21. 手作業でのROI設定を介した形状解析: 長さ
t
Excel 等にペースト or
テキストファイルに保存して
R スクリプトで統計処理 等.
線分や曲線をマウスで引き, t キーで ROI Manager に登録,を繰返す.
ROI Manager の「Show All」をチェックしておくと見やすい.
Measure ボタンで登録済の ROI 全部をまとめて測定.
角度や長さ(画素単位)が得られる. Excel等でμmに変換し,統計処理.
ROI: region of interest,関心領域,注目領域
22. 手作業でのROI設定を介した形状解析: 面積
or
t
測定項目は Analyze - Set Measurements... で決定.
「測定対象領域をマウスで指定し,
t キーで ROI Manager に登録」を繰返す.
Measure ボタンで測定.
23. 二値化による領域抽出 ( Shift + t キー)
二値画像
(白黒画像)
グレイスケール画像
(濃淡画像)
or
蛍光像の場合,「高い輝度の領域」が「測定対象領域」の
場合が多い.閾値となる輝度を決め,二値画像(白黒画像)
に変換することで,領域抽出(領域分割, segment)ができる.
ではどのように閾値を決めればいいのか?