RETI di LABORATORI - [Biotecnologie] BISIMANE

Rete Regionale di Laboratori per gli Approcci di
Biologia dei Sistemi nelle Malattie Umane
(BISIMANE; cod.rete 44)
Coordinatore scientifico
Francesco Paolo Schena
Consorzio CARSO
Valenzano (Bari)

Le unità di ricerca
Unità di ricerca Responsabile
Piattaforma di Genomica Prof. Francesco Paolo Schena
Piattaforma di Trascrittomica Prof. Loreto Gesualdo
Piattaforma di Proteomica Prof. Elena Ranieri
Piattaforma di Metabolomica Prof. Francesco Paolo Fanizzi
Piattaforma di Biologia dei Sistemi Dr.Nicola Ancona
Biobanca Prof. Michele Battaglia

Obiettivi della Rete
1. Mettere a disposizione dei centri di ricerca (pubblici e privati) e del
mondo produttivo industriale i service di omiche forniti dalla rete
(BISIMANE 44)
2. Realizzazione di un network informatico (rete GRID) tra i laboratori
per lo scambio di dati ed elaborazione statistica (ONEV; PONa3-134)
Settori di impatto
1. Centri di Ricerca (pubblici e privati)
2. Aziende Biotec
3. Aziende Farmaceutiche
4. Aziende dell’Agro-Alimentare

Domanda di innovazione del sistema
produttivo
• Progetto FIRB RBAP11B2SX
(CAROMICS). Identificazione di
biomarkers sierici ed urinari per la
diagnosi precoce di carcinoma
renale a cellule chiare.
Imprese coinvolte: Biotec
• Progetto PON 01-1958 (PIVOLIO).
Identificazione del printing
metabolomico degli oli
extravergine di oliva prodotti nel
territorio pugliese.
Imprese coinvolte: Aziende olearie
Offerta tecnologica della Rete
• SERVICE svolto dalle
piattaforme con prestazioni
offerte da catalogo visionabile
sui siti:
DETO,UNIBA
CARSO, Valenzano

Attività/progetto/servizio 1.
Progetto FIRB RBAP11B2SX. Strategie innovative ad alta tecnologia per lo studio del
carcinoma renale. Uso degli “OMICS” e della Biologia dei Sistemi per lo sviluppo dei nuovi
biomarkers (CAROMICS).
Risultati raggiunti:
1) Effettuate 104 nefrectomie per carcinoma renale (67 parziali e 37 radicali), da 22 feb
2012 al 31 dic 2013, di cui 54 con diagnosi istologica di RCC cellule chiare.
2) Raccolta e conservazione , da ciascun paziente, di tessuto renale sano, tessuto renale
tumorale e di liquidi biologici (siero, plasma e urine pre e post-intervento).
3) Isolamento e caratterizzazione di cellule staminali normali (ARPCs) e tumorali (RCSCs)
da 32 pazienti.
4) Studio del profilo di espressione genica ed identificazione dei marcatori di membrana
in grado di discriminare le RCSCs rispetto alla controparte staminale sana (ARPCs).
(Piattaforma di Genomica)
5) Studi del profilo di espressione proteica delle ARPCs e RCSCs
6) Studio del profilo metabolico delle ARPCs e RCSCs
Imprese coinvolte Tipo di contatto Frequenza di contatto
Nessuna Il contatto sarà attivato
dopo i risultati definitivi
PROGETTO DIMOSTRATORE

Immagini
Piattaforma di Trascrittomica, Policlinico, DETO-UNIBA
Piattaforma di Proteomica, Policlinico, UNIFG
SELDI-TOF/MS DIGE Imaging
System
MALDI-TOF/MS/MS
Piattaforma di Genomica, Cons.CARSO, Valenzano, Bari
iSCAN iSQ
F.Sallustio – S.Cox
M.Accetturo
M.Papale M.T.Rocchetti

Immagini
Piattaforma di Metabolomica, Consorzio CARSO,
Valenzano, Bari
R.Ragone S.Piccinonna
Piattaforma di Biologia dei Sistemi, CNR-ISSIA-Bari
MT.Creanza
Biobanca, Policlinico, DETO-UNIBA
M.Rutigliano
Piattaforma di Metabolomica, UNILE
L.Del Coco

Le attività svolte al 31/12/2013
Progetto MR/K01353X/1. An integrative genomics approach for non –invasive biomarkers
discovery in IgA nephropathy (UK – Italy).
Risultati raggiunti. Individuazione di 20 variabili geniche in pazienti con IgA Nefropatia
Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotech
Altri risultati
Nessuna
PROGETTI CHE UTILIZZANO LE PIATTAFORME OMICHE DELLA RETE BISIMANE

Immagini
iSCAN iSQ
F.Sallustio S.Cox
Biobanca, Cons.CARSO, Valenzano, Bari
G.De Palma

Progetto RF/2009-1471624. Italian Multicenter Randomized Clinical Trial on Subclinical
Acute Rejection in Kidney transplant.
Risultati raggiunti. Arruolamento di 110 pazienti con trapianto renale
Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotech
Altri risultati
Nessuna

Immagini
iSCAN iSQ
Piattaforma di Metabolomica, Consorzio CARSO,
Valenzano, Bari
Biobanca, Cons.CARSO, Valenzano, Bari
G.De Palma

• Progetto PON REC 01-01958 PIVOLIO: Sono in corso gli studi omici per caratterizzare
l’imprinting metabolomico di 4 oli extravergine di olive monovarietali:
1. 1. Cima di Mola
2. 2. Coratina
3. 3. Ogliarola
4. 4. Peranzana
Ricadute industriali. Proteggere e promuovere un prodotto più qualificato.
Evidenziare le proprietà anti-infiammatorie
Altri risultati
OLIVETI TERRA DI BARI-
BITONTO
Partecipazione al progetto Periodica e subordinata al
progetto.
BASILE - ANDRIA Partecipazione al progetto Periodica e subordinata al
progetto.

