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Sommaire

Résumé


Introduction


Matériels et méthodes

      1 – Matériels

              a – Types cellulaires

              b – Amorces et sondes de RT-PCR quantitative en temps réel

      2 – Méthodes

              a – Conditions générales de culture

              b – Extraction des ARN messagers

              c – Comparaison de la sensibilité au NGF des diverses lignées épithéliales de

sein humain

              d – Test de l’effet de l’inhibition de contact

              e – Effet de substances agissant sur la croissance et/ou l’apoptose

              f – RT-PCR quantitative en temps réel

              g – Immunoprécipitation et analyse en Western blot

              h – Test d’apoptose en Hoescht
Résultats

      1 – Expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) dans les lignées

de cancer du sein et sur les cellules normales

             a – Expression du gène p75

             b – Expression du gène TrkA

             c – Expression du gène du NGF

      2 – Variation de l’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75)

en fonction de l’inhibition de contact

      3 – Variation de l’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75)

en fonction de substances agissant sur la croissance et/ou l’apoptose



Discution et conclusion


Bibliographie


Remerciments
Sébastien DUPRAT, DEA biologie santé 1999-2000.


    REGULATION DE L’EXPRESSION DU NGF ET DE

         SES RECEPTEURS (TRKA ET P75) DANS LES

                    CELLULES DE CANCER DU SEIN.




RESUME :




       Le cancer du sein touche près d’une femme sur dix. La meilleure compréhension de

cette maladie est un des défis prioritaires de la santé publique à l’heure actuelle.

        Il a préalablement été prouvé dans le laboratoire que le Nerve growth factor (NGF)

stimule la croissance et la survie des cellules de cancer du sein par l’intermédiaire de deux

récepteurs : TrkA et p75 (Descamps et al. 1998). Dans cette recherche il a également été

démontré que les cellules épithéliales mammaires normales ne sont pas stimulées à proliférer

par ce facteur de croissance. L’objectif de mon travail de DEA est de définir la régulation du

NGF et de ses récepteurs dans les lignées de cancer du sein en culture.

       Différentes lignées de cancer du sein ainsi que des cellules épithéliales mammaires

normales ont été cultivées en présence de facteurs modifiant la prolifération et la survie

cellulaire. Les résultats ont alors été analysés en RT-PCR quantitative en temps réel ou en

western blot.
INTRODUCTION :                                    préalablement à mon arrivée dans mon

                                                  laboratoire d’accueil, cet effet a été

                                                  démontré      sur   les cellules épithéliales

                                                  mammaires cancéreuses (Descamps et al.
        La recherche en biologie cellulaire
                                                  1998). Une particularité est intéressante
sur les cancers hormonaux dépendants
                                                  dans ce modèle : le NGF stimule les cellules
repose principalement sur l’étude de la
                                                  cancéreuses du sein à proliférer mais reste
prolifération, de la différentiation et de
                                                  sans effets mesurables sur les cellules
l’apoptose.      Ces     phénomènes       sont
                                                  normales.
conditionnés par l’environnement cellulaire,
                                                          Le NGF agit par l’intermédiaire de
notamment        par    les   molécules     de
                                                  deux récepteurs membranaires : TrkA et
signalisation.    On    trouve    dans    cette
                                                  p75. Le proto-oncogène TrkA (p140trk) est
catégorie les facteurs de croissance, petits
                                                  un récepteur à activité tyrosine kinase, c’est
polypeptides de faible poids cellulaire qui
                                                  le récepteur à haute affinité du NGF. P75
agissent par l’intermédiaire de récepteurs
                                                  est un récepteur accessoire, de basse
membranaires.
                                                  affinité, et sans activité tyrosine kinase. Ce
        Le NGF est le premier facteur de
                                                  dernier semble pourtant posséder une voie
croissance à avoir été caractérisé. Ce travail
                                                  de transduction propre liée aux fonctions
a valu le prix Nobel de médecine en 1986 à
                                                  de survie cellulaire.
Rita-Levi Montalcini. C’est l’archétype des
                                                          L’étude du rôle du NGF dans le
facteurs de croissance neurotrophique. Il a
                                                  cancer du sein en est à ses débuts. Dans le
été très largement étudié pour son rôle
                                                  cadre de ce stage de DEA, nous nous
d’induction de la croissance et de la survie
                                                  somme intéressé aux mécanismes régulant
des     neurones        sympathiques.     Plus
                                                  la   sensibilité    des   cellules   épithéliales
récemment, une activité mitogène lui a été
                                                  mammaires humaines pour ce facteur de
attribuée sur certaines lignées de cellules
                                                  croissance.    Notre      approche     nous    a
épithéliales.    Dans   un    travail effectué
renseigné sur l’évolution de cette sensibilité   au NGF induite par des molécule agissant

                                                 sur la croissance et/ou l’apoptose.
MATERIEL & METHODES :

                                                              proto-oncogène                  ras

1 - Matériel                                                  (dénomination :      MCF-7     ras).

                                                              Ces dernières se comportent en

                                                              permanence comme stimulées
          a) Types cellulaires
                                                              par des facteurs de croissance,
          Un     certain    nombre        de     types
                                                              même en milieu de sevrage (sans
cellulaires ont été utilisés. Ce sont des
                                                              sérum de veau fœtal).
lignées       cancéreuses     ou     des       cellules
                                                          -   Les lignées T47D et SK-Br-3
normales,       mais toutes        sont    d’origine
                                                              sont     également      hormono-
épithéliales mammaires humaines.
                                                              dépendantes et peu invasives.
          -    la lignée MCF-7 est hormono-
                                                              Elle          sont           issues
               dépendante. Elle a été établie à
                                                              d’adénocarcinomes.       SK-Br-3
               partir d’effusions pleurales d’un
                                                              surexprime le récepteur erb-B2,
               adénocarcinome. Cette lignée a
                                                              et T47D possède des récepteurs
               conservé       de      nombreuses
                                                              à certains stéroïdes.
               caractéristiques d’un épithélium
                                                          -   La lignée BT20 semble être
               mammaire         (particulièrement
                                                              hormono-dépendante, mais ceci
               pour la présence des récepteurs
                                                              est    controversé      dans      la
               à haute affinité des œstrogènes
                                                              littérature. Elle est issue de
               et progesterone). En plus de la
                                                              cellules échapées d’une tumeur
               lignée MCF-7 commune, nous
                                                              en culture primaire. Elle a la
               avons également utilisé des
                                                              particularité de ne pas posséder
               MCF-7       transfectées        par   le
                                                              de récepteurs aux œstrogènes.
-   Nous avons également étudié 3                             Dr.Pellerin) et mises en culture

    lignées de MDA. Elles sont                                primaire au laboratoire.

