64 S IRM 1.5T Siemens Magnetom Sonata. IRM 3T Siemens Magnetom Prisma MEG CTF 275 MicroIRM BRUKER 7T . MicroTEP/CT Siemens Inveon . MicroCT Skyscan 1076 IRM/TEP Biograph mMR Infrastructures spécifiques Animalerie rongeurs, porcs, chats Laboratoire de production de radio-traceurs Laboratoire de radio-pharmacie CONDITIONS D’ACCES Aucune PRESTATIONS PROPOSEES Accompagnement administratif et scientifique au montage de protocole d'imagerie Développement de méthodes Réalisation des examens d'imagerie Accompagnement aux traitements des images. Production de radio-traceurs émetteurs de positons Hébergement d'animaux (rongeurs, porcs)
  • 10. CLARA / Annuaire des plateformes 201410 CICS Centre Imagerie Cellulaire Santé INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Philippe VAGO Contact : pvago@chu-clermontferrand.fr  Faculté de Médecine, 28 place Henri Dunant, 63000, Clermont Ferrand Appartenance : Université d'Auvergne Réseaux : RCCM, AFC Effectif : 3 ETP(1 IE, 2 Tech) DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Analyse en Microscopie Electronique en Transmission (MET) et en Microscopie Electronique à Balayage (MEB) : Etudes ultrastructurales pour des échantillons biologiques (tissus, cellules, ...) ou non biologiques (microparticules...) Immunolocalisation en MET Analyse en microscopie optique : Tissus, cellules, micro-organismes Immunomarquage (marqueurs enzymatiques ou fluorochromes) Analyse d’images : comptage, colocalisation... Analyse en cytométrie de flux Analyse en microdissection laser Préparation des échantillons pour les études en ME et en histologie DOMAINE D’EXPERTISE Microscopie électronique, Microscopie photonique, Cytométrie en flux, Microdissection laser THEMATIQUE
  • 11.       CLARA / Annuaire des plateformes 2014  11 © CICS EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Microscope Electronique en Transmission Hitachi H-7650 Microscope Electronique à Balayage Jeol 6060-Low Vacuum Microscopes Olympus + caméras (couleur, NB) + logiciel d’analyse d’images Metamorph Cytomètre en flux BD LSRII Microdissecteur Laser Arcturus Pixcell II AFS II, AMW, Ultramicrotome Leica pour la préparation des échantillons en ME. Automate à déshydratation et station à inclusion Microm Microtech, microtomes et cryostat Leica pour la préparation des échantillons en histologie CONDITIONS D’ACCES Ouvert à tous laboratoires publics ou privés PRESTATIONS PROPOSEES Prise en charge complète des projets en microscopies optique et électronique de la préparation des échantillons au rendu des résultats Expertise technique dans les domaines d’application Assistance et formation des utilisateurs Mise à disposition des équipements du CICS
  • 12. CLARA / Annuaire des plateformes 201412 CIQLE Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Ruth RIMOKH Contact : ruth.rimokh@lyon.unicancer.fr  Faculté de Médecine Lyon-Est, rue Guillaume Paradin, 69372, Lyon cedex 08 @ http://sfrsantelyonest.univ-lyon1.fr/plateau31-ciqle.html? Appartenance : GDR2588, RtMfm, RCCM, RECAMIA Labellisation : plateforme labellisée Ibisa au titre de membre fondateur de Lyon Bio-Image Effectif : 5 ETP (personnels statutaires) DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Le CIQLE est un centre commun de l’Université Claude Bernard de Lyon et une composante fondatrice de Lyon Bio-Image (Plateforme d'Imagerie Lyonnaise labellisée Ibisa). Sa mission est de mettre à la disposition des communautés académique et industrielle des équipements et des personnels permanents pour les assister dans l’utilisation des appareils, pour préparer leurs échantillons et pour mettre en place des protocoles dans les domaines de la microscopie électronique, photonique et traitement d'images. A ces fins, l’UCBL et l’Inserm y affectent des personnels. L’achat des équipements est co-financé (Inserm, CNRS, HCL, UCBL, SFR, Fondations, Associations, fonds propres) sous la coordination de la SFR Santé Lyon-Est, qui est une Unité Mixte de Service labellisée Inserm, CNRS et UCBL. L'entretien des équipements est assuré par la facturation des prestations. THEMATIQUE DOMAINE D’EXPERTISE Microscopie électronique, microscopie photonique (vidéomicroscopie, confocal mono et bi-photon, super-résolution et microinjection cellulaire). Formation, assistance. Expertise et prestation en traitement d'images
  • 13. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 13 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Microscopie électronique : MET Jeol 1400 120 kV, avec caméras numériques et détecteur EDS, robot de cryosubstitution, ultramicrotomes, contrasteur de grille automatisée, système informatisé de suivi des échantillons (logiciel TRACEMET développé en interne). Microscopie photonique : confocal LSM 780 Zeiss mono et multi- photon avec contrôle environnemental, confocal SP5 X laser blanc Leica avec détecteur hybride, STORM haute-résolution Nikon, stations de vidéomicroscopie (Biostation Nikon, axiovert 200-M), logiciels de traitement et de reconsctrucion d'image (ImageJ, Imaris, Amira) Infrastructures spécifiques Plateforme installée sur 3 sites : site Laennec 180 m², site Rockefeller 180 m², site Centre Léon Bérard 30 m²) CONDITIONS D’ACCES Ouvert aux structures académiques, universitaires et industrielles. La réservation des équipements se fait sur le site internet. Les tarifs sont disponibles sur le site internet. PRESTATIONS PROPOSEES Microscopie électronique : prestation complète de l'échantillon à l'image en ultrastructure conventionnelle, immunogold sur cellules, tissus, bactéries, virus, pseudoparticule. Assistance pour l'acquisition, la lecture et l'interprétation des images. Microscopie photonique : formation, assistance et expertise dans les domaines de la microscopie plein champ, confocale et haute-résolution. Traitement d'image : formation, conseil et mise en place de protocole de traitements d'images.
