1. ‫عن‬ ‫عامة‬ ‫مقدمة‬
‫ـيروسات‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ف‬‫لل‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫ل‬‫حو‬‫عرض‬:
‫إعداد‬:‫ي‬‫الشمير‬ ‫أحمد‬ ‫فيصل‬
Faisal A. Alshamiry
agrfaisal@gmail.com
Introduction to Gene Expression of Viruses

2. ‫الفيروسات‬
‫الفيروسات‬ ‫ات‬‫ز‬‫ممي‬
‫للفيروسات‬ ‫العامة‬ ‫السمات‬
‫للفيروسات‬ ‫العامة‬ ‫الصفات‬
‫للفيروسات‬ ‫العام‬ ‫التصنيف‬
‫للفيروسات‬ ‫الهيكلي‬ ‫التركيب‬
RNA‫الجيني‬‫التعبير‬‫في‬ ‫ة‬‫ر‬‫ودو‬
‫الفيروسات‬‫في‬‫التكاثر‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
‫املحللة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
‫البكتيرية‬ ‫للفيروسات‬ ‫شاذة‬ ‫حاالت‬
‫الجيني‬‫للتعبير‬ ‫العام‬ ‫النموذج‬
‫القهقرية‬ ‫الفيروسات‬‫في‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬(‫املناعة‬ ‫نقص‬)
‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬c
‫النوع‬ ‫الهربس‬‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬1
‫فاج‬ ‫إنتيروباكتيريا‬‫في‬ ‫املشغالت‬‫مع‬ ‫املنظمات‬ ‫تداخل‬λ
‫املحللة‬ ‫ة‬‫ر‬‫والدو‬ ‫الكابسيد‬
‫الكابسيد‬ ‫بتحلل‬ ‫للتحكم‬ ‫التنظيم‬
‫مرحلة‬‫الكابسيد‬ ‫في‬ ‫اإلنهاء‬
‫للفيروسات‬ ‫املستذيب‬ ‫دورة‬ ‫في‬‫ودوره‬ ‫الكبت‬ ‫بروتين‬
‫القويمة‬ ‫املخاطية‬ ‫الفيروسات‬ ‫في‬‫الجيني‬‫التعبير‬
(‫مثال‬‫اإلنفلونزا‬ ‫فيروس‬)
‫فيروس‬ ‫في‬‫الجيني‬‫التعبير‬HIV
‫الفيروسات‬ ‫في‬‫املستقر‬‫الجيني‬‫التعبير‬(‫اإلنفلونزا‬)
‫الغدية‬ ‫الفيروسات‬ ‫في‬‫الجيني‬‫التعبير‬
‫األيبوال‬ ‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫الهربس‬ ‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫الكبدية‬ ‫للفيروسات‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫البيكورناوية‬ ‫للفيروسات‬‫الجيني‬‫التعبير‬
‫آلفا‬ ‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫الربدية‬ ‫للفيروسات‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬
‫للفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬Rhabdoviridae
‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬Hepadnaviridae
‫املاء‬ ‫ي‬‫جدر‬ ‫لفيروس‬‫الجيني‬‫التعبير‬Varicella-Zoster Virus
‫النواة‬ ‫حقيقية‬ ‫مجموعة‬ ‫لفيروسات‬ ‫العام‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬ ‫مخطط‬.
‫المحتويات‬

3. ‫وقبل‬‫الولوج‬‫الى‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫يجب‬‫معرفة‬‫صفات‬‫ات‬‫ز‬‫وممي‬‫وأشكال‬‫وتص‬‫نيف‬
‫الفيروسات‬‫وهناك‬‫العديد‬‫من‬‫التصنيفات‬‫ومنها‬‫التي‬‫تعتمد‬‫على‬‫القواعد‬
‫النيتروجينية‬‫او‬‫الصفات‬‫املظهرية‬‫جية‬‫ر‬‫الخا‬‫للفيروسات‬‫او‬‫نوع‬‫الحمض‬‫ال‬‫ي‬‫و‬‫نو‬‫او‬
‫طريقه‬‫تضاعف‬‫الفيروس‬‫او‬‫حسب‬‫العناصر‬‫الداخلة‬‫في‬‫تركيبه‬‫او‬‫على‬‫معدل‬‫الكتلة‬
‫الجزيئية‬‫والكثافة‬‫الطفوية‬‫جة‬‫ر‬‫ود‬‫الحموضة‬
‫الفيروسات‬‫أو‬‫ات‬ َ‫م‬ ُ‫الح‬‫مفردها‬‫فيروس‬‫أو‬‫ة‬ َ‫م‬ ُ‫ح‬‫والتي‬‫تعني‬‫ايضا‬‫باللغة‬‫اليونانية‬‫القديمة‬«‫ذ‬‫ي‬‫فان‬»‫أو‬«‫م‬ ُّ‫س‬»
‫وهو‬‫عامل‬‫ممرض‬‫صغير‬‫ال‬‫يمكنه‬‫التكاثر‬‫أو‬‫العيش‬‫غالبا‬‫إال‬‫داخل‬‫خاليا‬‫كائن‬‫حي‬‫آخر‬.
3 Faisal A. Alshamiry

4. ‫الفيروسات‬ ‫مميزات‬
‫تتميز‬‫الفيروسات‬‫بأنها‬‫ة‬‫ر‬‫قاد‬‫على‬‫ر‬‫التطو‬‫بفعل‬‫االنتخاب‬‫الطبيعي‬‫والتكاثر‬‫لكي‬‫ت‬،‫تضاعف‬
َ
‫إال‬‫أنها‬‫ال‬
‫تستطيع‬‫القيام‬‫بذلك‬‫بنفسها‬‫إال‬‫في‬‫وجود‬‫املضيف‬.‫كما‬‫أن‬‫للفيروسات‬‫نية‬ُ‫ب‬‫ميز‬
ُ
‫ت‬‫ها‬‫عن‬‫غيرها‬‫من‬
‫الكائنات‬‫ى‬‫األخر‬‫وكذلك‬‫اتيجية‬‫ر‬‫است‬‫نسخها‬‫فهي‬‫ذات‬‫تنوع‬‫كبير‬‫إال‬‫أن‬‫هناك‬‫الكثير‬‫من‬‫ا‬‫لصفات‬‫أو‬
‫السمات‬‫التي‬‫تشترك‬‫بها‬‫الفيروسات‬‫جميعا‬‫وهي‬:
•‫صغير‬‫الحجم‬.
•‫قطرها‬‫أقل‬‫من‬200‫نانومتر‬‫في‬‫الغالب‬.
•‫ة‬‫ر‬‫قاد‬‫على‬‫التكاثر‬‫او‬‫التناسخ‬‫في‬‫الخاليا‬‫املضيفة‬‫فقط‬.
4 Faisal A. Alshamiry

5. ‫الصفات‬‫العامة‬‫للفيروسات‬
‫جسيم‬‫الفيروس‬Virusparticle‫ويعرف‬‫فيرون‬Virion‫ي‬‫حاو‬‫على‬‫نمط‬‫واحد‬‫من‬‫االحماض‬‫ية‬‫و‬‫النو‬.
‫الفيروسات‬‫محاطة‬‫بغطاء‬‫تيني‬‫و‬‫بر‬‫يعرف‬(‫الكابسيد‬)Capsid‫غالف‬‫القفيصة‬
‫ف‬ّ‫ر‬ُ‫يع‬‫الكابسيد‬‫مع‬‫الحامض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ب‬(‫النيكوكلوتيدكابسيد‬)Neuclecapsid.
‫يتركب‬(‫النيكوكلوتيدكابسيد‬)‫من‬‫وحدات‬‫صغيرة‬Subunits‫متماثلة‬‫تعرف‬‫ات‬‫ر‬‫الكابسومي‬
Capsomeres.
‫ات‬‫ر‬‫الكابسومي‬‫تتألف‬‫من‬‫تجمعات‬‫من‬‫متعددات‬‫الببتيدات‬‫مرتبة‬‫ل‬‫حو‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬.
‫الفيروس‬‫قد‬‫ن‬‫يكو‬‫يا‬‫ر‬‫عا‬Naked‫او‬‫مغلفا‬Enveloped‫وفيه‬‫ن‬‫يكو‬‫الحامض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬
‫املوجود‬‫ضمن‬‫الكاب‬‫سيد‬‫محاط‬‫بتركيب‬‫غشائي‬‫جي‬‫ر‬‫خا‬‫يدعى‬‫الغالفث‬Envelope
‫والذي‬‫ن‬‫يتكو‬‫من‬‫عدة‬‫طبقات‬‫من‬‫ن‬‫الدهو‬‫والبروتين‬.
5 Faisal A. Alshamiry

6. ‫ر‬‫بالتيمو‬ ‫ديفيد‬‫تصنيف‬‫على‬ ‫بناءا‬‫الفيروسات‬‫تصنيف‬‫لنظم‬ ‫التفصيلي‬‫املخطط‬‫يبين‬‫الشكل‬‫هذا‬
‫نوع‬‫على‬ ‫اعتمادا‬ ‫الفيروسات‬‫يصنف‬‫الشكل‬ ‫هذا‬
‫املادة‬‫ـة‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ي‬‫الوراث‬
‫التصنيف‬‫العام‬‫للفيروسات‬

7. ‫ملبادئ‬‫لهذه‬‫وفقا‬ ‫الفيروسات‬ ‫أنواع‬ ‫ملعظم‬‫العام‬‫التصنيف‬ ‫تبين‬‫ة‬‫ر‬‫الصو‬ ‫هذا‬:
•‫اثية‬‫ر‬‫الو‬ ‫املادة‬ ‫نوع‬
•‫للقفيصة‬ ‫ي‬ ‫الهندس‬ ‫الشكل‬
•‫ية‬‫ر‬‫عا‬ ‫أو‬ ‫مغطاة‬ ‫القفيصة‬ ‫نوع‬
•‫الشحنة‬ ‫نوع‬7 Faisal A. Alshamiry

8. 8 Faisal A. Alshamiry

9. Structures of Viruses
1- Helical capsid
2- Polyhedral capsid
3- Envelope
4-T-phage: the most complex
(bacteriophages or viruses that infect bacteria)
‫للفيروسات‬‫الهيكلي‬ ‫التركيب‬
1-‫نية‬‫و‬‫حلز‬‫قفيصة‬
2-‫السطوح‬ ‫متعدد‬ ‫كابسيد‬
3-‫املغلف‬
4-t‫فاج‬‫تعقيدا‬‫األكثر‬‫وهو‬
‫البكتيريا‬ ‫تصيب‬ ‫التي‬ ‫الفيروسات‬ ‫ضمن‬ ‫ويندرج‬