Piattaforme di Metabolomica
L.Del Coco
Piattaforma di Metabolomica, 400 MHz – DiSTeBA, UNILE Piattaforma di Metabolomica, 500 MHz – Consorzio CARSO

Progetto PON REC 3-00134 ONEV. Rafforzamento strutturale delle piattaforme omiche e
formazione dei ricercatori. Costituzione della rete GRID per il trasferimento dei risultati tra
le piattaforme
Risultati raggiunti . Collaborazione con le altre Reti di Laboratorio: BIOPOP, LIFE,
LABERPAR, TEGUVA, NABIDIT (Rete delle reti)
Ricadute industriali • Coinvolgimento di aziende Biotec in campo umano,
animale e vegetale
Altri risultati

Immagini
Piattaforma di Genomica, C.A.R.S.O.
iSCAN iSQ
Biobanca, C.A.R.S.O. GMP Facility, C.A.R.S.O.
Stabulario per animali germ-free, C.A.R.S.O.
Piattaforma di Metabolomica, C.A.R.S.O.
Piattaforma di Metabolomica, DiSTeBA - UNILE
L.Del Coco

Progetto (St.3432) Individuazione di pattern genomici associati allo
stress ossidativo ed alla microinfiammazione,
significativamente modulati dal trattamento con
eritropoietina in pazienti portatori di trapianto
renale e con insufficienza renale cronica.
Prospettive future per la farmacogenomica
dell’eritropoietina
Risultati raggiunti
Ricadute industriali Definizione di un assay di PCR-multiplex di predizione della risposta
farmacologica all’EPO individuare un gruppo di pazienti poco responsivi da
monitorare nel tempo e da sottoporre a un trattamento farmacologico
personalizzato o multifarmacologico.
Altri risultati
Amgen Dompè Monitoraggio e discussione
risultati
semestrale
Attività/progetto/servizio 5

Progetto (RF-2009-1471624) Chronic rejection in kidney transplantation:
identification of new dignostics targets
Risultati raggiunti
Ricadute industriali Definizione di un pannello di biomarcatori (geni e/o microRNA) per la
diagnosi non invasiva di rigetto cronico in seguito a trapianto renale.
Altri risultati

Progetto PRIN 2008NY2B9T_001 Caratterizzazione genomica della risposta
T helper in corso di rigetto cronico di
trapianto renale
Risultati raggiunti
diagnosi non invasiva di rigetto cronico in seguito a trapianto renale.
Altri risultati

Progetto (245/RF-2009-1470765) Prevalence and impact on total mortality o
f chronic kidney disease in patients with ty
pe 2 diabetes in Apulia Region.
Risultati raggiunti
diagnosi non invasiva di nefropatia diabetica.
Altri risultati

Progetti • RICERCANDO 2010 (Società Italiana di Nefrologia):
“ Identificazione di biomarcatori affidabili di
nefropatia diabetica mediante strategie di analisi
proteomica complementari” (UO coordinator M.
Papale)
• RF 2009 (Min. Sanità) (RF-2009-1470765):
“Prevalenza ed impatto sulla mortalità totale della
malattia cronica renale in pazienti con diabete
mellito di tipo 2 in Puglia” (UO coordinator L.
Gesualdo
1. Identificazione di un pattern proteomico urinario della nefropatia diabetica (ND)
2. Identificazione di un pattern di ubiquitinazione proteica nella ND
3. Sequenziamento, mediante AUTOFLEX III (Bisimane), di alcune proteine ubiquitinate escrete nelle
urine dei pazienti ND e nelle cellule renali cresciute in iperglicemia
4. Inserire i risultati eventualmente prodotti dalla unità di trascrittomica DETO
Ricadute industriali • Proof of concept per deposito brevetto internazionale di
un kit utile per la diagnosi e il monitoraggio del danno
renale nel diabete mellito di tipo II
Altri risultati • Incremento delle conoscenze sulla patofisiologia del
danno renale nel diabete di tipo 2
Apuliabiotech SCARL Trasferimemnto tecnologico semestrale

Unità delle rete coinvolte
Piattaforma di Proteomica Bioagromed
Università di Foggia
MALDI/TOF/MS/MS Autofllex III Smatrbeam
(Bisimane)
Piattaforma di Trascrittomica, UNIBA
Inserire un box per
L’unità di trascrittomica
DETO che collabora allo
svolgimento del progetto
RF2009

Progetto (Ateneo 60%) Ruolo diagnostico del CA 15-3, CA 125 e della β2-
microglobulina nel Carcinoma Renale a cellule
chiare
UO coordinator Prof. M. BATTAGLIA
1) Identificazione del ruolo di tre diverse proteine sieriche (CA 15-3, CA 125 e β2-
microglobulina) in pazienti affetti da RCC a cellule chiare e l’associazione tra i livelli di
questi marcatori e le caratteristiche clinico-patologiche della malattia.
Ricadute industriali
Altri risultati

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI GENOMICA
Attività di Service per terzi esterni, pubblici e privati:
Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it
Piattaforma di Genomica(1)
• Service di analisi di Gene Expression in pazienti con fibrosi cistica
con e senza trattamento farmacologico per Fondazione Ricerca
Fibrosi Cistica Onlus –Verona
• Service di analisi di Gene Expression in pazienti con glioblastoma per
S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera
Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul
Cancro - Genova-
• Service di Analisi di Metilazione su cellule immortalizzate di
glioblastoma per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS
Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto
Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova-

• Service di Analisi di Metilazione su cellule di glioblastoma modificate
geneticamente per S.C. Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS
Azienda Ospedaliera Universitaria San Martino – IST Istituto
Nazionale per la Ricerca sul Cancro - Genova-
• Service di Analisi di Metilazione su pazienti di glioblastoma per S.C.
Genetica ed Epigenetica dei Tumori- IRCCS Azienda Ospedaliera
Universitaria San Martino – IST Istituto Nazionale per la Ricerca sul
Cancro - Genova-
• Service di Genotyping per Analisi di genotipizzazione di varie razze di
pecore per IZS – Foggia

Piattaforma di Genomica (3)
• n° 3 Service di analisi di Gene Expression di cellule da topi knock-out
per geni correlati all’osteosarcoma per Sezione di Anatomia Umana
e Istologia, Dipartimento di Scienze Mediche di Base, UNIBA.
• Service di analisi di Gene Expression su PBMCs di pazienti affetti da
angioedema ereditario per Sezione di Nefrologia, DETO, UNIBA.

Analisi deicostiedeiricavi2012-2013perattivitàdiserviceoffertaaterzi
Entrate Uscite Ricavi
€ 56139.46 € 44905.08 € 11234.37

Attività interna di Service:
Piattaforma di Genomica (1)
• Analisi di Gene Expression su cellule CD14+ di pazienti affetti da IgA
Nefropatia
• Analisi di Gene Expression su cellule CD4+ di pazienti affetti da IgA
Nefropatia
• Analisi di Gene Expression su PBMCs di pazienti affetti da IgA
Nefropatia
• Analisi di Gene Expression su tessuto renale di pazienti trapiantati con
rigetto cronico (progetto RAS)
• Analisi di Gene Expression su tessuto renale di pazienti trapiantati
(progetto RAS)
• Analisi di Gene Expression su cellule staminali/progenitrici renali
danneggiate con cisplatino e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari
• Analisi di Gene Expression su cellule staminali/progenitrici renali in
condizioni ipossiche e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari
• Analisi di genotyping di pazienti affetti da IgA Nefropatia