  • 14. CLARA / Annuaire des plateformes 201414 THEMATIQUES Clinatec Clinatec: une plateforme technologique translationnelle multidisciplinaire INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : François BERGER Contact : francois.berger@chu-grenoble.fr  CLINATEC CEA LETI 17 rue des Martyrs, 38054, GRENOBLE cedex 09 @ http://issuu.com/co-influence/docs/plaquette-clinatec-ps Appartenance : Centre Hospitalier Universitaire de GRENOBLE INSERM UA 01 GDR Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant et Microscopie fonctionelle du vivant Labellisation : FLI, IBISA DESCRIPTION DE L’ACTIVITE CLINATEC est un centre de recherche technologique translationnel associant le CHU de Grenoble, l’INSERM, l’UJF et le CEA-LETI. Sa mission est d’accélérer le transfert de l’innovation technologique au lit du patient dans les meilleures conditions de sécurité. Sa spécificité est dans son domaine de recherche clinique lié aux pathologies neurologiques (neurodégénératifs, handicap et cancer) et dans l’utilisation des micro- nanotechnologies et de l’électronique pour la santé, expliquant sa localisation sur le campus MINATEC. Clinatec est aussi un hôtel à projet ouvert aux industriels et aux chercheurs dans d’autres domaines d’activité qui pourraient bénéficier de ses compétences et de sa plateforme. THEMATIQUE DOMAINE D’EXPERTISE Unité préclinique et clinique pour la validation des dispositifs médicaux innovants participant au développement sécurisé et accéléré de solutions technologiques nouvelles au service des patients, micro-nanosystemes et électronique pour la santé, biomarqueurs
  • 15. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 15 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Secteur clinique: IRM diagnostique et per op 1,5 tesla (première IRM interventionnelle en France), robot chirurgical Medtech, SPECT-CT, MEG, micro-endoscopie confocale (CellVizio), Fluobeam, microscopie de fluorescence interventionelle Secteur préclinique (animalerie): IRM wide bore 4.7 T, microscopie et endoscopie intravitale Un PACS (Picture Archiving and Communication System) centralise l’ensemble des données de l’imagerie Secteur biologie : plateforme Affymetrix, Ion torrent, PCR digital, chaine d’analyse de spectrométrie de masse, imagerie MS, « sample prep » automatisé Moyens biologiques Sérothèque, tumorothèque cerveau et tumeurs cérébrales incluant des ressources cellulaires et moléculaires associées, plusieurs modeles animaux de gliomes chez souris, rats, primates et porcs Infrastructures spécifiques Bloc opératoire et secteur clinique dédié, animalerie avec bloc opératoire et imagerie multimodale (IRM, X, optique) intégrée, laboratoire de culture cellulaire L2 COMMENTAIRES Cette plateforme est animée par une équipe dont les compétences sont dans le domaine de la neuro-oncologie. Cependant elle fonctionne aussi en hôtel à projet et accueille dès à présent des projets pour d'autres organes. Les coordinateurs cliniques apportent les compétences spécifiques et la structure ses compétences méthodologiques. CONDITIONS D’ACCES Comité scientifique PRESTATIONS PROPOSEES CLINATEC est destiné à la validation de preuves de concept précoces dans le domaine des micro-nano-systèmes pour la santé particulièrement en cancérologie. Nous mettons à disposition : 1) un comité de concertation technologique translationnel pour guider le plus tôt possible le dépôt de dossier de recherche clinique auprès des autorités réglementaires 2) Une équipe multidisciplinaire médicale et paramédicale, intégrant ingénieurs, biologistes, mathématiciens 3) une PTF préclinique (modèles gros animaux) 4) une PTF d’imagerie multimodale et interventionnelle 5) une PTF biomarqueur 6) Un secteur clinique dédié à des essais de recherche biomédicale. Son activité inclut des consultations, de l'hospitalisation de jour et de l'hospitalisation complète. Après ces premiers essais sur 5 à 10 patients qui sont la spécificité de clinatec ; le rôle de l'équipe est aussi d'assurer la dissémination de la technologie dans un environnement hospitalier courant et la formation des personnels de santé.