10. (Messenger RNA.)
(Ribosomal RNA.)
(Transfer RNA.)
(Small nuclear RNA.)
(SRP RNA.)
(Micro-RNA.)
RNA
Messen
ger
RNA
Riboso
mal
RNA
Transfe
r RNA
Micro-
RNA
Small
nuclear
RNA
SRP
RNA
‫الحمض‬‫النووي‬RNA‫له‬‫عدة‬‫أدوار‬‫هامة‬‫في‬‫عمليات‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫املختلفة‬‫حيث‬‫يتم‬‫تخليق‬‫ا‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬DNA
‫كنسخة‬‫من‬‫عملية‬‫النسخ‬.
‫التعبير‬‫الجيني‬‫يتطلب‬‫مشاركة‬‫عدة‬‫أنواع‬‫من‬‫الحمض‬‫النووي‬RNA‫ولكل‬‫واحد‬‫منها‬‫أدوار‬‫مختلفة‬‫في‬‫عملية‬
‫التعبير‬‫الجيني‬‫حسب‬‫التالي‬:
mRNA‫ل‬‫الرسو‬:‫اتفق‬‫علماء‬‫الوراثة‬‫على‬‫ان‬‫هناك‬‫شكل‬‫وسيط‬‫من‬‫معلومات‬‫الحمض‬‫النووي‬DNA‫يمكن‬
‫نقلها‬‫من‬‫النواة‬‫في‬‫مجموعات‬‫حقيقيات‬‫النواة‬‫إلى‬‫م‬‫ز‬‫السيتوبال‬‫ملعالجة‬‫الريبوسوم‬.
‫وكانت‬‫تسمى‬‫هذه‬‫النظرية‬‫نظرية‬‫ل‬‫الرسو‬‫او‬‫فرضية‬‫ل‬‫الرسو‬.
Ribosomal RNA‫وتسمى‬‫هذه‬‫الفئة‬‫من‬‫الحمض‬‫النووي‬RNA‫حيث‬‫وجدت‬‫في‬‫الريبوسوم‬‫ولها‬‫عدة‬‫أشكال‬
‫ولو‬‫وظيفة‬‫بالغة‬‫األهمية‬‫لعمل‬‫الريبوسوم‬.
TransferRNA‫هو‬‫الوسيط‬‫امليهئ‬‫بين‬mRNA‫وبين‬‫االحماض‬‫االمينية‬‫في‬،‫الريبوسومات‬
10 Faisal A. Alshamiry

11. ‫ـيروسات‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ف‬‫ال‬‫ال‬‫يمكن‬‫أن‬‫تتكاثر‬‫بحد‬‫ذاتها‬‫ها‬‫لكن‬‫عتمد‬
َ
‫ت‬‫على‬‫خلية‬‫ضي‬
ُ
‫ـ‬‫ـ‬‫م‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬‫ا‬‫ف‬.
‫الخلية‬‫املضيفة‬‫هي‬‫خلية‬‫تعمل‬‫بشكل‬‫طبيعي‬‫حتى‬‫تصاب‬‫ي‬‫بالعدو‬‫الفيروسية‬‫لها‬‫و‬‫يحقن‬‫الفيروس‬
‫املادة‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬.‫فيها‬‫وبمجرد‬‫حدوث‬،‫ذلك‬‫تبدأ‬‫الخلية‬‫املضيفة‬‫بعد‬‫ذلك‬‫في‬‫تكرار‬‫امل‬‫ادة‬‫الجينية‬
‫بها‬ ‫الخاصة‬ ‫املادة‬‫من‬‫بدال‬‫للفيروسات‬.11 Faisal A. Alshamiry

12. *‫ي‬‫البكتير‬ ‫بالفيروس‬‫البكتيرية‬ ‫الخلية‬ ‫إصابة‬ ‫عند‬T4‫تينات‬‫و‬‫بر‬‫تالمس‬ ‫الفيروس‬ ‫ل‬‫ذيو‬ ‫من‬ ‫األقل‬ ‫على‬ ‫واحدة‬‫فإن‬
‫الخلية‬ ‫ي‬‫الخلو‬‫الجدار‬‫ل‬‫لبكتيرية‬.
*‫البكتيرية‬ ‫الخلية‬ ‫سطح‬ ‫مع‬ ‫عموديا‬‫ي‬‫البكتير‬ ‫الفيروس‬‫أس‬‫ر‬ ‫من‬ ‫القرب‬ ‫من‬ ‫ل‬‫محمو‬‫الذيل‬ ‫هذا‬‫ن‬‫يكو‬‫يجعل‬ ‫مما‬
‫البكتيرية‬ ‫الخلية‬ ‫سطح‬ ‫تالمس‬ ‫القاعدية‬ ‫الصفيحة‬.
‫تين‬‫و‬‫بدر‬ ‫البكتيرية‬‫الفيروسات‬‫تتكاثر‬:
‫العلميات‬ ‫هذه‬‫عبر‬ ‫املضيفة‬ ‫للخلية‬ ‫جي‬‫ر‬‫الخا‬ ‫السطح‬ ‫من‬ ‫مختلفة‬‫أجزاء‬‫على‬‫أهدافه‬ ‫الفيروس‬ ‫يحدد‬:
1-‫االلتصاق‬ ‫أو‬‫تباط‬‫ر‬‫اال‬ ‫عملية‬ATTACHMENT OR ADSORPTION
2-‫الثنائي‬ ‫الفيروس‬ ‫هو‬ ‫فهما‬ ‫واألكثر‬‫الجيني‬ ‫ي‬‫املحتو‬ ‫إدخال‬T4
3-‫الحقن‬ ‫او‬ ‫اق‬‫ر‬‫االخت‬ ‫عملية‬INJECTION OR PENETRATION
4-‫البناء‬ ‫عملية‬SYNTHESIS
5-‫اإلطالق‬ ‫عملية‬RELEASE‫طريقتين‬‫عبر‬‫أ‬-‫ب‬ ‫املضيفة‬ ‫الخلية‬ ‫تفجير‬_‫ي‬‫الخلو‬‫الجدار‬ ‫على‬ ‫التبرعم‬
‫املضيفة‬‫الخلية‬‫أو‬‫بالعائل‬ ‫االتصال‬ ‫ق‬‫طر‬:
12 Faisal A. Alshamiry

13. (1)‫ة‬‫ر‬‫الدو‬‫او‬‫املعتدلة‬(‫املستذيب‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬)‫أو‬(‫االندماجية‬:)
‫تحدث‬‫الفيروسات‬ ‫في‬‫املعتدلة‬:
LYSOGENIC CYCLE
•‫إن‬‫تكامل‬‫الفيروسات‬‫البكتيرية‬‫ي‬‫باملحتو‬‫الجيني‬‫للخلية‬‫يشار‬‫إليه‬‫باالعتدال‬‫أو‬‫توليد‬‫التحلل‬LYSOGENY.
‫حيث‬‫يعاني‬‫الفيروس‬‫ي‬‫البكتير‬‫املعتدل‬‫من‬‫قمع‬‫تفعيل‬‫ي‬‫املحتو‬‫الجنيني‬‫عن‬‫طريق‬‫أحد‬‫البروتينات‬‫ا‬‫لفيروسية‬‫املنظمة‬
‫وهي‬‫ليست‬‫بحالة‬‫دائمة‬.
•‫ولكن‬‫عند‬‫أوقات‬‫إجهاد‬‫الخلية‬‫يمكن‬‫الة‬‫ز‬‫إ‬‫القمع‬‫او‬‫الكبت‬‫او‬‫الضاغط‬‫عن‬‫الفيروس‬‫األولى‬‫ويتم‬‫تفعيل‬‫ا‬‫و‬‫تنشيط‬
‫اإلنزيمات‬‫مة‬‫ز‬‫الال‬‫وإنتاجها‬‫بهدف‬‫فصل‬‫ي‬‫املحتو‬‫الجيني‬‫ي‬ ‫الفيروس‬،‫وتحريره‬
•‫بعدها‬‫يصبح‬‫الفيروس‬‫كما‬‫كان‬‫في‬‫الحالة‬‫األولى‬(‫ة‬‫ر‬‫الدو‬‫األولى‬)‫لتبدأ‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫التحليل‬(‫التحلل‬)‫بتفع‬‫يل‬‫مبكر‬‫للجينات‬
‫وتضاعف‬‫املادة‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬‫بعد‬‫ذلك‬‫يؤدي‬‫إلى‬‫تكوين‬‫جسيمات‬‫فيروسية‬‫تؤدي‬‫لتحلل‬‫الخلية‬‫وهكذا‬،
•‫ويسمى‬‫ل‬‫التحو‬‫من‬‫حالة‬‫االعتدال‬‫للفيروس‬‫األولى‬‫إلى‬‫حالة‬‫التحلل‬‫بعملية‬
ّ
‫الحث‬INDUCTION...
13 Faisal A. Alshamiry

14. LYSOGENIC CYCLE
•‫ال‬‫يتكاثر‬‫الفيروس‬‫بمجرد‬‫دخوله‬‫الى‬‫الخلية‬‫وانما‬‫يندمج‬‫باملادة‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬‫مع‬‫موسوم‬‫و‬‫كر‬‫الخلية‬‫ويت‬‫ضاعف‬.
•‫كلما‬‫تكاثرت‬‫خاليا‬‫البكتيريا‬‫يبقى‬‫الفيروس‬‫داخل‬‫الخلية‬‫في‬‫حالة‬‫سبات‬‫حتى‬‫تتغير‬‫ف‬‫و‬‫الظر‬‫امل‬‫حيطة‬‫بها‬‫ومن‬‫ثم‬
‫ينفصل‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫عن‬‫موسوم‬‫و‬‫كر‬‫الخلية‬‫البكتيرية‬.
•‫عندها‬‫وجه‬ُ‫ي‬‫الخلية‬‫لبناء‬‫خاليا‬‫فيروسية‬‫جديدة‬‫كما‬‫في‬‫ة‬‫ر‬‫الدو‬‫املحللة‬‫وعند‬‫انفصال‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫ي‬ ‫الفيروس‬
‫عن‬‫موسوم‬‫و‬‫كر‬‫الخلية‬‫البكتيرية‬‫قد‬‫يحمل‬‫معه‬‫قطعة‬‫من‬DNA‫البكتيريا‬‫ويحيطها‬‫بغالفه‬‫البروتيني‬.
•‫وبهذا‬‫ينتقل‬‫جزء‬‫من‬‫املادة‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬‫للبكتيريا‬‫الى‬‫خلية‬‫بكتيرية‬‫ى‬‫اخر‬‫عند‬‫مهاجمة‬‫الفيروس‬‫لها‬‫ب‬‫ما‬‫يعرف‬‫بعملية‬
‫االنتقال‬‫ي‬ ‫الفيروس‬.
14 Faisal A. Alshamiry

15. ‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫التحلل‬‫مراحل‬ ‫ست‬ ‫تشمل‬:
1-‫األولى‬ ‫املرحلة‬‫تسمى‬"‫اق‬‫ر‬‫االخت‬:"‫في‬‫به‬‫الخاص‬ ‫ي‬‫و‬‫النو‬ ‫الحمض‬ ‫بحقن‬ ‫الفيروس‬ ‫يقوم‬،‫املضيفة‬ ‫الخلية‬‫بعض‬ ‫في‬‫الفيروسات‬
‫دائرية‬ ‫هي‬‫الجينية‬ ‫املادة‬ ‫هذه‬‫ميد‬‫ز‬‫البال‬ ‫عمل‬ ‫آليه‬ ‫وتحاكي‬‫البكتيرية‬.
2-‫الثانية‬ ‫املرحلة‬‫السيطرة‬:‫يسيطر‬ ‫حيث‬‫الفيروس‬‫آليات‬ ‫على‬‫امل‬ ‫صنع‬ ‫في‬ ‫ويستخدمها‬،‫والترجمة‬‫املتماثل‬ ‫النسخ‬‫الفيروسات‬ ‫من‬‫زيد‬.
3-‫التحلل‬ ‫مرحلة‬:‫بمجرد‬‫املتخصصة‬ ‫الفيروسية‬ ‫للبروتينات‬ ‫يسمح‬ ،‫نات‬‫و‬‫الفاير‬ ‫من‬ ‫يكفي‬‫ما‬ ‫اكم‬‫ر‬‫ت‬‫بتحلل‬‫ا‬‫جدار‬‫البكتيرية‬ ‫لخلية‬.
4-‫االنفجار‬ ‫مرحلة‬:‫تنفجر‬‫الداخلي‬ ‫ي‬‫ز‬‫االسمو‬ ‫الضغط‬‫تفاع‬‫ر‬‫ا‬ ‫بسبب‬ ‫الخلية‬‫التي‬‫قب‬ ‫من‬ ‫تقييدها‬‫املمكن‬ ‫من‬‫يعد‬ ‫لم‬‫الخلية‬ ‫جدار‬ ‫ل‬.
5-‫االنطالق‬‫مرحلة‬:‫النسل‬ ‫فيرونات‬ ‫إطالق‬،‫بها‬ ‫املحيطة‬ ‫البيئة‬ ‫في‬
6-‫ر‬‫التحر‬ ‫مرحلة‬‫بحيث‬ ‫بها‬‫املحيطة‬ ‫ى‬‫األخر‬ ‫الخاليا‬ ‫وإصابة‬‫تستمر‬‫أن‬ ‫يمكن‬‫وهكذا‬‫اإلصابة‬ ‫في‬.
LYTIC CYCLE ‫التحللية‬‫ة‬‫ر‬‫الدو‬:‫تسمى‬‫تستخدمها‬ ‫التي‬‫الفيروسات‬‫السامة‬‫او‬ ‫الخبيثة‬‫الفيروسات‬
‫للفي‬‫توفر‬ ‫العلمية‬ ‫وهذه‬‫لها‬ ‫ي‬‫و‬‫النو‬ ‫الحمض‬ ‫مع‬ ‫ترتبط‬‫وإنما‬ ‫املضيفة‬‫الخاليا‬ ‫الفيروسات‬ ‫تقتل‬ ‫ال‬‫ة‬‫ر‬‫الدو‬ ‫هذه‬ ‫في‬‫البقاء‬ ‫إمكانية‬ ‫روس‬
‫املعتدلة‬ ‫بالفيروسات‬ ‫الفيروسات‬ ‫هذه‬ ‫وتسمى‬ ‫املضيفة‬‫للخلية‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬ ‫املادة‬ ‫مع‬ ‫والتضاعف‬TEMPERATE
‫ومثال‬‫الفيروسات‬ ‫هذه‬‫على‬:‫ن‬‫القولو‬ ‫ببكتيريا‬‫الخاص‬ ‫ي‬‫البكتير‬ ‫الفيروس‬E.coli‫من‬ ‫ن‬‫يتكو‬ ‫والذي‬48.502‫ولديه‬ ‫القواعد‬ ‫من‬23‫تين‬‫و‬‫بر‬ 15 Faisal A. Alshamiry

16. ‫كما‬‫أ‬‫نهم‬‫في‬‫الفترة‬‫األخيرة‬‫استطاعوا‬‫من‬‫تنشيط‬‫هذه‬‫الحال‬‫ة‬‫مختبريا‬
‫من‬‫خالل‬‫إحداث‬‫عوامل‬‫إجهاد‬‫او‬‫تجويع‬‫للخلية‬‫او‬‫تعريضها‬‫لألش‬‫عة‬
‫ق‬‫فو‬‫البنفسجية‬.‫وينتج‬‫من‬‫عملية‬‫الحث‬‫هذه‬‫إنتاج‬‫إنزيم‬‫مح‬‫لل‬
‫للبروتين‬‫الذي‬‫يمكنه‬‫تعطيل‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫املثبط‬‫او‬‫الكابت‬‫ل‬‫ي‬‫لمحتو‬
‫الجيني‬‫للفيروس‬‫ليبقى‬،‫صامتا‬‫وظيفة‬‫اإلنزيم‬‫هو‬‫تكس‬‫ير‬‫تين‬‫و‬‫بر‬
‫الخلية‬‫املضيفة‬‫او‬‫العائل‬‫املثبط‬‫والذي‬‫يتحكم‬‫في‬‫جينات‬‫إصالح‬
‫املادة‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬‫ويبدو‬‫أن‬‫كال‬‫البروتينين‬‫املثبطين‬‫متشاب‬‫هان‬‫جة‬‫ر‬‫لد‬‫ة‬‫ر‬‫قد‬
‫هذا‬‫اإلنزيم‬‫لتحليل‬‫البروتين‬.16 Faisal A. Alshamiry

17. •‫تان‬‫ر‬‫الدو‬‫السابقتان‬‫تعتمدان‬‫على‬‫نوع‬‫الفيروس‬‫إما‬‫أن‬‫يدمر‬
‫الخلية‬‫املضيفة‬‫او‬‫يندمج‬‫بمادتها‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬‫ويعتمد‬‫ذ‬‫لك‬‫على‬
‫مدي‬‫تفعيل‬‫الجينات‬‫ا‬‫ر‬‫مبك‬...!
•‫ويعتمد‬‫على‬‫نوعين‬‫من‬‫البروتينات‬‫املنظمة‬‫وتنافسه‬‫ما‬‫على‬
‫مواقع‬‫تباط‬‫ر‬‫اال‬‫بمواقع‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬‫ا‬DNA‫ي‬ ‫الفيروس‬.
•‫واعتمادا‬‫على‬‫أي‬‫البروتين‬‫ن‬‫سيكو‬‫له‬‫السبق‬‫في‬‫الوص‬‫ل‬‫و‬‫سيتم‬
‫تفعيل‬‫تينات‬‫و‬‫بر‬‫الجينات‬‫إما‬‫تحلليه‬‫وإما‬‫اندماجية‬.
17 Faisal A. Alshamiry

18. 18 Faisal A. Alshamiry

19. ‫للفيروسات‬ ‫شاذة‬ ‫حاالت‬‫البكتيرية‬
•‫وجد‬‫أن‬‫بعضا‬‫من‬‫الفيروسات‬‫البكتيرية‬‫تعمل‬‫على‬‫إضافة‬‫ب‬‫عض‬
‫الجينات‬‫الفيروسية‬‫التي‬‫ل‬ّ‫فع‬
ُ
‫ت‬‫بالوقت‬‫نفسة‬‫امنا‬‫ز‬‫ت‬‫م‬‫ع‬‫جينات‬‫الخلية‬
‫املضيفة‬‫خالل‬‫مرحلة‬‫التكامل‬‫في‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫التضاعف‬‫املعتدلة‬.
•‫ولكنه‬‫يغير‬‫ة‬‫ر‬‫صو‬‫الخلية‬‫املضيفة‬‫البكتيرية‬‫وهذا‬‫التغيي‬‫ر‬‫يسمى‬
‫ل‬‫التحو‬‫ي‬ ‫الفيروس‬‫ي‬‫البكتير‬PHAGE CONVERSION
‫ومثال‬‫ذلك‬‫على‬:
‫ل‬‫التحو‬‫ي‬ ‫الفيروس‬‫للبكتيريا‬‫املسببة‬،‫ا‬‫ر‬‫للكولي‬‫حيث‬‫توجد‬‫ب‬‫كتيريا‬‫ا‬‫ر‬‫الكولي‬
vibrio cholera‫عادة‬‫ة‬‫ر‬‫بصو‬‫غير‬‫مؤثرة‬‫او‬‫غير‬‫ممرضة‬‫ولكن‬‫في‬‫ف‬‫و‬‫ظر‬
‫خاصة‬‫ل‬‫تتحو‬‫إلى‬‫بكتريا‬،‫ممرضة‬‫حيث‬‫يدخل‬‫جين‬‫إلنتاج‬‫السم‬‫وي‬‫تم‬
‫تفعيله‬‫مع‬‫جين‬‫املضيف‬‫ل‬‫وتتحو‬‫البكتيريا‬‫من‬‫حميدة‬‫إلى‬‫ممرض‬‫ة‬.
19 Faisal A. Alshamiry

20. ‫هذا‬‫الشكل‬‫يوضح‬
‫الفكرة‬‫الرئيسية‬‫للبيولوجيا‬‫الجزي‬‫ئية‬‫حيث‬
‫يتم‬‫نسخ‬mRNA‫الذي‬‫ة‬‫ر‬‫بدو‬‫يترجم‬‫لتخليق‬
،‫تين‬‫و‬‫بر‬DNA‫إلى‬RNA‫خطوة‬‫لكي‬‫تنتج‬‫نسخة‬
‫طبق‬‫األصل‬‫من‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬DNA‫بكل‬
‫تفاصيله‬‫وخصائصه‬‫وصفاته‬.
‫إن‬‫تحويل‬RNA‫إلى‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫تسمى‬‫بخطوة‬‫إنها‬‫ء‬
‫الترجمة‬‫ال‬‫نه‬‫يتطلب‬‫ترجمة‬‫لألحماض‬‫و‬‫النو‬‫ية‬‫إال‬
‫أن‬‫فئة‬‫معينة‬‫من‬‫الفيروسات‬‫وتسمى‬‫الفيرو‬‫سات‬
‫القهقرية‬‫والتي‬‫يمكن‬‫لها‬‫أن‬‫ل‬‫تحو‬‫جينوم‬RNA‫إلى‬
‫كنسخة‬DNA‫وذلك‬‫باستخدام‬‫إنزيم‬‫فيروس‬
‫ا‬‫لنسخ‬‫ي‬ ‫العكس‬‫وهذه‬‫العلمية‬‫تعمل‬‫على‬‫تح‬‫ويل‬
‫ينتهك‬‫تدفق‬‫معلومات‬‫الجين‬‫األصلية‬‫ويحد‬‫ث‬
‫تشكيل‬‫جديد‬‫من‬‫البيانات‬‫اثية‬‫ر‬‫الو‬.
20 Faisal A. Alshamiry

21. ‫التعبير‬‫في‬ ‫للفيروسات‬ ‫الجيني‬
‫حقيقيات‬‫مجموعة‬‫النواة‬
‫تظل‬‫الفيروسات‬‫في‬‫منافسة‬‫مع‬‫ال‬‫خلية‬
‫املضيفة‬‫آلليات‬‫الترجمة‬‫الخلوية‬‫مما‬
‫يدفع‬‫الفيروسات‬‫ملنع‬‫التعبير‬‫ا‬‫لجيني‬
‫للخلية‬‫املضيفة‬‫وهو‬‫ايضا‬‫است‬‫اتيجية‬‫ر‬
‫تستخدمها‬‫الفيروسات‬‫ملنع‬‫وكب‬‫ح‬
‫االستجابة‬‫الخلوية‬‫في‬‫مكافحة‬
‫الفيروسات‬.‫وبعض‬‫الفيروسات‬‫ال‬‫تي‬
‫تكبح‬‫جينات‬‫املضيف‬‫عن‬‫طريق‬‫م‬‫نع‬
‫النسخ‬‫او‬‫تثبيط‬‫النسخ‬‫للمضيف‬‫او‬
‫قمع‬mRNA‫او‬‫الترجمة‬.
https://viralzone.expasy.org/1582?outline=all_by_protein
21 Faisal A. Alshamiry

