Currã culo do sistema de currã-culos lattes (luiz carlos jãºnior alcã¢ntara)

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Currã culo do sistema de currã-culos lattes (luiz carlos jãºnior alcã¢ntara)

  1. 1. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 1/47 Endereço Profissional Fundação Oswaldo Cruz, Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz ­ BA, Laboratório Avançado de Saúde Pública.  Rua Waldemar Falcão, 121 Candeal 40295001 ­ Salvador, BA ­ Brasil Telefone: (71) 31762255 Fax: (71) 31762300 URL da Homepage: http://www.bahia.fiocruz.br 1998 ­ 2002 Doutorado em Biologia Celular e Molecular (Conceito CAPES 7).  Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.  Título: Estudo do polimorfismo genético dos vírus linfotrópicos de células T humanas do tipo 1 e 2 (HTLV­1 e HTLV­2) em Salvador, Bahia, Brasil e em tribos indígenas brasileiras, Ano de obtenção: 2002.  Orientador:  Bernardo Galvão Castro Filho.  Nome Luiz Carlos Júnior Alcântara Nome em citações bibliográficas ALCANTARA, L. C. J.;Alcantara, Luiz Carlos Junior;Alcantara, Luiz Carlos Júnior;Junior Alcântara, Luiz Carlos;Alcântara, Luiz C.J.;Alcantara, Luiz C.J.;Alcantara, Luiz Carlos;Alcantara, Luiz Carlos J.;Alcantara, Luiz C. J.;Alcantara, Luis;ALCANTARA, LUIZ C J;ALCANTARA, LC Junior;ALCANTARA;ALCANTARA, LC;ALCANTARA, L. C.;LUIZ CARLOS JÚNIOR, ALCÂNTARA Luiz Carlos Júnior Alcântara Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq ­ Nível 2 Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/7428560072021675 Última atualização do currículo em 10/11/2014 Pesquisador Titular do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional (LHGB) do  Centro  de  Pesquisas  Gonçalo  Moniz  (CPqGM)  da  Fundação  Oswaldo  Cruz  (FIOCRUZ)  em Salvador, Bahia, Brasil. Professor Visitante bolsista da Bioquímica e Bioinformática da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS). Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal de Ouro  Preto  (1992),  mestrado  em  Bioquímica  pela  Faculdade  de  Medicina  de  Ribeirão  Preto  da Universidade  de  São  Paulo  (1994)  e  doutorado  em  Biologia  Celular  e  Molecular  pela  Fundação Oswaldo  Cruz  (2002).  Possui  também  2  pós­doutorados,  sendo  o  último  realizado  no  Instituto Nacional do Cancer, no Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Tem experiência na área de Biologia Molecular  e  Bioinformática  dos  Retrovírus  Humanos  (HIV  e  HTLV),  atuando  principalmente  nos seguintes temas: Epidemiologia molecular e evolução dos retrovírus humanos, Polimorfismos nos genes  dos  hospedeiros  dos  retrovírus  humanos,  Correlações  clínico­epidemiológicas  nas retroviroses humanas, Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para estudo dos genes dos retrovírus humanos/hospedeiros. Atua também como vice coordenador do curso de Pós Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. É professor do quadro permanente deste curso, bem como do curso de Pós Graduação em Patologia Humana e Experimental  da  FIOCRUZ/UFBA.  PESQUISADOR  EM  PRODUTIVIDADE  E  PESQUISA  DO  CNPQ  ­ NÍVEL 2 (Texto informado pelo autor) Identificação Endereço Formação acadêmica/titulação
  2. 2. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 2/47 Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.  Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia Celular e Molecular / Especialidade: Biologia Molecular.  Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Epidemiologia Molecular.  Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. 1992 ­ 1994 Mestrado em Bioquímica.  Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.  Título: Expressão em E. coli, purificação e caracterização parcial do domínio ligante de calmodulina da miosina­V de cérebro de galinha,Ano de Obtenção: 1996. Orientador:  Roy Edward Larson. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.  Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Bioquímica. 1987 ­ 1992 Graduação em Farmácia.  Universidade Federal de Ouro Preto, UFOP, Brasil. 1983 ­ 1985 Curso técnico/profissionalizante em Contabilidade.  Escola Estadual Maurício Augusto Azevedo. 2009 ­ 2011 Pós­Doutorado.  Vaccine Branch/National Cancer Institute/National Institutes of Health.  Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos / Especialidade: Vacina. 2005 ­ 2006 Pós­Doutorado.  Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, FIOCRUZ, Brasil.  Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB, Brasil. 2002 ­ 2004 Pós­Doutorado.  Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul.  Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB, Brasil.  Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Epidemiologia / Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos. 2006 ­ 2006 Estagio:Desenvolver software HTLV Subtyping Tool. (Carga horária: 160h).  University of Oxford. 2005 ­ 2005 Estágio:aperfeiçoamento no Banco de dados HIV­Base. (Carga horária: 96h).  Universidade da Flórida­Gainesville­Flórida. 2002 ­ 2002 Estágio: epidemiologia molecular do HTLV na África. (Carga horária: 720h).  Nelson Mandela Medical School­Durban. 2000 ­ 2000 Estágio:Ferramentas de bioinformática em virologia. (Carga horária: 240h).  Rega Institut ­ Universidade Católica de Leuven. Vínculo institucional 2013 ­ Atual Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor e Pós­doutorado Formação Complementar Atuação Profissional Universidade Estadual de Feira de Santana, UEFS, Brasil.
  3. 3. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 3/47 Atividades 03/2006 ­ Atual Direção e administração, Fundação Oswaldo Cruz/CPqGM, . Cargo ou função Pesquisador do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional. 03/2005 ­ Atual Ensino, Patologia Experimental, Nível: Pós­Graduação Disciplinas ministradas Bioinformática na Biologia Molecular 01/2004 ­ Atual Treinamentos ministrados , Laboratório Avançado de Saúde Pública­ BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, . Treinamentos ministrados Estudos Avançados em Bioinformática e Análises Evolutivas Virais (14 a 19 de Junho/2004) Segundo Workshop Brasileiro em Evolução Viral e Epidemiologia Molecular (HIV e HTLV) (08 a 13 de novembro/2004) Treinamento para a Utilização da Database HIV­Base (15 a 18 de novembro/2005) 01/2004 ­ Atual Outras atividades técnico­científicas , Laboratório Avançado de Saúde Pública­ BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, . Atividade realizada Implantação e Coordenação do Laboratório de Bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ. 4/2002 ­ Atual Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Avançado de Saúde Pública, . Linhas de pesquisa  Bioinformática Epidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV­1 e HIV­1) Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV­1 e do HTLV­1 Pesquisador, Carga horária: 20 Outras informações Professor e Tutor de Bioquímica e Bioinformática (cursos de Farmácia e Medicina) Vínculo institucional 2009 ­ 2011 Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pos­doctoral Fellow, Carga horária: 40 Vínculo institucional 2008 ­ Atual Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40 Outras informações Pesquisador Vice­Chefe do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional (LHGB) do CPqGM/FIOCRUZ Vínculo institucional 2002 ­ 2007 Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40 Outras informações Atua como pesquisador em Biologia molecular, Bioquímica, Epidemiologia molecular e Bioinformática aplicada aos retrovírus humanos (HIV­1, HTLV­1, HTLV­2). Atua também como professor/orientador colaborador no Curso de Pós­Graduação Strictu Senso em Biotecologia em Saúde e Medicina Investigativa. Vínculo institucional 2002 ­ 2007 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 20 National Institute Of Health, NIH, Estados Unidos. Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil. Laboratório Avançado de Saúde Pública­Centro de Pesq. Gonçalo Moniz FIOCRUZ, LASP, Brasil. Faculdade de Tecnologia e Ciências, FTC, Brasil.