    toutes        trois         hormono-

    indépendantes.        Ce    sont      les            b) Amorces et sondes de RT-
    lignées MDA-MB-231 (issues                           PCR quantitative en temps
    d’effusions                     pleurales
                                                         réél.
    d’adénocarcinomes,          fortement
                                                         Les séquences des amorces sens et
    invasive.        Ces             cellules
                                                antisens ainsi que des sondes sont les
    n’expriment pas de récepteurs
                                                suivantes :
    aux      œstrogènes        et     à    la

    progestérone),        MDA-MB-453
                                                TrkA :
    (possédant       de         nombreux
                                                Sens : CATCGTGAAGAGTGGTCTCCG
    récepteurs aux androgènes et                Antisens :
                                                GAGAGAGACTCCAGAGCGTTGAA
    très invasive. Elle surexprime
                                                Sonde :
    également erb-B2) et MDA-                   AGGAGTGAAATGGAAGGCATCTGGC
    MB-468 (possède de nombreux                 G

    récepteurs       à     l’EGF           et
                                                P75 :
    surexprime le FGF-2).                       Sens :
-   Enfin, nous avons utilisé des               CCTACGGCTACTACCAGGATGAG
                                                Antisens : TGGCCTCGTCGGAATACG
    cellules épithéliales mammaires
                                                Sonde :
    humaines                        normales    CTCGGGCCTCGTGTTCTCCTGC
    (dénomination : CEMN). Ces
                                                NGF :
    cellules sont issues de réduction
                                                Sens :
    mammaires non pathologiques                 Antisens :
    (venant     du   département          de    Sonde :

    chirurgie plastique, CHU Lille,
trypsine est inhibée par 5 ml de MEM SVF

2 – méthodes                                    (décrit ci-dessus).

                                                        Les    cellules   en   culture     sont

                                                régulièrement observées au microscope
       a) Conditions générales de
                                                inversé à contraste de phase. Cela permet
culture
                                                de suivre l’évolution de la confluance et de

                                                s’assurer du maintient de la morphologie
       En    routine,   les   cellules   sont
                                                épithéliale.
maintenues en MEM (Milieu essentiel
                                                        Avant un traitement de facteurs de
minimum, avec des sels de Eagle) (Gibco
                                                croissance, les cellules sont sevrées dans du
BRL) supplémenté avec 5% de sérum de
                                                MEM supplémenté comme pour le MEM –
veau fœtal (SVF) (Eurobio ? ? ? ?), 1%
                                                SVF d’acides aminés non essentiels, de L-
d’acides aminés essentiels (Eurobio), 2 mM
                                                glutamine,     de     pénistreptomycine,    de
de glutamine (Eurobio), 5 µl/ml d’insuline
                                                gentamycine, de bicarbonate de sodium, et
(Organon), et des antibiotiques (Penicilline-
                                                d’HEPES. A ceci, nous ajoutons 2 µg/ml
Streptomycine : 100 U/ml et Gentamycine :
                                                de fibronectine et 30 µg/ml de transférine.
50 µl/ml) (Eurobio). Les cellules sont

encemencées dans des flasques de plastique

de 75 cm2 (Falcon) et incubées dans un
                                                        b)     Extraction      des       ARN
atmosphère humide, à 37°C en présence de

5% de CO2. Le milieu est changé tous les 2      messagers

jours. Les cellules sont régulièrement

décolées, avant la confluance dans une                  Les ARN totaux ont été extraits

solution de trypsine (0,1%) – EDTA              avec le kit Quiagen selon le protocole

(0,25%) (eurobio), à 37°C pendant 5 à 10        décrit par Quiagen. Ensuite, on évalue la

minutes (en fonction du type cellulaire). La    quantité d’ARN en spectrophotométrie à
260 nm de longueur d’onde. On vérifie                 Ensuite, les cellules sont trypsinisées. La

aussi la pureté du résultat en s’assurant que         quantité de cellules comprise dans chaque

le ratio λ260/λ280 est compris entre 1,7 et           échantillon est déterminée par comptage

                                                      sur   lame   de   Malassez.    Ensuite,   on
2. Les ARN sont dilués à 10µg /ml puis les
                                                      centrifuge 10 minutes à 1200 tour par
solutions mères et dilués sont stockées à –
                                                      minutes. Les culots sont conservés à –80°C
80°C.
                                                      en attendant d’en extraire les ARN

                                                      messagers. Les ARN seront analysés en
         c)         Comparaison           de     la
                                                      RT-PCR quantitative en temps réel.
sensibilité au NGF des diverses

lignées épithéliales de sein humain

                                                             d)    Test        de   l’effet     de
         Pour évaluer le niveau d’expression
                                                      l’inhibition de contact
du NGF et de ses récepteurs, les cellules

ont été ensemencées dans des boites de
                                                             Les    cellules   MCF-7     ont    été
petri 100mm (………), à 10000 cellules
                                                      ensemencées à 10000 cellules par cm2 dans
             2
par     cm ,      puis   cultivées     dans    deux
                                                      des boites de Petri de 100mm de diamètre
conditions standard :
                                                      puis cultivées en MEM – SVF. Le milieu
         -       48 heures en MEM – SVF :
                                                      est régulièrement changé.     Chaque jours,
                 condition de sérum.
                                                      trois boites sont récoltées par une solution
         -       48 heures en MEM – SVF puis
                                                      de trypsine, le nombre de cellules est
                 48 heures en MEM sevrage :
                                                      déterminé par un compteur de cellules
                 condition de sevrage.
                                                      automatique. A partir de ces cellules, on
(Remarque : dans cette partie, le milieu MEM de
                                                      extrait les ARN messager que l’on analyse
sevrage ne contient pas de rouge de phénol. Ce

n’est pas le cas dans le reste de l’étude.)           en RT-PCR quantitative en temps réel.
MEM – SVF a été renouvelé

       e) Effet de substances agissant                      24h puis les cellules ont été

                                                            traitées 48h dans du MEM –
sur la croissance et/ou l’apoptose
                                                            SVF supplémenté de 1mM de

       Les cellules (MCF7 et BT-20) ont                     NaB ou 10µM de C2.