  • 16. CLARA / Annuaire des plateformes 201416 DOMAINE D’EXPERTISE Microscopie électronique, cryo-microscopie électronique, microscopie électronique cellulaire, contrôle qualité, particules isolées INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Guy SCHOEHN Contact : guy.schoehn@ibs.fr  IBS 71 Avenue des Martyrs CS 10090, 38044, Grenoble Cedex 9 @ http://www.ibs.fr/groupes/groupe-microscopie-electronique- et/plateforme-de-microscopie/ Appartenance : UMS3518, Partnership for Structural Biology, INSTRUCT Labellisation : Certification ISO9001 Effectif : 6 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE La plateforme propose trois types de prestations : contrôle qualité (coloration négative), cryo-microscopie électronique et microscopie électronique cellulaire. La plateforme propose également la mise à disposition de ses équipements. Des collaborations scientifiques peuvent être mises en place pour répondre à des demandes précises nécessitant des développements spécifiques. THEMATIQUE EMPLAT Plateforme de Microscopie Electronique
  • 17. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 17 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques La plateforme possède 3 microscopes électronique (FEI Tecnai12 120 kV, FEI Tecnai F20 200kV FEG, FEI Tecnai POLARA 300 kV FEG). Les deux derniers microscopes fonctionnent en mode cryo et le Polara sera équipé d'une caméra à détection directe d'électrons dans les mois qui viennent. Plusieurs instruments associés aux microscopes sont également disponibles (évaporateur de carbone, appareil de Glow-Discharge, FEI Vitrobot, scanner d'images haute résolution). Pour la préparation d'échantillons cellulaires, la plateforme possède un automate de cryo-fixation sous haute pression (Leica EM-HPM100), un automate de cryo-préparation (Leica EM-AFS2 + Em-FSP), un (cryo-)ultra-microtome (Leica EM-UC7 + EM-FC7) et un automate d'immuno-marquage (Leica EM-IGL). COMMENTAIRES La plateforme fait partie de l'Unité Mixte de Service UMS3518 mais est localisée à l'IBS Pour nous contacter : ibs-plateforme- em.contact@ibs.fr CONDITIONS D’ACCES Les services de la plateforme sont soumis à facturation. Les échantillons doivent respecter le niveau de sécurité L1 ou L2 et être conformes à la déclaration OGM correspondante. PRESTATIONS PROPOSEES Contrôle qualité (vérification de l'homogénéité d'un échantillon, détermination de l'état d'oligomérisation de certaines protéines, analyse d'images et reconstruction tridimensionnelle de complexes protéiques). Cryo-microscopie électronique (technique permettant d'observer des échantillons biologiques dans leur état natif, analyse d'images et reconstruction tridimensionnelle de complexes protéiques). Tomographie électronique. Microscopie électronique cellulaire (études morphologiques cellulaires/bactériennes, localisation de protéines au niveau sub- cellulaire). La plateforme propose également la mise à disposition de ses équipements sous certaines conditions.
  • 18. CLARA / Annuaire des plateformes 201418 GAIA Plateforme d'imagerie nucléaire DOMAINE D’EXPERTISE Oncologie, métabolisme, neuroscience, cardiologie, imagerie TEP, imagerie SPECT, imagerie CT, échographie INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Catherine GHEZZI Contact : catherine.ghezzi@chu-grenoble.fr  CHU Grenoble Rond point de la Chantourne, 38100, Grenoble @ http://www.imagerie-grenoble.fr/ Appartenance : France Life Imaging Labellisation : IbiSa DESCRIPTION DE L’ACTIVITE GAIA est localisé au sein de l'UMR 1039 qui regroupe le Laboratoire Radiopharmaceutique Biocliniques (LRB) et la clinique de Médecine Nucléaire du CHU de Grenoble. Cette unité développe depuis plus de 25 ans des radiopharmaceutiques, molécules marquées par des atomes radioactifs et utilisées pour le diagnostic et la thérapie. Les compétences développées sur la plateforme vont du marquage radioactif de composés aux études précliniques et cliniques. THEMATIQUE
  • 19. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 19 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Caméra SPECT/CT Bioscan Caméra PET/CT Bioscan Caméra Cliniques SPECT et TEP Echographe Vevo Autoradiographie Infrastructures spécifiques Plateforme animalerie : petits et gros animaux, animalerie agrémentée, microchirurgie Radiochimie : radio-HPLC, radio-CCM, activimètres, compteurs Gamma et Bêta CONDITIONS D’ACCES Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils/expertise, collaborations de recherche académiques / industrielles PRESTATIONS PROPOSEES Radiomarquage de divers composés (molécules organiques, protéines, anticorps, sucres, peptides, bactéries, ADN, ARN, cellules,…) Evaluation in vivo de la pharmacocinétique et de la biodistribution d'une molécule d'intérêt pharmaceutique Evaluation de l'efficacité thérapeutique de composés d'intérêt (tumeur, ischémie, métabolisme,...) Etude de phénommènes biologiques chez l'animal en utilisant des radiotraceurs existants (suivi de croissance tumorale, mesures de perfusion cérébrale ou cardiaque, ou encore études métaboliques) Validation de modèles animaux
