Apresentação feita por Solange Santos no VI Ciclo de Debates Periódicos UFSC, realizado nos dias 3 e 4 de de maio de 2018 na Universidade Federal de Santa catarina.
2. Tendências SciELO para publicações científicas
Solange Santos
Coordenadora de Publicação
Programa SciELO / FAPESP
Solange Santos, SciELO, CC-BY, 03 de maio 2018
3. Evolução do Modelo SciELO – 20 ANOS
Metapublisher
Plataforma comum
Infraestrutura de pesquisa
Preprint
Periódico
Autor
1998 – constituindo-se:
indexação, publicação,
interoperabilidade, agregação
2013 – melhorando qualidade:
serviços online para manuscritos
publicação contínua
maior interoperabilidade
2017-18 – ciência aberta
Preprint (OSF)
Autoria (Texture)
Dados abertos (Figshare)
Dados de Pesquisa - Referenciamento
Word
ou Latex
XML
JATS
PDF
ePUB
4. Modelo SciELO de Publicação – a edição dos artigos
A estrutura de comunicação da pesquisa como um continuum
• Rumo a intermediação minimizada – pontos de publicación
artigo final
com paginação
ou id eletrônico
4
XML, PDF, EPUB
- v(n):p1-p2
- v(n):elocation id
- v:elocation id
DOI-1
artigo final
sem paginação
(ahead of print)
3
XML, PDF
- data de publicação
DOI-1
artigo aprovado
em edição
Provisional PDF
2
PDF [futuro: XML, PDF]
- data de publicação
DOI-1
Manuscrito
preprint
1
PDF [futuro: XML, PDF]
- data de publicação
DOI-2
Solange Santos, SciELO, CC-BY, 03 de maio 2018
5. A Publicação Contínua é uma modalidade de publicação que visa
acelerar/antecipar a publicação no ano corrente e/ou no próximo ano.
Publicação Contínua
Apenas para periódicos online;
Publicação definitiva;
Diminui etapas do processo
editorial;
Indexado por bases que geram
indicadores.
Ahead of Print
Para periódicos impresso e online;
Publicação em transição;
Aumenta etapas do processo editorial;
Não é indexado por todas as bases (Ex:
Scopus e WoS) bases que publicam
indicadores;
Modelo de Publicação: Publicação Contínua x Ahead of Print
Solange Santos, SciELO, CC-BY, 03 de maio 2018
6. • Os artigos, números e volumes podem ser estruturados de três formas:
FAPESP - CAPES - CNPq - BIREME - FAP UNIFESP
Modelo de Publicação Contínua
Características técnicas
Solange Santos, SciELO, CC-BY, 03 de maio 2018
7. Perde-se paginação sequencial (apenas para impressão 1-X)
• Uso de identificador para cada documento dentro de um fascículo
elocation-id ;
FAPESP - CAPES - CNPq - BIREME - FAP UNIFESP
Características técnicas
Legenda bibliográfica PDF com elocation-id
Legenda bibliográfica PDF com paginação sequencial
Modelo de Publicação O que é a Publicação Contínua
8. ATENÇÃO: Publicação no Passado = em 2018 publicar artigos de 2017
FAPESP - CAPES - CNPq - BIREME - FAP UNIFESP
*SciELO recomenda a adoção de volume anual sem número.
Grade de números em SciELO
Legenda bibliográfica do artigo no site
Modelo de Publicação Contínua
9. Exemplo: Citação recomendada pelo PLoSOne - volume, número, elocation-id e
doi.