été ensemencées à 5000 cellules par cm2

dans des boites de petri de 100mm de

diamètre. Les cellules ont été laissées 48h            f) RT-PCR quantitative en
en MEM – SVF dans un incubateur (37°C,          temps réel.
5% de CO2). A partir de cette étape, il faut

différencier deux cas :
                                                       La réaction est faite en une seule
       -   Pour le test du FGF-2, ainsi que
                                                étape. Le mélange de réaction se compose
           le test conjoint du butyrate de
                                                dans chaque tube de : 50ng d’ADN total
           sodium (NaB) et du C2 avec le
                                                d’échantillon, MgCl2 : 6mM pour TrkA ;
           NGF, les cellules ont été lavées
                                                3mM pour p75 ; 4mM pour NGF, 5 µl de
           2 fois avec du PBS stérile (15
                                                tampon TaqMan 10X (500mM KCl, 0,1
           minutes puis 2 heures) et mises
                                                mM EDTA, 100 mM tris HCl, pH 8.3, 600
           24h en MEM sevrage. Enfin,
                                                nM ROX qui est un dérivé de la rhodamine
           elles ont été traitées 48h dans du
                                                utilisé comme référence interne passive
           MEM sevrage supplémenté de
                                                pour normaliser la fluorescence), 20 U
           1ng/ml de FGF-2, 0.5mM de
                                                d’ADN polymérase AmpliTaq Gold, 300
           NaB, 2µM de C2, et/ou 200
                                                µM de dATP, dCTP, dGTP, dUTP, 200
           ng/ml de NGF.
                                                nM d’amorces sens et antisens et 200 nM
       -   Concernant les test avec le C2
                                                de sonde.
           ou le butyrate de sodium (NaB)

           en présence de sérum, le milieu
La transcription inverse se fait                 Les cellules sont décolées par 200

pendant 30 min à 48°C. On active ensuite         µl (pour une boite de pétri 100mm) de
par chauffage l’AmpliTaq Gold 10 min à
                                                 tampon de lyse (0.3% SDS, 1% β-
95°C. Puis on effectue 40 cycles dans les
                                                 mercaptoéthanol, 0.5% Triton X100). Les
conditions suivantes : 15 sec à 95°C
                                                 cellules ainsi récupérées sont laissées 5 min
(dénaturation)     puis    90   sec   à   60°C
                                                 dans la glace, puis les protéines sont
(hybridation + élongation).
                                                 dissociées par ultrasons. On centrifuge 3
       Les       données    recueillies   sont
                                                 min à 10000 tr/min, on dose le surnageant
comparées à une courbe étalon amplifiée
                                                 en spectrophotométrie (longueur d’onde :
simultanément aux échantillons à partir
                                                 595nm), puis on stocke la solution de
d’une quantité connue des ARN standard
                                                 protéines à –20°C.
respectifs. Une courbe d’amplification est
                                                        Pour    augmenter     l’efficacité    du
réalisée par informatique (logiciel Abi-
                                                 western,          on       réalise          une
Prism 7700) en rapportant l’intensité du
                                                 immunoprécipitation au préalable avec les
signal fluorescent au nombre de cycles de
                                                 anticorps spécifiques de TrkA, p75 et NGF.
PCR. La courbe étalon est basée sur une

relation linéaire entre le logarithme de la

quantité d’ARN standard de départ et le
                                                        h) Test d’apoptose en Hoescht
seuil significatif d’augmentation de la

fluorescence ( = cycle de sortie).
                                                        Nous       avons   réalisé    les    test

                                                 d’apoptose dans des boites de pétri de

                                                 35mm de diamètre, dans lesquels sont
       g)     Immunoprécipitation           et
                                                 déposées 3 lamelles de microscopie cottées
analyse en Western blot                          au   collagène.     Les   cellules    y     sont

                                                 encemencées et traitées dans les mêmes

                                                 conditions que décrites précédemment.
A l’issue du traitement, on aspire le    puis montées sur lames microscopiques

millieu, les cellules sont fixées au méthanol   avec du glycérol.

à –20°C puis rincées 2 fois au PBS . On                On lit les lames en microscopie à

place ensuite les lamelles dans une solution    fluorescence.       L’observation      de    la

de Hoescht,     15 min, à température           morphologie     des    noyaux       permet   de

ambiante et à l’abris de la lumière. Les        déterminer la proportion de cellules en

lamelles sont enfin rincées 2 fois au PBS       apoptose.



            ________________________________________________________
RESULTATS :

                                                       de phénol, nous avons décidé d’utiliser en

           Les résultats obtenus se composent          sevrage du MEM sans rouge de phénol.

en     3     parties,      chacune       concernant    Ceci nous donne 2 conditions standard

l’expression du NGF et des ses récepteurs :            extrêmes de culture : en condition favorable

•    dans différents types cellulaires de sein         et en condition limitante.

     humain.                                                      L’objectif a été de collecter les

•    et leur évolution en fonction de la               informations necessaires au choix d’un

     densité cellulaire.                               modèle expérimental pour la suite du

                                                       travail.
•    sur des cellules traitées par des facteurs

     agissant    sur    la        prolifération   ou

     l’apoptose.                                                  a) Expression du gène p75.