  • 20. CLARA / Annuaire des plateformes 201420 IRMaGe Plateforme spécialisée en IRM et neurophysiologie DOMAINE D’EXPERTISE IRM, neuroimagerie, explorations fonctionnelles (EEG, TMS, NIRS) et métaboliques, imagerie fonctionnelle de la vascularisation INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Chantal REMY Contact : chantal.remy@ujf-grenoble.fr  Bâtiment Edmond J. Safra, Université Joseph Fourier - Site Santé, Chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche @ https://irmage.ujf-grenoble.fr/accueil?destination=node/850 Appartenance : France Life Imaging Labellisation : IbiSa DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Spécialisée en neuroimagerie et explorations fonctionnelles associées, IRMaGe est le partenaire idéal pour accompagner des projets de recherche sur petit animal et primate non humain, des projets de recherche à visée clinique ou cognitive, mais également pour le développement méthodologique d'imagerie et de spectroscopie RMN ou neurophysiologie. Dans le contexte de la cancérologie, peuvent être réalisés, pour des études pharmacologiques, des suivis longitudinaux du volume tumoral, des œdèmes, du métabolisme, de la vascularisation et de l'angiogenèse sur des modèles orthotopiques ou sous-cutanés (rat ou souris) ou chez l'homme. THEMATIQUE
  • 21. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 21 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques 3 IRMs petit animal : 4,7 T, 7,0 T et 9,4 T (rat, souris) - monitoring physiologique 2 IRMs corps entier : 3T 3 EEGs (électro-encéphalographie) haute résolution, compatibles TMS et IRM TMS (stimulation magnétique transcrânienne) neuronaviguée et robotisée Appareil de spectroscopie proche infra-rouge (NIRS) Enregistrements multi-unitaires Coordination possible pour imagerie multimodale (IRM, optique, nucléaire) Moyens biologiques Modèles de tumeurs cérébrales Infrastructures spécifiques Accès à une plateforme d'animalerie : souris, rats, primates Animalerie agréée ISO9001 Salles de microchirurgie COMMENTAIRES Lemasson B et al., NMR in Biomedicine 2011; 24:473-482. Lux F et al., Angewandte Chemie int Ed Engl, 2011, 50: 12299 –12303. Coquery N et al., PLoS ONE, 2012; 7:e40567 Lemasson B et al, Radiology. 2012; 265:743-752. Bouchet et al., Radiother Oncol. 2013; 108:143-148. CONDITIONS D’ACCES Prestations de services, mise à disposition d'équipements, conseils, collaborations de recherche académiques / industrielles PRESTATIONS PROPOSEES Développement méthodologiques (animal, homme) Phénotypage de souris transgéniques Suivi de l'évolution de pathologies (animal, homme) Études pharmacologiques (animal, homme) Evaluation de l'efficacité de nouveaux traitements (animal, homme) Imagerie cellulaire et moléculaire (animal) Évaluation de nouveaux agents de contraste (animal) Recherche cognitive (homme) Exploration fonctionnelles cérébrales (homme) Evaluation de la compatibilité RMN de matériaux Etude d'échantillons tissulaires à haute résolution
  • 22. CLARA / Annuaire des plateformes 201422 M4D Imagerie Cellulaire DOMAINE D’EXPERTISE Vidéo microscopie, microscopie confocale, cytométrie en flux INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Jean-Philippe KLEMAN Contact : jean-philippe.kleman@ibs.fr  IBS UMR 5075 (CNRS CEA UJF)- Campus EPN - 71 avenue des Martyrs, 38044, Grenoble Cedex 9 @ http://www.ibs.fr/plates-formes/autres-instruments-et/imagerie- cellulaire/ Appartenance : Integrated Structural Biology - Grenoble UMS 3518 (CNRS CEA UJF EMBL) French Integrated Structural Biology network (FrisBi) - IBISA Plateforme de Biologie Structurale - Grenoble Labellisation : ISO 9001:2008 LRQA du 3 juillet 2011 Effectif : 3 permanents DESCRIPTION DE L’ACTIVITE La plate-forme accueille les utilisateurs dans un environnement de niveau L2 (pièce de culture dédiée). Nous mettons à disposition nos microscopes (vidéomicroscope et confocal à roue de Nipkow - Olympus Perkin-Elmer et Andor) optimisés pour l'étude de cellules vivantes. Nous sommes également équipés d'un cytomètre en flux (Miltenyi Biotech) capable de mesurer les fluorescences de 8 canaux simultanément, compatibles avec l'étude des protéines fluorescentes (Ex. 405, 488 et 561nm). THEMATIQUE
  • 23. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 23 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Vidéo-microscope inversé à épifluorescence motorisé, chambre d'incubation, Z-piezo, 4 canaux fluo, DIC, 20X 40X et 60X, acquisition CCD Microscope confocal inversé motorisé à roue de Nipkow, chambre d'incubation, CO2, Z-piezo, 6 canaux fluo, DIC, 20X 40X 60X et 100X, acquisition dual EMCCD, module FRAP/PA Cytomètre en flux : 3 lasers, 8 canaux fluo, échantillonneur robotisé Infrastructures spécifiques Pièce de culture L2 dédiée Ordinateurs permettant le traitement des données Légende : acquisition confocale (60x NA 1,42; EMCCD iXon Ultra - Andor; Z=44x0,28µm) cellules NIH-3T3 exprimant HA-Survivine (Rouge) et transfectées par une construction GFP du transporteur membranaire AIT (vert). ADN (Bleu, DAPI). © F. Lacroix – IBS CONDITIONS D’ACCES Formation obligatoire et inscription sur le calendrier des réservations PRESTATIONS PROPOSEES Nos instruments sont mis à disposition des utilisateurs après une formation obligatoire dispensée par nos soins sur l'instrument concerné. Les utilisateurs sont également formés pour l'utilisation des logiciels d'acquisition et de traitement des données. Des ordinateurs pour le traitement sont mis à disposition. L'accès est possible après réservation du matériel (calendrier).
