＠第194回農林交流センターワークショップ

1. 第194回 農林交流センターワークショップ
植物科学・作物育種におけるフェノーム解析
はじめて画像処理を行う研究者のための入門実習
ImageJ を使った画像解析実習
ソフトウェアのインストールと
データのダウンロード
東京大学 / エルピクセル (株) 湖城 恵

2. Contents
・ImageJ のインストール (Win / Mac)
・画像をいつも ImageJ で開くには
・ImageJ plugin の導入
(時間が余れば)
・ImageJ で最初に設定すると便利な項目の紹介

3. Windows の場合

4. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
ブラウザを開き「ImageJ ダウンロード」などで検索

5. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
この画面が表示されたら、ほぼ完了
Mac はこっち
Windows はこっち

6. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
いろいろな種類があるけれど?
64 bit のWindows はこっち
32 bit のWindows はこっち
Mac は1種類 (32 bit 版と64 bit 版の両方)

7. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
64 bit か32 bit かの調べ方 ¦ Windows
コントロールパネル
- システムとセキュリティ

8. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
zip ファイルをダウンロード
ダウンロードフォルダ
デスクトップに展開

9. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
アプリケーションファイルは、どこに保存しても大丈夫
(program files に入れるのが安心?)
# ショートカットキーの作成は、右クリック - 送る - デスクトップ (ショートカットキーの作成)
# 保存場所が異なれば、
複数のバージョンを
管理できる
インストール完了

10. Mac の場合

11. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
64 bit か32 bit かの調べ方 ¦ Mac
このMacについて プロセッサを確認
32 bit
Intel Core Solo
Intel Core Duo
64 bit
Intel Core 2 Duo
Intel Quad-Core Xeon
Dual-Core Intel Xeon
Quad-Core Intel Xeon
Core i3
Core i5
Core i7

12. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
zip ファイルをダウンロード
展開
ダウンロードフォルダ

13. ImageJ のインストール ¦ zipを落とすだけ
Mac の場合もアプリケーションファイルは、どこに保存しても大丈夫
# 保存場所が異なれば、
複数のバージョンを
管理できる
(アプリケーションフォルダに入れるのが安心?)
インストール完了

14. 画像をいつも ImageJ で開くには
画像を開くと...
Windows フォトビューアーが
起動する
画像を開くアプリケーションとしてImageJを指定したい

15. 画像をいつも ImageJ で開くには
画像を右クリック - プロパティ - 変更 開くプログラムの選択で参照をクリック
ImageJを選択
JPEG画像はいつでも
ImageJで開ける

16. ImageJ plugin の導入
ImageJ フォルダの plugin フォルダに入れるだけ
# plugin は
***.class
***.jar
***.java 等

17. ImageJ plugin の導入
https://lpixel.net/services/research/lpixel-imagej-plugins/
plugin をダウンロード
Scala もダウンロード

18. おすすめの初期設定 - 1
ImageJ に割りあてるメモリ量を設定できる

19. おすすめの初期設定 - 1
白背景か、黒背景か選択できる