WP 1 : Efficience alimentaire en brebis laitières

Institut de l'Elevage - Idele
Institut de l'Elevage - IdeleInstitut de l'Elevage - Idele
WP1 - EFFICIENCE ALIMENTAIRE EN BREBIS LAITIERES
Validation et analyse génétique de critères d’efficience alimentaire
Coralie MACHEFERT (INRAE)
H. LARROQUE (INRAE), C. ROBERT-GRANIE (INRAE), G. LAGRIFFOUL (Idele), P. HASSOUN (INRAE)
Séminaire SMARTER France
5-6 avril 2022, Sèvremont, France
This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Introduction
p.2
WP1 SMARTER - Nouveaux caractères pour améliorer l’efficience de l’utilisation des ressources alimentaires
Trouver des phénotypes pertinents en lien avec l’efficience alimentaire
Les mesurer à grande échelle, en fermes commerciales, dans des milieux diversifiés
Réaliser une analyse génétique de ces critères : héritabilité et lien génétique avec les
caractères de production
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Le dispositif ovins laitiers français
15 fermes commerciales
- 8 Lacaune
- 7 ROLP : 3 MTR, 2 MTN, 2 BB
Mesures collectées sur deux campagnes laitières
2019-2020 et 2020-2021
p.3
RAYON DU ROQUE
3 organismes techniques de suivi : UNOTEC, SE CGR, CDEO
BASSIN DES
PYRENEES
300 à 700 brebis par cheptel
20 à 37 % en 1er lactation
15 à 30 % en 5ième lactation ou plus
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Diversité des systèmes d’alimentation
p.4
EH : Ensilage d’herbe
EM : Ensilage de maïs
ENR : Enrubanné
F : Foin
FD : Fourrages déshydratés
PAT : Pâturage
Système pâturant
Système transhumant
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
MISE-BAS SEVRAGE LUTTE
NEC
30 jours
avant MB
NEC
Fin
d’allaitement
NEC
CLO1 CLO5 CLO6
CLO4
CLO2 CLO3
NEC NEC
30 jours
avant lutte
30 jours
après lutte
EA1 EA2 EA3 EA4 EA5 EA6
RATION
+ DAC
RATION
+ DAC
RATION
+ DAC
RATION
+ DAC
RATION
+ DAC
RATION
+ DAC
Enquêtes alimentation
Le protocole de phénotypage SMARTER
p.5
CLO = Contrôle laitier officiel, DAC = Distributeur Automatique de Concentrés, EA = Efficience alimentaire, NEC = Note d’état corporel
Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus)
+ DAC + estimation de l’ingestion au pâturage
Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus)
+ DAC + estimation de l’ingestion au pâturage
au CLO1
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
La base de données SMARTER
Données brutes :
Données sélectionnées :
9549 brebis
69868 observations (cumul CLO et campagnes)
4586 brebis (48 %)
30298 observations (43 %) (cumul CLO et campagnes)
 Race (Lacaune)
 Respect des stades
physiologiques cibles (NEC)
 Avoir au moins 2 NEC / 5
 Performances laitières
complètes (lait et taux)
Sélection sur :
 Dont 1744 brebis suivies sur les 2 campagnes laitières
p.6
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Description des performances zootechniques
Performances laitières
p.7
Courbes de productions moyennes
TB
TP
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Description des performances zootechniques
Etat d’engraissement
Profil d’état corporel moyen par élevage
p.8
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Description des performances zootechniques
Alimentation
Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus)
+ DAC + estimation de l’ingestion au pâturage
Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus)
+ DAC + estimation de l’ingestion au pâturage
Quantité de MS ingérée (tous contrôles confondus)
p.9
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
BESOINS
Ratio efficience alimentaire =
Produits
Ressources
RATIO
RATIO = besoins de lactation
apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC
= besoins de lactation
apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC
RATIO = besoins de lactation
apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC
UFL/j
UFL/j
UFL/j
UFL/j
RATIO > 1 : EFFICIENTE
Estimation de l’efficience alimentaire
Méthode 1 : le ratio
p.10
APPORTS
UFL/j
UFL/j
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Aliments ingérés = β0 + β1 poids vif + β2 PL + β3 TB + β4 TP + β5 NECΔ + Ɛ
REI < 0 : EFFICIENTE
Estimation de l’efficience alimentaire
Méthode 2 : le REI (residual energy intake)
p.11
REI = Consommation ingérée – Consommation prédite REI
REI
UFL/j
SELON SES PERFORMANCES ZOOTECHNIQUES
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Dans le cadre du projet européen iSAGE au sein de l’unité
expérimentale de La Fage :
 Phénotypage de brebis Lacaune multipares en 2018 et 2019
(durant leur 2ème et/ou 3ème lactation)
 70 lactations (46 brebis) suivies individuellement sur :
- Les performances laitières
- L’alimentation (pesées des quantités et refus via les portillons)
- Poids vif
- Etat d’engraissement (fin d’allaitement – CLO 2)
 1 mesure d’efficience alimentaire par brebis (CLO 2)
Calculer l’efficience alimentaire avec ingestion de fourrages individuelle & moyennée (type SMARTER)
Validation des critères d’efficience proposés
Alimentation individuelle
p.12
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Comparaison des résultats d’efficience alimentaire
Avec alimentation individuelle ou collective/individuelle
p.13
Régression linéaire de l’EA avec une ingestion individuelle ou moyenne
cor = 0,61 cor = 0,98
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Résultats d’efficience alimentaire au CLO2
p.14
n = 4323 brebis
(5861 obs.)
n = 46 brebis
(70 obs.)
µPrimipares µMultipares µMultipares µPrimipares
µMultipares µMultipares
Efficiente
Inefficiente Inefficiente
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Résultats d’efficience alimentaire
Au cours de la lactation
Efficiente
Inefficiente
p.15
Efficiente
Inefficiente
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Résultats d’efficience alimentaire
Facteurs environnementaux
p.16
Efficiente
Inefficiente
Effet de la parité par stade de lactation
(moyennes corrigées)
Effet de la portée par stade de lactation
(moyennes corrigées)
et +
et +
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Premières estimations de paramètres génétiques
Sur toute la lactation
LAIT RATIO REI
Répétabilité (r) 0.54 0.40 0.36
Héritabilité (h² ± SE) 0.20 ± 0.02 0.12 ± 0.02 0.19 ± 0.02
p.17
LACAUNE
h² REI (caprins SMARTER) = 0.18 (± 0.08) à 0.20 (± 0.07)
h² LAIT (caprins SMARTER) = 0.19 (± 0.09) à 0.20 (± 0.07)
h² RFI (bovins lait) = 0.04 (± 0.08) à 0,36 (± 0.17)  Brito et al., 2020
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Premières estimations de paramètres génétiques
Au cours de la lactation
p.18
LACAUNE
Séminaire SMARTER France
06/04/2022 – Coralie Machefert
Conclusions, Perspectives
p.19
Données recueillies en fermes :
- Réalisation de fiches éleveur
- Deux critères intéressants avec des applications différentes
- Limite : alimentation collective
Poursuites de l’étude :
- Relation avec les critères de production
- Comparaison des analyses génétiques SMARTER et analyses
génétiques La Fage (ingestion individuelle)
- Est-il possible de prédire l’efficience alimentaire par les spectres MIR
du lait ?
- Caractériser l’efficience des animaux par une étude multi-critères &
longitudinale
20
This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787
Merci pour votre attention
www.smarterproject.eu
SMARTER PARTNERS
p.20
1 de 20

