Bakteri diklasifikasikan berdasarkan bentuk tubuhnya (kokus, basil, vibrio, spirillum), letak flagelanya, dan uji Gram. Ada empat bentuk utama: kokus (bulat), basil (batang), vibrio (koma), dan spirillum (spiral). Contohnya termasuk Streptococcus dan Staphylococcus.