Attività interna di Service:
• Analisi di Gene Expression su cellule staminali tumorali renali
ricavate da pazienti con RCC
• Analisi di exome sequencing di pazienti affetti da IgA Nefropatia
• Analisi di Metilazione su cellule CD4+ di pazienti affetti da IgA
Nefropatia
• Analisi di Metilazione su PBMCs di pazienti affetti da IgA Nefropatia
• Analisi di Metilazione su cellule staminali/progenitrici renali in
condizioni ipossiche e/o in cocoltura con cellule epiteliali tubulari

Pubblicazioni
• Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. Abnormal miR-148b
expression promotes aberrant glycosylation of IgA1 in IgA nephropathy.
J Am Soc Nephrol. 23: 814-24, 2012
• S.N. Cox, F. Sallustio, G. Serino, A. Loverre, F. Pesce, M. Gigante, G. Zaza,
P.F. Stifanelli, N. Ancona, F.P. Schena. Activated innate immunity and
the involvement of CX3CR1-fractalkine in promoting hematuria in
patients with IgA nephropathy. Kidney Int. 82:548-560, 2012.
• Sallustio F, Costantino V, Cox SN, Loverre A, Divella C, Rizzi M, Schena FP.
Human renal stem/progenitor cells repair tubular epithelial cell injury
through TLR2-driven inhibin-A and microvesicle-shuttled decorin.
Kidney Int. 83: 392-403, 2013.
• Sallustio F, Serino G, Costantino V, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena
FP. miR-1915 and miR-1225-5p regulate the expression of CD133, PAX2
and TLR2 in adult renal progenitor cells. PLoS One. 8: e68296, 2013.

Comunicazioni /Poster
• Poster: SN. Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F, Stifanelli P, Ancona N, Schena FP. Coinvolgimento dell’immunità
innata e dell’asse CX3CR1-FKN nel promuovere l’ematuria macroscopica in pazienti affetti da IgA nefropatia. 52th National
Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 21-24, 2011, GIN, VOL S53, P.S8
• Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b modula l’espressione del gene core 1, β1,3-
galactosiltransferasi 1 spiegando l’alterata glicosilazione delle IgA1 nella IgA nefropatia. 52th National Congress of the Società
Italiana di Nefrologia, September 21-24, 2011, GIN, VOL S53, P.S6
• Costantino V., Sallustio F., Cox S.N, Loverre A., Schena F.P.: Le cellule progenitrici adulte renali contribuiscono al riparo del
danno renale acuto mediante la secrezione di specifici fattori paracrini(secretoma). 52° Congresso Nazionale SIN - Genova
21-24 Settembre 2011: PUBLISHED IN: G Ital Nefrol 2011; 28 (S53): S2. ISSN 0393-5590
• Sallustio F., Costantino V., Cox S.N., Loverre A., Rizzi M. Schena F.P.: Adult Renal Progenitor Cells Revert Acute Renal Tubular
Cells Injury by Means of TLR2-Driven Specific Paracrine Factors. 44th Annual Meeting Of The American Society Of Nephrology
Philadelphia, Pa. November 8 – 13, 2011. PUBLISHED IN: J Am Soc Nephrol 22, 2011: 615A
• Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b upregulation modulating core 1, β1,3-
galactosyltransferase 1 expression explains the abnormal glycosylation process of IgA1 in IgA nephropathy. 44th Annual
Meeting of the American Society of Nephrology Philadelphia, PA November 8-13, 2011
• ●Poster: SN. Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F, Stifanelli P, Ancona N, Zaza G, Schena FP. Activated innate
immunity and involvement of the CX3CR1-FKN axis in promoting hematuria in IgA nephropathy. 44th Annual Meeting of the
American Society of Nephrology Philadelphia, PA November 8-13, 2011.
• Poster: Cox SN, Sallustio F, Serino G, Loverre A, Pesce F,Gigante M, Zaza G, Stifanelli P, Ancona N, Schena FP. Altered antigen
handling and involvement of the CX3CR1-FKN axis in promoting hematuria in IgA nephropathy patients. 49th ERA-EDTA
Congress, Paris May 24-27, 2012.
• Oral communication: Pesce F, Cox SN, Serino G, Sallustio F, Froguel P, Schena FP, Falchi M. Linkage Analysis detects two
additional regions in familial IgA nephropathy. 49th ERA-EDTA Congress, Paris May 24-27, 2012.
• Oral communication: Serino G, Sallustio F, Cox SN, Pesce F, Schena FP. miR-148b upregulation modulating core 1, β1,3-
galactosyltransferase 1 expression explains the abnormal glycosylation process of IgA1 in IgA nephropathy. 49th ERA-EDTA
Congress, Paris May 24-27, 2012.
• Poster: Serino G, Sallustio F, Pesce F, Cox SN, De Palma G, Schena FP. Serum miR-148b as a Novel Non-Invasive Biomarker of
IgA Nephropathy (IgAN). 45th Annual Meeting of the American Society of Nephrology. San Diego, CA, USA, October 30–
November 4, 2012
• Poster: Schena FP on behalf of the Italian Group of Renal Transplantomics. Histology and trascriptomics in one core of FFPE
renal biopsy from patients with renal graft. 4th International conference on Trasplantomics and Biomarker in organ
transplantation. Cambridge, UK, April 4 –6, 2013.

• Poster: Serino G, Sallustio F, Curci C, Cox SN, Pesce F, De Palma G, Schena FP. Role of miRNA let-7b
in the Deregulation Process of IgA1 Glycosylation in IgA Nephropathy. 46th Annual Meeting of the
American Society of Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-10, 2013
• Poster: Cox SN, Serino G, Sallustio F, Pesce F, Schena FP. Altered Monocyte Expression and
Expansion of CD14+CD16+ Subset in IgA Nephropathy Patients. 46th Annual Meeting of the
American Society of Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-104, 2013
• Poster: Sallustio F, Cox SN, Serino G, Pesce F, De Palma G, Falchi M, Schena FP. Genome-Wide Scan
of Copy Number Variations (CNVs) Identifies a Variable Region at 3p21.1 Regulating the TLR9
Expression in Familial IgA Nephropathy Patients. 46th Annual Meeting of the American Society of
Nephrology. Atlanta, GA, USA, November 5-104, 2013
• Oral communication: C. Curci, F. Sallustio, G De Palma, M. Fiorentino, M. Rossini, L. Gesualdo, M.
Quaglia, C. Bozzola, P. Stratta, S. Zanini, L. Furian, P. Rigotti, V. Pietroni, F. Citterio, L. Biancone, E.
Gallo, G.P. Segoloni, F.P. Schena. Istologia e trascritto mica su biopsie renali FFPE in pazienti con
trapiant odi rene. 37th National Congress of the Società Italiana Trapianti D’Organo, Bari, October
24-26, 2013.
• Oral communication: Sallustio F, Serino G, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena FP I miR-1915 e
miR-1225-5p regolano l'espressione di CD133, PAX2 e TLR2 nelle cellule progenitrici adulte renali.
54th National Congress of the Società Italiana di Nefrologia, September 25-28, 2013, GIN, VOL
S61, P.61
• Oral communication: Cox SN, Serino G, Sallustio F, Pesce F, Schena FP. Aberrante espressione
genica dei monociti isolati da pazienti affetti da IgA Nefropatia. 54th National Congress of the
Società Italiana di Nefrologia, September 25-28, 2013, GIN, VOL S61, P.61
• Poster: Pesce F, Cox SN, Serino G, Sallustio F, Schena FP, Falchi M. Identification of quantitative
trait loci for deglycosylated IgA1 serum levels in familial IgA Nephropathy. 50th ERA-EDTA
Congress, Istanbul May 18-21, 2013.
• Poster: Sallustio F, Serino G, Curci C, Cox SN, De Palma G, Schena FP. miR-1915 and miR-1225-5p
Regulate The Expression of CD133, PAX2 and TLR2 in Adult Renal Progenitor Cells. 50th ERA-EDTA
Congress, Istanbul May 18-21, 2013.