                                                                  La fig. 1A présente le résultat en

1) Expression du NGF et de ses                         RT-PCR          quantitative      du    niveau

                                                       d’expression des ARN messagers de p75.
récepteurs (TrkA et p75) dans les
                                                       Les types cellulaires sont classées de la
lignées de cancer du sein et sur les
                                                       façon      suivante :   d’abord   les   cellules
cellules normales.
                                                       normales, puis les lignées cancéreuses par

                                                       ordre décroissant d’hormonodépendance.
           Cette étude regroupe toutes les
                                                                  On observe pour la majorité des
lignées      décrites      dans      « matériel   et
                                                       types cellulaires une expression de p75
méthodes ». Les cellules ont été cultivées
                                                       significativement plus importante sans SVF.
dans des conditions d’étude standard : en
                                                       Il y a une exception néanmoins : la lignée
MEM – SVF ou en MEM sevrage. Compte

tenu de l’activité oestrogénique du rouge
MCF-7 exprime de façon égale ce gène            MDA-MB-231, MDA-MB-453 et MDA-

dans les conditions de sérum et de sevrage.     MB-468. Dans le cas des lignées BT-20 et

       Ce sont dans les lignées MCF-7,          T47-D, TrkA est largement plus exprimé

T47-D et BT-20 que l’expression du gène         dans les cultures avec du sérum.

p75 est la plus importante. Elle est par                L’expression de TrkA est la plus

contre particulièrement faible dans les         faible dans les cellules normales, les MCF-

cellules normales, ainsi que dans les lignées   7, les MDA-MB-231 et les MDA-MB-453.

SKBr3, MDA-MB-453 et MDA-MB-468.



                                                        c) Expression du gène du
       b) Expression du gène TrkA.              NGF.


       Les résultats sont présentés dans la             Les résultats ne sont pas présentés
fig. 1B.                                        car l’expression est nulle ou suffisamment
       On observe dans la plupart des           faible pour ne pas être détectable en PCR,
types cellulaires une expression équivalente    même après 40 cycles, et ce, dans chacune
de TrkA dans les conditions de sérum et de      des conditions précédentes et pour chaque
sevrage.   Cela    concerne    les   cellules   type cellulaire testé.
normales, ainsi que les MCF-7, SKBr3,
Fig. 1A :




Fig. 1B :
représente le début de la phase plateau avec

2) Variation de l’expression du                  270000 cellules.

                                                        Ce travail présente l’expression des
NGF et de ses récepteurs (TrkA et
                                                 ARN messagers des étudiés.
p75) en fonction de l’inhibition de

contact.
                                                        Le résultat de cette étude est

                                                 présenté dans la fig. 2A pour p75 et fig.

                                                 2B pour TrkA. Comme dans l’étude
         Cette étude a été réalisée sur la
                                                 précédente, l’expression du NGF a été testé
lignée          cancéreuse              MCF-7.
                                                 et il n’est pas exprimé de façon mesurable.
L’encemencement      s’est   fait   à    50000
                                                        On     observe     une    expression
cellules par boites. Le jour 1 correspond à
                                                 relativement forte des 2 récepteurs du NGF
la phase « lag » avec 71600 cellules par
                                                 lors de la phase d’adhérence. Par la suite,
boites. Les jours 2 et 3 composent la phase
                                                 cette expression diminue progressivement
« log » avec respectivement 104000 et
                                                 jusqu’à la phase de plateau.
181000 cellules par boites. Enfin, le jour 4
Fig. 2A :




Fig. 2B :
3) Variation de l’expression du               MEM – SVF, ou après un traitement par le

                                              FGF-2 en condition de sevrage. Suite aux
NGF et de ses récepteurs (TrkA et
                                              résultats de cette étude qui montre une
p75) en fonction de substances
                                              réponse parfaitement identique dans les 2
agissant sur la croissance et/ou
                                              lignées, nous avons continué le travail sur
l’apoptose.
                                              la seule lignée MCF-7.

                                                     Nous avons ensuite étudié en détail

                                              l’effet conjoint du NaB ou du C2 avec le
       Cette étude a été commencé sur         NGF.
deux lignées cellulaires (MCF-7 et BT-20)            Cette 3ème partie comprend des tests
choisies comme modèle d’étude au vue des      d’apoptose en Hoescht, des tests de RT-
résultats précédents. Nous avons défini       PCR quantitative sur les gènes TrkA et p75
l’expression de TrkA et p75 (NGF n’étant      qui sont confirmés par Western blot.
pas exprimé, comme précédemment) après

un traitement par le C2 ou le NaB en milieu
DISCUSSION ET CONCLUSION:



       Les résultats de cette étude montrent comment évolue la sensibilité des cellules

épithéliales mammaires humaines pour le NGF.

       Il a fallu tout d’abord choisir le modèle expérimental de l’étude. Nous avons pour cela

comparé le niveau d’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) dans les différentes

cellules usuelles d’étude du cancer du sein. Le profil obtenu, tant pour p75 que pour TrkA, a

montré des divergences de comportement entre les différents types cellulaires. Nous avons

donc choisi deux lignées : MCF7 qui est typiquement la lignée prototype des études sur le

cancer du sein ; et BT-20 dont le comportement semble (au vu de cette étude préalable)

différent de MCF7 et qui a l’avantage d’avoir un niveau d’expression assez élevé pour les

gènes de notre étude. Par la suite, en constatant que la réponse de ces deux lignées aux

traitements, aussi bien sur la plan de la croissance que de l’expression des gènes, était

identique, nous avons fini l’étude sur la seule lignée MCF-7.

       Tout d’abord, les cellules épithéliales mammaires humaines (aussi bien les cellules

normales que les cellules cancéreuses) ne produisent pas le NGF. L’hypothèse de la voie de

régulation autocrine s’avère donc non fondée.