22. 22
Most important of Translational regulatory mechanisms of virus
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC98994/
1-‫المضيفة‬ ‫الخلية‬ ‫في‬ ‫البروتين‬ ‫تخليق‬ ‫إيقاف‬
2-‫نقل‬ ‫تثبيط‬mRNA‫النواة‬ ‫في‬ ‫وتحليله‬ ‫الخلية‬
3-‫تثبيط‬PKR‫بواسطة‬P58IPK
4-‫تثبيط‬PKR‫بواسطة‬NS1
5-‫الــ‬ ‫منطقة‬ ‫على‬ ‫تعتمد‬CAP،‫لــ‬ ‫انتقائية‬ ‫ترجمة‬mRNA‫الفيروس‬‫اإلنفلونزا‬ ‫فيروس‬ ‫مثل‬
6-‫ترجمة‬ ‫تثبيط‬mRNA‫الخلية‬‫واالستطالة‬ ‫البدء‬ ‫مراحل‬ ‫في‬
7-‫من‬ ‫التفضيلية‬ ‫للترجمة‬ ‫الفطرية‬ ‫القدرة‬mRNA‫الخلية‬‫األنفلونزا‬ ‫فيروس‬ ‫مثل‬
8-‫بواسطة‬ ً‫ا‬‫ايض‬ ‫تفضيلية‬ ‫ترجمة‬5`UTR‫من‬mRNA‫الفيروس‬
9-‫لــ‬ ‫تجنيد‬ ‫او‬ ‫تطويع‬eIF4E‫إلى‬mRNA‫الفيروسي‬
10-‫لــ‬ ‫الفسفرة‬eIF4E
11-‫التنظيم‬‫الفيروسي‬ ‫البروتين‬ ‫لتخليق‬ ‫الزمني‬ ‫التوقيت‬ ‫أو‬
‫لعملية‬ ‫املنظمة‬ ‫اآلليات‬ ‫أهم‬
‫في‬ ‫الترجمة‬‫الفيروسات‬:
Faisal A. Alshamiry

23. ‫املجموعة‬ ‫النموذجي‬‫العضو‬
‫الفيروسات‬‫واألنفية‬ ‫املعوية‬
‫البشرية‬ ‫األنفية‬ ‫الفيروسات‬ ‫الشائعة‬ ‫البرد‬ ‫فيروسات‬‫املصلي‬‫األنماط‬ ‫من‬ ‫والعديد‬‫ة‬
‫الفيروسات‬‫املعوية‬
‫ي‬‫املعو‬‫والفيروس‬ ‫األطفال‬ ‫شلل‬ ‫فيروس‬‫وفيروس‬
‫ي‬‫جدر‬‫أيكو‬ ‫حمى‬‫وفيروس‬ ‫الجمال‬
‫التقرحية‬ ‫والفيروسات‬ ‫القلبية‬ ‫الفيروسات‬(‫القالعية‬)
‫القلبية‬ ‫الفيروسات‬ ‫منغو‬ ‫وفيروس‬‫والنخاع‬ ‫الدماغ‬ ‫إلتهاب‬ ‫فيروس‬
‫فيروس‬‫القالعية‬ ‫الحمى‬ ‫القالعية‬ ‫الحمى‬ ‫فيروس‬
‫الكبدية‬ ‫الفيروسات‬ ‫الكبد‬ ‫إلتهاب‬ ‫فيروس‬A
‫فيروس‬‫ن‬‫الطاعو‬ ‫ي‬‫البقر‬ ‫اإلسهال‬ ‫فيروس‬
‫الفيروسات‬‫الكبدية‬ ‫الكبد‬ ‫إلتهاب‬ ‫فيروس‬C
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC98994/table/T2/
‫آلي‬ ‫تستخدم‬ ‫التي‬‫النموذجية‬ ‫الفيروسات‬‫ة‬
‫بواسطة‬‫الترجمة‬IRES
Enteroviruses and rhinovirusesa
Human rhinoviruses
Enteroviruses
Cardioviruses and aphthovirusesa
Cardioviruses
Aphthoviruses
Hepatovirusesa
Pestiviruses
Hepaciviruses
Internal Ribosome Entry Site Internal Ribosome Entry Site Internal Ribosome Entry Site
Faisal A. Alshamiry23

24. Target
‫الهدف‬
Virus/inhibitor
‫تثبيط‬/‫الفيروس‬
Mechanism of action
‫الحدث‬ ‫او‬ ‫الفعل‬ ‫او‬ ‫العمل‬ ‫آلية‬
dsRBMs
The double-stranded
RNA-binding motif
Adenovirus/VAI RNA Competitively inhibits dsRNA-binding reaction ‫تنافسي‬
Epstein-Barr virus/EBER RNAs Competitively inhibits dsRNA-binding reaction ‫تنافسي‬
Vaccinia virus/E3L ‫الجدرية‬ Sequesters dsRNA ‫عزل‬
Influenza virus/NS1 ‫اإلنفلونزا‬ Sequesters dsRNA ‫عزل‬
Reovirus/ς3 ‫التنفسية‬ Sequesters dsRNA ‫عزل‬
HIV TAR RNA ‫اإليدز‬
Competitively inhibits activator dsRNA binding; may activate PKR;‫تنافسي‬
could target TAR RNA binding protein to PKR
TAR RNA binding protein Binds to PKR, inhibits kinase activity; may sequester dsRNA
Dimerization
‫مع‬‫مرتبطين‬‫متشابهين‬ ‫وحدتين‬‫ا‬
Influenza virus/P58IPK
Disrupts dimerization ‫الوحدتين‬ ‫تعطيل‬
Hepatitis C virus/NS5A ‫الكبدية‬ Disrupts dimerization ‫الوحدتين‬ ‫تعطيل‬
Substrateinteraction
‫األساسي‬ ‫التفاعل‬
Vaccinia virus/K3L // HIV Tat Binds to PKR as a pseudo substrate; blocks PKR-substrate interaction
Expression andstability
‫الثب‬ ‫أو‬ ‫واالستقرار‬ ‫التعبير‬‫ات‬
Poliovirus ‫السنجابية‬(‫األطفال‬ ‫شلل‬) Induces PKR proteolysis ‫التحلل‬ ‫تحفيز‬
HIV Tat‫اإليدز‬ Lowers expression of PKR ‫لــ‬ ‫التعبير‬ ‫تخفيض‬
Regulation of eIF2α
‫لــ‬ ‫تنظيم‬eIF2α
HSV/γ134.5 gene product ‫الهربس‬ Complexes with eIF2α and induces an eIF2α phosphatase
Simian virus 40/T antigen ‫السعاليات‬ Targets processes downstream of eIF2α24
‫تثبيط‬ ‫آليات‬PKR‫الفيروسات‬ ‫في‬Protein kinase RNA(PKR)
Eukaryotic Initiation Factor(eIF)
viral hemorrhagic septicaemia (VHS)
Herpes simplex virus type 1 ICP27
protein phosphatase 1α (PP1α) PKR ‫هو‬‫البروتينات‬ ‫تلك‬‫تضمها‬ ‫التي‬ ‫الفوسفات‬ ‫ملجموعات‬‫كيميائية‬ ‫إضافة‬ ‫طريق‬ ‫عن‬ ‫ى‬‫األخر‬ ‫البروتينات‬ ‫تعديل‬ ‫هي‬‫وضيفته‬‫كيناز‬ ‫انزيم‬(‫ال‬‫فسفرة‬)
Faisal A. Alshamiry

25. ‫حمل‬ُ‫ي‬RNA‫كمعلومات‬‫جينية‬‫عندما‬‫تغزو‬‫الخلي‬‫ة‬
‫المضيفة‬‫وتحويل‬RNA‫الخلية‬‫المضيفة‬‫إلى‬
‫نسخة‬DNA‫باستخدام‬‫طريقة‬‫النسخ‬‫العكسي‬
(ReverseTranscriptase)
‫الرجعية‬ ‫الفيروسات‬(‫القهقرية‬)‫مثل‬‫املناعة‬ ‫نقص‬ ‫فيروس‬‫اإليدز‬
DNA↔RNAProtein
‫وهكذا‬‫يتم‬‫تعديل‬‫او‬‫تحوير‬‫البناء‬‫وقد‬‫ساعد‬‫هذا‬‫االك‬‫تشاف‬
‫على‬‫تفسير‬‫ة‬‫ر‬‫قد‬‫الفيروسات‬‫في‬‫التكاثر‬‫ر‬‫والتطو‬.
25 Faisal A. Alshamiry

26. ‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫حياة‬‫فيروس‬HIV
‫حيث‬‫يستخدم‬‫النسخ‬‫ي‬ ‫العكس‬‫لصن‬‫ع‬
DNA‫من‬‫قالب‬RNA.
‫يندمج‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫ي‬ ‫الفيروس‬
DNA‫مع‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫املتحلل‬
‫للخيلة‬‫املضيفة‬.
‫وتبدأ‬‫مرحلة‬‫البدء‬‫من‬‫التعبير‬‫الجي‬‫ني‬.
TAT
(Trans Activator of Transcription)
‫حيث‬‫يحافظ‬‫على‬‫الخلية‬‫املضيفة‬
‫وكبحها‬‫من‬‫تركيب‬‫أنظمة‬‫دفاعية‬‫من‬
‫شأنها‬‫توقف‬‫النسخ‬‫ي‬ ‫الفيروس‬.
‫كما‬‫يترك‬‫الفيروس‬‫الفرصة‬‫لالندم‬‫اج‬
‫ومن‬‫ثم‬‫تدمير‬‫الخلية‬‫املضيفة‬
26 Faisal A. Alshamiry

27. ‫ي‬‫البشر‬‫املناعة‬ ‫نقص‬ ‫فيروسات‬‫في‬ ‫النسخ‬ ‫تنظيم‬ ‫يوضح‬‫شكل‬
‫ـ‬‫ل‬ ‫النسخ‬mRNA‫املبك‬ ‫واإلنهاء‬‫ر‬27 Faisal A. Alshamiry

28. 28
HSV-1 Infection
VHS
VP 16
ICP27
1- Host mRNA
translation shut off
Viral mRNA
proceeds
2- Viral mRNAs
5` top cellular mRNA
U(L)13
ICP0
PKR
eIF-2αPeIF-2αP
HSV-1Us11
Γ134.5
PP1α
eIF-2α
mRNA translation
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC98994/figure/F11/
‫التعبير‬‫الجيني‬‫لفيروس‬‫الهربس‬‫البسيط‬‫من‬‫النوع‬1(HSV-1)
‫وهو‬‫من‬‫الفيروسات‬‫ذات‬DNA‫وله‬‫نوعان‬‫ويصيب‬‫مجموعة‬‫حقيقيات‬‫النواة‬
‫التحكم‬‫املتعدد‬‫خالل‬‫اإلصابة‬‫ى‬‫العدو‬‫بفيروس‬‫الهربس‬‫البسيط‬‫من‬‫النوع‬1.
1-‫عند‬‫ى‬‫العدو‬‫بفيروس‬‫الهربس‬‫البسيط‬‫من‬‫النوع‬1‫يدفع‬‫اإلغالق‬‫السريع‬‫لتخليق‬‫بروتين‬‫الخلي‬‫ة‬
،‫املضيفة‬‫ويرجع‬‫ذلك‬‫جزئيا‬‫إلى‬‫قدرة‬‫فيروس‬‫الهربس‬‫للسيطرة‬‫على‬‫البروتينات‬‫عن‬‫ط‬‫ريق‬ICP27،
‫والتي‬‫تؤثر‬‫بشكل‬‫غير‬‫مباشر‬‫على‬‫ترجمة‬mRNA.‫ويمكن‬‫أن‬‫تتشكل‬‫مباشرة‬‫من‬‫قبل‬‫الفيروس‬‫عن‬
‫طريق‬‫إيقاف‬‫مباشر‬‫من‬‫خالل‬‫البروتين‬‫ي‬ ‫الفيروس‬VP16.
2-‫كبت‬‫او‬‫كبح‬‫او‬‫قمع‬‫فيروس‬‫الهربس‬‫بواسطة‬VP16‫قد‬‫يساهم‬‫في‬‫الترجمة‬‫االنتقائية‬‫من‬mRNA
‫ي‬ ‫الفيروس‬.
-‫يمكن‬‫للبروتينات‬(U (L) 13‫و‬ICP0)‫الفيروسية‬‫تعديل‬‫مماثل‬‫لترجمة‬mRNA‫ي‬ ‫الفيروس‬‫عن‬
‫طريق‬‫الفسفرة‬‫على‬‫التوالي‬‫حتى‬‫ل‬‫الوصو‬‫إلى‬EF1-δ..
-‫خالل‬،‫اإلصابة‬‫بفيروس‬‫الهربس‬‫البسيط‬‫من‬‫النوع‬1‫يضمن‬‫أن‬‫الخلية‬‫املضيفة‬‫تبقى‬‫عملية‬
‫الترجمة‬‫بكفاءة‬‫عن‬‫طريق‬‫منع‬‫الفسفرة‬‫ـ‬‫ل‬‫ـ‬eIF2α.
-‫وقد‬‫يحدث‬‫قطع‬‫أو‬‫خلل‬‫لعملية‬‫الفسفرة‬eIF2α‫من‬‫خالل‬‫البروتين‬‫ي‬ ‫الفيروس‬Us11،‫والذي‬‫يمنع‬
‫تفعيل‬PKR،,‫وإنتاج‬‫الجين‬‫ي‬ ‫الفيروس‬γ134.5،‫الذي‬‫يوجه‬‫عملية‬‫الفسفرة‬‫من‬‫خالل‬eIF2α
‫بواسطة‬PPIα.
-‫وأخيرا‬،‫التعديل‬‫ي‬ ‫الفيروس‬‫من‬‫البروتين‬‫الريبوسومي‬S6‫والفسفرة‬‫قد‬‫تساهم‬‫في‬‫ترجمة‬‫مستمرة‬
‫من‬‫الخلية‬‫املضيفة‬TOP5'mRNA،‫بما‬‫في‬‫ذلك‬‫تشفير‬‫البروتين‬‫الريبوسومي‬.
‫واستمرار‬‫تخليق‬‫البروتين‬‫الريبوسومي‬‫وتعطيل‬‫عملية‬‫الفسفرة‬eIF2α‫يسهل‬‫استمرار‬‫ل‬‫وصو‬
‫الفيروس‬‫من‬‫خالل‬‫دعم‬‫عمليات‬‫الترجمة‬‫ـ‬‫ل‬mRNA‫ي‬ ‫الفيروس‬.
Protein kinase RNA(PKR)
Eukaryotic Initiation Factor(eIF)
viral hemorrhagic septicaemia (VHS)
Herpes simplex virus type 1 ICP27
protein phosphatase 1α (PP1α)
Faisal A. Alshamiry