Attività promozionali svolte dal Consorzio C.A.R.S.O.
• PARTECIPAZIONE AD EVENTI
Festival dell’Innovazione – Bari 1 – 3 dicembre 2010
Festival dell’Innovazione – Bari 22 – 24 maggio 2013
• PRESENZE SU QUOTIDIANI E RIVISTE
Stil’è n. 9 luglio 2011 pag. 97
Il Sole 24 ore 23 settembre 2013
• PRESENZA TELEVISIVA
Rai Tre Buongiorno Regione – Presentazione del Progetto PIVOLIO –
12 maggio 2011

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI
TRASCRITTOMICA:
• Pubblicazione dei servizi offerti e dei relativi tariffari sul sito del Dipartimento
dell’Emergenza e Trapianti di Organi dell’Università di Bari:
(http://www.uniba.it/ricerca/dipartimenti/deto/servizi/trascrittomica-e-genomica)
• Coinvolgimento dei rappresentanti locali di varie aziende nella promozione a livello
locale dei servizi svolti
Sito web della Rete: http://www.carsoconsortium.it/

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI
TRASCRITTOMICA
Pubblicazioni
• Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Fiorentino L, Federici M, Grandaliano G,
Di Paolo S, Gesualdo L. Kidney microRNA Profiling of Human Diabetic Nephropathy.
Sottomesso alla rivista PLoS ONE. In revisione.
• Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Castellano G, Gigante M, Stallone G, Zito A,
Zaza G, Ditonno P, Battaglia M, Gesualdo L, Grandaliano G. An interferon-alpha signature
characterizes chronic antibody-mediated rejection in kidney transplantation. Sottomesso
alla rivista J Am Soc Neph. In revisione.

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA
Comunicazioni / Poster
• SIN 2011 (PREMIO NATIONAL GRANT ERA-EDTA). Caratterizzazione del profilo trasrittomico nei linfomonociti periferici di
trapiantati renali con rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM).
Rascio F., Accetturo M., Tataranni T., Pontrelli P., Zito A., Zaza G., Schena F.P., Gesualdo L., Grandaliano G.
• ASN 2012. Transcriptomic Profile of Pherioheral blood mononuclear cells (PBMCs) in renal Chronic antibody-mediated
rejection (CAMR)
Pontrelli P, Rascio F, Accetturo M, Gigante M, Stallone G, Zito A, Gigante M, Castellano G, , Gesualdo L, Grandaliano G
• ASN 2013. miRNA Profiling in Human Diabetic Nephropathy
Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L
• SIN-Al 2013. Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia Diabetica
Conserva Francesca, Pontrelli Paola, Accetturo Matteo, Cordisco Giorgia, Annarita Oranger, Di Palma Anna Maria, Grandaliano
Giuseppe*, Gesualdo Loreto
• AME 2013. Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia Diabetica
Conserva Francesca, Paola Pontrelli, Matteo Accetturo, Giorgia Cordisco, Loredana Fiorentino*, Massimo Federici*, Giuseppe
Grandaliano§, Salvatore di Paolo#, Loreto Gesualdo
• ERA-EDTA 2013. Integrated messanger Rna and microRna profiles suggest an inteferon alpha signature in chronic antibody-
mediated rejection (CAMR) of kidney transplantation.
Pontrelli P, Rascio F, Accetturo M, Castellano G, Gigante M, Fiorentino M, Zito A, Zaza G, Stallone G, Gesualdo L, Grandaliano G
• SIN-Al 2013. Individuazione di patterns trascrittomici modulati dal trattamento con eritropoietina in pazienti con trapianto
renale
Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L
• SITO 2013. Individuazione di patterns trascrittomici modulati dal trattamento con eritropoietina in pazienti con trapianto
renale: prospettive future per la farmacogenomica dell’eritropoietina
Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI TRASCRITTOMICA
Sito web della Rete: http://
Service esterno per altri Enti
Anno Entrate € Introiti € Note
2012 15400 9356,534
2013 20122,3
In corso (Pagamento a service
completato)
TOT 35522,3 9356,534
Service esterno per Università di Bari
Anno Entrate € Introiti € Note
2011 8057,67 1779,827
2011 1500 1500
2013 4942,06 1000
TOT 14499,73 4279,827
Ricerca interna
Anno Progetto Note
2010 Cellule staminali renali
2011 Nefropatia Diabetica
2011 Rigetto cronico umorale
2012 Rigetto cronico umorale
2013 Rigetto cronico umorale (sottopopolazioni PBMCs)
2013 Anemia
2013 Neoplasie post-trapianto
TOT

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI PROTEOMICA
Pubblicazioni
• M. Papale…Gesualdo L. et al. Urine Proteome Analysis May Allow Non-
Invasive Differential Diagnosis of Diabetic Nephropathy. DIABETES
CARE 33: 2409-2415, 2010
• M.T. Rocchetti...L. Gesualdo et al. Association of Urinary Laminin G-Like
3 and Free K Light Chains with Disease Activity and Histological Injury in
IgA Nephropathy. ClinJASN 8: 1115–1125, 2013.
• M. Papale et al. Clinical proteomics: the potentiality of urine analysis for
understanding Diabetic Nephropathy EMJ Neph. 1: 32-39, 2013
• M. Papale…Gesualdo L. et al Proteomics and Diabetic Nephropathy: what
we learned from a decade of clinical proteomics studies? JNephrol, in press