  4. 4. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 4/47 Atividades 2/2002 ­ 7/2007 Ensino, Farmacia, Nível: Graduação Disciplinas ministradas Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioquímica Clínica e Bioinformática Atividades 01/2002 ­ 1/2013 Ensino, Medicina, Nível: Graduação Disciplinas ministradas Bioinformática Bioquímica 01/2002 ­ 1/2013 Ensino, Medicina e saúde humana, Nível: Pós­Graduação Disciplinas ministradas Seminários em retrovirologia Outras informações Professor de Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, bioquímica Clínica e Bioinformática no Curso de Farmácia. Vínculo institucional 2000 ­ 2013 Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40 Outras informações Atuou como professor nas disciplinas, Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioinformática, Seminários Interdisciplinares, Bioquímica Médica e Biofunção 1 nos cursos de Odontologia, Biomedicina e Medicina, nos sistemas de ensino clássico e PBL. Atuou também como orientador colaborador do curso de pós­graduação strictu senso em Medicina e Saúde Humana. Vínculo institucional 1994 ­ 1995 Vínculo: Empregatício, Enquadramento Funcional: Farmacêutico Hospitalar do Hospital do Aparel, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. Outras informações Trabalhou durante os seis primeiros meses no Hospital do Aparelho Locomotor Sarah em Brasília e posteriormente foi transferido para a filial de Salvador­Bahia Atividades 9/1994 ­ 12/1995 Direção e administração, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Lider do Serviço de Farmácia Hospitalar. Cargo ou função Lider do Setor de Farmácia Hospitalar e Clínica. 9/1994 ­ 12/1995 Serviços técnicos especializados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Setor de Farmácia Hospitalar. Serviço realizado Implantação do Serviço de Farmácia Hospitalar e Farmácia Clínica. 9/1994 ­ 12/1995 Conselhos, Comissões e Consultoria, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Laboratório de Análises Clínicas do Hospital Sarah Salvador. Cargo ou função Membro da Comissão de Controle das Infecções Hospitalares. 1/1995 ­ 3/1995 Treinamentos ministrados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Enfermarias do Hospital Sarah Salvador. Treinamentos ministrados Treinamento ao Corpo de Enfermagem e Médico sobre a Biologia Molecular, Imunologia e Patogenia do HTLV­I; Treinamento em Prevenção das interações Medicamentosas no Hospital. 1. Bioinformática Objetivo: Estudar a evolução dos retrovírus humanos (HIV­1 e HTLV­1): Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública, EBMSP, Brasil. Associação das Pioneiras Sociais, APS, Brasil. Linhas de pesquisa
  5. 5. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 5/47 utilizando técnicas de biologia molecular, bioquímica e bioinformática; Desenvolver programas de bioinformática dando suporte aos estudos das infecções virais. . 2. Epidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV­1 e HIV­1) Objetivo: Monitorar a infecção do HIV e do HTLV­1 nos estudos sobre polimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aos antirretrovirais e transmissão materno­fetal; 2) Desenvolver projetos de vacinas anti­HIV­1 e anti­HTLV­1; 3) Elaborar um algoritmo de resgate terapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nos serviços clínicos do SUS.. 3. Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV­1 e do HTLV­1 Objetivo: Monitoramento da infecção do HIV e do HTLV­1 nos estudos sobre polimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aos antirretrovirais e transmissão materno­fetal; Desenvolvimento de vacinas anti­HIV­1 e anti­HTLV­1; 3) Eelaboração de um algoritmo de resgate terapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nos serviços clínicos do SUS.. 2014 ­ 2014 2o Workshop Internacional de Bioinformática sobre Evolução Viral e Epidemiologia Molecular 2014 Descrição: A Filogenia molecular e genética populacional são técnicas estabelecidas com importância para a compreensão de epidemias e dinâmicas virais. Por exemplo, a análise filogenética tem sido utilizada até o momento para explicar a origem do HIV­1 e HIV­2 e suas epidemias em humanos, para estudar a epidemiologia molecular da gripe em aves selvagens e suas conexões com pandemias humanas, assim como estudar a epidemiologia molecular de muitos outros vírus. Muitos dos trabalhos envolvendo estas técnicas estão sendo publicados em revistas internacionais de alto impacto. Novos métodos de mineração de dados estão se tornando cada vez mais importantes para organizar e explorar a enorme quantidade de dados de sequências de vírus que foi gerado nos últimos anos. Por exemplo, a mineração de dados é extremamente importante para o estudo das respostas às terapias antivirais. Além disso, a combinação da mineração de dados com análises filogenéticas permitem uma melhor compreensão do comportamento dos diversos vírus. A utilização destes métodos já foi aplicada ao estudo de mutações de resistência às drogas e tais técnicas podem ser aplicadas a muitos outros campos de pesquisa de vírus. 2. Detalhes sobre o Workshop O Workshop Internacional sobre a utilização da Bioinformática para estudos de Evolução e Epidemiologia Molecular dos vírus foi organizado nos últimos 17 anos pela Profa. Anne­Mieke Vandamme, do Laboratório de Virologia Clínica e Epidemiologia da Katholieke Universiteit Leuven (Rega Institut), Bélgica, e desde 2003 viaja ao redor do globo (http://regaweb.med.kuleuven.be/workshop). Este workshop está dividido em três módulos: Básico, análises filogenéticas avançadas e Mineração de Dados. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 20 por módulo) só poderão candidatar­se a um dos módulos. Todos os módulos conterão aulas teóricas e práticas (cerca de 50/50). Haverá também tempo reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, pa.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / AnneMieke Vandamme ­ Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ­ Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior ­ Auxílio financeiro. 2014 ­ Atual Desenvolvimento de ferramenta didática para avaliação de fatores de risco e prevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis (HIV­1/HTLV­1) Descrição: EDITAL PPSUS: Este estudo objetiva desenvolver uma ferramenta Projetos de pesquisa
  6. 6. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 6/47 web para avaliar a evolução do conhecimento de jovens e adolescentes residentes em áreas de risco para as infecções causadas pelo HIV­1 e HTLV­1 na cidade. O estudo caracterizar­se­á por ser uma coorte de intervenção prospectiva, composta por 25 educadores, que irão participar das etapas de identificação dos fatores de risco e avaliação do nível de conhecimento acerca da infecção pelo HIV/HTLV. A execução do mesmo se dará no Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) e na sedes do projeto parceiro Adolescente Aprendiz, situadas nos bairros do Pau Miúdo e Rio Vermelho. Este estudo trará como contribuição no desenvolvimento de um banco de dados e de um algoritmo capaz de contabilizar o número de acessos ao conteúdo disponibilizado pela ferramenta; e a organização estatística das informações provenientes do mesmo. Além disso, prevê­se a elaboração de material lúdico/didático (impressos e audiovisuais) a ser disponibilizado para ações de promoção da saúde do Serviço Único de Saúde (SUS) e caracterização do nível de conhecimento acerca da infecção por retrovírus humanos em áreas de risco. Espera­se também, propor novas medidas de promoção da saúde mais específicas para jovens e adolescentes residentes nessas áreas.  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Carlos Brites ­ Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo ­ Integrante / Marilda Souza Gonçalves ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2014 ­ Atual INTERAÇÃO ENTRE OS PRODUTOS DAS ORFs I E IV DO HTLV­1 COM AS PROTEÍNAS DO CITOESQUELETO MIOSINA Va E PAXILINA RESPECTIVAMENTE Descrição: Pela análise das estruturas primarias de p12I/p8I e da Paxilina, hipotetiza­se que não há interação física entre elas, entretanto a presença de regiões ricas em prolina em ambas as proteínas, e pelo fato da Paxilina ser um dos componentes das adesões focais, sugere que elas participem do complexo de polarização do citoesqueleto no momento do contato e transmissão do HTLV­1 célula­célula. Como a Paxilina está mais expressa em indivíduos TSP/HAM, é possível que a expressão da proteína Tax, transativador viral, interfira na expressão de Paxilina. Assim o estudo inicial da possível interação entre essas proteínas é importante para melhor compreensão da significância do aumento de expressão da Paxilina em indivíduos com TSP/HAM. Por outro lado, acredita­se que a miosina Va esteja envolvida no tráfego de p8I partindo de Golgi até a membrana plasmática. Considerando que p8I exerce importante função na transmissibilidade viral, participando ativamente da sinapse virológica e da formação dos conduítes celulares, o estudo das interações proteicas que contemplam o mecanismo de transporte desta proteína, desde sua formação até seu sítio de atuação, pode estabelecer um ponto inicial para a elucidação desta via, além de sugerir possíveis alvos terapêuticos para redução da infectividade, e transmissibilidade viral, e consequentemente, um controle da disseminação do vírus nos indivíduos infectados. Assim, pretendemos avaliar a interação entre os produtos das ORFs I e IV do HTLV­1 com as proteínas do citoesqueleto Paxilina e Miosina Va, respectivamente. .  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Simone Kashima ­ Integrante / Maria Fernanda Castro­Amarante ­ Integrante / Jaqueline Goes de Jesus ­ Integrante / Marilda Souza Gonçalves ­ Integrante / Maria Enilza Espreafico ­ Integrante. 2013 ­ 2013 WORKSHOP INTERNACIONAL DE BIOINFORMÁTICA SOBRE EVOLUÇÃO VIRAL E EPIDEMIOLOGIA Descrição: O workshop está dividido em dois módulos: Análises Básicas de Bioinformática, Análises filogenéticas Avançadas. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 25 por módulo) só podem candidatar­se a um dos módulos. Todos os módulos contem aulas teóricas e práticas (cerca de 50 alunos num total). Possui também um tempo