  • 24. CLARA / Annuaire des plateformes 201424 MEC Plateforme de Microscopie Electronique de la Cellule DOMAINE D’EXPERTISE Neurosciences, oncologie, vascularisation, spermatozoides, ovaires INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Karin PERNET-GALLAY Contact : karin.pernet-gallay@ujf-grenoble.fr  Grenoble Institut des Neurosciences chemin Fortuné Ferrini, 38700, La Tronche @ neurosciences.ujf-grenoble.fr/ Appartenance : INSERM U836 Université Jopseph Fourier Labellisation : plateforme Ibisa Effectif : 2 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Inclusion Epon pour études morphololgiques Immunomarquage à l'or sur des cryosections pour l'immunolocalisation de protéines THEMATIQUES
  • 25. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 25 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX) Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica) Appareil de congélation haute Pression (HPM100, Leica) Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica) Infrastructures spécifiques Laboratoire pour l'inclusion Local pour la coupe et la préparation cryo des échantillons Pièce pour le microscope électronique CONDITIONS D’ACCES Facturation à l'heure PRESTATIONS PROPOSEES Mise à disposition Microscope électronique à transmission (JEOL 1200 EX) Ultra-(cryo)-microtome (Ultracut S, Leica) Appareil de congélation haute pression (HPM100, Leica) Appareil de cryosubstitution (AFS2 Leica) Mesures morphométriques (iTEM, Olympus) Inclusion Epon pour analyse morphologique Méthode de Tokuyasu pour immunomarquage
  • 26. CLARA / Annuaire des plateformes 201426 MiBiop Microscopie pour la Biophysique DOMAINE D’EXPERTISE Microscopie à forces de traction, imagerie ultra-sensible en milieu diffusant, mesure de mobilité moléculaire, optique adaptative, microscopie à force atomique, biophysique INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Antoine DELON Contact : antoine.delon@ujf-grenoble.fr  140, rue de la physique - Université Joseph Fourier - Domaine universitaire, 38402, Saint Martin d'Hères Cedex 9 Appartenance : Laboratoire Interdisciplinaire de Physique (LIPhy) UJF (Université de Grenoble 1) et CNRS GDR 2588 (Microscopie fonvtionnelle du vivant) Effectif : Environ 110 pers. (non permanents compris) DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Le plateau MiBiop est un lieu de développement instrumental et méthodologique, qui met à disposition de ses utilisateurs des instruments de microscopie uniques par leurs performances en termes de sensibilité, de fonctionnalité et de précision. Ce sont en général des prototypes qu’on ne retrouve pas sur une autre plate-forme. Développés au laboratoire par des chercheurs, ils répondent aux besoins des chercheurs : super- résolution, microscopie à force de traction, microscopie à corrélation de fluorescence, optique adaptative, microscopie non linéaire, microscopie à force atomique. THEMATIQUE
  • 27. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 27 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Microscope bi-photonique droit de très grande étendues spectrale (680 – 1080 nm) Microscope FCS et multi-FCS (488 et 637 nm) Microscopes pour multi-FRAP, photoactivation/photoinactivation Microscope confocal pour l'optique adaptative (561 nm) Microscope pour la mesure de forces de traction Microscope à force atomique couplé à un microscope inversé (en milieu liquide) Microscopie ultra-sensible d’objets en milieux diffusants par rétro-diffusion à 1080 nm Spectrofluorimètre Jobin-Yvon en absorption (250 – 1000 nm) et fluorescence (290 – 850 nm) Micro-fabrication CONDITIONS D’ACCES Compte-tenu de l'axe développement de la plate-forme, nous privilégions les "prestations" sous forme collaborative. PRESTATIONS PROPOSEES Imagerie ultra-sensible en milieu fortement diffusant Optique adaptative Imagerie profonde de tissus biologiques Mesures de forces exercées par des cellules sur des substrats microstructurés Mesure de mobilité et d’interactions moléculaires dans des cellules vivantes Microscopie à force atomique ; mesure de l’adhérence et de la rhéologie cellulaire
  • 28. CLARA / Annuaire des plateformes 201428 MicroCell Microscopie Photonique - Imagerie Cellulaire DOMAINE D’EXPERTISE Prestations et développement des applications innovantes en microscopie de fluorescence, détection des mobilités et des complexes moléculaires, cytomtrie de flux et tri cellulaire INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Alexei GRICHINE Contact : alexei.grichine@ujf-grenoble.fr  IAB, CRI-U823, Domaine de la Merci, Rond point de la Chantourne, 38706, La Tronche @ http://www-iab.ujf-grenoble.fr/plf_d.php?b=2&c=23&i=9 Appartenance : GDR 2588, RTmfm Labellisation : GIS IBiSA, Imagerie Sciences du Vivant - In Vitro (ISdV) Effectif : 5 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Le plateau Micro-Cell IAB fait partie de la plate-forme grenobloise Imagerie Sciences du Vivant (ISdV) de l’Université Joseph Fourier, labellisée par le GIS IBiSA. Il est localisé au sein de l’Institut Albert Bonniot (IAB), Centre de Recherche Inserm/UJF (U823). Les techniques de microscopie de fluorescence dans la cellule vivante sont le cœur de métier de ce plateau. Nos points forts : microscopie confocale et biphotonique, spectroscopie de fluorescence, développements technologiques et méthodologiques, équipements de pointe, microscopies sur cellules vivantes. MicroCell offre : prestations de services, mise à disposition d’équipements, formations théoriques et pratiques, collaborations de recherche académique / industrielle. THEMATIQUES