Bessi A, Coletto M, Davidescu GA, Scala A, Caldarelli G, et al. (2015) Science vs
Conspiracy: Collective Narratives in the Age of Misinformation. PLoS ONE 10(2):
e0118093. doi:10.1371/journal.pone.0118093
FAPESP - CAPES - CNPq - BIREME - FAP UNIFESP
Modelo de Publicação Contínua
Características técnicas
10. FAPESP - CAPES - CNPq - BIREME - FAP UNIFESP
Principais benefícios
Os artigos são publicados imediatamente após estarem finalizados;
Os artigos não dependem de fechamento de números;
A interoperabilidade entre bases dos artigos é mais rápida;
Os artigos ganham maior tempo de exposição;
O tempo de exposição aumenta a expectativa de citação;
O processo de gestão editorial ganha maior flexibilidade.
Modelo de Publicação Contínua
11. Linhas prioritárias de Ação 2013-2017
Profesionalização,
Internacionalização e
sustentabilidade financeira
Critérios 2018 – Alinhamento com a Ciência
Aberta
Editoriais, apresentações, etc.: título
próprio, autoria, afiliação, citação e
referências
Dupla publicação, traduções,
Datas históricos: dia, mês e ano
Licença CC também no PDF
ORCID - Recomendado
Dados de Pesquisa – Referenciamento
Preprint (OSF)
Criterios SciELO Brasil
12. “Artigos científicos são o principal resultado tangível e duradouro de um cientista.
É como comunicamos nossas descobertas e como somos avaliados para
contratações, promoções e prêmios. O sistema atual pelo qual trabalhos
científicos são publicados precede a Internet por várias centenas de anos, e
pouco mudou ao longo dos séculos.”
Acreditamos que este sistema não serve mais às necessidades dos cientistas.
... É lento ... É caro ... É arbitrário ... É inacessível ..
EISEN, M. and VOSSHALL, L.V. Associando Pre-Prints e Revisão por Pares Pós-Publicação para Publicação Científica Rápida, Barata e Efetiva [Publicado originalmente no
blog “it is not junk” de Michael Eisen] [online]. SciELO em Perspectiva, 2016 [viewed 21 June 2017]. Available from: https://goo.gl/pF8HPR
Evolução do Modelo de Publicação
Forças e tendências mundiais
13. O que é um preprint?
O que é um servidor ou repositório de Preprints?
“Um preprint é um manuscrito científico completo que é depositado
pelos autores em um servidor público. O preprint contém dados e
metodologias completos; é frequentemente o mesmo manuscrito que
está sendo submetido a um periódico (…). Depois de uma breve
inspeção de controle de qualidade para garantir que o trabalho é de
natureza científica, o manuscrito do autor é publicado na Web dentro
de aproximadamente um dia sem passar por avaliação pelos pares e
pode ser visualizado gratuitamente por qualquer pessoa no mundo. ...”
Preprint info center. What is a preprint? [online] ASAPbio. 2016 [viewed 16 February 2017].
Available from: http://asapbio.org/preprint-info
15. “Com base no feedback e/ou novos dados, novas versões do seu preprint podem
ser submetidas; no entanto, versões anteriores do preprint também são
mantidas.
Os servidores de preprint permitem que os cientistas controlem diretamente a
disseminação de seu trabalho na comunidade científica mundial. Na maioria
dos casos, o mesmo trabalho publicado como preprint também é submetido
para avaliação por pares em um periódico. Assim,...
Os preprints (rápidos, mas não validados através de peer review) e a
publicação de ...
Periódicos (lentos, mas validados por meio de peer-review) funcionam em
paralelo como um sistema de comunicação da pesquisa científica”.
Preprint info center. What is a preprint? [online] ASAPbio. 2016 [viewed 16 February 2017]. Available
from: http://asapbio.org/preprint-info
O que é um preprint?
O que é um servidor ou repositório de Preprints?
16. Citation: Bourne PE, Polka JK, Vale RD, Kiley R (2017)
Ten simple rules to consider regarding preprint submission.