  7. 7. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 7/47 reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, para discutir e analisar os seus conjuntos de dados com os professores e discutir possíveis colaborações entre os alunos e professores. O curso terá a duração de cinco dias. Para nosso conhecimento, nenhum outro curso semelhante é organizado mundialmente, contendo teoria e aplicações práticas de técnicas de bioinformática, aplicados aos estudos de evolução viral, e aberto a um fórum internacional de estudantes de mestrado e doutorado, jovens pesquisadores, e até mesmo aos pesquisadores seniores. Salientamos que não haverá custo de inscrição no Workshop, e das 50 vagas, 80% serão destinadas preferencialmente a brasileiros e as vagas restantes para estrangeiros, tendo preferência inscritos da América Latina. Os alunos que participam deste workshop são convidados a submeter um resumo, e apresentam o seus trabalhos na forma de poster. Assim, estes alunos terão a oportunidade de discutir o trabalho de pesquisa que eles apresentaram com os professores e outros alunos. Depois da oficina, e tendo em consideração os comentários e discussões recebidos no workshop sobre o seu trabalho, cada aluno terá o seu resumo publicado na IGE (Infection, Genetics and Evolution, uma revista do grupo Elsevier que tem a Dra. Anne­Mieke Vandamme no Editorial Board) numa edição regular, mas inteiramente dedicado ao Workshop, e também terá um tempo para melhorar a qualidade do seu trabalho, sendo então convidado a submeter um artigo, a esta mesma revista científica, que sempre publicou (dos workshops anteriores) e os trabalhos dos alunos apresentados na forma de poster durante o works.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / AnneMieke Vandamme ­ Integrante / Tulio de Oliveira ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante / Paula Carvalhal Lage von B. Ristow ­ Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ­ Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2013 ­ Atual The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship of the African and Brazilian HIV­1 and HTLV­1 epidemics Descrição: This project will use genomics and bioinformatics to further study the origin of the Brazilian and South African Human Immunodeficiency virus type 1 (HIV­1) and Human T­cell lymphotropic virus type 1 (HTLV­1). In addition, it will study co­infected individuals, as there is growing evidence that HIV­1 and HTLV­1 co­infection affects the course of the AIDS disease. This project is built on a long­standing collaboration between two Brazilian researchers, Dr. Luiz Carlos Junior Alcantara from F CPqGM/FIOCRUZ Foundation and Dr. Tulio de Oliveira from the Africa Centre for Health and Population Studies, Nelson Mandela School of Medicine. This partnership has already given rise to a number of peer­reviewed publications, the graduation of post­graduate students and training workshops in Brazil. At present, the two researchers are co­supervising a PhD student from Brazil. This project, if funded, will allow this successful collaboration to continue and a Brazilian researcher (Dr. Tulio de Oliveira) living outside the country to continue to contribute to local research and the training of post­graduate students in Brazil. Previous results of this collaboration: One of the reasons why we believe that this exchange project will be successful is due to the previous results that have been produced by this collaboration. The collaborators have been working together since 2001. During this time, Dr. Tulio de Oliveira has been based in Durban and Cape Town, South Africa and in Oxford, the U.K., whereas Dr. Luiz Carlos Alcantara has been based in Salvador, Brazil and in Washington, the U.S.A. They have made many exchange visits. They have also produced many collaborative publications on the study of the origin of the HIV­1 and HTLV­1 epidemics in Brazil, which will be one of the topics to be studied in this project. For example, they have shown that HTLV­1 strains from South Africa (sampled and produced during a visit by Dr. Alcantara to the Dr. de Oliveira group in 2005) are directe.  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . 
  8. 8. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 8/47 Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Tulio de Oliveira ­ Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida ­ Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ­ Auxílio financeiro. 2012 ­ 2014 Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV­1 no estado da Bahia ­ Brasil Descrição: Estudo de coorte transversal com amostragem de conveniência que avaliará amostras sanguíneas de pacientes, no período de 1 de Março de 2012 à 31 de Setembro de 2012. A população do estudo será formado por pacientes com idade igual ou superior à 18 anos, soro­reagentes para HIV­1 sem uso de Terapia Antirretroviral (TARV), que após assinarem termo de consentimento livre, respondam a questionário epidemiológico e permita a coleta de 10 ml de sangue para o estudo. A amostra para o estudo será obtida durante coleta sanguínea, no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa, para realização de carga viral do HIV ou estudo das subpopulações linfocitárias. O questionário epidemiológico será preenchido pelo pesquisador e equipe, esse o documento conterá informações sobre identificação, data de nascimento, gênero, data do diagnóstico do HIV­1, uso de TARV, provável forma de aquisição, orientação sexual e discordância sorológico dos parceiros atuais. Será descartado aleatoriamente 1 das amostras de pacientes com concordância sorológica entre parceiros ou transmissão vertical. O projeto e o termo de consentimento livre e esclarecido será submetido, previamente a qualquer fase do estudo, ao Comitê de Ética em Pesquisa da Fundação Gonçalo Muniz, do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa.A extração do DNA das amostras usará o kit de extração QIAmp Blood Kit (Qiagen Inc., Valencia, CA, USA) segundo protocolo do fabricante. Os genes pol e env serão amplificados através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCR serão purificados e posteriormente sequenciados. Os objetivos são: Caracterizar a epidemiologia molecular do HIV­1 na Bahia através de estudos evolutivos nos genótipos B, F e formas recombinantes BF, buscando inferir a história evolutiva deste retrovírus na nossa população. Estimar a taxa evolutiv.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Carlos Brites ­ Integrante / Genoveffa Franchini ­ Integrante / Erika Andrade ­ Integrante / Marcio Oliveira Silva ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. 2012 ­ 2013 Banco de Dados sobre o HTLV­1/paciente infectado Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Tulio de Oliveira ­ Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo ­ Integrante / Antonio Eduardo de Albuquerque­Junior ­ Integrante. 2012 ­ Atual Implantação e Consolidação do Centro Integrado de Biodesenvolvimento da Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública no Parque Tecnológico da Bahia Descrição: Luiz Alcantara coordena um subprojeto, especificamente Utilização do HTLV­2 Pseudotipado como Vetor Vacinal contra a Infecção pelo HTLV­1 . O presente projeto faz parte do esforço da Secretaria de Ciência, Tecnologia e Inovação do Estado da Bahia SECTI, através do Parque Tecnológico da Bahia, para implantação dos Laboratórios Compartilhados dos Equipamentos Dinamizadores, que serão consolidados na segunda etapa do Parque. Neste esforço, composto por dez plataformas agregadas que integram parceiros públicos e privados operando em conjunto, tem como objetivo comum o fortalecimento da rede de pesquisa nas áreas de Biotecnologia e Saúde do Estado..  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Maria Luisa Carvalho Soliani ­ Coordenador / Luiz Erlon Araujo Rodrigues ­ Integrante.