Comunicazioni/Poster
• M. Papale….Ranieri E. et al. Combined analysis of tissue and urine proteome allowed to identify RC-specific urinary
biomarkers; 53 Congresso SIN - Milano 2012;
• M. Papale…..Ranieri E. et al. Cross-comparison between tissue and urine proteomics allowed to identify RCC-specific urinary
biomarkers; ERA-EDTA XLVIII Congress Prague (Czech Republic) June 23-26 2011;
• MT Rocchetti, … L Gesualdo et al. Urine proteome analysis reveals perlecan LG3 peptide and kappa free light chains as
potential non-invasive progression markers of IgA nephropathy. 53°Congresso della Società Italiana di Nefrologia (SIN).
Milano 3-6 Ottobre 2012
• MT Rocchetti, … L Gesualdo et al. Decrease of Perlecan LG3 peptide and free k-light chains urine excretion in Iga
nephropathy: new insights for a non-invasive diagnosis of IgAN49th ERA-EDTA. Paris 24-27 Maggio 2012
• MT Rocchetti, …L Gesualdo, et al. Urine proteome analysis: an attempt to biomarker discovery for the non-invasive diagnosis
of IgA nephropathy. 52th SIN. Genova, 21-24 Settembre 2011.
• Papale M. ….Gesiualdo L. et al. Ruolo delle proteine ubiquitinate nella nefropatia diabetica (ND) 12 AME congress , Bari
2013
• Papale M. ….Gesualdo L. et al. The progression of renal damage in Type 2 Diabetes Mellitus (T2D) correlates with the
increased excretion of ubiquitinated proteins: report of a proteomic study; ERA-EDTA XLX congress Istambul (Turkey) 2013
• Pontrelli P…M. Papale, Gesualdo L. et al. L’iperglicemia stimola l’ubiquitinazione in lisina-63 mediata da ube2v1 nella
nefropatia diabetica; 53 Congresso nazionale SIN; Milano 2012;
• Pontrelli P, ….Papale M. …Gesualdo L. et al. Hyperglycemia stimulates ubiquitin-conjugating enzyme e2 variant 1 (ube2v1)
mediated lysine 63 ubiquitination in Diabetic Nephropathy (DN); ERA-EDTA XLIX Congress Paris (France) 2012
• Papale M. et al. Contribution of urine proteome analysis for non-invasive differential diagnosis of diabetic nephropathy
12 Italian Proteomic Association (ItPA) congress, Florence 2010
• MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Il fosfoproteoma dei linfomonociti periferici (LMP): uno strumento innovativo per lo
studio del rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM); 37 Congresso Nazionale SITO, Bari 2013.
• MT Rocchetti, … G. Grandaliano. et al. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) phosphoproteome analysis: A new tool
to investigate antibody-mediated chronic graft rejection; ERA-EDTA XLX congress, Istambul (Turkey) 2013.
• MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Il fosfoproteoma dei linfomonociti periferici (LMP): uno strumento innovativo per lo
studio del rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM); 54 Congresso nazionale SIN, Firenze 2013.
• MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Phosphoproteome analysis of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) to
investigate antibody-mediated chronic graft rejection; 1st Meeting on OMICS, Bari 2013.
• MT Rocchetti, … G. Grandaliano et al. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) phosphoproteome analysis to investigate
antibody-mediated chronic graft rejection; ASN Kidney Week 2013

Comunicazioni / Poster
• ASN 2012. miRNA Microarray Expression Profiling in Human Diabetic Nephropathy
Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L
• SIN 2012. Ruolo dell’interferone alfa nella risposta immune in corso di rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM)
Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Zito A, Stallone G, Gigante M, Schena A, Castellano G, Schena FP, Gesualdo L,
Grandaliano G.
• SITO 2012. Ruolo dell’interferone alfa nella risposta immune in corso di rigetto cronico anticorpo-mediato (RCAM)
Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Zito A, Stallone G, Gigante M, Schena A, Castellano G, Schena FP, Gesualdo L,
Grandaliano G.
• ERA-EDTA 2012. Characterization of the transcriptomic profile of pheripheral lymphomonocytes in renal chronic
antibody-mediated rejection (CAMR)
Rascio F, Pontrelli P, Accetturo M, Gigante M, Gigante M, Tataranni T, Zito A, Schena A, Schena FP, Stallone G, Gesualdo L,
Grandaliano G
• SIN 2013 (Selected as Best Poster). Caratterizzazione dei miRNA espressi a livello renale in corso di Nefropatia
Diabetica
Conserva F, Pontrelli P, Accetturo M, Cordisco G, Oranger AR, Di Palma AM, Grandaliano G*, Gesualdo L
• 1st Meeting on OMICS towards the Systems Biology Approach in Renal Disease and Transplantation 2013
Transcriptomic profiling of patients with renal transplant under erythropoietin (EPO) treatment
Accetturo M, Montemurno E, Fiorentino M, Pontrelli P, Zaza G, Castellano G, Pertosa GB, Grandaliano G, Gesualdo L.

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI METABOLOMICA
Attività 2010 - 2013
 2010:
Analisi metabolomica di urine di pazienti affetti da IgA Nefropatia (in
collaborazione con Unità di ricerca di metabolomica dell’Università di
Verona, Prof. H. Molinari, Prof. M. Assfalg);
 2011:
Analisi metabolomica di oli di oliva extravergini italiani (pugliesi) e non
italiani (Tunisia, Spagna, Grecia), committente Olearia Basile snc Bari;
 2012:
Analisi metabolomica di oli extravergini di oliva pugliesi provenienti da
alberi secolari (collaborazione con CRA, Centro di Ricerca per
l’Olivicoltura e l’Industria Olearia, Rende, CS);
 2013:
Analisi metabolomica di vini monovarietali autoctoni pugliesi, forniti dal
CRA-UTV (Unità di ricerca per l’uva da tavola e la vitivinicoltura in
ambiente mediterraneo), Turi (BA).

Pubblicazioni
•Papadia P, Del Coco L, Muzzalupo I, Rizzi M, Perri E, Cesari G, Simeone V, Mondelli D,
Schena FP, Fanizzi FP. Multivariate analysis of 1H-NMR spectra of genetically characterized
extra virgin olive oils and growth soil correlations. J Am Oil Chem Soc 88, 1463-1475
(2011)
• Del Coco L, Schena FP, Fanizzi FP. 1H Nuclear Magnetic Resonance Study of Olive Oils
Commercially Available as Italian Products in the United States of America. Nutrients 4,
343-355 (2012)
• Del Coco L, Assfalg M, D’Onofrio M, Sallustio F, Pesce F, Fanizzi FP, Schena FP. A proton
nuclear magnetic resonance-based metabolomic approach in IgA nephropathy urinary
profiles. Metabolomics 9, 740-751 (2013)
• Del Coco L, Perri E, Cesari G, Muzzalupo I, Zelasco S, Simeone V, Schena FP, Fanizzi FP.
NMR-based metabolomic approach for EVOO from secular olive trees of Apulia region.
Eur J Lipid Sci Technol 115, 1043–1052 (2013)