Mais conteúdo relacionado

Similar a WP 1 : Efficience alimentaire en brebis laitières(20)

Indicateurs de bien-être animal Indicateurs de bien-être animal
Indicateurs de bien-être animal
Institut de l'Elevage - Idele1.3K visualizações
[iSAGE] Evaluer la durabilité des élevages ovins et caprins[iSAGE] Evaluer la durabilité des élevages ovins et caprins
[iSAGE] Evaluer la durabilité des élevages ovins et caprins
Institut de l'Elevage - Idele280 visualizações
Catalogue de Formation GRABHN | 2015 - 2016 Catalogue de Formation GRABHN | 2015 - 2016
Catalogue de Formation GRABHN | 2015 - 2016
Groupement Régional des Agriculteurs BIO de Haute-Normandie1.6K visualizações
Catalogue anfopeil 2021 webCatalogue anfopeil 2021 web
Catalogue anfopeil 2021 web
ANFOPEILRseaudesENIL173 visualizações
Atelier 1 introduction - Enjeux et questions clésAtelier 1 introduction - Enjeux et questions clés
Atelier 1 introduction - Enjeux et questions clés
Institut de l'Elevage - Idele1K visualizações
Exploitations laitières françaises : une diversité en mouvementExploitations laitières françaises : une diversité en mouvement
Exploitations laitières françaises : une diversité en mouvement
Institut de l'Elevage - Idele318 visualizações
5. Les principaux enseignements sur les nouvelles conduites en engraissement5. Les principaux enseignements sur les nouvelles conduites en engraissement
5. Les principaux enseignements sur les nouvelles conduites en engraissement
Institut de l'Elevage - Idele1.7K visualizações
TECH-OVIN 2023 : SmarterTECH-OVIN 2023 : Smarter
TECH-OVIN 2023 : Smarter
Institut de l'Elevage - Idele56 visualizações
[GAV2018] Les gains à long terme en génétique allaitante[GAV2018] Les gains à long terme en génétique allaitante
[GAV2018] Les gains à long terme en génétique allaitante
Institut de l'Elevage - Idele675 visualizações
SPACE 22 Biomarq'lait.pdfSPACE 22 Biomarq'lait.pdf
SPACE 22 Biomarq'lait.pdf
Institut de l'Elevage - Idele285 visualizações
GAL2023 - Vers l'autonomie protéique de l'élevage laitier françaisGAL2023 - Vers l'autonomie protéique de l'élevage laitier français
GAL2023 - Vers l'autonomie protéique de l'élevage laitier français
Institut de l'Elevage - Idele297 visualizações
SMARTER_Sèvremont_MChassier.pdfSMARTER_Sèvremont_MChassier.pdf
SMARTER_Sèvremont_MChassier.pdf
Institut de l'Elevage - Idele128 visualizações
Day 1 cta dakar 0915 togo_agriculture-nutrition_tounouDay 1 cta dakar 0915 togo_agriculture-nutrition_tounou
Day 1 cta dakar 0915 togo_agriculture-nutrition_tounou
Technical Centre for Agricultural and Rural Cooperation ACP-EU (CTA)924 visualizações