  9. 9. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 9/47 2012 ­ Atual Utilização do HTLV­2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV­1 Descrição: O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV­1) é conhecido por ser o agente etiológico de doenças de natureza neoplásica, como a Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL) (Yoshida et al., 1982). Além disso, a infecção pelo HTLV­1 é endêmica em diferentes regiões geográficas do mundo, sendo Salvador a cidade brasileira com a mais alta prevalência entre a população geral, atingindo valores próximos a 1,8% (Dourado et al., 2003). As glicoproteínas do envelope viral são reconhecidas de maneira específica pelos receptores de linfócitos B (anticorpos de membrana), por anticorpos neutralizantes e por receptores de células T (TCR) de linfócitos­T citotóxicos (CTL), o que proporciona posteriormente uma resposta imune protetora. Estas glicoproteínas poderiam representar importantes . Para explorar as propriedades imunológicas em potencial do envelope viral como candidato à vacina, pretendemos utilizar as glicoproteínas gp46 e gp21 do HTLV­1, como um imunógeno. Há três anos firmamos uma colaboração internacional com o grupo de vacinas do Instituto Nacional do Câncer, do Instituto Nacional de Saúde do Governo dos EUA (Vaccine Branch NCI/NIH), liderado pela Dra. Genoveffa Franchini, resultando no desenvolvimento de um vetor vacinal anti­HTLV­1. Este vetor foi baseado no HTLV­2 atenuado, sendo desenhado por mim e construído pela GeneArt (USA). Este vetor foi cedido pela Dra Franchini para o CPqGM/FIOCRUZ, para montagem do vetor recombinante, ensaios in vitro e ex­vivo e testes bioquímicos e imunológicos (a serem realizados no CPqGM/FIOCRUZ). Após estes experimentos, os testes em modelo animal, utilizando coelhos serão realizados utilizando coelhos e macacos no NCI­NIH. .  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Genoveffa Franchini ­ Integrante / Maria Fernanda Castro­Amarante ­ Integrante / Fernanda Khouri Barreto ­ Integrante / Loianna Mascarenhas ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ­ Auxílio financeiro. 2012 ­ Atual Caracterização de genomas completos do vírus da Leucemia de células T do adulto do tipo 1 (HTLV­1) provenientes de pacientes com diferentes perfis clínicos Descrição: Embora o HTLV­1 tenha sido convincentemente associado à Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL), é observado que a grande maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (95­98%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como não é conhecido os motivos pelos quais alguns indivíduos desenvolvem algum tipo de doença, seja ela de natureza neoplásica ou inflamatória, bem como os fatores que direcionam o curso clínico ao longo da infecção. Acredita­se que as diversas manifestações clínicas possam ser influenciadas pelo tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os antígenos do HTLV­1, bem como pelo local ou órgão no qual a reação inflamatória predominantemente acontece. Fatores relacionados às variantes genéticas do vírus e fatores referentes ao hospedeiro também têm sido sugeridos. Alguns trabalhos ainda apontam que fatores ambientais, como idade, modo de transmissão e características étnicas (Gadelha et al., 2005; Miller et al., 1994; Vine et al., 2002; Sabouri et al., 2005) podem contribuir para a manifestação de doença em indivíduos infectados. A análise de indivíduos, com diferentes status clínicos da doença, porém apresentando níveis semelhantes de carga proviral, demonstrou que células de pacientes assintomáticos produzem menores níveis das citocinas inflamatórias: TNF­  (Fator de necrose tumoral  ) e IFN­  (Interferon  ) (Nishimura et al., 2000), sugerindo que esta baixa produção seria importante para a manutenção do estado assintomático, e que outros fatores, além da carga proviral, também devem influenciar a sintomatologia da infecção (Furukawa et al, 2003). Visto isto, pretendemos estudar a diversidade genética no genoma total do HTLV­1 mais prevalente em cada grupo de indivíduos infectados: 10 com TSP/HAM, ATLL, 10 com dermatite infecciosa,
  10. 10. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 10/47 10 com dermatite infecciosa e TSP/HAM e 10 assintomáticos. Todos os indivíduos com idade superior a 45 anos e mediana da carga proviral de 1.500 copias/106 PBMC..  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo ­ Integrante / Marcio Roberto T Nunes ­ Integrante / Luis Felipe Ivanoff de Menezes ­ Integrante. 2012 ­ Atual IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS­GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM Descrição: Bioinformática é a coleção, organização e análise de grandes quantidades de dados biológicos utilizando uma rede de computadores e bancos de dados. Implica na análise de seqüências de genes e seus produtos (proteínas), mas o campo tem sido expandido para a gerência, processamento, análise e visualização de grandes quantidades de dados genômicos, proteômicos, triagem de drogas e química medicinal. Hoje a bioinformática já é considerada uma ciência, que além de ser indispensável ao melhor entendimento da genética, da bioquímica, da imunologia, da biologia celular e molecular e das outras ciências, vem se tornando uma área cada vez mais independente. Procuramos, com a implantação de um laboratório de bioinformática, criar uma infraestrutura que permita ao aluno de mestrado e doutorado, do curso de pós­graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa, ter a possibilidade de conhecer melhor esta ciência, não só na disciplina Bioinformática, mas também nas outras disciplinas, podendo também contar com a estrutura necessária para procurar desenvolver ferramentas de bioinformática que lhes possam auxiliar em responder questões importantes dos seus projetos. Será também possível, ensinando uma bioinformática mais completa a estes estudantes, fornecer recursos e o treinamento em banco de dados e programas relacionados à estrutura macromolecular, permitindo a estes cientistas da área biológica o acesso a esta rica fonte de informações, desenho de tutoriais, etc. .  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2011 ­ Atual Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar Copenhageni e possível associados ao desfecho clínico e Síndrome Hemorrágica Pulmonar Descrição: O estudo molecular de sequências do genoma completo da L. interrogans sorovar Copenhageni possibilita testar a hipótese de que mutações estejam associadas a diferentes desfechos e fenótipos clínicos. Além disso, é possível ainda identificar grupamentos filogenéticos de isolados com características epidemiológicas, como tempo e espaço, que tenham associação com um maior sucesso na transmissão de um determinado clone. Objetivo: Identificar polimorfismos genéticos associados ao desfecho clínicos da leptospirose e ao sucesso de transmissão em determinado tempo e espaço .  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / Albert Ko ­ Integrante / Mitermayer Galvão dos Reis ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. Financiador(es): National Institutes of Health ­ Auxílio financeiro. 2010 ­ 2011 Identificação in silico de Retrovírus Endógenos Humanos usando a região LTR de PTLV­1, PTLV­2 e PTLV­3 Descrição: O HTLV­1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido pelo HTLV­2 e HTLV­3. Acredita­se que HTLV­1, HTLV­2 e HTLV­3 se originaram independentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatas não­humanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação desses retrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com
  11. 11. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 11/47 repetições terminais longas. Estima­se que mais de 40% do genoma humano seja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugere­se ainda que os HERVs estão no genoma humano por um período de aproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposição envolvendo­os podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindo ao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivo identificar a presença de isolados de HTLV­1, HTLV­2, HTLV­3, STLV­1, STLV­2 e STLV­3 como retrovírus internos humanos.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Costa, Giselle Calasans Souza ­ Integrante / Fernanda Khouri Barreto ­ Integrante / Jaqueline Goes de Jesus ­ Integrante / Aline Cristina Mota Miranda ­ Integrante. 2010 ­ 2011 ESTUDO DA DIVERSIDADE DO HIV­1 NA BAHIA ­ BUSCA E ANÁLISE DE NOVAS FORMAS RECOMBINANTES CIRCULANTES (CRF) DO HIV Descrição: Após quase três décadas do início da epidemia de AIDS, inúmeros esforços vêm sendo feitos no combate ao HIV, porém até o momento não se chegou à uma vacina capaz de prevenir a infecção ou medicamentos capazes de eliminar o vírus. A intensa variabilidade genética do HIV­1 reflete­se no surgimento de isolados virais com comportamentos biológicos diversos e esta característica representa o principal obstáculo para a eficiência do funcionamento do sistema imune humano e para o desenvolvimento de vacinas e terapias universais. Estudos anteriores realizados pelo nosso grupo indicaram uma grande diversidade de genótipos de HIV­1 na Bahia e a prevalência de uma forma recombinante ainda não identificada, apresentando o mesmo padrão genético, em cerca de 6% da população infectada. O objetivo deste trabalho é investigar a existência de uma nova forma recombinante circulante (CRF) do HIV­1 na Bahia e a identificação de propriedades moleculares relacionadas com a adaptação e dispersão destas variantes. Para tanto, será realizado o seqüenciamento do genoma total de isolados previamente caracterizados em dois genes virais: gag e env. Estas seqüências de DNA serão então submetidas às análises filogenéticas e de recombinação através de ferramentas de Bioinformática. Este estudo poderá contribuir para o melhor entendimento a respeito das propriedades evolutivas do HIV, para vigilância da epidemia local de AIDS e para a escolha adequada de medidas de controle..