PLoS Comput Biol 13(5): e1005473. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005473
Published: May 4, 2017
Preprints:
1. speed up dissemination
2. should be licensed and formatted to facilitate reuse
3. provide a record of priority
4. do not lead to being scooped
5. provide access to scholarly content that would otherwise be lost
6. do not imply low quality
7. support the rapid evaluation of controversial results
8. do not typically preclude publication
9. can further inform grant review and academic advancement
10.one shoe does not fit all
acelera a disseminação
deve ter licença de uso, reutilizável, incorporar dados, ...
provê registro de prioridade de aparecimento, autoria, ...
assegura originalidade, evita furos / passar na frente ...
provê acesso a conteúdos acadêmicos que hoje são perdidos
não implica qualidade baixa, ao contrário ...
contribui para a avaliação rápida de resultados polêmicos
não impede publicação em periódicos
informa avaliação de auxílios e progresso na carreira acadêmica
nem tudo pode ser depositado ... ethical, legal, and social issues (ELSI)
17. Data from prepubmed.org, retrieved February 20, 2018.
• ArXiv (1.377,322)
• BioRxiv (~15000)
• PeerJ (~4000)
• SocArXiv (~1000)
Preprint Tendência mundial em varias áreas
18. Anunciado em Fevereiro de 2017
ASAPBio é a referência
Operação regular esperada a partir de julho de 2018
Plataforma OSF (Open Science Framework), do COS (Center for
Open Science)
Servidor preprint – coleção SciELO
Compatível com o estado da arte internacional
Motivações específicas
Valorização e posicionamento dos periódicos SciELO e do
Programa SciELO
Vantagens/objetivos dos preprints, especialmente
acelerar a publicação
SciELO Preprints
19. Mudanças de Paradigmas
Ineditismo
Papel do periódico passa a ser o de “validador” do conteúdo.
Avaliação duplo-cega
Perde o sentido já que os autores poderão ser facilmente identificados.
Ciência Aberta.
Avaliação por pares
Modelo como conhecemos hoje está sendo questionado
20. Próximos Passos
“Call for preprints” inicialmente para periódicos da área de
biológicas;
Incentivo a autores;
Definição de políticas, critérios;
Definição do comitê de moderação;
Pré-aprovação via ORCID ID quando houver 2 ou mais artigos
publicados no SciELO;
Adesão dos periódicos SciELO Brasil;
Consolidação dos preprints nos próximos 2-3 anos.
21. Integridade, validade – confiabilidade – avaliação das pesquisas
Preocupações globais sobre a reprodutibilidade (+50% não reprodutíveis)
visibilidade - impacto da pesquisa
abertura
interoperabilidade – interna e externa
transparência e boas práticas
maximizar uso – maior produtividade; permitir reutilização, menor
desperdício de tempo na duplicação de trabalho, retorno dos
investimentos em pesquisa
Dados Abertos de pesquisa: reconhecimento da comunidade do valor dados
Evolução do Modelo de Publicação
Forças e tendências mundiais
FREEDMAN, L. P., COCKBURN, I. M. and SIMCOE, T. S. The Economics of Reproducibility in Preclinical Research. PLOS Biology [online]. 2015, vol. 13, no. 6, e1002165, ISSN: 1545-7885 [viewed 29 October 2017]. DOI:
10.1371/journal.pbio.1002165. Available from: http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.1002165
BAKER, M. 1,500 scientists lift the lid on reproducibility [online]. Nature. 2016 [viewed 29 October 2017]. Available from: http://www.nature.com/news/1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-1.19970
22. Forças e tendências mundiais
State of Open Data survey 2017 [online]. Figshare. 2017 [viewed 29 October 2017].
Available from: https://figshare.com/articles/State_of_Open_Data_survey_2017/5480710
Maior consciência entre pesquisadores da importância dados abertos – 73% - 82%
Maior disposição dos pesquisadores para reutilizar dados abertos passou de 10% - 80%
Aumento da proporção de pesquisadores que organizam seus dados visando compartilhamento
Aumento da proporção pesquisadores que compartilham seus dados: 57% para 60%
23. Forças e tendências mundiais
State of Open Data survey 2017 [online]. Figshare. 2017 [viewed 29 October 2017].