29. ‫الهربس‬ ‫لفيروس‬‫املبكر‬‫الجيني‬‫التعبير‬
‫الجنيني‬‫للتعبير‬ ‫العامة‬ ‫القواعد‬
‫الهربس‬ ‫لفيروس‬‫املنظ‬ ‫البروتينات‬‫و‬‫مة‬
‫النسخ‬ ‫تنظيم‬
‫التنشيط‬
‫التثبيط‬‫أو‬‫القمع‬
‫التنشيط‬
‫البروتين‬‫استقرار‬ ‫عدم‬
http://darwin.bio.uci.edu/~faculty/wagner/hsv4f.html
29 Faisal A. Alshamiry

30. 30
‫هذا‬‫املخطط‬‫يوضح‬‫ترجمة‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬‫ا‬mRNA‫واملواقع‬
‫الرئيسية‬‫املنظمة‬‫ـ‬‫ل‬‫فيروس‬‫الكبد‬‫الوب‬‫ائي‬C
(1‫حيث‬‫يتم‬‫عرض‬‫عوامل‬‫بدء‬‫الترجمة‬‫وهي‬
(2(40S-80S)‫والتي‬‫تدلالن‬‫على‬‫الوحدة‬‫الفرعية‬
‫الريبوسومية‬‫الصغير‬‫والكبيرة‬.‫وثمن‬‫ثم‬‫تش‬‫كيل‬
‫معقد‬‫البدء‬‫ز‬‫واملرمو‬‫له‬‫ـ‬‫ـ‬‫ب‬(43s).
TER‫تشير‬‫إل‬‫نهاء‬‫الترجمة‬‫و‬eIF2-GDP‫للمعالجة‬
(3‫تشكيل‬‫املعقد‬‫الثالثي‬‫قبل‬‫البدء‬‫وتجميع‬‫م‬‫عقد‬‫البدء‬
‫في‬‫منطقة‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬‫ا‬cap‫على‬mRNA‫والبدء‬‫من‬‫ل‬‫او‬‫ن‬‫كودو‬
‫وهو‬AUG‫مع‬‫تباط‬‫ر‬‫اال‬‫مع‬60S‫في‬‫الوحدة‬‫الفرعية‬‫من‬
‫الريبوسوم‬.‫وهنا‬‫تظهر‬‫أيضا‬‫املواقع‬‫الرئيس‬‫ية‬
‫للتحكم‬‫ي‬ ‫الفيروس‬‫بعملية‬‫الترجمة‬‫وآليات‬‫م‬‫اقبة‬‫ر‬
‫الترجمة‬.‫كما‬‫ال‬‫يظهر‬mRAN & 3`URT‫والتي‬‫توثر‬‫على‬
‫كفاءة‬‫الترجمة‬‫وتخليق‬‫األحماض‬‫األمينية‬
Ohsawa M, Shingu N, Miwa H, Yoshihara H, Kubo M, Tsukuma H, Teshima H, Hashimoto M, Aozasa K. Risk of non-
Hodgkin's lymphoma in patients with hepatitis C virus infection. Int J Cancer. 1999;80:237–239
3`URT(Three prime untranslated region)
Faisal A. Alshamiry

31. ‫يقوم‬‫كابت‬‫ومشغالت‬lambda
‫بتحديد‬‫منطقة‬‫املناعة‬.
*‫العديد‬‫من‬LAMBDA‫لديها‬‫مناطق‬
‫مناعية‬‫مختلفة‬.
‫والفاج‬‫في‬‫مرحلة‬‫املستذيب‬‫يعطي‬‫ا‬‫ملزيد‬
‫من‬‫املناعة‬‫مقابل‬‫املزيد‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬‫عن‬
‫طريق‬‫أي‬‫الفاج‬‫أخر‬‫بنفس‬‫املنطقة‬
‫املناعية‬.
‫البلمرة‬ ‫انزيم‬ ‫يبدأ‬‫حيث‬‫الشكل‬ ‫هذا‬ ‫في‬RNA ‫من‬ ‫البدء‬ ‫مرحلة‬‫في‬ PI & Pr ‫ن‬‫بدو‬ ‫ولكن‬ Prm ‫الحالة‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬ ‫خالل‬
31 Faisal A. Alshamiry

32. ‫تشكيل‬‫غالف‬DNA‫من‬‫كبت‬LAMBDA‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬Is‫من‬Dimer
*‫ي‬‫يحتو‬‫كابت‬monomer‫على‬‫مجالين‬‫اساسين‬:
1-‫املجال‬N‫لإلنهاء‬‫ي‬ ‫األساس‬‫املستمر‬‫للحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬DNA‫في‬‫مواقع‬‫الغالف‬.
2-‫املجال‬C‫منطقة‬‫اإلنهاء‬‫األساسية‬‫ـ‬‫ل‬dimerism
‫يحتاج‬‫املشغل‬‫إلى‬‫غالف‬‫من‬‫اثنان‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬DNA.
‫ولذا‬‫النطاق‬‫ي‬ ‫االساس‬‫واملشغل‬‫يعمالن‬‫في‬‫نفس‬‫الوقت‬.
‫وفي‬‫الشكل‬‫املقابل‬‫يوضح‬‫انشقاق‬‫الكابت‬‫بين‬‫مجالين‬‫من‬‫ش‬‫أنه‬‫يقلل‬‫من‬
‫ب‬‫ر‬‫تقا‬‫املشغل‬‫ويؤدي‬‫إلى‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫الحالة‬(‫التحلل‬).
‫االنشقاق‬‫الكابت‬‫يدفع‬‫ة‬‫ر‬‫لدو‬‫التحلل‬(‫الحالة‬).
32 Faisal A. Alshamiry

33. ‫في‬‫الفيروسات‬‫املخاطية‬‫القويمة‬‫ي‬‫تحو‬‫على‬6‫اجناس‬‫منها‬
(‫فيروس‬‫ا‬‫ز‬‫اإلنفلون‬)RNA‫آحادي‬‫سالب‬
‫بعد‬‫عملية‬‫التعلق‬‫و‬‫اق‬‫ر‬‫االخت‬‫للخلية‬‫املضيفة‬‫يتش‬‫كل‬
ssRNA‫من‬RNA‫ي‬ ‫الفيروس‬‫لكي‬‫يتكاثر‬‫داخل‬‫النواة‬.
‫ويستخدم‬RdRp‫لصنع‬+ssRNA‫ثم‬‫إلى‬+ssRNA
‫والذي‬‫يحتاجه‬‫في‬‫بداية‬‫الكاب‬C‫لتخليق‬mRNA
‫والريبوسوم‬‫للتعريف‬.‫يبقى‬C‫مستضيف‬mRNA‫عند‬
‫نهاية‬cap 5.‫في‬‫حين‬‫أن‬‫تينات‬‫و‬‫بر‬‫املغلف‬‫ي‬ ‫الفيروس‬‫ا‬‫ملنقولة‬
‫من‬RER‫الى‬GA‫في‬‫العضيات‬‫مية‬‫ز‬‫البال‬‫لتشكيل‬
‫نوكليوكاسيد‬.
33 Faisal A. Alshamiry

34. ‫خطوتين‬‫للفيروسات‬‫للتعبير‬‫املستقر‬‫مع‬GFP
-‫شكل‬‫يوضح‬‫هياكل‬‫ملقطع‬NS(‫غير‬‫البنائي‬)‫و‬GFP-NS116(‫تينات‬‫و‬‫بر‬‫ية‬‫ر‬‫فلو‬‫اء‬‫ر‬‫خض‬)‫في‬‫الفيروسات‬
-‫حيث‬‫يمثل‬125‫او‬aa‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬ORF(‫فتح‬‫إطار‬‫القراءة‬)‫من‬NS1(‫البروتين‬‫غير‬‫البنائي‬‫المضاد‬IFN)‫في‬‫حين‬‫أن‬NEP
(‫البروتين‬‫النووي‬‫المصدر‬)‫و‬ORF‫عبر‬‫الربط‬‫كما‬‫هو‬‫محدد‬.
-‫حيث‬‫يمثل‬‫املربع‬‫ق‬‫ر‬‫األز‬‫الفاتح‬12 aa‫تتقسم‬‫بين‬NS1‫و‬NEP‫بينما‬‫يمثل‬‫ق‬‫الصندو‬‫األسود‬‫تعتبر‬‫اء‬‫ز‬‫أج‬‫غير‬‫مترجمة‬.
-‫ويمثل‬‫املربع‬‫الرمادي‬‫الفاتح‬‫عن‬‫النيوكليوتيدات‬‫ذات‬‫الترميز‬‫العشوائي‬12 aa‫لتندمج‬‫إلى‬GFP،‫واملربع‬‫الرمادي‬‫الداكن‬
‫يمثل‬‫تسلسل‬‫الترميز‬‫املستمدة‬‫من‬‫تتابعات‬‫ناقالت‬‫استنساخ‬‫من‬‫البدء‬GFP‫متوجه‬‫إلى‬29 aa.
Kuznetsova, I., Shurygina, A. P., Wolf, B., Wolschek, M., Enzmann, F., Sansyzbay, A., ... & Egorov, A. (2014). Adaptive mutation in nuclear export protein allows stable
transgene expression in a chimaeric influenza A virus vector. Journal of General Virology, 95(2), 337-349. ISO 690
34 Faisal A. Alshamiry