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / joana Paixão Monteiro ­ Integrante / Adriano Fernando Araujo ­ Integrante. 2009 ­ 2014 O reverso genetico de pacientes infectados pelo HTLV­1 Descrição: As proteinas da ORF­1 do HTLV­1 (p12 e p8) provenientes de 140 pacientes infectados pelo HTLV­1 com diferentes status clinicos foram analisadas quanto ao padrao mutagenico. As mutacoes estatisticamente significantes quanto a carga proviral e status clinicos foram criadas in vitro utilizando o vetor de expressao pME­p12­p8. Estes vetores (mutantes e WT) foram utilizados para transfeccao de celulas 293­TN (ensaios de expressao) e HeLa (ensaios de co­localizacao por microscopia confocal). Estas mutacoes foram utilizadas para criacao de lentivirus mutantes para ensaios de infectividade e modelo animal utilizando macaco Rhesus..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Rego, Filipe Ferreira de Almeida ­ Integrante / Genoveffa Franchini ­ Integrante / Maria Fernanda Castro­Amarante ­ Integrante / Fernanda Khouri ­ Integrante. Financiador(es): National Institutes of Health ­ Auxílio financeiro. 2009 ­ 2013 Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV) e avaliação da transmissão materno­fetal em gestantes da região sul da Bahia Descrição: o projeto pretende: (1) conhecer a prevalência dos vírus HTLV e
  12. 12. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 12/47 CMV em gestantes na nossa região, a fim de conhecer o perfil da infecção nessa população; (2) informar, conscientizar e alertar aos profissionais de saúde sobre a importância da realização da pesquisa dos vírus nas gestantes; (3) minimizar os riscos de infecção materno­fetal, possibilitando que intervenções e medidas de educação em saúde sejam implementadas; (4) fornecer dados para elaborar projetos e políticas de saúde para essa população vulnerável..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Sandra Rocha Gadelha ­ Coordenador / Filipe F A Rêgo ­ Integrante / Melo, Marco Antônio Gomes ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2009 ­ Atual Desenvolvimento de vacina anti­HIV­1 utilizando modelo animal e vetor contendo regioes LTR do HTLV­1 Descrição: Os genes pol, gag e env do SIV­1 foram inseridos no vetor pMA contendo o gene GFP e as regioes 3' e 5' do HTLV­1. A insercao foi realizada de maneira que os gene da GFP ficou sobre controle do LTR 5' e os genes do SIV sobre controle da regiao LTR 3' contendo o sinal de hipermetilacao. Este vetor foi utilizado para transfeccao de celulas 293­T, 293­TN e HeLa. Foram medidas a expressao de GFP, expressao dos produtos genicos gag­pro e env do SIV. Este vetor expressando porcoes conservadas de varios genes do SIV­ HIV sera utilizado em testes utilizando modelo animal (SIVmac251 macaque model)..  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Genoveffa Franchini ­ Coordenador. Financiador(es): National Institute Of Health ­ Outra. 2008 ­ 2013 Contribuição de polimorfismos nas proteínas gp46, gp21 e HBZ, para a manifestação da HAM/TSP. Descrição: Embora o HTLV­1 tenha sido convincentemente associado a doenças, a grande maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (95­98%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como, não é conhecido o motivo pelo qual alguns indivíduos desenvolvem uma síndrome neurológica, enquanto outros desenvolvem uma leucemia ou outras patologias inflamatórias. Assim, as diversas manifestações clínicas podem depender do tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os antígenos do HTLV­1, bem como do local ou órgão no qual a reação inflamatória predominantemente acontece. A avaliação das proteínas gp46, gp21 e HBZ, de isolados do HTLV­1 provenientes de indivíduos com diversos estados de sintomatologia, neste estudo, poderá contribuir para o conhecimento da presença de polimorfismos nestas proteínas. Estas investigações inter­hospedeiros permitirão avaliar a dinâmica das variantes virais correlacionando com o perfil clínico de cada paciente. Além disso, ao avaliar o mesmo indivíduo infectado, em diferentes tempos, é possível analisar o movimento das cepas do HTLV­1 e o curso da infecção, além de estimar mudanças no tamanho da população viral efetiva, ao longo do tempo. Também é possível obter um maior entendimento HTLV­1 quando comparando a dinâmica da evolução do vírus com os dados clínicos do paciente. Justifica­ se assim, a análise de proteínas virais e o estudo filodinâmico do vírus para contribuir para o melhor entendimento do HTLV­1 e sua relação com as manifestações clinicas e progressão do paciente..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Viviana Galazzi ­ Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida ­ Integrante / Miranda, Aline Cristina Andrade Mota ­ Integrante / Galvao­Castro, Bernardo ­ Integrante / Fernanda Khouri Barreto ­ Integrante.
  13. 13. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 13/47 2008 ­ 2012 Avaliação filodinâmica de isolados do HIV­1 na transmissão materno­fetal Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Marco Salemi ­ Integrante / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / Adriano Fernando Araujo ­ Integrante / Santos, Edson ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. 2008 ­ 2011 EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HTLV EM MULHERES PORTADORAS DE HIV­1 E ANÁLISE DAS VARIAÇÕES GENÉTICAS DO HTLV­1 EM DIFERENTES COMPARTIMENTOS DO HOSPEDEIRO Descrição: O HTLV­1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outras perturbações inflamatórias. Alguns estudos tentam analisar as variações do HTLV­1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto sobre a infecção pelo HTLV. A coinfecção HTLV/HIV­1 é associada com graves manifestações clínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem como comportamento de risco. Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem a maior prevalência para o HTLV­1 (1,74%) encontrada no país. Poucos estudos descrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e muito menos investigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Para descrever a epidemiologia molecular do HTLV­1 e as características da coinfecção HTLV/HIV­1 em mulheres, nós realizamos um corte transversal envolvendo 107 mulheres infectadas com HIV­1 do centro de referência da DST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras das pacientes foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmada usando o WB e PCR. A análise filogenética foi realizada nas seqüências LTR do HTLV para obter mais informações sobre a epidemiologia molecular e a origem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no ELISA foram confirmadas como HTLV­1 no WB e PCR e uma amostra confirmada como HTLV­2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de 4,7%, menor que o esperado, provavelmente pela baixa prevalência da infecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de controle de DST/AIDS implementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenética da região LTR das quatro seqüências do HTLV­1 revelou que todos os isolados foram classificados como subgrupo Transcontinental do subtipo Cosmopolita e se agrupam no principal grupo latino­americano, que possui um ancestral comum com isolados da África do Sul, sugerindo uma introdução pós Colombiana deste vírus na Bahia. A seqüência de HTLV­2 foi classificada como subtipo c, a variante brasileira do subtipo 2a. Também foi obs.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Filipe F A Rêgo ­ Integrante / Vitor Uchoa Carvalho ­ Integrante / Liliane Lins ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2008 ­ 2009 Desenvolvimento de uma ferramenta de rastreamento de mutações em árvores filogenéticas, para o estudo da evolução dos isolados do HIV­1 Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo o desenvolvimento de uma nova ferramenta de bioinformática para auxiliar os pesquisadores e clínicos nos projetos de pesquisa visando um melhor conhecimento das seqüências dos isolados do HIV­1, podendo ser estendida posteriormente para o estudo das seqüências de outros patógenos de importância epidemiológica no Brasil como o HTLV­1, HCV, HBV, HPV, HHV8, vírus da dengue, Leishmania, Tripanossoma, etc. A nova ferramenta permitirá, de uma forma intuitiva e simples, rastrear mutações presentes nas seqüências destes patógenos (inicialmente, do HIV­1) representando­as graficamente nos grupamentos monofiléticos das árvores filogenéticas, reconstruídas conforme o protocolo de pesquisa do LASP. Cada mutação identificada nas seqüências será avaliada quanto a sua relação com a resistência às drogas anti­HIV/AIDS e procurar­se­á na estrutura da árvore, quando esta mutação ocorreu, a partir do processo de especiação. Desta forma os pesquisadores e clínicos poderão responder várias questões importantes que não podem ser facilmente