       Nous avons largement observé l’expression des deux récepteurs du NGF (TrkA et p75)

en conditions routinière ainsi que son évolution suite à un traitement par des molécules

agissant sur la prolifération ou/et sur l’apoptose. Grâce à la technique de RT-PCR quantitative,

nous n’avons pas constaté de différence d’expression des récepteurs TrkA et p75 suite à un

traitement de 48h avec du FGF-2 ou du C2. Nous avons par contre observé une expression de

p75 de l’ordre de trois fois celle du contrôle en cas de traitement 48h avec du NaB. Avec ce
même traitement, TrkA ……… Ceci a pu être vérifié dans deux lignées différentes (MCF-7 et

BT-20), avec un profil de réponse au traitement parfaitement identique.
BIBLIOGRAPHIE :


Descamps et al. (1998) J. Biol. Chem. 273 : 16659-62.
REMERCIMENTS :




         Je remercie chaleureusement le Professeur H. Hondermarck et le Docteur J.P. Peyrat pour

m’avoir laissé beaucoup de liberté dans l’organisation de mon travail tout en me faisant bénéficier d’un

encadrement régulier et de qualité.

         Un grand merci au Professeur B. Boilly pour l’interret constant qu’il a porté à mon travail et

pour m’avoir généreusement fait profiter de son expérience.

         Je remercie tout particulièrement Simon Descamps pour sa patience et sa disponibilité à mon

égard.

         Merci aux Docteurs X. Dong-Lebouhris et Y. El Yazidi pour leur bonne humeur et leur

gentillesse.

         Je me dois aussi de ne pas oublier tous ceux sans qui mon travail n’aurait pas pu être aussi

enrichissant : Pr Victor Nurcombe, Dr Patrice Richard, Dr. Louis Hornez, Dr. Françoise Révillon,

Valérie C., Valérie P., Anne-Sophie, Rachel, Sylviane, Isabelle, Marie-Michelle, Laurent, Robert-Alain,

David V., David L., Johan, Alain, Arnaud,…

         Une pensée émue enfin, avec l’espoir sincère d’une rapide guérison, pour Anthony, je te

souhaite tous mes vœux pour une longue carrière dans la recherche quand ta maladie sera passée.