  • 29. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 29 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Equipements d’imagerie 4 stations confocales (dont 2 spectrales) (LSM710, 510, Andromeda) 2 modules de spectroscopie à corrélation (Confocor2 ,3) 2 systèmes biphotoniques et FLIM (SPC830) 4 vidéomicroscopes inversés, motorisées 2 modules TIRF et FRAP 5 microscopes droits, motorisés Equipements de cytometrie 2 analyseurs (LSR2, Accuri), 1 trieur (BD FACS Aria) 5 postes informatiques dédiés à l’analyse Logiciels d’acquisition et d’analyse : MetaMorph, ZEN, AxioVision, Volocity, SPCImage, SimFCS, Origin, DIVA Equipements complémentaires accessibles : spectrophotomètre, spectrofluorimètres, équipements de métrologie Infrastructures spécifiques 100 m2 de surface dédiée à l'imagerie de fluorescence à bas niveau de lumière et température stabilisée, équipement de culture cellulaire, salle d'analyse et traitement des données © IAB CRI U823, équipe 1 CONDITIONS D’ACCES Tout laboratoire académique ou privé, accès via Floralis/UJF : Valentine PANEL - 04 56 00 60 42, responsable scientifique : Dr. Yves USSON - 04 56 52 00 74, responsable technique : Dr. Alexeï GRICHINE - 04 76 54 94 89 PRESTATIONS PROPOSEES Imagerie cellulaire multiparamétrique : migration cellulaire, localisation subcellulaire, interactions in situ, dynamique moléculaire, photomanipulations Microscopie confocale (3D, spectrale, ultrarapide, FRAP, FLIP, FRET, photoactivation, anisotropie, imagerie en comptage de photons) Spectroscopie à corrélation de fluorescence (FCS, FCCS, RICS) Microscopie biphotonique (2PE, SHG, NIR-NIR, Spectroscopie d’excitation 2P) Microscopie de fluorescence à onde évanescente TIRF et photo(in-)activation (CALI, PA) Optogénétique et photomanipulations multidimentionnelles en cellule vivante Imagerie en durée de vie de fluorescence (TCSPC-FLIM, FAD) Microscopie à épifluorescence et contrastes transmises, vidéomicroscopie Imagerie 3D par illumination structurée Traitement et analyse d’images et données spectrales
  • 30. CLARA / Annuaire des plateformes 201430 NanOpTec Centre de Nano-Opto-Technologies DOMAINE D’EXPERTISE Imagerie et spectroscopie de nanomatériaux et de milieux biologiques (nanoparticules métalliques, nanoparticules diélectriques dopées par des terres rares, molécules et biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…) INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Pierre-François BREVET Contact : pierre-francois.brevet@univ-lyon1.fr  Centre NanOpTec, Dép. de Physique, 14 rue Enrico Fermi, Bât. G. Lippmann, UCBL La DOUA, 69622, Villeurbanne @ http://nanoptec.univ-lyon1.fr/ Appartenance : ORA - Pôle Optique Rhône-Alpes RTmfm - Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle LBI associé - Lyon Bio -Image Effectif : environ 70, majoritairement des permanents de l'Institut Lumière Matière (ILM) DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Les activité de la plateforme NanOpTec s’articulent autour de l'imagerie et la spectroscopie de nanomatériaux et de milieux biologiques (nanoparticules métalliques, nanoparticules diélectriques dopées par des terres rares, molécules et biomolécules, interfaces, membranes cellulaires,…), notamment à l’échelle du nano- objet unique ce qui constitue l’originalité des approches menées au Centre. Ces études nécessitent en particulier le développement de nouvelles méthodes de microscopie optique linéaire et non linéaire. THEMATIQUES
  • 31. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 31 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques AFM Dispositifs de spectroscopie de nanoparticules uniques (absorption et diffusion) Dispositif de spectroscopie SHG aux interfaces et de particules piégées Microscope confocal achromatique Microscope confocal multiphotonique (visible, biphoton, SHG, THG) Microscope confocal SHG Moyens biologiques Les utilisateurs du centre NanOpTec apportent leur propres échantillons (agrégats cellulaires, tissus biologiques, ADN…). CONDITIONS D’ACCES Si vous souhaitez réaliser des mesures au Centre NanOpTec, la procédure consiste à en faire la demande à son directeur. PRESTATIONS PROPOSEES Les activités de la plateforme s’appuient sur les équipes de recherche des laboratoires fondateurs. Le Centre est aussi ouvert aux collaborations internes à l’établissement et plus largement aux collaborations extérieures.
  • 32. CLARA / Annuaire des plateformes 201432 OPTIMAL Plateforme d'imagerie optique du petit animal DOMAINE D’EXPERTISE Oncologie, thérapie ciblée du cancer, drug delivery, nanoparticules, angiogénèse INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Véronique JOSSERAND Contact : veronique.josserand@ujf-grenoble.fr  Institut Albert Bonniot, BP170 La Tronche 38042 Grenoble cedex 9 @ http://www.imagerie-grenoble.fr/ Appartenance : France Life Imaging Labellisation : IbiSa Effectif : 4 DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Au sein de l’équipe «Thérapie ciblée, diagnostic précoce et imagerie du cancer» dirigée par le Dr Jean-Luc Coll de l’INSERM U823, l’équipe OPTIMAL s’est développée sous la direction du Dr Véronique Josserand pour promouvoir l’innovation technologique et méthodologique dans le domaine de l’imagerie optique du petit animal. OPTIMAL permet à l'ensemble des chercheurs du monde académique ou industriel d'avoir accès à des méthodes d'imagerie sophistiquées, sous la forme de projet collaboratifs ou de prestations de service prises en charge par du personnel hautement spécialisé. THEMATIQUE