  14. 14. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 14/47 inferidas com as ferramentas de bioinformática existentes, como por exemplo: (a) Quais mutações são responsáveis pela diferenciação entre duas seqüências ou entre um grupo delas, sejam de um mesmo cluster ou de clusters diferentes; (b) Quais dessas mutações podem estar relacionadas com resistência a anti­retrovirais, e quando (onde) essas mutações apareceram; (c) Quais dessas mutações induzem sítios de modificações pós­traducionais, principalmente glicosilação, fosforilação e miristilação; (d) Quais das mutações presentes numa seqüência estão em sítios com pressão seletiva positiva; (e) Se as mutações observadas na seqüência em estudo ocorreram freqüentemente em outros clusters ou predominantemente apenas no seu próprio cluster. Assim, esta ferramenta permitirá rastrear uma mutação de interesse ao longo da árvore filogenética de forma gráfica interativa, permitindo a extração de informações essenciais de forma r.  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Diego Gervásio Frias ­ Integrante. 2008 ­ 2009 Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para seleção de regiões protéicas potenciais, dos isolados brasileiros do HIV­1, para dar suporte aos projetos de desenvolvimento de protótipos vacinais vinculados ao PN­DST/AIDS, Ministério da Saúde Descrição: Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática de fácil manuseio, gerando novos da­dos sobre as nossas sequências do HIV­1, e treinamento dos investigadores que atuam na área de resistência do HIV­1 às drogas antiretrovirais e na pesquisa de vacinas contra HIV­1/AIDS, capacitando­os nos diversos aspectos teóricos e práticos de data management e data mining das seqüências dos isolados brasileiros deste retrovírus, bem como nos aspectos práticos de designer , armazenamento, recuperação e análise dos dados genéticos, epidemiológicos e clíni­cos provenientes dos bancos de dados locais e públicos.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. 2007 ­ 2010 variabilidade genética dos isolados do HIV­1 num grupo de mulheres e crianças infectadas do Município de Feira de Santana/Bahia/ Brasil Descrição: A intensa variabilidade genética do HIV­1 ao longo do tempo exige estudos para compreender a dinâmica do seu advento em determinada comunidade, seu padrão de transmissão e evolução, que permitam estabelecer uma estratégia eficaz de combate a tão sério problema de saúde publica. No Brasil, os trabalhos com o genoma do HIV­1 vêm sendo desenvolvidos desde a década passada para mapear a sua epidemiologia molecular, nas diversas regiões do país, constatando a maior prevalência do subtipo B, do C, do F e dos recombinantes B/F e outros. Estudos mais recentes na Bahia mostram um alto grau de diversidade genotípica neste Estado, decorrente da circulação de diversas formas de recombinantes. Constata­se também uma elevada taxa de resistência aos antirretrovirais o que pode facilitar a difusão destas cepas para outras localidades. A difusão do HIV­1 para as cidades de médio e pequeno porte, o aumento da transmissão heterossexual, afetando cada vez mais as mulheres mais jovens e pobres justificaram este trabalho na cidade de Feira de Santana. Ela é a segunda cidade mais importante do estado, abrangendo uma região de mais de 1.000.000 de habitantes. É um entroncamento de três grandes rodovias federais, constituindo­se na porta de entrada de um grande fluxo migratório de várias partes do país, tornando­a vulnerável a surtos de doenças transmissíveis. Já foram registrados no Centro de Referência para DST/AIDS, 791 casos de pacientes soropositivos, sendo que 180 foram mulheres e 32 foram crianças. Não há relato de nenhum estudo sobre a diversidade genética do HIV­1 nesta população, porém os resultados oriundos da população de Salvador podem refletir a realidade do Município de Feira de Santana, pois este se localiza a 110 km de distância da capital. Assim, pretendemos com este projeto: Verificar a freqüência e distribuição dos subtipos do HIV­1, em
  15. 15. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 15/47 relação ao gene pol, na população estudada. Descrever a variabilidade genética do gene pol dos novos isolados do HIV­1 relacionada.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / Adriano Fernando Araujo ­ Integrante / Santos, Edson de Souza ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro­Cunha ­ Integrante. 2007 ­ 2010 Utilização de códons pelos retrovírus humanos 'in silico" Descrição: Desenvolver uma nova ferramenta para analisar o comportamento dos diferentes transcritos dos genes do HIV­1 e HTLV­1, provenientes do GenBank, em relação a utilização de códons e disponibilidade de tRNA da célula hospedeira. Considerando que as informações sobre o codon usage e número de cópias de genes para tRNA do Homo sapiens é conhecido, é possível inferir sobre a dinâmica evolutiva intra­celular do HIV­1. Assim, estas análises contribuirão para o melhor entendimento a respeito da dinâmica e da adaptação viral.  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Diego Gervásio Frias ­ Integrante / joana Paixão Monteiro ­ Integrante. 2007 ­ 2009 Correlação entre Polimorfismos nas Regiões Promotora e Regulatórias do Gene da GLUT1, Expressão e Exposição da Proteína na Membrana e o Desenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos infectados pelo HTLV­1 Descrição: A infecção pelo HTLV­1 é endêmica em Salvador, onde a prevalência é de 1,8%. O desenvolvimento de manifestações clínicas associadas ao HTLV­1, como a doença neurológica paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV­1 (TSP/HAM) ocorre em 2­4% da população infectada e ainda não se sabe porque esta infecção permanece assintomática na maioria dos portadores. Recentemente foi demonstrado que a glicoproteína transportadora de glicose do tipo 1 (GLUT1) funciona como receptor para a infecção do linfócito­T CD4+ e que sua expressão aumenta a susceptibilidade ao HTLV­1. Tem sido demonstrado que polimorfismos em um único nucleotídeo (SNPs) nas regiões promotora e regulatórias do gene da GLUT1 estão associados à susceptibilidade a nefropatia diabética em diferentes populações. Estes polimorfismos poderiam influenciar a expressão da proteína GLUT1 na membrana celular e, no caso da infecção pelo HTLV­1, poderiam facilitar a entrada do vírus na célula e a transmissão célula­célula do mesmo, levando a um aumento na carga proviral e, posteriormente, ao desenvolvimento de TSP/HAM. Entretanto, não existem estudos que avaliem a associação entre os polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene da GLUT1 e a infecção pelo HTVL­1. O objetivo deste projeto é verificar possíveis correlações entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene humano da GLUT1 com o desenvolvimento de TSP/HAM..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo GalvaoCastro ­ Integrante / Sandra Rocha Gadelha ­ Integrante / Gisele Calazans Costa ­ Integrante / Gabriel Muricy ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2006 ­ 2011 Perfil da Saúde Bucal em pacientes infectados pelo HTLV­1: Análise clínica, carga proviral e analise molecular do vírus na saliva. Descrição: Este estudo objetiva descrever o perfil bucal de carreadores assintomáticos do HTLV­1 e pacientes infectados e com HAM/TSP, para investigar a associação entre carga proviral na saliva e severidade de doença periodontal. Também pretendemos analisar as variações intra­hospedeiro, de PBMCs e células na saliva destes indivíduos infectados..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Simone Kashima ­