Available from: https://figshare.com/articles/State_of_Open_Data_survey_2017/5480710
O futuro será mais aberto...
70% dos pesquisadores agora estão dispostos a reutilizar dados abertos em suas
próprias pesquisas
24. FAIR data principles – principios para a gestão cuidadosa de datos
Findable, Accessible, Interoperable, Reusable.
TOP Guidelines – Diretrizes de promoção de transparencia, abertura e
reprodutibilidade dos estudos
Transparency and Openness Promotion (TOP)
Encontráveis, Acessíveis, Interoperavéis e Reutilizáveis
Promoção da Transparência e Abertura
Gestão dos dados de pesquisa– condições, diretrizes, etc
SciELO recomenda o deposito de dados em repositórios seguindo princípios FAIR e
TOP Guidelines
citação–referenciamento - ponto crítico na comunicação das pesquisas
identificação / recomendação de repositórios
figshare – extração automática de tabelas, imagens, ...
25. Findable / Encontráveis
F1. ids únicos e persistentes
F2. dado com metadados detalhados
F3. metadado com o id do dado
F4. indexados e recuperáveis
Accessible / Acessíveis
A1. recuperáveis pelo id
via protocolo padronizado
A1.1. aberto, livre e universal
A1.2. com autenticação e autorização
A2. metadado acessível
independente do dado
Interoperable / Interoperáveis
I1. formatos / linguagens de dados
I2. vocabulários segundo FAIR
I2. referências a outros metadados
Reusable
R1. exaustivamente descritos
R1.1. licenças de uso
R1.2. fonte / origem detalhada
R1.3. uso de padrões comuns
Princípios FAIR de gestão cuidadosa de [meta] dados de pesquisa
Fonte: Dutch Techcentre for Life Sciences (DTL). https://www.dtls.nl/fair-data/fair-principles-explained/
26. Fonte: COS. Transparency and Openness Promotion Guidelines. https://osf.io/9f6gx/
Citation Standards
Citação no texto e nas referências de todos os dados, códigos de programas e
outros métodos - reconhecimento de contribuição intelectual original
Data Transparency
Analytic Methods (Code) Transparency
Research Materials Transparency
Design and Analysis Transparency
Padrões / diretrizes para informar o desenho da pesquisa e métodos de
análise - dependente das diferentes disciplinas
Study Preregistration
Disponibilidade e acessibilidade do registro do estudo previamente ao início
da pesquisa
Analysis Plan Preregistration
Disponibilidade e acessibilidade do registro do estudo e plano de análise
previamente ao início da pesquisa
Replication
Estudos de reprodução de resultados de pesquisa, especialmente no mesmo
periódico da pesquisa original - expectativa é ser avaliado em dois passos
Padrão / Critério Descrição
Disponibilidade e acessibilidade dos datos, códigos fontes de programas e
outros métodos de análise e materiais de pesquisa com vistas à reprodução
dos resultados ou reaplicação de procedimentos
... OSF/COS - Diretrizes TOP – Promoção da abertura e transparência
8 padrões (ou criterios) de Transparencia
SciELO recomenda o deposito de dados em repositórios seguindo
princípios FAIR e TOP Guidelines
27. Not Level I Level II Level III
Citation Standards
Journal encourages citation of
data, code, and materials, or says
nothing.
Journal describes citation of data in
guidelines to authors with clear
rules and examples.
Article provides appropriate
citation for data and materials used
consistent with journal's author
guidelines.
Article is not published until
providing appropriate citation for
data and materials following
journal's author guidelines.
Data Transparency
Journal encourages data sharing, or
says nothing.
Article states whether data are
available, and, if so, where to
access them.
Data must be posted to a trusted
repository. Exceptions must be
identified at article submission.
Data must be posted to a trusted
repository, and reported analyses
will be reproduced independently
prior to publication.
Analytic Methods (Code) Transparency
Journal encourages code sharing,
or says nothing.