  • 33. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 33 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Imagerie de bioluminescence in vivo Imagerie de fluorescence 2D in vivo en temps réel aux longueurs d’ondes de 480 à 800 nm Imagerie FRET in vivo, imagerie de fluorescence 3D in vivo Imagerie de fluorescence macroscopique à capacité de zoom de 1 à 1600x aux longueurs d’ondes de 360 à 750 nm Systèmes portatifs d’imagerie de fluorescence pour l’imagerie per opératoire des petits et gros animaux Imagerie microCT à haute résolution (<14 µm) Tous nos instruments sont équipés de systèmes d’anesthésie gazeuse et de maintien de température CONDITIONS D’ACCES Prestations de services personnalisées, mise à disposition d'équipements, conseils, collaborations de recherche académiques / industrielles PRESTATIONS PROPOSEES Etudes pharmacocinétiques de biodistribution in vivo Nombreuses lignées cancéreuses bioluminescentes Développement à façon de lignées cancéreuses bioluminescentes Nombreux modèles in vivo pour l’oncologie Evaluation de l’efficacité thérapeutique de candidats anticancéreux Imagerie de l’angiogénèse in vivo Imagerie per opératoire en fluorescence temps réel Evaluation de vecteurs pour la thérapie génique in vivo Suivi d’infections bactériennes, virales ou fongiques in vivo Moyens biologiques Nombreuses lignées cellulaires cancéreuses murines ou humaines exprimant la luciférase de façon stable. Nombreux modèles animaux de cancers murins ou humains implantés en sous cutané ou sur leur site naturel (orthotopique) ou sur leur site métastatique Infrastructures spécifiques Animalerie agréée pour l'hébergement des souris (y compris nudes et transgéniques) et des rats Laboratoire de culture cellulaire
  • 34. CLARA / Annuaire des plateformes 201434 PAVIRMA Plateforme d'irradiation en Auvergne DOMAINE D’EXPERTISE Irradiateur X de petits echantillons pour de la recherche INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Serge ALZIARI Contact : serge.alziari@univ-bpclermont.fr  Campus des Cezeaux, 24 avenue des Landais, 63170, AUBIERE @ http://start.univ-bpclermont.fr/rubrique17.html Appartenance : UBP-START (structure de l’Université Blaise Pascal) Labellisation : ASN DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Equipé d’un irradiateur X (opérationnel) et d’un générateur neutron (en cours), il permet de réaliser des irradiations de matériel biologique (cellules eucaryotes, bactéries, petits animaux, végétaux, autres préparations biologiques…) et non biologique (polymères, composants électroniques…). THEMATIQUE
  • 35. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 35 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Dans sa première phase (Pavirma 1), elle est équipée d'un irradiateur à rayon X de 320KV, autoprotégé et pouvant délivrer jusqu'à 5KGy, avec un débit de dose max de 13Gy/min. La chambre d'irradiation (102x86x75cm) permet d'irradier des échantillons de grande taille ou de petits animaux. Moyens biologiques Un "laboratoire de biologie", comprenant une hotte à flux laminaire, un incubateur à CO2, une centrifugeuse, un bloc froid, deux microscopes (dont un inversé à contraste de phase) et une paillasse équipée, complète l'équipement de cette plateforme. CONDITIONS D’ACCES Accès libre sur demande aupres du responsable de la plateforme PRESTATIONS PROPOSEES Irradiations X tariffées à l'heure, le prix de l'heure d'irradiation dépend de l'appartenance du demandeur (EPST, Université, PME..)
  • 36. CLARA / Annuaire des plateformes 201436 PIM Lyon Tech Plateforme d'Imagerie Multimodale Lyon Tech DOMAINE D’EXPERTISE IRM, optique, ultra-sons INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Denis GRENIER Contact : denis.grenier@creatis.insa-lyon.fr  Domaine scientifique de la Doua - CREATIS- 7 avenue Jean Capelle, 69621, VILLEURBANNE @ http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/ Appartenance : France Life Imaging Labex PRIMES, Labex CELYA Effectif : 4 ingénieurs, 1 technicien DESCRIPTION DE L’ACTIVITE PIM Lyon Tech est une plate-forme préclinique qui couvre un large domaine d'applications : - Tests non invasifs ex vivo ou in vivo - Développements méthodologiques : imagerie et spectroscopie par résonance magnétique, imagerie ultrasonore, imagerie optique - Elastographie - Imagerie haute résolution - Imagerie anatomique, fonctionnelle - Etudes de pathologies sur modèles animaux avec le suivi longitudinal associé - Tests de compatibilité IRM de matériaux THEMATIQUES
  • 37. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 37 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques IRM : 4,7 T dédié au petit animal US : 3 échographes Optique : laser pulsé et échographe (photoacoustique), endoscope fibré, endoscope rigide, spectromètre multicanaux, endomicroscope confocal fibré Cell-Vizio (MKT®) Anesthésie gazeuse Monitoring petit animal Infrastructures spécifiques Agrément pour l'utilisation d'animaux à des fins scientifiques : numéro A 69 266 1401 PRESTATIONS PROPOSEES PIM Lyon Tech propose la réalisation de prestations d'imagerie en adéquation avec la demande : organisation du protocole expérimental, acquisition et analyse des résultats. La plate-forme est équipée de matériels dédiés à l'expérimentation sur le petit animal. Les ingénieurs de la plate-forme sont habilités à expérimenter sur le petit animal. La plate-forme dispose aussi d'un cluster de calcul et d'un accès à la grille de calcul EGEE pour faciliter le traitement massif des donnés acquises.
