Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
7.HAFTA DERS SUNUMU AYHAN ÜĞÜDEN.pptx
1. Amino Asitlerin Karbon İskeletlerinin Katabolizmaları
İstanbul Üniversitesi – Cerrahpaşa
Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalı Doktora
Ayhan ÜĞÜDEN
5. Amino Asit Karbon İskeletinin Kaderi
•20 amino asitin karbon iskeletleri sitrat çevriminde (28 farklı yol ile) birleşir.
•Bu aminoasitler çevrimdeki her bir oksidasyon adımında 5 bölgeden giriş yaparlar.
•Büyük amino asitlerin karbonları TCA çevrimine birden fazla bölgeden katılabilirler.
–Phe, Tyr, Leu, ve Ile 2 farklı bölgeden
–Trp (ve Thr) 3 farklı bölgeden
•Hücrede sıklıkla karşılaşılan 2 reaksiyon;
–Transaminasyon
–Bir karbon transferi
•Tüm reaksiyonlar karaciğerde gerçekleşir, sadece dallanmış zincirli aminoasitler; lösin, isolösin, ve valin (kas)
istisnadır.
7. Aminoasitlerin Karbon İskeleti
Amino asitlerin, amino grubu uzaklaştırıldığında (deaminasyon), a-keto asitler oluşur, direkt
olarak veya ilave bazı reaksiyonlar ile ana metabolik yolları beslerler (örn; Sitrat çevrimi).
Amino asitler karbon iskeletlerinin glukoza dönüşüpdönüşmemesine göre 2 sınıfta toplanırlar;
Glukojenik aminoasitler
Ketojenik aminoasitler
Glukojenik: Sitrat çevrimi ara ürünlerinden birine ya da pirüvata dönüşebilen amino asitler
Ketojenik: Asetoasetat ve Asetil-CoA’ya dönüşebilen ve keton sentezinde kullanılabilen amino
asitler
9. Glukojenik amino asitlerin karbon iskeletlerinin yıkım ürünleri:
Piruvat (3C'lu) veya Sitrik asit (Krebs) çevriminin 4-C lu veya 5-C lu ara ürünleridir.
Bu ara ürünler glukoneogenez prekürsorleridir.
Glukojenik amino asitler glukoneogenez için ana karbon kaynağıdır (glukoz seviyeleri düşük olduğunda). Ayrıca
bunlar enerji eldesi için katabolizmaya girerler veya enerji depolanması için glikojen veya yağ asitlerine
dönüşürler.
Ketojenik amino asitlerin karbon iskeletlerinin yıkım ürünleri:
Asetil-CoA, veya
Asetoasetat
Asetil CoA ve prekürsörü olan asetoasetat, glukoneojenez prekürsörü olan okzaloasetat oluşturmazlar.
Her bir 2-C lu asetil artığı sitrat (Krebs) çevrimine girer, 2 C; CO2 olarak uzaklaşır.
Ketojenik amino asitlerin karbon iskeletleri Sitrik asit çevriminde enerji için katabolize olurlar, veya keton cisimleri
veya yağ asitlerine dönüşürler.
Glukoza dönüşümleri mümkün değildir.
12. Süksinil-CoA veren amino asitler
4-C lu Sitrat çevrimi ara ürünü olan suksinil-CoA, izolösin, valin, ve metiyonin degredasyonu sonucu oluşur.
Propiyonil CoA, bu metabolik yolların ara ürünüdür ve tek karbon sayılı yağ asitlerinin b-Oksidasyon ile yıkımı
sonucu oluşan üründür.
13. Dallanmış zincirli amino asitler
Lösin
Valin
Izolösin
Propiyonil-CoA
Suksinil-CoA
Metilmalonil-CoA
Metilmalonil-CoA
mutaz
Vitamin B12
Keto asit
NH3
Sitrat Çevrimi
Dallanmış zincir a-keto asit
dehidrogenaz
Piruvat
dehidrogenaz
analoğu
Eksikliğinde
Maple syrup
idrar hastalığı
14. H
C COO
NH3+
H3C
CH
H3C
H
COO
NH3+
CH2 C
H3C
CH
H3C
CH
CH3 H
C COO
NH3+
CH3 CH2
İzolösin
Dallanmış zincirli amino asit
aminotransferaz
Valin Lösin
Metilakrilil-CoA
(Valin)
Dallanmış zincirli a-keto asit
dehidrogenaz
açil-CoA
dehidrogenaz
Propiyonil-CoA
Suksinil-CoA
Propiyonil-CoA
Suksinil-CoA
O
-OOC C CH2 COO
Asetoasetat
O
H3C C SCoA
Acetyl-CoA
Tiglil-CoA
(Izolösin)
3 reaksiyon
O
H3C C SCoA
Asetil-CoA
b-Metilkrotonil-CoA
(Lösin)
3 reaksiyon
4 reaksiyon
Dallanmış Zincirli Amino
Asitlerin Süksinil-CoA ve
Asetoasetata Degradasyonu
Keton
cisimleri
15. Val, Ile, ve Leu Ekstrahepatik Metabolizma
• Dallanmış zincirli a-keto asit dehidrogenaz kompleksi oksidatif dekarboksilasyon reaksiyonunu katalizler.