 Comunicazioni/Poster
 Caratterizzazione Geografica e Varietale di Oli Extra Vergini di Oliva Monovarietali Pugliesi mediante Analisi
NMR e Multivariata.
• Papadia P, Del Coco L, Muzzalupo I, Rizzi M, Perri E, Cesari G, Simeone V, Mondelli D, Schena FP, Fanizzi FP
(comunicazione orale)
• Workshop: Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, GIDRM, Roma, 27-28
Maggio 2010
 Influenza della modalità di lavorazione delle olive nella discriminazione varietale di oli extra vergini di oliva
mediante spettroscopia NMR.
• Del Coco L, Papadia P, Bilancia MT, Summo C, Caponio F, Rizzi M, Schena FP, Fanizzi FP (poster)
• Workshop: Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, GIDRM, Roma, 27-28
Maggio 2010
 NMR per la caratterizzazione geografica e varietale di olio di oliva extravergine pugliese.
• Fanizzi FP, Del Coco L, Papadia P, Perri E, Zelasco S, Cesari G, Muzzalupo I, Rizzi M, Simeone V, Mondelli D,
Schena FP (comunicazione orale)
• Workshop: GDRM Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, Roma 28-29
Maggio 2012
 Caratterizzazione di oli extravergini di oliva e relative paste e sanse mediante spettroscopia NMR.
• Fanizzi FP, De Pascali SA, Del Coco L, Iacovelli V, Cesari G, Muzzalupo I, Portoghese M, Gaimari M,
Meneghesso M, Bianchi D, Schena FP (poster)
• Workshop: GDRM Applicazioni della Risonanza Magnetica nella Scienza degli Alimenti, Roma 28-29
Maggio 2012

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI
SISTEMI.
Partecipazioni a Convegni e Congressi
• N. Ancona. Dall’Intelligenza Artificiale alla Systems Medicine. BiP-Day 2013 -
Prima Giornata della Bioinformatica Pugliese, 5 Dicembre 2013. Bari.
Comunicazione Orale.
• T.M. Creanza. Systems Biology for understanding complex human diseases.
Matlab and Simulink conference 2013, 6 Novembre 2013, Roma. Comunicazione
Orale.
• P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee and N. Ancona, A
comparative study of Gaussian Graphical Model approaches for genomic data, Il
Nuovo Cimento C, 35: 119-127, 2012.
• P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee, N. Ancona, A
comparative study of covariance selection models for the inference of gene
regulatory networks, Journal of Biomedical Informatics, 46: 894–904, 2013.
• F. Valerio, M. Di Biase, L. Caputo, T. M. Creanza, N. Ancona, A. Visconti, P.
Lavermicocca, Effect of Lactobacillus brevis-based bioingredient and bran on
microbiological, physico-chemical and textural quality of yeast-leavened bread
during storage, Innovative Food Science and Emerging Technologies, INNFOO–
01059, No of Pages 7, in PRESS.

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOLOGIA DEI SISTEMI.
Partecipazioni a Convegni e Congressi
• P.F. Stifanelli, T.M. Creanza, R. Anglani, V.C. Liuzzi, S. Mukherjee, and N. Ancona. A comparative study of Gaussian
Graphical Model approaches for genomic data. In Structural Biology and Bioinformatics. 1st International
Workshop on Pattern Recognition in Proteomics, 13 Settembre 2011, Ravenna - Italia. Comunicazione orale.
• R. Anglani, T. M. Creanza, V. C. Liuzzi, P. F. Stifanelli, R. Maglietta, A. Piepoli, S. Mukherjee, P. F. Schena, N. Ancona.
Topological Study of Coexpression Network in Neoplastic Tissues. EMBnet. journal 18 (A), pp 127. BITS2012, Ninth
Meeting of Bioinformatics Italian Society, 3 Maggio 2012, Catania - Italia. Comunicazione Poster.
• T. M. Creanza, R. Maglietta, V. C. Liuzzi, R. Anglani, P. F. Stifanelli, A. Piepoli, S. Mukherjee, F. P. Schena, N. Ancona.
A microRNA-mRNA Integrated Pathway Analysis: An Application To Colorectal Cancer, EMBnet. journal 18 (A), pp
129. BITS2012, Ninth Meeting of Bioinformatics Italian Society, 3 Maggio 2012, Catania - Italia. Comunicazione
Poster.
• T. M. Creanza, V. C. Liuzzi, R. Maglietta, R. Anglani, P. F. Stifanelli, A. Piepoli, S. Mukherjee, F. P. Schena, N. Ancona.
Comparative study of microRNA pathway analysis methodologies in colorectal cancer. WCSB2012, 9th
International Workshop on Computational Systems Biology, 4 Giugno 2012, Ulm - Germania. Comunicazione
Poster.
• O. Palmieri, F. Bossa, T.M. Creanza, T. Latiano, G. Corritore, F. Bossa, D. Scimeca, G. Biscaglia, V.C. Liuzzi, R. Anglani,
M. Carella, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting the role of Unfolded Protein Response pathway in
Inflammatory Bowel Disease: In silico mRNA-miRNA co-expression analysis. ECCO2013, 8th ECCO DigestScience
Workshop, 16 Febbraio 2013, Vienna - Austria. Comunicazione Orale.
• O. Palmieri, T. M. Creanza, G. Corritore, T. Latiano, N. Buccianti, D. Scimeca, G. Biscaglia, V. C. Liuzzi, R. Anglani, G.
Martino, M. Carella, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting the role of Unfolded Protein Response pathway
in Inflammatory Bowel Disease: In silico mRNA-miRNA co-expression analysis. Digestive Disease Week, 18-21
maggio 2013, Orlando – Florida. Comunicazione Orale.
• O. Palmieri, T. M. Creanza, F. Bossa, D. Scimeca, G. Biscaglia, G. Corritore, T. Latiano, R. Anglani, M. Carella, N.
Ancona, V. Annese, A. Andriulli, A. Latiano. Dissecting The Trascriptome And Mirnome In Inflammatory Bowel
Disease: In Silico Mrna-Microrna Co-Expression Analysis. Congresso Nazionale IG – IBD, 7-9 Novembre 2013,
Padova. Comunicazione Orale.