  16. 16. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 16/47 Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Rochele Azevedo ­ Integrante / Filipe F A Rêgo ­ Integrante / Vitor Uchoa Carvalho ­ Integrante / Liliane Lins ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2006 ­ 2010 Analise dos polimorfismos genotípicos do HIV­1 e estudo in silico de como estas mutações podem interferir na maquinaria de tradução da célula hospedeira Descrição: A utilização do HMA como técnica de subtipagem tem sido eficaz em áreas com índices elevados de infecção pelo HIV, pois além de ser rápida é economicamente mais viável. Além disso, o estudo de duas regiões genômicas, tais como env e gag tem auxiliado na identificação de formas recombinantes64. Entretanto, dado o crescente numero de formas recombinantes circulantes e únicas sendo reportadas no país, se faz necessária uma reavaliação na eficiência deste método em detectar estas variantes virais. Ainda que não seja completamente esclarecido que os vários grupos, subtipos e CRFs de HIV­1 tenham diferenças biológicas, ao menos no que diz respeito à transmissibilidade e ao curso de progressão para AIDS, torna­se claro que o conhecimento da prevalência e das mudanças temporais na incidência dessas variantes em diferentes áreas geográficas, seja importante para auxiliar na avaliação da dinâmica de propagação da epidemia na região, podendo também ser útil para o desenho de vacinas adaptadas especificamente para variantes do HIV circulantes em cada área e na atualização dos teste sorológicos de triagem. O alto polimorfismo do HIV representa um dos principais obstáculos para o desenvolvimento de terapias e vacinas anti­HIV. O principal mecanismo de escape viral é a grande quantidade de substituições sinônimas, quando comparadas com as substituições não­sinônimas (pressão seletiva positiva), nos diferentes genes do HIV­1, contribuindo para a alta diversidade viral no hospedeiro65Pretendemos assim, estimar a prevalência de subtipos genéticos de HIV­1 no estado da Bahia; investigar a existência de eventos de recombinação entre isolados de HIV­1 de diferentes subtipos com base na caracterização dos genes gag e env e sua importância nesta população; verificar a existência de possíveis associações entre os subtipos de HIV­1 e variáveis clínicas e sócio­demográficas; vvaliar a eficiência do Ensaio de Mobilidade de Heteroduplexes (HMA) na determinação dos subtipos de HIV­1 em compar.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Coordenador / joana Paixão Monteiro ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2006 ­ 2010 DIVERSIDADE MOLECULAR DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO 1 NO ESTADO DA BAHIA Descrição: A análise de sequências genômicas é uma forma poderosa de se estudar a diversidade do HIV­1 e sua expansão nas populações, além de ser crucial para dar suporte à vigilância epidemiológica e ao desenvolvimento de terapias e vacinas eficazes. Neste estudo foram geradas sequências dos genes gag e env de 61 pacientes infectados em Salvador e do pol de 58 em Feira de Santana, Bahia, Brasil. A bioinformática foi utilizada para subtipar, genotipar as mutações de resistência, determinar a pressão seletiva e predizer o uso de coreceptor. Em Salvador, 92,6% das amostras foram do subtipo B e 7,4% foram recombinantes BF1. Em Feira de Santana, 67,2% foram do subtipo B, 6,9% F1, 1,7% C e 24,1% BF1. Onze (19,0%) destes isolados apresentaram mutações de resistência. Pacientes infectados pelo B tinham em média 0,4 mutações de resistência e nenhuma mutação deste tipo foi observada em BF1. Com base na caracterização da alça V3 do B de 43 amostras de Salvador, foram encontradas 18,2% de variantes brasileiras (B ­ GWGR), 46,5% de GPGR e 34,9% de GXGX. O grupo de sequencias GPGR mostrou passar por maior pressão seletiva. O tempo médio de diagnóstico positivo foi de 13 anos para o B' e 9 anos para o B (GPGR + GXGX). Setenta e seis por cento destes vírus fazem uso do coreceptor CCR5, enquanto 24%
  17. 17. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 17/47 foram classificados como capazes de usar o CXCR4. Encontramos uma associação entre o B e um maior tempo desde o diagnóstico. As prevalências de B' e de B/F1 em Salvador foram menores do que as encontradas em estudos anteriores na Bahia e no Brasil, por outro lado, em Feira de Santana foi encontrada uma alta prevalência de B/F1..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Carlos Brites ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / joana Paixão Monteiro ­ Integrante / Adriano Fernando Araujo ­ Integrante. Financiador(es): Ministério da Saúde ­ Auxílio financeiro. 2006 ­ 2009 Caracterização Étnica/geográfica da população de Salvador e de Portadores do HIV­1 e a Correlação entre o Índice de Ancestralidade Africana e Vulnerabilidade ao HIV/AIDS Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Inês Dourado ­ Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho ­ Coordenador / Flora Maria Fernandes ­ Integrante / Angelina Xavier Acosta ­ Integrante / Geraldo Argolo Ferraro ­ Integrante / Taís Bomfim ­ Integrante / Kyoko Abe Sandes ­ Integrante. Financiador(es): Ministério da Saúde ­ Auxílio financeiro. 2005 ­ 2007 Avaliação das alterações no metabolismo ósseo e mineral de indivíduos portadores de retrovírus (HIV/HTLV) e correlações destas alterações com polimorfismos no promotor de IL­6 e nos níveis de osteocalcina Descrição: Visa avaliar as alterações do metabolismo ósseo e mineral de individuos portadores de retrovírus e correlações dessas alterações com polimorfismos no promotor de IL­6 e nos níveis de osteocalcina.  Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho ­ Coordenador / Sandra Rocha Gadelha ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2003 ­ 2006 ESTUDO DOS DETERMINANTES DE RISCO PARA INFECÇÃO PELO HTLV EM DOADORES DE SANGUE DO ESTADO DA BAHIA E CARACTERIZAÇÃO GENOTÍPICA DOS ISOLADOS VIRAIS Descrição: Objetivo: Caracterizar epidemiologicamente a infecção pelo HTLV em doadores de sangue do Estado da Bahia e analisar filogeneticamente os isolados virais. Material e métodos: entre 01/2000 e 12/2003 foram entrevistados 91 doadores infectados pelo HTLV­I (casos) e 195 doadores não infectados (controles), dos quais foram obtidas informações de ordem demográfica, sócio­econômica, educacional, bem como relativas ao comportamento sexual, através de um questionário padronizado aplicado por um único entrevistador. Isolados virais de 25 doadores foram seqüenciados e analisados filogeneticamente. Resultados: Na análise multivariada foram identificados como fatores de risco independentes para infecção pelo HTLV sexo feminino, baixa renda familiar, DST prévia, uso inconsistente de preservativos e número de parceiros sexuais durante a vida. Observamos diferenças significativas de comportamento sexual entre homens e mulheres infectados. Todos os isolados virais analisados pertenciam ao subgrupo transcontinental, subgrupo cosmopolita. Pela primeira vez foi observado um isolado da África do Sul inserido no grupamento latino­americano. Conclusão: Os resultados deste estudo revelam uma associação entre baixo nível sócio­ econômico e práticas sexuais não seguras e infecção pelo HTLV. A menor prevalência observada confirma dados epidemiológicos recentes e pode ser decorrente de uma melhor triagem clínica, da redução da prevalência de infecção pelo HTLV na população geral, ou de um efeito dilucional no universo de doadores ocasionado pela exclusão definitiva ao longo dos anos dos doadores infectados. Os dados da comparação entre homens e mulheres
  18. 18. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 18/47 reforçam a tese de que a principal via de transmissão de HTLV­I no nosso meio seja a sexual. A análise filogenética demonstrou pela primeira vez que a África do Sul pode ter contribuído na introdução do HTLV­I no Brasil..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Coordenador / Sergio Araujo Pereira ­ Integrante / Artur Trancoso Lopo Queiróz ­ Integrante / Flora Maria Fernandes ­ Integrante / Augusto Cesar Andrade Mota ­ Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2003 ­ 2005 Correlações dos Polimorfismos Genéticos do HTLV­I/II e da Resposta Imune do Hospedeiro com a Infecção e/ou Patogênese Descrição: Avaliar o genoma do HTLV­1 e do hospedeiro,bem como da resposta imune,para melhor compreensão dos mecanismos biológicos envolvidos na infecção e/ou patogenia viral.  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Coordenador / Angelina Xavier Acosta ­ Integrante / Fernada Grazzi ­ Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ­ Auxílio financeiro. 2002 ­ 2005 Correlações do Polimorfismo Genético do HTLV­I/II com o Polimorfismo dos genes do Hospedeiro envolvidos no Desenvolvimento de Paraparesia Espática Tropical/Mielopatia Associada (TSP/HAM) em Salvador Descrição: Transferência de tecnologia para um núcleo emergente no Nordeste do país; Estabelecer as correlações entre fatores virais e do hospedeiro assintomático e sintomático com TSP/HAM; Caracterização molecular do genoma proviral (TAX) dos indivíduos infectados; Anáilise dos polimorfismos destas regiões,relacionando os mesmos com a sintomatologia TSP/HAM;Caracterização molecular dos genes do hospedeiro envolvido no mecanismo de transativação por Tax (NF­KB,IK­B,CREB,SRFp50,p65,p52,c­ Rel,p­16) em indivíduos infectados assintomáticos e com TSP/HAM, correlacionando estes resultados com as alterações genotípicas do hospedeiro..  Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.  Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvao Castro ­ Coordenador / Marilda Gonçalves ­ Integrante. 2013 ­ Atual Formação de uma rede de discussão e disseminação do conhecimento sobre as infecções pelo HIV­1 e HTLV­1, utilizando a educação como ferramenta de redução de novos casos Descrição: De acordo com Ministério da Saúde, em 2012, (Brasil, 2012) a faixa etária entre 15­24 anos mantém uma tendência de aumento da prevalência da infecção pelo HIV­1, o que evidencia a vulnerabilidade desse grupo. Alguns aspectos da vulnerabilidade os atingem de maneira especial, dentre eles a falta de informação eficaz e barreiras materiais e culturais que limitam o seu acesso aos meios de proteção (AYRES,J. 1996). De acordo com o MS, tanto a infecção pelo HIV quanto pelo HTLV devem ser considerados problema de saúde pública, sendo a educação o melhor caminho para prevenção e promoção da saúde. Objetivo Geral: Formar e capacitar uma rede de adolescentes e jovens vulneráveis, da região metropolitana de Salvador, para atuarem como disseminadores do conhecimento sobre a infecção pelo HIV­1 e HTLV­1, visando a redução da incidência destas epidemias entre seus pares. Objetivos Específicos: 1. Habilitar educadores de escolas públicas e Projetos de extensão