35. ‫توضح‬‫هذه‬‫ة‬‫ر‬‫الصو‬‫وس‬ ُ‫ير‬
َ
‫الف‬
ُ
‫ط‬‫ب‬
َ
‫ت‬ْ‫ر‬
ُ
‫امل‬‫يروس‬
َ
‫بالف‬‫ال‬‫ي‬‫د‬
ُ
‫غ‬(AAV)
‫والتعبير‬‫الجيني‬‫واملنبه‬‫او‬‫املحفز‬‫له‬.
‫وهو‬‫من‬‫الفيروسات‬‫الصغيرة‬‫جدا‬ssDNA‫حيث‬‫ي‬‫يحتو‬‫جينومه‬‫فقط‬‫جينان‬.‫وال‬‫يملك‬‫ة‬‫ر‬‫القد‬
‫على‬‫التضاعف‬‫لوحده‬‫اال‬‫بوجود‬‫انتان‬‫افق‬‫ر‬‫م‬‫ب‬adeno virus‫وليس‬‫معروفا‬‫تباطه‬‫ر‬‫ا‬‫بأي‬‫مرض‬
‫ويمكن‬‫أن‬‫ينتقل‬‫للخاليا‬‫الغير‬‫املنقسمة‬‫ويعبر‬‫على‬‫مدى‬‫طويل‬‫عن‬‫الجين‬‫املدخل‬.
‫حيث‬(A)Tet-off‫النظام‬:
‫وهناك‬‫عامل‬‫دمج‬‫بين‬‫بكتيريا‬‫اسايكلن‬‫ر‬‫تيت‬(‫الكابت‬TetR)‫والفيروس‬VP16‫لتعزيز‬‫الربط‬‫بمشغل‬
‫اسايكلن‬‫ر‬‫تيت‬((tetO‫وتنشيط‬‫عملية‬‫النسخ‬‫في‬‫غيابه‬.
-AAV‫احد‬‫ناقالت‬‫التشفير‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬(TetR/VP16)‫عامل‬‫الدمج‬(tTA)،‫في‬‫حين‬‫أن‬‫األخر‬‫ي‬‫يحتو‬‫على‬
‫الجين‬‫العالجي‬‫تحت‬‫تحكم‬(tetO)‫للمشغل‬‫األدنى‬‫او‬‫األصغر‬(miniP).
-‫حيث‬(CMV)‫يشير‬‫لتضخيم‬‫الفيروس‬‫و‬(ITR)‫ار‬‫ر‬‫التك‬‫النهائي‬‫املعكوس‬.
‫حيث‬(B)Tet-on‫النظام‬:
-‫كبت‬‫اسايكلن‬‫ر‬‫تيت‬‫العاكس‬(rTetR)‫الذي‬‫ل‬‫يتحو‬‫إلى‬VP16(rtTA)‫والذي‬‫يربط‬‫تسلسل‬‫الجين‬
‫في‬‫وجود‬(‫يمين‬)‫ولكن‬‫في‬‫غياب‬‫دوكسيسايكلين‬(‫شمال‬).
‫حيث‬(C):‫التجنيد‬‫الناجم‬‫عن‬‫عملية‬‫النسخ‬‫مع‬‫وجود‬‫عامل‬‫الجزيئات‬‫الثنائية‬.
35 Faisal A. Alshamiry

36. ‫استراتيجية‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫ل‬‫فيروس‬
‫األيبوال‬
‫النسخة‬‫األولية‬‫من‬‫الجين‬‫غير‬‫املعدلة‬GP‫ينتج‬
‫عنها‬mRNA‫والذي‬‫يؤدي‬‫الى‬‫التعبير‬‫ما‬‫ق‬‫بل‬
‫الــ‬sGP.
‫والذي‬‫ة‬‫ر‬‫بدو‬‫ل‬‫يتحو‬‫إلى‬‫النضج‬‫والتجانس‬‫منت‬‫جا‬
‫جليكوبروتين‬(sGP)‫ببتيدات‬‫متغيرة‬.
RNA‫لفيروس‬‫األيبوال‬‫يعتمد‬‫على‬‫إنزيم‬‫الب‬‫لمرة‬
RNA‫للتحرير‬‫في‬‫منطقة‬7U‫داخل‬‫جين‬GP.
‫وبالتالي‬‫يتم‬‫تعطيل‬‫اءة‬‫ر‬‫ق‬‫القالب‬(ORF)‫واالنضمام‬
‫إلى‬sGP‫من‬‫موقع‬‫التحرير‬‫مع‬‫التداخل‬‫مع‬
(ORFs).
‫الحمض‬‫النووي‬‫الريبوزي‬‫الرسولي‬(mRNA)‫يتم‬
‫تحرير‬‫في‬‫املوقع‬8A‫وينتج‬‫عنه‬‫التعبير‬‫عما‬‫قبل‬
(GP).
‫ولكنه‬‫ما‬‫ال‬‫ز‬‫ي‬‫متصال‬‫من‬‫خالل‬‫الروابط‬‫ثنائ‬‫ية‬
‫الكبريت‬‫في‬GP1 &GP2.
‫ومعظم‬‫الفيروسات‬‫ضمن‬‫هذه‬‫العائلة‬‫يتم‬‫التعب‬‫ير‬‫عنها‬
‫بنفس‬‫النمط‬‫والطريقة‬.
36 Faisal A. Alshamiry

37. ‫الج‬‫التعبير‬‫استراتيجية‬‫يني‬
‫الكبدية‬‫للفيروسات‬
(NCLDVs)
.1‫في‬‫احل‬‫ر‬‫امل‬‫األولى‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬‫يتم‬‫تنش‬‫يط‬
‫التعبير‬‫الجيني‬‫وتمثيل‬‫االحماض‬‫ال‬‫نووية‬
‫وتسمى‬‫هنا‬‫الجينات‬‫املبكرة‬.
.2‫بعد‬‫ار‬‫ر‬‫تك‬‫الحمض‬‫النووي‬DNA‫يبدأ‬
‫تفعيل‬‫الجينات‬‫المتأخرة‬.
.3‫ك‬‫ر‬‫تشا‬‫الجينات‬‫املتأخرة‬‫في‬‫إنتاج‬
‫البروتينات‬‫الهيكلية‬‫الفيروسية‬.
.4‫الصناديق‬‫ذات‬‫ن‬‫اللو‬‫جواني‬‫ر‬‫األ‬‫تمثل‬
‫املنظمين‬‫لعملية‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫و‬‫فقا‬‫لكل‬
‫فئة‬(‫مبكرة‬‫ومتوسطة‬‫ومتأخرة‬).
.5‫الصناديق‬‫ذات‬‫ن‬‫اللو‬‫األصفر‬‫تمثل‬
‫الوظائف‬‫البيولوجية‬‫لكل‬‫فئة‬‫مع‬‫بع‬‫ض‬
‫الجينيات‬‫داخل‬‫االقواس‬.
‫في‬‫هذه‬‫الصورة‬‫التي‬‫توضح‬‫املالمح‬‫الرئيسية‬‫آلليات‬‫بدء‬‫النسخ‬‫في‬‫الفيروسات‬‫الكبدية‬‫حيث‬‫أن‬:
(TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH and TBP)‫هي‬‫عوامل‬‫النسخ‬‫وهي‬‫املسؤولة‬‫عن‬‫التجميع‬‫في‬‫منطقة‬
‫املنظم‬‫البروموتر‬‫ومنها‬‫يتم‬‫تجنيد‬‫إنزيم‬‫البلمرة‬RNA‫يلهيا‬‫ق‬‫صندو‬‫تاتا‬..‫نفس‬‫اآلليات‬‫موجوده‬‫في‬‫بدائيات‬‫النواة‬
‫وحقيقيات‬‫النوأة‬.http://www.mdpi.com/1999-4915/9/1/16/htm
37 Faisal A. Alshamiry

38. ‫ة‬‫ر‬‫الصو‬‫املرفقة‬‫توضح‬‫التنظيم‬‫الجيني‬‫في‬‫الفي‬‫روسات‬
‫ناوية‬‫ر‬‫البيكو‬‫وهي‬‫تندرج‬‫تحت‬‫النوع‬RNA‫األحادية‬‫املوجبة‬.
‫ومنها‬‫الفيروسات‬،‫املعوية‬‫والتهاب‬‫الكبد‬‫الوبائي‬.
‫يتم‬‫عرض‬‫مناطق‬:
1-P1‫الوردي‬
2-P2‫ق‬‫ر‬‫األز‬
3-P3‫البني‬
‫جنبا‬‫إلى‬‫جنب‬‫مع‬‫البروتينات‬‫الفيروسية‬‫املشفرة‬‫داخل‬‫ك‬‫ل‬‫مجال‬.
P1‫ترميز‬‫البروتينات‬‫كابسيد‬‫و‬P2‫و‬P3‫املجاالت‬‫ترميز‬‫البروتينا‬‫ت‬
‫إلى‬‫كابسيد‬‫املستخدمة‬‫ملعالجة‬‫البروتين‬‫ها‬‫ر‬‫وتكرا‬.‫وت‬‫رجم‬‫الجينوم‬
‫الحمض‬‫النووي‬‫الريبي‬‫واحد‬‫ائد‬‫ز‬‫تقطعت‬‫بهم‬‫السبل‬‫إلى‬‫ا‬‫لبروتين‬
‫املتعدد‬‫واحد‬‫ومن‬‫ثم‬‫ق‬‫املشقو‬‫من‬‫قبل‬‫ابطة‬‫ر‬‫ل‬‫الدو‬‫املست‬،‫قلة‬
‫والتعامل‬‫البروتياز‬‫ي‬ ‫الفيروس‬.
https://www.researchgate.net/publication/45167836_Novel_Roles_of_the_Picornaviral_3D_Polymerase_in_Viral_Pathogenesis/figures?lo=1
38 Faisal A. Alshamiry

39. ‫لفيروس‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬‫الفي‬ ‫من‬‫وهو‬‫إلفا‬‫روسات‬
‫ض‬ ‫وينتمي‬‫الطخائية‬‫العائلة‬ ‫إلى‬ ‫تنتمي‬ ‫التي‬‫من‬
‫املجموعة‬RNA‫املوجبة‬‫األحادية‬.
-‫حيث‬‫يتم‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫إلى‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫متعدد‬‫غي‬‫ر‬‫هيكلي‬‫يتم‬
‫معالجته‬‫بواسطة‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫الفيروس‬.
-RdrP‫يتم‬‫التعبير‬‫عنه‬‫عن‬‫طريق‬‫كبت‬‫او‬‫قمع‬‫النه‬‫اية‬‫من‬
nsP‫البروتين‬‫املتعدد‬.
-‫في‬‫املرحلة‬‫املتأخرة‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬‫يتم‬‫التعبير‬‫عن‬‫ا‬‫لبولي‬
‫تين‬‫و‬‫بر‬‫الهيكلي‬‫من‬‫خالل‬mRNA‫والذي‬‫ي‬‫يحتو‬‫لوب‬
‫لتجنب‬‫إنهاء‬‫الترجمة‬‫والتي‬‫يمكن‬‫أن‬‫تنتج‬‫من‬‫جين‬
‫املضيف‬‫في‬‫املرحلة‬‫املتأخرة‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬.
-‫بعدها‬‫يتم‬‫إنتاج‬‫نسخة‬‫من‬‫البروتين‬‫املتعدد‬‫اله‬‫يكلي‬‫من‬
‫قبل‬‫الريبوسوم‬‫عند‬‫املنطقة‬6،‫بعدها‬‫يدفع‬‫للترجمة‬‫على‬
‫القالب‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬TF‫البروتيني‬.
https://viralzone.expasy.org/625?outline=all_by_species
39 Faisal A. Alshamiry