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA
Pubblicazioni
• Lucarelli G, Ditonno P, Bettocchi C, Vavallo A, Rutigliano M, Galleggiante V, Larocca A, Castellano G, Gesualdo L, Grandaliano G,
Selvaggi FP, Battaglia M. DIAGNOSTIC AND PROGNOSTIC ROLE OF PRE-OPERATIVE CIRCULATING CA 15-3, CA 125 AND BETA-2
MICROGLOBULIN IN RENAL CELL CARCINOMA Disease Markers 2014 (in press)
• Lucarelli G, Rutigliano M, Bettocchi C, Palazzo S, Vavallo A, Galleggiante V, Trabucco S, Di Clemente D, Selvaggi FP, Battaglia M,
Ditonno P. SPONDIN-2, A SECRETED EXTRACELLULAR MATRIX PROTEIN, IS A NOVEL DIAGNOSTIC BIOMARKER FOR PROSTATE
CANCER. J Urol. 2013 Dec;190(6):2271-7.
• Lucarelli G, Fanelli M, Larocca AM, Germinario CA, Rutigliano M, Vavallo A, Selvaggi FP, Bettocchi C, Battaglia M, Ditonno P.
SERUM SARCOSINE INCREASES THE ACCURACY OF PROSTATE CANCER DETECTION IN PATIENTS WITH TOTAL SERUM PSA LESS
THAN 4.0 NG/ML. Prostate. 2012 Nov;72(15):1611-21.
• Lucarelli G, Ditonno P, Bettocchi C, Spilotros M, Rutigliano M, Vavallo A, Galleggiante V, Fanelli M, Larocca AM, Germinario CA,
Maiorano E, Selvaggi FP, Battaglia M. SERUM SARCOSINE IS A RISK FACTOR FOR PROGRESSION AND SURVIVAL IN PATIENTS
WITH METASTATIC CASTRATION-RESISTANT PROSTATE CANCER. Future Oncol. 2013 Jun;9(6):899-907.
•Muscarella LA, D'Agruma L, la Torre A, Gigante M, Coco M, Parrella P, Battaglia M, Carrieri G, Carella M, Zelante L, Fazio VM,
Gesualdo L, Ranieri E. VHL GENE ALTERATIONS IN ITALIAN PATIENTS WITH ISOLATED RENAL CELL CARCINOMAS. Int J Biol
Markers. 2013 Jun 28;28(2):208-15.
• de Martino M, Gigante M, Cormio L, Prattichizzo C, Cavalcanti E, Gigante M, Ariano V, Netti GS, Montemurno E, Mancini
V, Battaglia M, Gesualdo L, Carrieri G, Ranieri E.JAK3 IN CLEAR CELL RENAL CELL CARCINOMA: MUTATIONAL SCREENING AND
CLINICAL IMPLICATIONS. Urol Oncol. 2013 Aug;31(6):930-7.
•Fuzio P, Ditonno P, Rutigliano M, Battaglia M, Bettocchi C, Loverre A, Grandaliano G, Perlino E. REGULATION OF TGF-Β1
EXPRESSION BY ANDROGEN DEPRIVATION THERAPY OF PROSTATE CANCER. Cancer Lett. 2012 May 28;318(2):135-44.
•Fuzio P, Ditonno P, Lucarelli G, Battaglia M, Bettocchi C, Senia T, Perlino E. ANDROGEN DEPRIVATION THERAPY AFFECTS BCL-2
EXPRESSION IN HUMAN PROSTATE CANCER. Int J Oncol. 2011 Nov;39(5):1233-42.

Attività promozionali svolte dalla PIATTAFORMA DI BIOBANCA
Comunicazioni/Poster
• G. Lucarelli, M. Rutigliano, M. Fanelli, A. Larocca, A. Vavallo, C. Germinario, F.P. Selvaggi, C. Bettocchi, M. Battaglia, P.
Ditonno. “Serum sarcosine is more accurate than PSA in low-risk prostate cancer detection”84 Congresso nazionale
S.I.U.,2011
• Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Bettocchi C, Ditonno P, Vavallo A, Battaglia M. “Carcinoma renale: la
possibile deregolazione trascrizionale di cellule staminali/progenitrici adulte renali porta all’oncogenesi?”84 Congresso
nazionale S.I.U., 2011
• Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Ricapito V, Bettocchi C, Vavallo A, Selvaggi FP, Battaglia M.
“Identificazione e caratterizzazione delle cellule staminali tumorali del carcinoma renale a cellule chiare: risultati
preliminari”13 Congresso nazionale SUN, 2011
• G. Lucarelli, M. Rutigliano, Galleggiante V, Vavallo A, C. Bettocchi, F.P. Selvaggi, P. Ditonno, M. Battaglia. “Serum sarcosine
increase the accuracy of prostate cancer detection in low range PSA (<4 ng/ml)” 13 Congresso nazionale SUN, 2011
• Lucarelli G, Larocca A, Fanelli M, Germinario C, Rutigliano M, Vavallo A, Bettocchi C, Selvaggi F P, Battaglia M, Ditonno P.
“SERUM SARCOSINE INCREASES THE ACCURACY OF PROSTATE CANCER DETECTION IN LOW RANGE PSA”European Urology
Supplements, Mar 2011, Vol 10, Issue 2: 205, 26th Annual EAU Congress, Vienna, 2011
• Vavallo A, Lucarelli G, Tedeschi M, Impedovo SV, Rutigliano M, Bettocchi C, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P.”DIABETES
MELLITUS IS A RISK FACTOR FOR RECURRENCE AND MORTALITY IN PATIENTS WITH RENAL CELL CARCINOMA” European
Urology Supplements, Mar 2011, Vol 10, Issue 2: 139-140, 26th Annual EAU Congress, Vienna, 2011
• Galleggiante V, Rutigliano M, Sallustio F, Lucarelli G, Bettocchi C, Ditonno P, Vavallo A, Battaglia M. “RENAL CELL
CARCINOMA: DOES TRANSCRIPTIONAL DEREGULATION OF ADULT RENAL STEM/PROGENITOR CELLS LEAD TO
ONCOGENESIS?”Anticancer Research, May 2011, Vol 31, Issue 5: 1893-1894, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011.
• Rutigliano M, Lucarelli G, Vavallo A, Tedeshi M, Palazzo S, Bettocchi C, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M. “ASSOCIATION OF
N-ACETYLTRANSFERASE 2 POLYMORPHISM WITH RISK FACTORS IN UROTHELIAL CANCER”Anticancer Research, May 2011,
Vol 31, Issue 5: 1892-1893, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011.
• Vavallo A, Lucarelli G, Rutigliano M, Spilotros M, Simone S, Impedovo S, Palazzo S, Bettocchi C, Loverre A, Cariello M,
Grandaliano G, Battaglia M, Ditonno P.“DIABETES MELLITUS IN RENAL CELL CARCINOMA: ROLE OF OGG1 AND
TUBERIN”Anticancer Research, May 2011, Vol 31, Issue 5:1898-1899, 21 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2011.
• Lucarelli G, Forte S, Vavallo A, Rutigliano M, Galleggiante V, Bettocchi C, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M.”THE
DIAGNOSTIC ROLE OF CA 15-3, CA 125 AND BETA2-MICROGLOBULIN IN RENAL CELL CARCINOMA.”Anticancer Research,
May 2012, Vol 32, Issue 5: 1930, 22 Congresso Nazionale S.I.Ur.O, 2012