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Mémoire de dea

  • 1. Sommaire Résumé Introduction Matériels et méthodes 1 – Matériels a – Types cellulaires b – Amorces et sondes de RT-PCR quantitative en temps réel 2 – Méthodes a – Conditions générales de culture b – Extraction des ARN messagers c – Comparaison de la sensibilité au NGF des diverses lignées épithéliales de sein humain d – Test de l’effet de l’inhibition de contact e – Effet de substances agissant sur la croissance et/ou l’apoptose f – RT-PCR quantitative en temps réel g – Immunoprécipitation et analyse en Western blot h – Test d’apoptose en Hoescht
  • 2. Résultats 1 – Expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) dans les lignées de cancer du sein et sur les cellules normales a – Expression du gène p75 b – Expression du gène TrkA c – Expression du gène du NGF 2 – Variation de l’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) en fonction de l’inhibition de contact 3 – Variation de l’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) en fonction de substances agissant sur la croissance et/ou l’apoptose Discution et conclusion Bibliographie Remerciments
  • 3. Sébastien DUPRAT, DEA biologie santé 1999-2000. REGULATION DE L’EXPRESSION DU NGF ET DE SES RECEPTEURS (TRKA ET P75) DANS LES CELLULES DE CANCER DU SEIN. RESUME : Le cancer du sein touche près d’une femme sur dix. La meilleure compréhension de cette maladie est un des défis prioritaires de la santé publique à l’heure actuelle. Il a préalablement été prouvé dans le laboratoire que le Nerve growth factor (NGF) stimule la croissance et la survie des cellules de cancer du sein par l’intermédiaire de deux récepteurs : TrkA et p75 (Descamps et al. 1998). Dans cette recherche il a également été démontré que les cellules épithéliales mammaires normales ne sont pas stimulées à proliférer par ce facteur de croissance. L’objectif de mon travail de DEA est de définir la régulation du NGF et de ses récepteurs dans les lignées de cancer du sein en culture. Différentes lignées de cancer du sein ainsi que des cellules épithéliales mammaires normales ont été cultivées en présence de facteurs modifiant la prolifération et la survie cellulaire. Les résultats ont alors été analysés en RT-PCR quantitative en temps réel ou en western blot.
  • 4. INTRODUCTION : préalablement à mon arrivée dans mon laboratoire d’accueil, cet effet a été démontré sur les cellules épithéliales mammaires cancéreuses (Descamps et al. La recherche en biologie cellulaire 1998). Une particularité est intéressante sur les cancers hormonaux dépendants dans ce modèle : le NGF stimule les cellules repose principalement sur l’étude de la cancéreuses du sein à proliférer mais reste prolifération, de la différentiation et de sans effets mesurables sur les cellules l’apoptose. Ces phénomènes sont normales. conditionnés par l’environnement cellulaire, Le NGF agit par l’intermédiaire de notamment par les molécules de deux récepteurs membranaires : TrkA et signalisation. On trouve dans cette p75. Le proto-oncogène TrkA (p140trk) est catégorie les facteurs de croissance, petits un récepteur à activité tyrosine kinase, c’est polypeptides de faible poids cellulaire qui le récepteur à haute affinité du NGF. P75 agissent par l’intermédiaire de récepteurs est un récepteur accessoire, de basse membranaires. affinité, et sans activité tyrosine kinase. Ce Le NGF est le premier facteur de dernier semble pourtant posséder une voie croissance à avoir été caractérisé. Ce travail de transduction propre liée aux fonctions a valu le prix Nobel de médecine en 1986 à de survie cellulaire. Rita-Levi Montalcini. C’est l’archétype des L’étude du rôle du NGF dans le facteurs de croissance neurotrophique. Il a cancer du sein en est à ses débuts. Dans le été très largement étudié pour son rôle cadre de ce stage de DEA, nous nous d’induction de la croissance et de la survie somme intéressé aux mécanismes régulant des neurones sympathiques. Plus la sensibilité des cellules épithéliales récemment, une activité mitogène lui a été mammaires humaines pour ce facteur de attribuée sur certaines lignées de cellules croissance. Notre approche nous a épithéliales. Dans un travail effectué
  • 5. renseigné sur l’évolution de cette sensibilité au NGF induite par des molécule agissant sur la croissance et/ou l’apoptose.
  • 6. MATERIEL & METHODES : proto-oncogène ras 1 - Matériel (dénomination : MCF-7 ras). Ces dernières se comportent en permanence comme stimulées a) Types cellulaires par des facteurs de croissance, Un certain nombre de types même en milieu de sevrage (sans cellulaires ont été utilisés. Ce sont des sérum de veau fœtal). lignées cancéreuses ou des cellules - Les lignées T47D et SK-Br-3 normales, mais toutes sont d’origine sont également hormono- épithéliales mammaires humaines. dépendantes et peu invasives. - la lignée MCF-7 est hormono- Elle sont issues dépendante. Elle a été établie à d’adénocarcinomes. SK-Br-3 partir d’effusions pleurales d’un surexprime le récepteur erb-B2, adénocarcinome. Cette lignée a et T47D possède des récepteurs conservé de nombreuses à certains stéroïdes. caractéristiques d’un épithélium - La lignée BT20 semble être mammaire (particulièrement hormono-dépendante, mais ceci pour la présence des récepteurs est controversé dans la à haute affinité des œstrogènes littérature. Elle est issue de et progesterone). En plus de la cellules échapées d’une tumeur lignée MCF-7 commune, nous en culture primaire. Elle a la avons également utilisé des particularité de ne pas posséder MCF-7 transfectées par le de récepteurs aux œstrogènes.
  • 7. - Nous avons également étudié 3 Dr.Pellerin) et mises en culture lignées de MDA. Elles sont primaire au laboratoire. toutes trois hormono- indépendantes. Ce sont les b) Amorces et sondes de RT- lignées MDA-MB-231 (issues PCR quantitative en temps d’effusions pleurales réél. d’adénocarcinomes, fortement Les séquences des amorces sens et invasive. Ces cellules antisens ainsi que des sondes sont les n’expriment pas de récepteurs suivantes : aux œstrogènes et à la progestérone), MDA-MB-453 TrkA : (possédant de nombreux Sens : CATCGTGAAGAGTGGTCTCCG récepteurs aux androgènes et Antisens : GAGAGAGACTCCAGAGCGTTGAA très invasive. Elle surexprime Sonde : également erb-B2) et MDA- AGGAGTGAAATGGAAGGCATCTGGC MB-468 (possède de nombreux G récepteurs à l’EGF et P75 : surexprime le FGF-2). Sens : - Enfin, nous avons utilisé des CCTACGGCTACTACCAGGATGAG Antisens : TGGCCTCGTCGGAATACG cellules épithéliales mammaires Sonde : humaines normales CTCGGGCCTCGTGTTCTCCTGC (dénomination : CEMN). Ces NGF : cellules sont issues de réduction Sens : mammaires non pathologiques Antisens : (venant du département de Sonde : chirurgie plastique, CHU Lille,
