Harmat Veronika - Fehérjék működésének vizsgálata krisztallográfiával - Budapest Science Meetup Május

A fehérjék működése, ahogy a krisztallográfus látja ELTE Kémiai Intézet, Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium MTA-ELTE Fehérjemodellező Kutatócsoport Harmat Veronika http://www.chem.elte.hu/departments/protnmr

Fehérjék röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálata: kémia a biológia mögött ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Kémiai Nobel díj 2009 Riboszóma szerkezetvizsgálata V. Ramakrishnan, T. A. Steitz, A. E. Yonath (több mint 120 szerkezet) 30S alegység: ~35000 atom, 50S alegység:~64000 atom Kémiai Nobel díj 1962 Globuláris fehérjék szerkezetvizsgálata M. F. Perutz, J. C. Kendrew mioglobin:~1200 atom

Fehérjekrisztallográfia: lehetőségek és korlátok Elektronsűrűségi térkép Atomi pozíciók Diffrakciós mintázat Kristály Szerkezet-hatás összefüggések Fehérje oldat ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Szerin proteázok ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Szubsztrát Kiindulási molekulák Termék molekulák Átmeneti állapot Katalizátorral Reakcióút Energia

Prolil-oligopeptidáz család ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],üreg Kat. triád propeller proteáz Fülöp et al, Cell 94 , 161 , 1998 „ Csukott” szerkezet

Hogyan jut be a szubsztrát az aktív helyre? ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Shan et al, PNAS 102, 3599, 2005 Fuxreiter et al, Proteins. 60 , 504 , 2005

Hogyan jut be a szubsztrát az aktív helyre? ,[object Object],[object Object],Rasmussen et al Nat Struct Biol. 10 , 19 , 2003

Acilpeptid hidroláz szerkezetvizsgálata ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],nyitott/nyitott Asp/Ala mutáns (üres szerkezet) ,[object Object],[object Object],Eredeti célkitűzés: ,[object Object],[object Object],Harmat et al, J Biol Chem, 286, 1987 2011

A szerkezetek kétállapotú rendszerre utalnak ,[object Object],[object Object],[object Object]

A katalitikus és szelektivitási funkció szétválik csukott Mi változik a kinyílás során? A szubsztrát bejutása lehetséges Katalitikusan inaktív konformáció nyitott Az aktív hely intakt, a reakció lejátszódhat A szubsztrát nem tud bejutni az aktív helyhez

Stabil állapotok mozgékony régiókkal: ,[object Object],Ser A His-hurok és vele kölcsönható hurok kinyíláskor destabilizálódik. Asp ● csukott szerkezet His His mozgékony merev

Zárt szerkezetek: az Asp szerepe a katalízisben ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],● vad típusú szerkezet ● propeller ● Ser ● His hurok ● Asp hurok

Mechanizmus: konformációs szelekció ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Együttműködők MTA Enzimológiai Intézet Polgár László Domokos Klarissza Szeltner Zoltán Szamosi Ilona MTA Kémiai Kutatóközpont Palló Anna

Harmat Veronika - Fehérjék működésének vizsgálata krisztallográfiával - Budapest Science Meetup Május

Recomendados

Recomendados

Mais conteúdo relacionado

Mais de Budapest Science Meetup

Mais de Budapest Science Meetup (20)

Harmat Veronika - Fehérjék működésének vizsgálata krisztallográfiával - Budapest Science Meetup Május