  19. 19. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 19/47 organizações sociais sobre os conhecimentos básicos das infecções pelo HIV­ 1 e HTLV­I; 2. Orientar na elaboração de um plano de ação, a ser executado pelos educadores, para a formação/capacitação de adolescentes e jovens multiplicadores de informações sobre a prevenção das infecções pelo HIV­1 e HTLV­1; 3. Capacitar adolescentes e jovens em situação de vulnerabilidade, através da rede de educadores previamente habilitados (objetivo 1); 4. Difundir os conhecimentos sobre a prevenção destas infecções pelos jovens multiplicadores entre seus pares; 5. Acompanhar periodicamente o aprendizado dos jovens e adolescentes sobre a infecção pelo HIV e HTLV­1; 6. Estimular o desenvolvimento de um material lúdico/didático, por parte dos adolescentes/jovens, que foram alvo da formação educativa, para ser aplicado a adolescentes e jovens em diferentes instituições/eventos voltados para esse público; 7. Proporcionar certificação profissionalizante da rede de multiplicadores em informações sobre prevenção das infecções pelo HIV­ 1/HTLV­1; 8. Desenvolver vídeos de todas as atividades teóricas de capacitação dos educadores, para serem disponibilizados no site do CPqGM/FIOCRUZ, pasra que estes possam fazer uso durante o processo de treinamento dos jovens e adolescentes; 9. Desenvolver vídeos de todas as atividades praticas laboratoriais que posteriormente serão utilizados no processo de capacitação dos educadores. 10. Disponibilizar estes vídeos no sitio do CPqGM/FIOCRUZ, para serem utilizados pelos educadores durante o processo de capacitação dos jovens e adolescentes. .  Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.  Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado profissional: (5) / Doutorado: (4) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / de Oliveira, Tulio ­ Integrante / Kashima, Simone Haddad ­ Integrante / Marcio Oliveira Silva ­ Integrante / Marilda Souza Gonçalves ­ Integrante / Gilson Carlos Soares ­ Integrante / Sandra do Valle ­ Integrante / Alfredo Dorea ­ Integrante. Financiador(es): Ministério da Saúde ­ Auxílio financeiro. 2005 ­ 2008 Promoção de saúde por meio da pesquisa e educação em Monte Gordo: Uma comunidade carente da área rural do Estado da Bahia Descrição: Implantação de um laboratório de informática numa escola pública de área rural carente, visando fornecer fundamentos da informática a escolares de uma área rural com a finalidade de inclusão digital..  Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho ­ Coordenador. Financiador(es): Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz ­Fundação Instituto Oswaldo Cruz ­ Cooperação / Fundação de apoio à pesquisa e extensão do estado da Bahia ­ Auxílio financeiro. 2012 ­ 2014 IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS­GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia.  Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador. 2010 ­ Atual Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV­1 Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV­1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes Projetos de desenvolvimento
  20. 20. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 20/47 de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV­1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui­se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV­1/AIDS, mas também em relação ao HTLV­ 1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise .  Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.  Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo ­ Integrante / Dustin Edwards ­ Integrante / Leandro I Souza­Brito ­ Integrante. 2007 ­ 2010 LASP­HIV1­ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV­1 aos antirretrovirais Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV­1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV­1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV­1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti­HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós­traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós­traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta.  Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Domingos Ramon Moreau ­ Integrante / José Carlos Couto Fernandez ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro­Cunha ­ Integrante. 2005 ­ 2006 Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN­DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases) Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN­DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV­1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil.  Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.  Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Domingos Ramon Moreau ­ Integrante / Filipe F A Rêgo ­ Integrante / Luciane Amorim Santos ­ Integrante / Saul Vislei ­ Integrante / Aline Cristina Andrade Mota­Miranda ­ Integrante / Queiroz, Artur TL ­ Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho ­
  21. 21. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 21/47 Integrante / Carvalho, Chandra Mara ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. 2003 ­ 2005 Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti­retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV­I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV­1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV­1 e HTLV­1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV­1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV­1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população. .  Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.  Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .  Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara ­ Coordenador / Bernardo Galvao Castro ­ Integrante / Domingos Ramon Moreau ­ Integrante / Aline Cristina Andrade Mota­Miranda ­ Integrante / de Oliveira, Tulio ­ Integrante / Queiroz, Artur TL ­ Integrante / Carvalho, Chandra Mara ­ Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha ­ Integrante. 2009 ­ Atual Periódico: The Scientific World Journal 2002 ­ Atual Periódico: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz 2007 ­ Atual Periódico: The Journal of Medical Virology 2007 ­ Atual Periódico: Emerging Infectious Diseases 2008 ­ Atual Periódico: AIDS Research and Human Retroviruses 2008 ­ Atual Periódico: Retrovirology Research and Treatment 2011 ­ Atual Periódico: PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) 2011 ­ Atual Periódico: Plos One 2010 ­ Atual Periódico: Nucleic Acids Research 2014 ­ Atual Periódico: Journal of Virology (Print) 2008 ­ Atual Periódico: Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (1999) 2014 ­ Atual Periódico: Journal of General Virology 2014 ­ Atual Periódico: PLoS Pathogens 2009 ­ Atual Periódico: Retrovirology (Auckland) 2013 ­ Atual Periódico: Bioinformatics 2010 ­ Atual Periódico: Virology Journal 2009 ­ Atual Periódico: AIDS (London) Membro de corpo editorial Revisor de periódico Revisor de projeto de fomento
  22. 22. 16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara) http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 22/47 2008 ­ Atual Projeto: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico 2008 ­ Atual Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia 2009 ­ Atual Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo 1. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Epidemiologia/Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.  2. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Medicina Preventiva.  3. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Saúde Pública.  4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica Básica e Metabólica.  5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.  6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática/Especialidade: Epidemiologia Molecular de Retrovirus.  Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem. 2005 HTLV­1 Travel Scholar, 12th International Conference on Human Retrovirology ­ Montego Bay (Jamaica). 2005 Prêmio da IX Jornada Científica de Pós­graduação, FIOCRUZ. 2005 (Melhor Painel) The Genetic Characteristic Study of the Brazilian HTLV­1 Isolates Suggests the Pre and Post­Columbian Origin of the Virus in this Country, 8º Simpósio Internacional Sobre HTLV. 2002 (Melhor Tese de Doutorado em Virologia no Brasil em 2002) Prêmio Helio Gelli Pereira no XIII Encontro Nacional de Virologia ­ Setembro/2002., Sociedade Brasileira de Virologia ­ Águas de Lindóia (SP). 1999 Fellowship Award, Nineth International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses ­ Kagoshima ­ Japão. Áreas de atuação Idiomas Prêmios e títulos Produções Produção bibliográfica Citações SCOPUS Artigos completos publicados em periódicos

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