• Maple Syrup Hastalığı; a-keto asitlerin birikimi
17. Alanin direk transaminasyon ile piruvata yıkılır.
Serin; serin dehidrataz (PLP-bağımlı enzim) ile dehidratasyon reaksiyonu ile pirüvata dönüşür.
Sistein bir seri reaksiyon dizisi üzerinden sülfidril grubunun H2S, SO3
-2, veya SCN- salınımı ile piruvata dönüşür.
Glisin ve treonin serin hidroksimetiltransferaz (PLP-bağımlı enzim) ile serine dönüşür.
Serin hidroksimetiltransferaz; N5,N10-metil-tetrahidrofolat kullanır. Bu ise glisinin serine dönüşümünde 1 Karbon
verici kofaktörü olarak görev alır.
Treonin hem glukojenik hem de ketojeniktir.
Sistein, Glisin, Alanin, Serin, ve Treonin’in Piruvat’a Degradasyonu
19. H2N O
COO
CH2
HC NH3
+
C H2O NH4
+
CH2
HC NH3
+
COO
asparagine
COO
aspartate
Asparagin; Yan grubunda bulunan amino grubunu hidroliz ile kaybeder. Reaksiyon Asparaginaz ile katalizlenir.
Ürün olarak aspartat oluşur, bu ise transaminasyon ile okzaloasetata dönüşür.
Asparagin ve Aspartat’ın Okzalasetat’a Degradasyonu
Asparaginaz
20. 5 karbonlu α-ketoglutarata dönüşen amino asitler
5-C lu Sitrat çevrimi ara ürünü olan a-ketoglutarat, arginin, glutamat, glutamin, histidin ve prolin metabolizması
sonucu oluşur.
Glutamat deaminasyonu Transaminaz ile gerçekleşir ve a-ketoglutarat oluşur.
21. Lizin’in Degradasyonu
Lizin ketojenik bir amino asittir.
Lizin’in karbon iskeleti ara metabolizmaya Asetoasetil-CoA olarak katılır.
Lizinin NH2 grubu diğer amino asitler üzerine transfer edilebilir ancak tersi reaksiyon mümkün
değildir.
22. O
-OOC C CH2 COO
Asetoasetat
O
H3C C SCoA
Asetil-CoA
Lizin
a-Aminoadipat-6-semialdehid
aminoadipatsemialdehid
dehidrogenaz
a-Aminoadipat
aminoadipat
aminotransferaz
a-Ketoadipat
a-keto asit dehidrogenaz
Glutaril-CoA
glutaril-CoA dehidrogenaz
Glutakonil-CoA
dekarboksilaz
enoil-CoA hidrataz
Krotonil-CoA
HMG-CoA sentaz
Asetoasetil-CoA
β-hidroksiaçil-CoA
dehidrogenaz
b-Hidroksibutiril-CoA
HMG-CoA
HMG-CoA liyaz
H
COO
NH3+
CH2 CH2 CH2 CH2 C
H 3N
+
Lizin’in Asetoasetata
Degradasyonu
kondenzasyon
a-ketoglutarat
sakharopin dehidrogenaz
Sakharopin
sakharopin dehidrogenaz
23. Triptofan’ın Degradasyonu
Triptofan NAD prekürsörüdür.
Triptofan yıkımı karaciğerde gerçekleşir ve nikotinik asit eldesi söz konusudur.
Ayrıca biyolojik aktif amin olan seratonin’e dönüşüm gerçekleşir.
Enerji metabolizmasına katılır. Ketojenik (asetoasetil CoA) ve Glukojenik (alanin) dir.
İndol grubu 280 nm’de absorbsiyon verir.
24.
25.
26. Aromatik Amino Asitlerin Degradasyonu
Fenilalanin ve tirozin; fumarat ve asetoasetat’a yıkılırlar.
Fenilalaninin hidroksilasyonu ile tirozin oluşur. Bu reaksiyon indirgen olarak tetrahidrobiyopiterin içerir.
Dihidrobiyopiterin, NADH’dan elektron transferi ile tetrahidrobiyopiterine indirgenir.
NADH fenilalaninin tirozine dönüşümünde ikinci elektron donörüdür.