40. http://viralzone.expasy.org/2?outline=all_by_species
‫التعبير‬‫الجيني‬‫الكبدية‬ ‫الفيروسات‬ ‫في‬
‫في‬‫الفيروسات‬‫الكبدية‬‫املسماة‬(Rhabdoviridae)‫حيث‬‫أنها‬
‫فيروسات‬‫تنتمي‬‫ـ‬‫ة‬‫ـمجموع‬‫ل‬RNA‫والذي‬‫ة‬‫ر‬‫بدو‬‫يعتمد‬‫على‬
‫إنزيم‬‫البلمرة‬RNA‫ليصبح‬‫كابسيد‬‫ثم‬‫بالتتابعات‬‫مل‬‫نطقة‬
،‫القائد‬‫يتم‬‫نسخ‬‫الجينات‬‫والتعرف‬‫على‬‫مناطق‬‫البد‬‫ء‬
‫واإليقاف‬‫طبقا‬‫ات‬‫ر‬‫لإلشا‬‫افقة‬‫ر‬‫امل‬‫للجينات‬‫الفير‬‫وسية‬.
‫بعدها‬‫يقوم‬mRNA‫في‬‫منطقة‬‫الكاب‬‫أثناء‬‫عملية‬‫تخلي‬‫ق‬
‫البروتين‬.40 Faisal A. Alshamiry

41. ‫الجينوم‬‫الجزئي‬dsDNA‫ويسمى‬‫الجينوم‬‫ي‬‫الدائر‬‫ويصل‬‫حجمه‬‫إلى‬3.2kb.
‫التعبير‬‫الجيني‬‫حيث‬‫يتم‬‫نسخ‬‫موسوم‬‫و‬‫الكر‬‫الصغير‬‫بواسطة‬‫إنزيم‬‫الب‬‫لمرة‬
RNA‫ي‬‫الخلو‬،‫الثاني‬‫تحت‬‫تحكم‬3‫إلى‬4‫من‬‫املنظمات‬‫البروموتر‬.‫في‬‫الثدييات‬‫مع‬2
‫ات‬‫ز‬‫معز‬‫في‬‫املنطقة‬.
‫حيث‬‫يتم‬‫تقسيم‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬RNA،‫البديل‬‫يتم‬‫تصدير‬‫النموذج‬‫غير‬‫املصر‬‫ح‬
‫به‬‫من‬‫النواة‬‫من‬‫خالل‬PRF‫ليصبح‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫الكابسيد‬.
‫ات‬‫ر‬‫البوليم‬‫والبروتين‬‫القصير‬(‫القفيصة‬)‫يتم‬‫التعبير‬‫عن‬‫البوليم‬‫ات‬‫ر‬‫عن‬‫طريق‬
‫عملية‬‫املسح‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬mRNA‫مع‬sRNA‫على‬‫التوالي‬.
Hepadnaviridae
http://viralzone.expasy.org/2?outline=all_by_species
41 Faisal A. Alshamiry

42. Varicella-Zoster Virus
‫فيروس‬‫ي‬‫جدر‬‫املاء‬‫املنطقي‬‫أو‬‫حمة‬‫الحماق‬‫املنطقي‬‫وي‬‫عرف‬
‫أيضا‬‫بالفيروس‬‫النطاقي‬‫الحماقي‬‫أو‬‫فيروس‬‫ي‬‫جدر‬‫ا‬‫ملاء‬
‫النطاقي‬‫وهو‬‫األشهر‬‫وهو‬‫أحد‬‫فيروسات‬‫الهربس‬‫الثما‬‫نية‬‫التي‬
‫تصيب‬،‫البشرية‬‫وهي‬‫لة‬‫و‬‫املسؤ‬‫عن‬‫حدوث‬‫مرض‬‫الحماق‬
(‫ي‬‫جدر‬‫املاء‬)‫واأللم‬‫العصبي‬.
‫ة‬‫ر‬‫الصو‬‫املرفقة‬:
-‫نموذج‬‫ر‬‫للدو‬‫الذي‬‫يعليه‬sp3/sp1‫في‬‫منطقة‬VZV
‫املعتمدة‬‫على‬DNA‫للتكاثر‬‫ومن‬‫ثم‬‫التعبير‬‫الجيني‬.
-‫ويمثل‬A))‫تشكيل‬‫املجتمعات‬SP3/SP1‫وتأثيرهم‬‫على‬
ORF63‫على‬‫التعبير‬‫في‬‫الخطوة‬‫الوسطية‬‫بعد‬‫العدو‬‫ي‬.
-‫ويمثل‬B))‫وجود‬‫املجمعات‬SP1/SP3‫إلى‬‫جانب‬ORF63‫ثم‬
‫ز‬‫يعز‬OBP‫في‬‫املرحلة‬‫املبكرة‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬.
-‫ويمثل‬C))‫وجود‬‫النسخ‬‫املعتمد‬‫على‬DNA‫مع‬‫وجود‬
‫ات‬‫ز‬‫املحف‬‫و‬ORF62‫و‬ORF63‫في‬‫احل‬‫ر‬‫امل‬‫املبكرة‬‫وأيضا‬
‫املتأخرة‬‫من‬‫ي‬‫العدو‬.http://jvi.asm.org/content/86/23/13070/F8.expansion.html
42 Faisal A. Alshamiry

43. https://veteriankey.com/rhabdoviridae-2/
‫الفيروسات‬‫الربدية‬‫وينتمي‬‫للفيروس‬‫ات‬
‫السلبية‬،‫األحادية‬‫حيث‬‫توضح‬‫ة‬‫ر‬‫الصو‬:
‫أن‬:
-G‫ي‬‫السكر‬‫البروتين‬‫يمثل‬
-N‫ي‬‫و‬‫النو‬‫كابسيد‬
-P‫ية‬‫ر‬‫الفسفو‬‫البروتينات‬
-M‫البروتينات‬‫املختلطة‬
-L‫البلمرة‬ ‫إنزيم‬RNA
43 Faisal A. Alshamiry

44. ‫تجميع‬ ‫نموذج‬‫المدا‬ ‫جينوم‬ ‫في‬‫الوظيفة‬ ‫بحسب‬‫الجينات‬(‫إنتيروباكتيريا‬‫فاج‬λ)Enterobacteria phage λ
‫وهو‬‫يصيب‬ ‫ي‬‫بكتير‬ ‫فيروس‬E. coli
oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
Recombination Control region Replication Lysis
Virus head &tail
Late control
‫المتأخر‬ ‫التحكم‬
‫التحكم‬ ‫منطقة‬‫الجيني‬ ‫التركيب‬ ‫إعادة‬ ‫وثني‬ ‫تضاعف‬ ‫تحلل‬
originPromoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
44 Faisal A. Alshamiry

45. ‫املباشر‬‫املبكر‬ ‫النسخ‬
‫بواسطة‬E.coli‫يبدأ‬RNA‫املنظمان‬ ‫بقوة‬‫البداية‬ ‫في‬‫بوليميريز‬PR&PL‫في‬ ‫وينتهي‬T.
Recombination Control region Replication Lysis
Virus head &tail
Late control
‫المتأخر‬ ‫التحكم‬
‫التحكم‬ ‫منطقة‬‫الجيني‬ ‫التركيب‬ ‫إعادة‬ ‫وثني‬ ‫تضاعف‬ ‫تحلل‬
oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
6S RNA
N Cro
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
45 Faisal A. Alshamiry

46. Pint PL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
N N N
N protein Cro
6S RNA
CIII
Recombination proteins
CII
Replication proteins
Q protein
‫بواسطة‬ ‫اإلنهاء‬ ‫كبح‬‫أو‬ ‫تثبيط‬N‫املبكر‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬‫إلى‬ ‫يؤدي‬ ‫تين‬‫و‬‫بر‬
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
46 Faisal A. Alshamiry

47. oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
Cro Cro Q
Lytic functions
Replication proteins Viral head & tail proteins
‫ـ‬‫ـ‬‫ب‬ ‫السلسلة‬ ‫تحلل‬Cro‫إيقاف‬ ‫على‬‫يعمل‬clQ‫الجيني‬‫التعبير‬‫تأخير‬ ‫إلى‬ ‫يؤدي‬ ‫تين‬‫و‬‫بر‬
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
47 Faisal A. Alshamiry

48. oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
Cro Cro Q
Lytic functions
Viral head & tail proteins
‫املتسلسل‬ ‫التحلل‬ ‫من‬ ‫املتأخرة‬ ‫املرحلة‬
‫من‬‫عالية‬ ‫ات‬‫ز‬‫تركي‬‫هناك‬ ‫ن‬‫يكو‬ ‫عندما‬Cro‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬ ‫إيقاف‬ ‫على‬ ‫يعمل‬PR& PL
‫من‬ ‫ونشط‬‫وافر‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬ ‫ن‬‫يكو‬ ‫لذا‬PR
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
48 Faisal A. Alshamiry

49. +
oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
CIII CII
CI
+
Repressor
PRE = promoter for repression
establishment
Int
tint
CII
Lysogeny‫أن‬ ‫حيث‬CII & CIII‫بينما‬ ‫الجيني‬‫التعبير‬ ‫ان‬‫ز‬‫تحف‬CI‫او‬ ‫كبح‬ ‫على‬ ‫يعمل‬
‫الجيني‬‫التعبير‬‫قمع‬
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
49 Faisal A. Alshamiry

50. Lysogeny‫النس‬ ‫علمية‬ ‫توقف‬ ‫املثبطات‬ ‫حيث‬‫خ‬
oR
Pint oLPL PRM PR PRE PR‘
tR3
tL1 tR1 tR2 t6S
att
int
xis
red
gam
cIII N cI cro cII O P Q S R A…J
CI
Repressor
PRM = promoter for
Repression maintenance
CI
CI
Activated by Repressor
binding to oR1 & oR2
Promoter
Operator
Terminator
‫المنظم‬
‫المشغل‬
‫المنهي‬
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
50 Faisal A. Alshamiry

51. ‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ل‬ ‫ل‬‫املتحو‬ ‫التنظيم‬‫المدا‬(‫فاج‬ ‫إنتيروباكتيريا‬λ)
Enterobacteria phage λ
‫المتحولة‬ ‫اللوحة‬ ‫مسح‬
Clear plaque mutants
‫الخبيثة‬ ‫التحوالت‬Virulent mutants (vir)
‫عملية‬ ‫عند‬ ‫األصلي‬ ‫للنوع‬ ‫إلى‬ ‫بحاجة‬lysogeny
‫الـتأسيس‬
Establishment
‫والحفظ‬ ‫الصيانة‬
Maintenance
cI Yes Yes
cII Yes No
cIII Yes No
‫البادئ‬ ‫في‬ ‫الفعل‬
Act in trans
‫في‬ ‫الفعل‬Cis
Act in cis
‫في‬ ‫المضاعف‬ ‫التحول‬Double mutants in oR &/or oL
‫املستذيبة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
51 Faisal A. Alshamiry

52. oR1oR2oR :
TTGACT GATAAT
-10-35
ATAGAT 5’TTAGAT 5’
-10 -35
oR3
croN
PR
PRM
‫في‬ ‫املشغالت‬ ‫مع‬ ‫املنظمات‬ ‫تشابك‬‫أو‬‫تداخل‬l
52 Faisal A. Alshamiry