Article states whether code is
available, and, if so, where to
access it.
Code must be posted to a trusted
repository. Exceptions must be
identified at article submission.
Code must be posted to a trusted
repository, and reported analyses
will be reproduced independently
prior to publication.
Research Materials Transparency
Journal encourages materials
sharing, or says nothing.
Article states whether materials are
available, and, if so, where to
access them.
Materials must be posted to a
trusted repository. Exceptions must
be identified at article submission.
Materials must be posted to a
trusted repository, and reported
analyses will be reproduced
independently prior to publication.
Design and Analysis Transparency
Journal encourages design and
analysis transparency, or says
nothing.
Journal articulates design
transparency standards.
Journal requires adherence to
design transparency standards for
review and publication.
Journal requires and enforces
adherence to design transparency
standards for review and
publication.
Study Preregistration Journal says nothing.
Article states whether
preregistration of study exists, and,
if so, where to access it.
Article states whether
preregistration of study exists, and,
if so, allows journal access during
peer review for verification.
Journal requires preregistration of
studies and provides link and badge
in article to meeting requirements.
Analysis Plan Preregistration Journal says nothing.
Article states whether
preregistration of study exists, and,
if so, where to access it.
Article states whether
preregistration with analysis plan
exists, and, if so, allows journal
access during peer review for
verification.
Journal requires preregistration of
studies with analysis plans and
provides link and badge in article to
meeting requirements.
Replication
Journal discourages submission of
replication studies, or says nothing.
Journal encourages submission of
replication studies.
Journal encourages submission of
replication studies and conducts
results blind review.
Journal uses Registered Reports as
a submission option for replication
studies with peer review prior to
observing the study outcomes.
Implementation Level
Padrão / Critério
8 padrões (ou critérios) de Transparêcia em 4 níveis de rigor crescente
https://osf.io/9f6gx/
Not Level I Level II Level III
Journal encourages citation of
data, code, and materials, or
says nothing.
Journal describes citation of
data in guidelines to authors
with clear rules and examples.
Article provides appropriate
citation for data and materials
used consistent with journal's
author guidelines.
Article is not published until
providing appropriate citation for
data and materials following
journal's author guidelines.
1. Citation Standards
Not Level I Level II Level III
Journal encourages data
sharing, or says nothing.
Article states whether data are
available, and, if so, where to
access them.
Data must be posted to a
trusted repository. Exceptions
must be identified at article
submission.
Data must be posted to a trusted
repository, and reported analyses
will be reproduced independently
prior to publication.
2. Data Transparency
Not Level I Level II Level III
Journal discourages
submission of replication
studies, or says nothing.
Journal encourages submission
of replication studies.
Journal encourages submission
of replication studies and
conducts results blind review.
Journal uses Registered Reports as
a submission option for replication
studies with peer review prior to
observing the study outcomes.