  • 8. trypsine est inhibée par 5 ml de MEM SVF 2 – méthodes (décrit ci-dessus). Les cellules en culture sont régulièrement observées au microscope a) Conditions générales de inversé à contraste de phase. Cela permet culture de suivre l’évolution de la confluance et de s’assurer du maintient de la morphologie En routine, les cellules sont épithéliale. maintenues en MEM (Milieu essentiel Avant un traitement de facteurs de minimum, avec des sels de Eagle) (Gibco croissance, les cellules sont sevrées dans du BRL) supplémenté avec 5% de sérum de MEM supplémenté comme pour le MEM – veau fœtal (SVF) (Eurobio ? ? ? ?), 1% SVF d’acides aminés non essentiels, de L- d’acides aminés essentiels (Eurobio), 2 mM glutamine, de pénistreptomycine, de de glutamine (Eurobio), 5 µl/ml d’insuline gentamycine, de bicarbonate de sodium, et (Organon), et des antibiotiques (Penicilline- d’HEPES. A ceci, nous ajoutons 2 µg/ml Streptomycine : 100 U/ml et Gentamycine : de fibronectine et 30 µg/ml de transférine. 50 µl/ml) (Eurobio). Les cellules sont encemencées dans des flasques de plastique de 75 cm2 (Falcon) et incubées dans un b) Extraction des ARN atmosphère humide, à 37°C en présence de 5% de CO2. Le milieu est changé tous les 2 messagers jours. Les cellules sont régulièrement décolées, avant la confluance dans une Les ARN totaux ont été extraits solution de trypsine (0,1%) – EDTA avec le kit Quiagen selon le protocole (0,25%) (eurobio), à 37°C pendant 5 à 10 décrit par Quiagen. Ensuite, on évalue la minutes (en fonction du type cellulaire). La quantité d’ARN en spectrophotométrie à
  • 9. 260 nm de longueur d’onde. On vérifie Ensuite, les cellules sont trypsinisées. La aussi la pureté du résultat en s’assurant que quantité de cellules comprise dans chaque le ratio λ260/λ280 est compris entre 1,7 et échantillon est déterminée par comptage sur lame de Malassez. Ensuite, on 2. Les ARN sont dilués à 10µg /ml puis les centrifuge 10 minutes à 1200 tour par solutions mères et dilués sont stockées à – minutes. Les culots sont conservés à –80°C 80°C. en attendant d’en extraire les ARN messagers. Les ARN seront analysés en c) Comparaison de la RT-PCR quantitative en temps réel. sensibilité au NGF des diverses lignées épithéliales de sein humain d) Test de l’effet de Pour évaluer le niveau d’expression l’inhibition de contact du NGF et de ses récepteurs, les cellules ont été ensemencées dans des boites de Les cellules MCF-7 ont été petri 100mm (………), à 10000 cellules ensemencées à 10000 cellules par cm2 dans 2 par cm , puis cultivées dans deux des boites de Petri de 100mm de diamètre conditions standard : puis cultivées en MEM – SVF. Le milieu - 48 heures en MEM – SVF : est régulièrement changé. Chaque jours, condition de sérum. trois boites sont récoltées par une solution - 48 heures en MEM – SVF puis de trypsine, le nombre de cellules est 48 heures en MEM sevrage : déterminé par un compteur de cellules condition de sevrage. automatique. A partir de ces cellules, on (Remarque : dans cette partie, le milieu MEM de extrait les ARN messager que l’on analyse sevrage ne contient pas de rouge de phénol. Ce n’est pas le cas dans le reste de l’étude.) en RT-PCR quantitative en temps réel.
  • 10. MEM – SVF a été renouvelé e) Effet de substances agissant 24h puis les cellules ont été traitées 48h dans du MEM – sur la croissance et/ou l’apoptose SVF supplémenté de 1mM de Les cellules (MCF7 et BT-20) ont NaB ou 10µM de C2. été ensemencées à 5000 cellules par cm2 dans des boites de petri de 100mm de diamètre. Les cellules ont été laissées 48h f) RT-PCR quantitative en en MEM – SVF dans un incubateur (37°C, temps réel. 5% de CO2). A partir de cette étape, il faut différencier deux cas : La réaction est faite en une seule - Pour le test du FGF-2, ainsi que étape. Le mélange de réaction se compose le test conjoint du butyrate de dans chaque tube de : 50ng d’ADN total sodium (NaB) et du C2 avec le d’échantillon, MgCl2 : 6mM pour TrkA ; NGF, les cellules ont été lavées 3mM pour p75 ; 4mM pour NGF, 5 µl de 2 fois avec du PBS stérile (15 tampon TaqMan 10X (500mM KCl, 0,1 minutes puis 2 heures) et mises mM EDTA, 100 mM tris HCl, pH 8.3, 600 24h en MEM sevrage. Enfin, nM ROX qui est un dérivé de la rhodamine elles ont été traitées 48h dans du utilisé comme référence interne passive MEM sevrage supplémenté de pour normaliser la fluorescence), 20 U 1ng/ml de FGF-2, 0.5mM de d’ADN polymérase AmpliTaq Gold, 300 NaB, 2µM de C2, et/ou 200 µM de dATP, dCTP, dGTP, dUTP, 200 ng/ml de NGF. nM d’amorces sens et antisens et 200 nM - Concernant les test avec le C2 de sonde. ou le butyrate de sodium (NaB) en présence de sérum, le milieu
  • 11. La transcription inverse se fait Les cellules sont décolées par 200 pendant 30 min à 48°C. On active ensuite µl (pour une boite de pétri 100mm) de par chauffage l’AmpliTaq Gold 10 min à tampon de lyse (0.3% SDS, 1% β- 95°C. Puis on effectue 40 cycles dans les mercaptoéthanol, 0.5% Triton X100). Les conditions suivantes : 15 sec à 95°C cellules ainsi récupérées sont laissées 5 min (dénaturation) puis 90 sec à 60°C dans la glace, puis les protéines sont (hybridation + élongation). dissociées par ultrasons. On centrifuge 3 Les données recueillies sont min à 10000 tr/min, on dose le surnageant comparées à une courbe étalon amplifiée en spectrophotométrie (longueur d’onde : simultanément aux échantillons à partir 595nm), puis on stocke la solution de d’une quantité connue des ARN standard protéines à –20°C. respectifs. Une courbe d’amplification est Pour augmenter l’efficacité du réalisée par informatique (logiciel Abi- western, on réalise une Prism 7700) en rapportant l’intensité du immunoprécipitation au préalable avec les signal fluorescent au nombre de cycles de anticorps spécifiques de TrkA, p75 et NGF. PCR. La courbe étalon est basée sur une relation linéaire entre le logarithme de la quantité d’ARN standard de départ et le h) Test d’apoptose en Hoescht seuil significatif d’augmentation de la fluorescence ( = cycle de sortie). Nous avons réalisé les test d’apoptose dans des boites de pétri de 35mm de diamètre, dans lesquels sont g) Immunoprécipitation et déposées 3 lamelles de microscopie cottées analyse en Western blot au collagène. Les cellules y sont encemencées et traitées dans les mêmes conditions que décrites précédemment.
  • 12. A l’issue du traitement, on aspire le puis montées sur lames microscopiques millieu, les cellules sont fixées au méthanol avec du glycérol. à –20°C puis rincées 2 fois au PBS . On On lit les lames en microscopie à place ensuite les lamelles dans une solution fluorescence. L’observation de la de Hoescht, 15 min, à température morphologie des noyaux permet de ambiante et à l’abris de la lumière. Les déterminer la proportion de cellules en lamelles sont enfin rincées 2 fois au PBS apoptose. ________________________________________________________