53. ‫الحالة‬ ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬
‫الكاسيد‬ ‫قبل‬ ‫من‬ ‫ر‬‫التطو‬ ‫بعملية‬‫التحكم‬ ‫يتم‬
‫معينة‬‫بطريقة‬‫تحفز‬ ‫منها‬ ‫واحدة‬ ‫وكل‬‫العمليات‬ ‫من‬ ‫تتابعات‬‫عبر‬.
‫الجينات‬ ‫هذه‬ ‫من‬‫مرحلة‬ ‫كل‬ ‫في‬‫مراحل‬ ‫إلى‬ ‫النسخ‬ ‫تنظيم‬ ‫وينقسم‬
‫ال‬‫املرحلة‬ ‫جينات‬ ‫عن‬‫للتعبير‬‫مة‬‫ز‬‫الال‬ ‫الجينات‬ ‫أحد‬‫تشفير‬ ‫يتم‬‫تالية‬
53 Faisal A. Alshamiry

54. ‫استراتيجية‬‫تنظيم‬‫الجينات‬‫للتكاثر‬‫الفيروس‬‫ي‬
‫التنظيم‬‫الجيني‬‫للفيروسات‬‫تستخدم‬‫آليات‬‫وإم‬‫كانيات‬
‫الخلية‬‫املضيفة‬‫الستنساخ‬‫الفيروس‬‫نفسه‬.
‫فاج‬‫البكتيريا‬‫في‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫التحلل‬
‫الفيروسات‬‫لديها‬‫منظمات‬‫الذي‬‫يربط‬‫إنزيم‬‫البل‬‫مرة‬
RNA‫مما‬‫ينتج‬‫عنه‬‫نسخ‬‫الجينات‬‫الخاصة‬‫به‬.
-‫البروتينات‬‫املنتجة‬‫من‬‫قبل‬‫الخلية‬‫املضيف‬‫ة‬‫يتم‬
‫إيقافة‬‫فيحدث‬‫تحلل‬‫لحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬‫ويتداخل‬
‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬DNA‫ي‬ ‫الفيروس‬‫للنسخ‬.
-‫ايضا‬‫يحفز‬‫نسخ‬‫جينوم‬‫الفيروس‬‫للتكاثر‬‫ا‬‫و‬‫للنسخ‬.
-‫وبالطبع‬‫سوف‬‫يستخدم‬‫الفيروس‬‫النيوكليو‬‫تيدات‬
‫من‬‫تحلل‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬DNA
54 Faisal A. Alshamiry

55. ‫ة‬‫ر‬‫الدو‬‫الحالة‬‫الكا‬‫قبل‬ ‫من‬ ‫بها‬ ‫التحكم‬ ‫يتم‬‫ب‬‫سيد‬
•‫تتضمن‬‫الجينات‬‫املبكرة‬‫والتي‬‫تم‬‫نسخها‬‫من‬‫قبل‬‫مليريز‬‫و‬‫ب‬RNA‫بعد‬،‫ي‬‫العدو‬
‫او‬‫تتضمن‬‫احتياجات‬‫التنظيم‬‫للتعبير‬‫هو‬‫املرحلة‬‫الوسطى‬‫ملجموعة‬‫من‬‫الفاج‬.
•‫وتشمل‬‫املجموعة‬‫الوسطي‬‫من‬‫الجينات‬‫املنظمة‬‫لنسخ‬‫الجينات‬‫املتقدمة‬.
•‫وهذا‬‫يؤدي‬‫إلى‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫عن‬‫طريق‬‫مجموعات‬‫من‬‫الجينات‬‫خالل‬‫ي‬‫عدو‬‫الفاج‬.
55 Faisal A. Alshamiry

56. ‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫ل‬‫التحو‬(‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫املستذيب‬)‫هي‬‫حدى‬ٍ‫ا‬‫طريق‬‫تي‬
‫تتكاثر‬‫الفيروسات‬‫حيث‬‫يتم‬‫الحفاظ‬‫على‬‫آلي‬‫تها‬‫عبر‬
‫تين‬‫و‬‫بر‬‫الكبت‬:
1-LAMBDA‫يتم‬‫كبتها‬‫عن‬‫طريق‬‫التشفير‬‫بوا‬‫سطة‬
CL‫جين‬‫وهو‬‫مطلوب‬‫للحفاظ‬‫على‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫املستذيب‬.
2-‫يعمل‬‫كابت‬LAMBDA‫بالتأثير‬‫على‬‫تر‬‫و‬‫األبر‬OL &
OR‫ملنع‬‫عملية‬‫النسخ‬‫في‬‫وسط‬‫املرحلة‬‫املبك‬‫رة‬‫للجين‬.
3-‫تعمل‬‫الجينات‬‫املبكرة‬‫على‬‫نشوء‬‫ن‬‫وتكو‬‫سل‬‫سلة‬
‫تنظيمية‬‫كنتيجة‬‫للقمع‬‫او‬‫الكبت‬‫الذي‬‫يمنع‬‫د‬‫ة‬‫ر‬‫و‬
‫التحلل‬‫من‬‫االستمرار‬‫واملتابعة‬.‫املستذيب‬‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫كبت‬ ‫على‬ ‫الحفاظ‬ ‫آلية‬56 Faisal A. Alshamiry

57. ‫الكاسيد‬‫تحلل‬ ‫ة‬‫ر‬‫بدو‬ ‫للتحكم‬ ‫التنظيم‬‫من‬‫نوعين‬‫هناك‬.
‫عن‬‫طريق‬‫البروتينات‬‫املنظمة‬‫والتي‬‫تستخدم‬‫في‬‫مرح‬‫لة‬‫البدء‬
‫وتسمى‬‫الفاج‬‫او‬‫عند‬‫املنظم‬‫موتر‬‫و‬‫بر‬‫ينتج‬‫عنها‬‫إما‬‫فاج‬‫ج‬‫ديد‬‫او‬
‫حدوث‬‫عملية‬‫البلمرة‬‫اءتها‬‫ر‬‫لق‬‫اثناء‬‫مرحلة‬‫النسخ‬.
57 Faisal A. Alshamiry

58. ‫املبكرة‬ ‫املرحلة‬
‫بلمرة‬ ‫إنزيم‬RNA ‫ينسخ‬ N‫مع‬ Cro
‫من‬PR & PL
‫املبكر‬‫التباطؤ‬ ‫مرحلة‬
‫ز‬‫البريمر‬PN ‫املنظم‬ ‫مكان‬ ‫نفس‬ ‫من‬ ‫ينسخ‬
‫بمحاذاة‬ ‫وتستمر‬N & Cro
‫املتأخرة‬ ‫املرحلة‬
‫من‬ ‫البدء‬ ‫مرحلة‬ ‫في‬ ‫النسخ‬ ‫عملية‬ ‫تتم‬PR ‫بين‬
(Q & S )‫لكن‬ PQ ‫ر‬‫بالعبو‬ ‫يستمر‬‫بريمر‬
‫املتأخرة‬‫للجينات‬‫لتطور‬ ‫مراحل‬ ‫ثالثة‬Lambda
58 Faisal A. Alshamiry

59. ‫ة‬‫ر‬‫دو‬‫الحالة‬(‫التحلل‬)‫تعتمد‬‫على‬‫مرحلة‬‫اإلنهاء‬‫قبل‬‫موعدة‬‫بواسطة‬pN
‫في‬‫هذه‬‫الحالة‬‫في‬‫مجموعة‬‫بدائيات‬‫النواة‬،‫يحدث‬‫إنهاء‬‫سابق‬‫ملوعدة‬‫يعم‬‫ل‬‫على‬
‫إيقاف‬‫عملية‬‫توليف‬‫الحمض‬‫ي‬‫و‬‫النو‬RNA‫اثناء‬‫علمية‬‫النسخ‬‫من‬‫الحمض‬
‫ي‬‫و‬‫النو‬RNA‫ويحدث‬‫ذلك‬‫بسبب‬‫تجاهل‬‫بوليميريز‬RNA‫ة‬‫ر‬‫إشا‬‫اإلنهاء‬‫ولكنه‬
‫يوفر‬‫آلية‬‫بموجبها‬‫يتم‬‫تحويل‬‫جين‬‫واحد‬‫أو‬‫اكثر‬‫في‬‫نهاية‬‫ن‬‫و‬‫األبر‬‫اما‬‫أ‬‫ن‬‫يشغل‬
‫ن‬‫و‬‫األبر‬‫او‬‫يعمل‬‫على‬‫إيقافه‬‫اعتمادا‬‫على‬‫البلمرة‬.
‫وتستخدم‬‫هذه‬‫اآللية‬‫من‬‫قبل‬‫الفاجات‬‫لتنظيم‬‫التقدم‬‫في‬‫املرحلة‬‫األ‬‫ولى‬‫من‬
‫التعبير‬‫الجيني‬‫للمرحلة‬‫القادمة‬.
‫الجين‬lambda‫جين‬N‫ي‬‫ر‬‫و‬‫ضر‬‫للسماح‬‫بحدوث‬‫عملية‬‫البلمرة‬RNA‫بهدف‬
‫قراءته‬‫من‬‫خالل‬‫نهايات‬‫الجين‬‫املبكرة‬‫بشكل‬‫مباشر‬.
‫وهناك‬‫حاجة‬‫إلى‬‫تين‬‫و‬‫بر‬‫أخر‬‫مضاد‬‫للتحلل‬‫يسمى‬pQ‫ومع‬pN‫يؤثران‬‫على‬‫بلمرة‬
RNA‫ألنه‬‫ر‬ ُّ‫يم‬‫من‬‫منطقة‬‫محددة‬‫ويقعان‬‫كليهما‬‫في‬‫املواقع‬‫نسبية‬‫مخ‬‫تلفة‬‫في‬
‫وحدات‬‫النسخ‬‫الخاصة‬‫بها‬59 Faisal A. Alshamiry

60. ‫التعبير‬‫الجيني‬‫وتنظيمه‬‫في‬‫الفيروسات‬‫أمر‬‫بالغ‬‫التعقيد‬‫ومن‬‫خالل‬‫هذا‬‫العرض‬‫ا‬‫لمختصر‬‫تم‬
‫التطرق‬‫وتحديد‬‫العضيات‬‫األساسية‬‫في‬‫ذلك‬(‫علميات‬‫التعبير‬‫الجيني‬)‫ولكن‬‫بطرق‬‫ونظريات‬
‫مختلفة‬.
‫دراسة‬‫خطوات‬‫البدء‬‫واالستطالة‬‫واإلنهاء‬‫عند‬‫تخليق‬‫البروتين‬،‫الحيوي‬‫ل‬‫لجينومات‬‫من‬‫الحمض‬
‫النووي‬RNA‫وتحديد‬‫أهم‬‫البروتينات‬‫المساهمة‬‫والمنظمات‬‫والمشغالت‬‫في‬‫تلك‬،‫الخطوات‬‫وبعد‬
‫القدرة‬‫في‬‫الحصول‬‫على‬mRNA‫من‬‫الخلية‬‫سهل‬‫كثيرا‬‫من‬‫دراسة‬‫الفيروس‬‫والبروتين‬‫ا‬‫لحيوي‬
‫من‬‫قبل‬‫الباحثين‬‫في‬‫ال‬ِ‫ك‬‫وعتين‬ُ‫م‬‫المج‬‫حقيقيات‬‫وبدائيات‬‫النواة‬.
‫تم‬‫التطرق‬‫على‬‫أهم‬‫استراتيجيات‬‫التعبير‬‫الجيني‬‫لمجموعة‬‫واسعة‬‫من‬‫الفيروسات‬‫و‬‫التعرف‬‫على‬
‫الخصائص‬‫الخاصة‬‫بها‬.
‫الخالصة‬
60 Faisal A. Alshamiry

61. Faisal A. Alshamiry
agrfaisal@gmail.com