Mais de Institut de l'Elevage - Idele(20)

2bis Benoît Rouyer Baromètre social.pdf2bis Benoît Rouyer Baromètre social.pdf
2bis Benoît Rouyer Baromètre social.pdf
Institut de l'Elevage - Idele9 visualizações
Caprinov2023 RuminalCaprinov2023 Ruminal
Caprinov2023 Ruminal
Institut de l'Elevage - Idele11 visualizações

WP 1 : Efficience alimentaire en brebis laitières

  • 1. WP1 - EFFICIENCE ALIMENTAIRE EN BREBIS LAITIERES Validation et analyse génétique de critères d’efficience alimentaire Coralie MACHEFERT (INRAE) H. LARROQUE (INRAE), C. ROBERT-GRANIE (INRAE), G. LAGRIFFOUL (Idele), P. HASSOUN (INRAE) Séminaire SMARTER France 5-6 avril 2022, Sèvremont, France This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787
  • 2. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Introduction p.2 WP1 SMARTER - Nouveaux caractères pour améliorer l’efficience de l’utilisation des ressources alimentaires Trouver des phénotypes pertinents en lien avec l’efficience alimentaire Les mesurer à grande échelle, en fermes commerciales, dans des milieux diversifiés Réaliser une analyse génétique de ces critères : héritabilité et lien génétique avec les caractères de production
  • 3. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Le dispositif ovins laitiers français 15 fermes commerciales - 8 Lacaune - 7 ROLP : 3 MTR, 2 MTN, 2 BB Mesures collectées sur deux campagnes laitières 2019-2020 et 2020-2021 p.3 RAYON DU ROQUE 3 organismes techniques de suivi : UNOTEC, SE CGR, CDEO BASSIN DES PYRENEES 300 à 700 brebis par cheptel 20 à 37 % en 1er lactation 15 à 30 % en 5ième lactation ou plus
  • 4. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Diversité des systèmes d’alimentation p.4 EH : Ensilage d’herbe EM : Ensilage de maïs ENR : Enrubanné F : Foin FD : Fourrages déshydratés PAT : Pâturage Système pâturant Système transhumant
  • 5. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert MISE-BAS SEVRAGE LUTTE NEC 30 jours avant MB NEC Fin d’allaitement NEC CLO1 CLO5 CLO6 CLO4 CLO2 CLO3 NEC NEC 30 jours avant lutte 30 jours après lutte EA1 EA2 EA3 EA4 EA5 EA6 RATION + DAC RATION + DAC RATION + DAC RATION + DAC RATION + DAC RATION + DAC Enquêtes alimentation Le protocole de phénotypage SMARTER p.5 CLO = Contrôle laitier officiel, DAC = Distributeur Automatique de Concentrés, EA = Efficience alimentaire, NEC = Note d’état corporel Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus) + DAC + estimation de l’ingestion au pâturage Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus) + DAC + estimation de l’ingestion au pâturage au CLO1
  • 6. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert La base de données SMARTER Données brutes : Données sélectionnées : 9549 brebis 69868 observations (cumul CLO et campagnes) 4586 brebis (48 %) 30298 observations (43 %) (cumul CLO et campagnes)  Race (Lacaune)  Respect des stades physiologiques cibles (NEC)  Avoir au moins 2 NEC / 5  Performances laitières complètes (lait et taux) Sélection sur :  Dont 1744 brebis suivies sur les 2 campagnes laitières p.6
  • 7. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Description des performances zootechniques Performances laitières p.7 Courbes de productions moyennes TB TP LACAUNE
  • 8. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Description des performances zootechniques Etat d’engraissement Profil d’état corporel moyen par élevage p.8 LACAUNE
  • 9. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Description des performances zootechniques Alimentation Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus) + DAC + estimation de l’ingestion au pâturage Quantités ingérées individuelles  Moyenne des quantités distribuées collectivement (+ 10% refus) + DAC + estimation de l’ingestion au pâturage Quantité de MS ingérée (tous contrôles confondus) p.9 LACAUNE