• Vavallo A, Forte S, Rutigliano M, Lucarelli G, Galleggiante V, Bettocchi C, Ditonno P, Ricapito V, Selvaggi FP, Battaglia
M.“Ruolo diagnostico del CA 15-3, CA 125, e della beta2-microglobulina nel carcinoma renale a cellule chiare ”85°
Congresso nazionale S.I.U, 2012
• Lucarelli G, Vavallo A, Rutigliano M, Bettocchi C, Spilotros M, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P.“La sarcosina sierica è un
fattore di rischio per la progressione e la sopravvivenza di pazienti con carcinoma prostatico ormono-refrattario in
trattamento con docetaxel”85° Congresso nazionale S.I.U, 2012
• Vavallo A, Lucarelli G, Rutigliano M, Galleggiante V, Bettocchi C, Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P. “ La sarcosina sierica è
aumentata nei pazienti con carcinoma prostatico ed è un fattore di rischio per progressione e morte nella malattia
metastatica ormonorefrattaria”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova,2013
• Lucarelli G, Rutigliano M, Galleggiante V, Vavallo A, Palazzo S, Martino P, Di Lorenzo V, Palumbo F, Ricapito V, Bettocchi C,
Selvaggi FP, Battaglia M, Ditonno P. “ Spondin2 (SPON2) è un biomarker diagnostico più specifico per il carcinoma della
prostata”XV° Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova, 2013
• Lucarelli G, Galleggiante V, Rutigliano M, Ditonno P, Bettocchi C, Vavallo A, Selvaggi FP, Battaglia M. “ Isolamento e
catatterizzazione delle cellule staminali tumorali del carcinoma renale a cellule chiare”XV° Congresso Nazionale della
Società Urologia Nuova,2013
• Rutigliano M, Vavallo A, Galleggiante V, Lucarelli G, Matera M, Campagna M, Palumbo F, Selvaggi FP, Ditonno P, Battaglia M,
Bettocchi C. “Isolamento di cellule epiteliali uroteliali EPCAM+ per rigenerazione di tessuto uroteliale in vitro”XV°
Congresso Nazionale della Società Urologia Nuova, 2013
• M. Rutigliano, A. Vavallo, V. Galleggiante, G. Lucarelli, F. Giangrande, M. Matera, M. Campagna, D. Di Clemente, F. Palumbo,
P. Ditonno, M. Battaglia, C. Bettocchi “Nuova metodica di isolamento di cellule epiteliali uroteliali EpCAM+ per
rigenerazione tissutale in vitro”86° Congresso nazionale S.I.U., 2013
• V. Galleggiante, M. Rutigliano, G. Lucarelli, P. Ditonno, C. Bettocchi, A. Vavallo, M. Campagna, F. Selvaggi, M. Battaglia
“Identificazione e caratterizzazione delle cellule staminali tumorali nel carcinoma renale a cellule chiare: ctr2 come
marcatore putatativo di cellule staminali tumorali”86° Congresso nazionale S.I.U, 2013
• G. Lucarelli, M. Rutigliano, V. Galleggiante, A. Vavallo, C. Bettocchi, S. Palazzo, M. Matera, G. Di Cosmo, O. Colamonico, M.
Ancona, M. Campagna, F. Selvaggi, P. Ditonno, M. Battaglia “Spondin 2 - una proteina della matrice extracellulare- è un
nuovo marcatore del carcinoma prostatico”86° Congresso nazionale S.I.U., 2013

Attività programmate
- Progetto DIMOSTRATORE– Partecipano tutte le Piattaforme
FIRB RBAP11B2SX CAROMICS
- Progetti di ricerca – Piattaforma di Genomica
PON REC 01-01958 PIVOLIO
PON REC 03-00134 ONEV
- Progetti di ricerca – Piattaforma di Trascrittomica
Giovani Ricercatori (GR-2009-1608662): Therapeutic Inhibition of Classical and Lectin Pathways of
Complement to Prevent Local and Systemic effects of Renal Ischemia Reperfusion Injury
Progetto AIRC 2012: Neoplasie post-trapianto
Progetto in collaborazione con l’Amgen Dompè per lo studio di pattern trascrittomici modulati
dall’uso dell’eritropoietina in pazienti sottoposti a trapianto renale
-Progetti di ricerca – Piattaforma di Proteomica
RICERCANDO 2010 (Società Italiana di Nefrologia): “Identificazione di biomarcatori affidabili di
nefropatia
diabetica mediante strategie di analisi proteomica complementari” (UO coordinator M. Papale)
RF 2009 Min. Sanità: Chronic rejection in kidney transplantation: identification of new diagnostics
targets (UO coordinator G. Grandaliano)
RF 2009 (Min. Sanità): “Prevalenza ed impatto sulla mortalità totale della malattia cronica renale
in pazienti con diabete mellito di tipo 2 in Puglia” (UO coordinator L. Gesualdo)
- Progetti di ricerca – Piattaforma di Metabolomica
PON REC 01-01958 PIVOLIO

- Depositi brevetti
Piattaforma di Genomica:
• PCT/IB2011/002637 “Combination of active ingredients for the
treatment of the acute kidney injury ”
• PCT/IB2011/002494 “Method and kit for the diagnosis of IgA-
Nephropathy”
- Rapporti con Aziende:
Piattaforma di Genomica e Metabolomica
- ApuliaBiotec. Bari
- Oliveti Terra di Bari. Bitonto
- Basile. Andria

METABOLOMICAPROTEOMICATRASCRITTOMICAGENOMICA
OMICHE E BIOLOGIA DEI SISTEMI (BISIMANE)
APPROCCIO INTEGRATO
PIATTAFORME Illumina Agilent Autoflex Bruker

Contatti dei responsabili del Progetto BISIMANE
Prof. Francesco Paolo Schena paolo.schena@uniba.it
Prof. Loreto Gesualdo loreto.gesualdo@uniba.it
Prof. Elena Ranieri e.ranieri@unifg.it
Prof. Francesco Paolo Fanizzi fp.fanizzi@unisalento.it
Prof. Michele Battaglia michele.battaglia@uniba.it
Dr. Nicola Ancona ancona@ba.issia.cnr.it
Contatti dei responsabili delle Piattaforme del Progetto BISIMANE
Piattaforma di Genomica e Metabolomica
Dr.F.Sallustio fabio.sallustio@uniba.it
Dr.ssa SN.Cox sharoncox@libero.it
Dr.ssa R. Ragone rosaragone@yahoo.it
Dr.ssa S.Piccinonna sara.piccinonna@libero.it
Piattaforma di Trascrittomica
Dr.M.Accetturo matteo.accetturo@uniba.it
Piattaforma di Proteomica
Dr.M.Papale massimo.papale@unifg.it
Dr.ssa Maria Teresa Rocchetti mariateresa.rocchetti@unifg.it
Piattaforma di Metabolomica
Dr.ssa L.Del Coco lauradelcoco@gmail.com
Piattaforma di Biologia dei Sistemi
Dr.ssa MT.Creanza creanza@ba.issia.cnr.it
BioBanca
Dr.ssa M.Rutigliano monica.rutigliano@virgilio.it

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