  • 38. CLARA / Annuaire des plateformes 201438 Radiograaff Radiobiologie au Van de Graaff DOMAINE D’EXPERTISE Radiobiologie INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Michaël BEUVE Contact : michael.beuve@univ-lyon1.fr  IPNL, Campus de la Doua 4 Enrico Fermi, 69622, Villeurbanne Appartenance : Plateforme du LabEx PRIMES, de l'infrastructure nationale France Hadron, du GdR MI2B / réseau RESPlaNDir (http://www.mi2b.fr/spip.php?article30) DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Irradiation avec des protons de 3 MeV avec contrôle dosimétrique pour les études de la réponse de cellules biologiques, de détecteurs, de films radiosensibles... THEMATIQUE
  • 39. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 39 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Dose uniforme sur un disque de 2 cm de diamètre à +/- 3%, dose absolue à mieux que +/- 5%, débit de dose < 10Gy/min Enceinte thermostatée, porte échantillion automatisé Laboratoire de cultures cellulaires avec materiel standard (PSM, surpression, incubateurs, congélateurs, hotte chimique, microscope, compteur cellulaire...) CONDITIONS D’ACCES Tarifs selon prestation, signature d'une charte précisant les conditions d'accès PRESTATIONS PROPOSEES Irradiation de cellules en monocouche, de détecteurs, de films... Accès à un laboratoire de cultures cellulaires
  • 40. CLARA / Annuaire des plateformes 201440 X-Ray CERVO Lyon-Sud Plateforme d'irradiation par rayons X DOMAINE D’EXPERTISE Radiobiologie, irradiations photoniques cellulaires et du petit animal INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Claire RODRIGUEZ-LAFRASSE Contact : claire.rodriguez@univ-lyon1.fr  Plateforme CERVO - Faculté de Médecine Lyon-Sud, 69921, Oullins cedex DESCRIPTION DE L’ACTIVITE L'irradiateur XRad 320 (PXI) est sous la responsabilité du Laboratoire de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (équipe 4 de l'EMR3738 - Pr C. Rodriguez-Lafrasse) qui s'intéresse aux mécanismes de la radiorésistance tumorale et développe des traitements adjuvants radiosensibilisants. Les irradiations photoïques sont réalisées sur lignées cellulaires en culture et petit animal (souris, rats). THEMATIQUE
  • 41. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 41 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Irradiateur XRad 320 (PXI) Infrastructures spécifiques Plateforme technologique CERVO Lyon-Sud CONDITIONS D’ACCES Contacter C. Rodriguez-Lafrasse par e-mail PRESTATIONS PROPOSEES Irradiations cellulaires et du petit animal
  • 42. CLARA / Annuaire des plateformes 201442 Imagerie intégrée multimodalité DOMAINE D’EXPERTISE Cancérologie, radiopharmaceutique, ciblage, imagerie TEP petit animal, imagerie TDM petit animal, scintigraphie, imagerie de bioluminescence, imagerie de fluorescence, autoradiographie digitale quantitative corps entier INFORMATIONS GENERALES Responsable de la plateforme : Elisabeth MIOT-NOIRAULT Contact : elisabeth.noirault@inserm.fr  UMR 990 INSERM/UdA, 63005, clermont Ferrand cédex @ http://www.clermont-universite.fr/PLATE-FORME-D-IMAGERIE Appartenance : INSERM/Université d'Auvergne Effectif : 2 ETP DESCRIPTION DE L’ACTIVITE Les champs d'application concernent: (i) les études scanner X de caractérisation anatomique et structurale (ex: mesure de densité minérale osseuse), avec ou sans injection d'agent de contraste, (ii) les études de biodistribution et pharamcocinétique de substances d'intérêt (absorption, distribution, métabolisme, excrétion) tant in vivo qu'ex vivo apres marquage radioactif ou fluorescent (iii) le suivi longitudinal de pathologies évolutifs et de leur réponse à la thérapie, au moyen de traceurs pertinents (croissance tumorale, prolifération, activité métabolique glucidique, inflammation, remaniement osseux, cartilage, hypoxie, MMP,...) THEMATIQUE
  • 43. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 43 EQUIPEMENTS DEDIES Moyens techniques Les équipements d'imagerie sont les suivants: (i) un système autoradiographique quantitatif digital permettant l'analyse corps entier rat et souris (betaImager, Biospace), (ii) deux têtes de détection de gamma camera permettant l'imagerie scintigraphique gamma, plane et tomographique (gammaImager, Biospace), (iii) un scanner X petit animal (Explore CT120, GE Healthcare), (iv) un imageur TEP petit animal (ExploreVista, GE Healthcare), (v) un equipement d'imagerie optique permettant l'imagerie 2D et 3D en bioluminescence et fluorescence in vivo (IvisSpectrum, Perkin Elmer). CONDITIONS D’ACCES Les équipements sont ouverts à la communauté scientifique académique et aux sociétés privées, sous forme de collaboration ou de prestations de services. PRESTATIONS PROPOSEES Située à l'UMR 990 iNSERM/UdA, le plateau d'imagerie intégrée multimodalité in vivo a pour objectif d'offrir à la communauté scientifique des études "multi- échelles", pouvant aller de la caractérisation tissulaire de l'échantillon, à l'exploration fonctionnelle in vivo chez le petit animal. Les équipements de haute technologie du plateau permettent de proposer, tant des approches structurales et anatomiques à haute résolution (50 µm in vivo pour le scanner), que fonctionnelles après administration de composés radiomarqués, fluorescents ou bien encore de cellules bioluminescentes. Moyens biologiques Notre unité possède l'expertise nécessaire pour le développement de modèles expérimentaux en cancérologie, tant in vitro (culture en 2 ou 3 dimensions telle que sphéroïdes), qu'in vivo (modèles de xénogreffes ou orthotopiques). Les modèles qui sont développés en routine sont principalement: le mélanome, le chondrosarcome, l'ostéosarcome, les tumeurs mammaires, de colons, de prostate, de lymphome… Infrastructures spécifiques Notre unité dispose des infrastructures nécessaires à l'hébergement des animaux (animalerie agrée), l'hébergement temporaire des animaux pendant la durée de leur examen (armoires ventilées dédiées), y compris pour les animaux ayant reçu une administration de traceur radioactif (armoire ventilées plombées), les équipements nécessaires au radiomarquage (enceintes blindées, automates de radiosynthèse), les locaux nécessaires à la culture cellulaire et aux études de pharmacologie.
  • 44. CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1 www.canceropole-clara.com CLARA / Annuaire des plateformes 2014 1 www.canceropole-clara.com