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講演スライド—日本進化学会第20回大会シンポジウム・S5〈Basal lineageは「原始的」か？：生物界と分野を超えて〉：三中信宏「Basal Lineage の幻想と実態：系統樹の有根化と形質状態復元の観点から」2018年8月22日（水）15:50〜17:50＠東京大学駒場キャンパス5号館（Room 5）
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- 1. Basal Lineage の幻想と実態 系統樹の有根化と形質状態復元の観点から 噺役 三中 信宏 MINAKA Nobuhiro 国立研究開発法人 農研機構 農業環境変動研究センター 東京農業大学農学部生物資源開発学科 mail: minaka@affrc.go.jp website: http://leeswijzer.org/ twitter: @leeswijzer 日本進化学会第 20 回大会シンポジウム・S5 〈Basal lineage は「原始的」か？：生物界と分野を超えて〉 2018 年 8 月 22 日（水）15:50 〜 17:50 東京大学駒場キャンパス 5 号館（目黒区駒場）
- 3. Charles Darwin's Tree Diagrams Origin Notebook
- 4. Stephen J. Gould's Tree Diagrams diversification decimation
- 5. 系統樹の深読みと誤読 〜 Basal Lineage のケース 〜
- 7. Basal Lineage とは何か？ Basal Lineage ? Root
- 12. Basal Lineage とは何か？ Systematic Entomology, 29: 279–281 (2004)
- 13. Basal Lineage は 「ない」 Sister Taxa は 「ある」
- 14. Sister Taxa と形質進化の方向性の推定 Hennig, Willi (1957). Systematik und Phylogenese. Pp. 50-71 in: H. J. Hannemann (ed.), Bericht über die Hundertjahrfeier der Deutschen Entomologischen Gesellschaft Berlin, 30. September bis 5. Oktober 1956. Akademie-Verlag, Berlin. 原始的状態 派生的状態 姉妹群関係
- 15. Sister Taxa と形質進化の方向性の推定 ©Geol. Bundesanstalt, Wien; download unter www.geologie.ac.at Abel, Othenio 1910. Kritische Untersuchungen über die paläogenen Rhinocerotiden Europas. Abhandlungen der kaiserlich-königlichen Geologischen Reichsanstalt, Wien, 20(3): 1-52. 外群
- 18. 形質進化の方向性を決める
- 19. 間接法（indirect method）＝外群比較法 対象となる内群（ingroup）に対して “近縁” と仮定さ れる外群（outgroup）を仮定し，外群を基準として内 群の形質状態の原始性／派生性の方向性を推定し，内 群の最節約分岐図（外群有根化）を推定する． ↓ 内群＋外群の全体にわたる大域的最節約分析（MP）を 行うと同時に，無根最節約分岐図の樹形推定と同時に 原始性／派生性の方向性が決まり，外群有根化される．
- 20. 直接法（direct method）＝個体発生法 外群の仮定を置かずに，個体発生形質（発生段階遷移 の情報）を用いれば，より直接的な形質状態の方向性（原 始性／派生性）の推定と分岐図の有根化が可能だろう という主張が 1970 年代に分岐学派の中で活発に議論 された．その後，十年以上も論争が続いたが，方向性 推定の方法としては，最終的に外群比較法に押されて 影が薄くなってしまったようだ．
- 21. ひょっとして 「直接法」 の 復活 ？
- 22. Nobuhiro Minaka Phylogenetic Thinking: A History and Philosophy of Systematic Biology in the Twentieth Century. Published in April 20, 2018. 507 pp., Keiso Shobo, Tokyo. 三中信宏『系統体系学の世界：生物学の哲 学とたどった道のり』2018 年 4 月 20 日 刊行，勁草書房［けいそうブックス］.