  • 13. RESULTATS : de phénol, nous avons décidé d’utiliser en Les résultats obtenus se composent sevrage du MEM sans rouge de phénol. en 3 parties, chacune concernant Ceci nous donne 2 conditions standard l’expression du NGF et des ses récepteurs : extrêmes de culture : en condition favorable • dans différents types cellulaires de sein et en condition limitante. humain. L’objectif a été de collecter les • et leur évolution en fonction de la informations necessaires au choix d’un densité cellulaire. modèle expérimental pour la suite du travail. • sur des cellules traitées par des facteurs agissant sur la prolifération ou l’apoptose. a) Expression du gène p75. La fig. 1A présente le résultat en 1) Expression du NGF et de ses RT-PCR quantitative du niveau d’expression des ARN messagers de p75. récepteurs (TrkA et p75) dans les Les types cellulaires sont classées de la lignées de cancer du sein et sur les façon suivante : d’abord les cellules cellules normales. normales, puis les lignées cancéreuses par ordre décroissant d’hormonodépendance. Cette étude regroupe toutes les On observe pour la majorité des lignées décrites dans « matériel et types cellulaires une expression de p75 méthodes ». Les cellules ont été cultivées significativement plus importante sans SVF. dans des conditions d’étude standard : en Il y a une exception néanmoins : la lignée MEM – SVF ou en MEM sevrage. Compte tenu de l’activité oestrogénique du rouge
  • 14. MCF-7 exprime de façon égale ce gène MDA-MB-231, MDA-MB-453 et MDA- dans les conditions de sérum et de sevrage. MB-468. Dans le cas des lignées BT-20 et Ce sont dans les lignées MCF-7, T47-D, TrkA est largement plus exprimé T47-D et BT-20 que l’expression du gène dans les cultures avec du sérum. p75 est la plus importante. Elle est par L’expression de TrkA est la plus contre particulièrement faible dans les faible dans les cellules normales, les MCF- cellules normales, ainsi que dans les lignées 7, les MDA-MB-231 et les MDA-MB-453. SKBr3, MDA-MB-453 et MDA-MB-468. c) Expression du gène du b) Expression du gène TrkA. NGF. Les résultats sont présentés dans la Les résultats ne sont pas présentés fig. 1B. car l’expression est nulle ou suffisamment On observe dans la plupart des faible pour ne pas être détectable en PCR, types cellulaires une expression équivalente même après 40 cycles, et ce, dans chacune de TrkA dans les conditions de sérum et de des conditions précédentes et pour chaque sevrage. Cela concerne les cellules type cellulaire testé. normales, ainsi que les MCF-7, SKBr3,
  • 16. représente le début de la phase plateau avec 2) Variation de l’expression du 270000 cellules. Ce travail présente l’expression des NGF et de ses récepteurs (TrkA et ARN messagers des étudiés. p75) en fonction de l’inhibition de contact. Le résultat de cette étude est présenté dans la fig. 2A pour p75 et fig. 2B pour TrkA. Comme dans l’étude Cette étude a été réalisée sur la précédente, l’expression du NGF a été testé lignée cancéreuse MCF-7. et il n’est pas exprimé de façon mesurable. L’encemencement s’est fait à 50000 On observe une expression cellules par boites. Le jour 1 correspond à relativement forte des 2 récepteurs du NGF la phase « lag » avec 71600 cellules par lors de la phase d’adhérence. Par la suite, boites. Les jours 2 et 3 composent la phase cette expression diminue progressivement « log » avec respectivement 104000 et jusqu’à la phase de plateau. 181000 cellules par boites. Enfin, le jour 4
  • 18. 3) Variation de l’expression du MEM – SVF, ou après un traitement par le FGF-2 en condition de sevrage. Suite aux NGF et de ses récepteurs (TrkA et résultats de cette étude qui montre une p75) en fonction de substances réponse parfaitement identique dans les 2 agissant sur la croissance et/ou lignées, nous avons continué le travail sur l’apoptose. la seule lignée MCF-7. Nous avons ensuite étudié en détail l’effet conjoint du NaB ou du C2 avec le Cette étude a été commencé sur NGF. deux lignées cellulaires (MCF-7 et BT-20) Cette 3ème partie comprend des tests choisies comme modèle d’étude au vue des d’apoptose en Hoescht, des tests de RT- résultats précédents. Nous avons défini PCR quantitative sur les gènes TrkA et p75 l’expression de TrkA et p75 (NGF n’étant qui sont confirmés par Western blot. pas exprimé, comme précédemment) après un traitement par le C2 ou le NaB en milieu
  • 19.
  • 20. DISCUSSION ET CONCLUSION: Les résultats de cette étude montrent comment évolue la sensibilité des cellules épithéliales mammaires humaines pour le NGF. Il a fallu tout d’abord choisir le modèle expérimental de l’étude. Nous avons pour cela comparé le niveau d’expression du NGF et de ses récepteurs (TrkA et p75) dans les différentes cellules usuelles d’étude du cancer du sein. Le profil obtenu, tant pour p75 que pour TrkA, a montré des divergences de comportement entre les différents types cellulaires. Nous avons donc choisi deux lignées : MCF7 qui est typiquement la lignée prototype des études sur le cancer du sein ; et BT-20 dont le comportement semble (au vu de cette étude préalable) différent de MCF7 et qui a l’avantage d’avoir un niveau d’expression assez élevé pour les gènes de notre étude. Par la suite, en constatant que la réponse de ces deux lignées aux traitements, aussi bien sur la plan de la croissance que de l’expression des gènes, était identique, nous avons fini l’étude sur la seule lignée MCF-7. Tout d’abord, les cellules épithéliales mammaires humaines (aussi bien les cellules normales que les cellules cancéreuses) ne produisent pas le NGF. L’hypothèse de la voie de régulation autocrine s’avère donc non fondée. Nous avons largement observé l’expression des deux récepteurs du NGF (TrkA et p75) en conditions routinière ainsi que son évolution suite à un traitement par des molécules agissant sur la prolifération ou/et sur l’apoptose. Grâce à la technique de RT-PCR quantitative, nous n’avons pas constaté de différence d’expression des récepteurs TrkA et p75 suite à un traitement de 48h avec du FGF-2 ou du C2. Nous avons par contre observé une expression de p75 de l’ordre de trois fois celle du contrôle en cas de traitement 48h avec du NaB. Avec ce
  • 21. même traitement, TrkA ……… Ceci a pu être vérifié dans deux lignées différentes (MCF-7 et BT-20), avec un profil de réponse au traitement parfaitement identique.
  • 22. BIBLIOGRAPHIE : Descamps et al. (1998) J. Biol. Chem. 273 : 16659-62.
  • 23. REMERCIMENTS : Je remercie chaleureusement le Professeur H. Hondermarck et le Docteur J.P. Peyrat pour m’avoir laissé beaucoup de liberté dans l’organisation de mon travail tout en me faisant bénéficier d’un encadrement régulier et de qualité. Un grand merci au Professeur B. Boilly pour l’interret constant qu’il a porté à mon travail et pour m’avoir généreusement fait profiter de son expérience. Je remercie tout particulièrement Simon Descamps pour sa patience et sa disponibilité à mon égard. Merci aux Docteurs X. Dong-Lebouhris et Y. El Yazidi pour leur bonne humeur et leur gentillesse. Je me dois aussi de ne pas oublier tous ceux sans qui mon travail n’aurait pas pu être aussi enrichissant : Pr Victor Nurcombe, Dr Patrice Richard, Dr. Louis Hornez, Dr. Françoise Révillon, Valérie C., Valérie P., Anne-Sophie, Rachel, Sylviane, Isabelle, Marie-Michelle, Laurent, Robert-Alain, David V., David L., Johan, Alain, Arnaud,… Une pensée émue enfin, avec l’espoir sincère d’une rapide guérison, pour Anthony, je te souhaite tous mes vœux pour une longue carrière dans la recherche quand ta maladie sera passée.