8. Replication
... OSF/COS - Diretrizes TOP – Promoção da abertura e transparência
SciELO recomenda adoção princípios FAIR e TOP Guidelines
28. Próximos passos rumo à ciência aberta
promover, criar condições na plataforma e implantar adoção obrigatória dos
preprints e das Principios FAIR e diretrizes TOP nos próximos 3 anos
identificar os grupos de periódicos inovadores e promover a
formação de uma maioria inicial com base em ganhos de percepção
de qualidade e visibilidade
Preprint - innovación - desintermediación
SciELO Preprint – posicionamiento dos periódicos SciELO e do Programa SciELO
alinhamento com práticas da Ciência Aberta
Precondições estarão dadas nos próximos até junho de 2018
29. Contribuição do SciELO
TOP Guidelines (Versão Português) : https://osf.io/us5yg/
TOP Guidelines (versão Espanhol): https://osf.io/h6mbk/
Diretrizes TOP – Promoção da abertura e transparencia – Tradução SciELO
31. BIBLIOGRAFIA E LEITURA RECOMENDADA
• ALVAREZ, G.R. and CAREGNATO, S.E. Práticas de comunicação científica na Física de Altas Energias: potencialidade dos preprints [online]. SciELO em Perspectiva,
2018 [viewed 06 March 2018]. Available from: http://blog.scielo.org/blog/2018/02/15/praticas-de-comunicacao-cientifica-na-fisica-de-altas-energias-
potencialidade-dos-preprints/
• NASSI-CALÒ, L. A (pré) história dos preprints em ciências biológicas [online]. SciELO em Perspectiva, 2017 [viewed 06 March 2018]. Available from:
http://blog.scielo.org/blog/2017/12/20/a-pre-historia-dos-preprints-em-ciencias-biologicas/
• NASSI-CALÒ, L. Saiu no NY Times: Biólogos se rebelam e publicam diretamente na Internet [online]. SciELO em Perspectiva, 2016 [viewed 06 March 2018]. Available
from: http://blog.scielo.org/blog/2016/04/07/saiu-no-ny-times-biologos-se-rebelam-e-publicam-diretamente-na-internet/
• PACKER, A.L., SANTOS, S. and MENEGHINI, R. SciELO Preprints a caminho [online]. SciELO em Perspectiva, 2017 [viewed 06 March 2018].
Available from: http://blog.scielo.org/blog/2017/02/22/scielo-preprints-a-caminho/
• PIRMEZ, C. Na rota da ciência aberta as Memórias do Instituto Oswaldo Cruz aceitam submissão de manuscritos preprints [online]. SciELO em Perspectiva, 2017
[viewed 06 March 2018]. Available from: http://blog.scielo.org/blog/2017/12/07/na-rota-da-ciencia-aberta-as-memorias-do-instituto-oswaldo-cruz-aceitam-
submissao-de-manuscritos-preprints/
• SCHONFELD, R. C. O Center for Open Science, alternativa para a Elsevier, anuncia novo serviço de preprints [Publicado originalmente no blog Ithaka S+R em
Agosto/2017] [online]. SciELO em Perspectiva, 2017 [viewed 06 March 2018]. Available from: http://blog.scielo.org/blog/2017/09/13/o-center-for-open-science-
alternativa-para-a-elsevier-anuncia-novo-servico-de-preprints/
• SPINAK, E. O que é este tema dos preprints? [online]. SciELO em Perspectiva, 2016 [viewed 06 March 2018]. Available from:
http://blog.scielo.org/blog/2016/11/22/o-que-e-este-tema-dos-preprints/
• SPINAK, E. Sobre as vinte e duas definições de revisão por pares aberta… e mais [online]. SciELO em Perspectiva, 2018 [viewed 06 March 2018]. Available from:
http://blog.scielo.org/blog/2018/02/28/sobre-as-vinte-e-duas-definicoes-de-revisao-por-pares-aberta-e-mais/
• VELTEROP, J. Preprints – o caminho a seguir para o compartilhamento rápido e aberto do conhecimento [online]. SciELO em Perspectiva, 2017
[viewed 06 March 2018]. Available from: http://blog.scielo.org/blog/2017/02/01/preprints-o-caminho-a-seguir-para-o-compartilhamento-rapido-e-aberto-
do-conhecimento/
• VELTEROP, J. A crise de reprodutibilidade pode estar sendo agravada pela avaliação por pares pré-publicação? [online]. SciELO em Perspectiva, 2016 [viewed 06
March 2018]. Available from: http://blog.scielo.org/blog/2016/10/20/a-crise-de-reprodutibilidade-pode-estar-sendo-agravada-pela-avaliacao-por-pares-pre-
publicacao/
• VELTEROP, J. Sobre assinaturas e Taxas de Processamento de Artigos [online]. SciELO em Perspectiva, 2018 [viewed 06 March 2018]. Available from:
http://blog.scielo.org/blog/2018/01/03/sobre-assinaturas-e-taxas-de-processamento-de-artigos/