Fenilalanin Tirozin
Fenilalanin
Hidroksilaz
Tetrahidrobiyopiterin dihidrobiyopiterin
Fenilalanin yıkımındaki ilk reaksiyon tirozine hidroksilasyondur.
Son ürünler ise sitrat çevrimi ara ürünü olan fumarat ve keton cisimciği olan asetoasetat tır.
Phe ve Tyr; ketojenik ve glukojeniktir.
27. H
CH2 C COO
NH3+
Fenilalanin
O
H3C C CH2 COO +
Asetoasetat
-OOC C H
H C COO-
Fumarat
Fenilalanin
Hidroksilaz Tyr
aminotransferaz
p-Hidroksifenilpruvat
p- hidroksifenilpruvat
dioksigenaz
Homogentisat
Homogentisat
dioksigenaz
4-Maleilasetoasetat
4-Fumarilasetoasetat
Maleilasetoasetat
izomeraz
Fumarilasetoasetaz
HO CH2 C
H
COO
Tirozin osine NH3+
28. Amino Asit Degradasyonu; Özet
Pruvat
Asetil-CoA
OAA
a-ketoglutarat
Suksinil-CoA
Fumarat
Asetoasetat
Ile
Leu
Trp
Phe
Tyr
Lys
Ala, Gly, Cys, Ser, Thr
Asp,Asn
Glu, Gln, His,
Pro,Arg
Val Met
Yağ asitleri
Keton cisimleri
Glukoz
31. Fenilketonüri
Amino asit metabolizmasının en sık rastlanan yenidoğan hastalığı;
• Yüksek Phe düzeyi nörolojik hasara neden olur
•Anormal bileşenler: fenilpruvat; fenillaktat; fenil asetat
•Beyin toksisitesi: diğer aromatik aminoasitlerin alımının azalması
• Tirozin eksikliği; hipopigmentasyona neden olur
32. Alkaptonüri
İlk olarak bulunan amino asit yenidoğan sendromu Sir Archibald Garrod; 1900’lerin başları
İdrarda Homogentisat görülür.
Kıkırdak ve bazı dokularda çökelek oluşumu polimerizasyon (siyah)
Alkaptanürili hastada
Ocular ochronosis
Kulak kıkırdağında
Polimerleşmiş homogentisat
34. N5-CH3 THF
THF
Metiyonin-S-CH3
Homosistein-SH
CH3 grubu
verilmesi
adenozin
Hidroksi B12
CH3-B12
Metiyonin sentaz
Sistatiyonin
Sistatiyonin b-sentaz (PLP)
3
Propiyonil
CoA
5
S-Adenozilmetiyonin
Metiyonin
adenoziltransferaz
1
ATP
Pruvat + SO4 NH3
Sistein
a-Ketobutirat
4
Sistatiyonaz
HOMOSİSTİNÜRİ
atherosckleroz?
X
Besin eksikliği;
Prosesleme veya enzime bağlanma
X
X
X
X
2a
X
2b
Metiyonin ve
Sistein
Metabolizması
Bozuklukları
MMAÜ
35. HOMOSİSTİNÜRİ VE KALP HASTALIĞI
Arteriosklerozlu bazı hastalarda homosistein seviyeleri artar.
Düşük plazma B vitamini ve düşük besin değerleri kalp hastalığı riskini arttırır.
Folat/B12 eksikliği risk yaratır (özellikle sigara içenler).
B vit; plazma homosistein düzeyini düşürür. Homosistein lipoproteinleri ve damar duvarı
36. “MAPLE SYRUP URINE DISEASE”
“Ardıç Ağacı Şurubu Hastalığı”
(Dallı Zincirli Amino Asit Metabolizma Bozukluğu Hastalığı)
En sık rastlanan Dallanmış zincirli AA bozukluğu (1/185,000)
Dallanmış zincir ketoasit dehidrogenaz (veya dekarboksilaz) eksikliği Tiamin eksikliğinde de aynı sonuç
Biriken keto asitlerin kokusu ardıç ağacı şurubuna benzer.
Dallanmış zincirli amino asitlerin birikimi de söz konusudur
Mental gerilik
Tedavi edilmez ise ölüm ile sonuçlanır
37. Lösin İzolösin Valin
Dallanmış zincir a-ketoasit
Glutamat
Transaminaz
a-Ketoglutarat
CO2 + NADH
CoA+ NAD+
Dallanmış zincirli
ketoasit Dehidrogenaz
Dallanmış zincirli keto asitlerin CoATürevleri
(lösin den)
Metilmalonil CoA
Suksinil CoA
adenozil B12
biyotin
3Asetil CoA
Propiyonil CoA
biyotin