  • 10. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert BESOINS Ratio efficience alimentaire = Produits Ressources RATIO RATIO = besoins de lactation apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC = besoins de lactation apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC RATIO = besoins de lactation apports de la ration − besoins d’entretien & croissance + variation de NEC UFL/j UFL/j UFL/j UFL/j RATIO > 1 : EFFICIENTE Estimation de l’efficience alimentaire Méthode 1 : le ratio p.10 APPORTS UFL/j UFL/j
  • 11. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Aliments ingérés = β0 + β1 poids vif + β2 PL + β3 TB + β4 TP + β5 NECΔ + Ɛ REI < 0 : EFFICIENTE Estimation de l’efficience alimentaire Méthode 2 : le REI (residual energy intake) p.11 REI = Consommation ingérée – Consommation prédite REI REI UFL/j SELON SES PERFORMANCES ZOOTECHNIQUES
  • 12. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Dans le cadre du projet européen iSAGE au sein de l’unité expérimentale de La Fage :  Phénotypage de brebis Lacaune multipares en 2018 et 2019 (durant leur 2ème et/ou 3ème lactation)  70 lactations (46 brebis) suivies individuellement sur : - Les performances laitières - L’alimentation (pesées des quantités et refus via les portillons) - Poids vif - Etat d’engraissement (fin d’allaitement – CLO 2)  1 mesure d’efficience alimentaire par brebis (CLO 2) Calculer l’efficience alimentaire avec ingestion de fourrages individuelle & moyennée (type SMARTER) Validation des critères d’efficience proposés Alimentation individuelle p.12
  • 13. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Comparaison des résultats d’efficience alimentaire Avec alimentation individuelle ou collective/individuelle p.13 Régression linéaire de l’EA avec une ingestion individuelle ou moyenne cor = 0,61 cor = 0,98
  • 14. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Résultats d’efficience alimentaire au CLO2 p.14 n = 4323 brebis (5861 obs.) n = 46 brebis (70 obs.) µPrimipares µMultipares µMultipares µPrimipares µMultipares µMultipares Efficiente Inefficiente Inefficiente LACAUNE
  • 15. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Résultats d’efficience alimentaire Au cours de la lactation Efficiente Inefficiente p.15 Efficiente Inefficiente LACAUNE
  • 16. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Résultats d’efficience alimentaire Facteurs environnementaux p.16 Efficiente Inefficiente Effet de la parité par stade de lactation (moyennes corrigées) Effet de la portée par stade de lactation (moyennes corrigées) et + et + LACAUNE
  • 17. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Premières estimations de paramètres génétiques Sur toute la lactation LAIT RATIO REI Répétabilité (r) 0.54 0.40 0.36 Héritabilité (h² ± SE) 0.20 ± 0.02 0.12 ± 0.02 0.19 ± 0.02 p.17 LACAUNE h² REI (caprins SMARTER) = 0.18 (± 0.08) à 0.20 (± 0.07) h² LAIT (caprins SMARTER) = 0.19 (± 0.09) à 0.20 (± 0.07) h² RFI (bovins lait) = 0.04 (± 0.08) à 0,36 (± 0.17)  Brito et al., 2020
  • 18. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Premières estimations de paramètres génétiques Au cours de la lactation p.18 LACAUNE
  • 19. Séminaire SMARTER France 06/04/2022 – Coralie Machefert Conclusions, Perspectives p.19 Données recueillies en fermes : - Réalisation de fiches éleveur - Deux critères intéressants avec des applications différentes - Limite : alimentation collective Poursuites de l’étude : - Relation avec les critères de production - Comparaison des analyses génétiques SMARTER et analyses génétiques La Fage (ingestion individuelle) - Est-il possible de prédire l’efficience alimentaire par les spectres MIR du lait ? - Caractériser l’efficience des animaux par une étude multi-critères & longitudinale
  • 20. 20 This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787 Merci pour votre attention www.smarterproject.eu SMARTER PARTNERS p.20