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Abril 2016
TÉCNICAS DE MODIFICACIÓN GENETICA
Y PURIFICACIÓN DE PROTEINAS RECOMBINANTES
2
Contenido
I. Objetivo de la presentación
II. ADN y Mutaciones
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
IV. Técnicas de Manipulación Genética
V. Técnicas de Purificación
VI. Aplicaciones
• Dar a conocer los principales métodos de Modificación Genética en
Bacterias y otros organismos, así como dar los fundamentos de las
técnicas de purificación de Proteínas Recombinantes.
I. Objetivo
II. ADN
ADN: ácido nucleico que
contiene las instrucciones
genéticas usadas en el
desarrollo y
funcionamiento de todos
los organismos vivos
conocidos y algunos
virus, y es responsable de
su transmisión hereditaria
II. ADN
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
DNA polimerasa RNA Polimerasa “Priones”
Neomicina y Ribosomas
II. ADN
2 Purinas
2 Pirimidinas
II. ADN
II. ADN
II. ADN
Mutaciones Génicas
 GEN: unidad de información en un locus de Ácido desoxirribonucleico
(ADN) que codifica un producto funcional, o Ácido ribonucleico (ARN)
o proteínas y es la unidad de herencia molecular
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
 El genoma humano presenta una
densidad de genes muy inferior a
la que inicialmente se había
predicho, con sólo en torno al 1.5
% de su longitud compuesta por
exones codificantes de proteínas
 GENES HUMANOS: 25,000
(Proyecto Genoma Humano
esperaba más de 100,000 genes)
 Del genoma humano solo 1–2%
consistan de genes codificantes
de proteínas
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
Especie
Tamaño del
genoma (Mb)
Número
de genes
Candidatus Carsonella ruddii 0.15 182
Streptococcus pneumoniae 2.2 2300
Escherichia coli 4.6 4400
Saccharomyces cerevisiae 12 5800
Caenorhabditis elegans
(nemátodo)
97 19000
Arabidopsis thaliana 125 25500
Drosophila melanogaster
(mosca)
180 13700
Oryza sativa (arroz) 466 45 000-55 000
Mus musculus (ratón) 2500 29 000
Homo sapiens (ser humano) 2900 27 000
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
 El genotipo se refiere a
la información genética
que posee un
organismo en particular,
en forma de ADN.
 El fenotipo se refiere a
la expresión del
genotipo más la
influencia del medio.
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
Interacción
con el
Medio
Ambiente
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
Interacción
con el
Medio
Ambiente
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
III. Gen, Cromatina y Cromosomas
IV. Técnicas de Manipulación Genética
VECTOR DE CLONACIÓN es el vehículo que transporta un gen
dentro
de la célula receptora y es responsable de su replicación.
CARACTERÍSTICAS ESENCIALES
• Replicación en Célula Receptora.
• Agentes o Genes de Selección.
• Secuencias de Restricción
IV. Técnicas de Manipulación Genética
ENZIMAS DE RESTRICCIÓN O
ENDONUCLEASAS
• Enzimas que catalizan la ruptura de
enlaces fosfodiéster en diferentes
regiones ubicadas en el interior de una
cadena polinucleotídica
• La secuencia de nucleótidos reconocida
para escisión por una enzima de
restricción se denomina sitio de
restricción
• Típicamente un sitio de restricción es una
secuencia palindrómica de entre cuatro a
seis nucleótidos de extensión
IV. Técnicas de Manipulación Genética
IV. Técnicas de Manipulación Genética
Ejemplos de Vectores:
1. Plásmidos
2. PAC (Fago P1)
3. BAC (bacterial)
4. YAC (yeast artificial
cromosome)
5. Bacteriofago Lamda
o Virus
6. Cósmidos
7. Fagémidos (ADN
monocatenario OR Fago F1
8. HAC (human)
IV. Técnicas de Manipulación Genética
Diferentes sitios para la enzima de restricción. Ayuda en la
selección de Cepas Transformadas
IV. Técnicas de Manipulación Genética
YACS
BAC
Originado del Factor F que genera
los procesos de fertilidad de E. Coli
Puede integrarse en el cromosoma
bacteriano o liberarse
Altamente estable
Bajo Quimerismo (dos copias
diferentes del mismo gen o
cromosoma)
IV. Técnicas de Manipulación Genética
YACS
YAC
Región Centromérica (Cromosoma 4
de S. cerevisae)
Función: Unión al Huso mitótico
Región Telomérica (Tetrahymena)
Función: Estabilidad del Cromosoma
Gen de Selección
Región de Clonación
IV. Técnicas de Manipulación Genética
Bacteriófago Lambda
IV. Técnicas de Manipulación Genética
CÓSMIDOS
Plásmidos con borde
cohesivo procedente del
genoma del Fago lambda
(COS)
TRANSFORMACIÓN: Introducción del ADN en la Célula Huésped
IV. Técnicas de Manipulación Genética
Choque Térmico.
• Cl₂Ca a 0ºC para afectar la pared celular
• El DNA se adhiere a sitios accesibles de la pared.
• Choque térmico a 42ºC favorece la incorporación del
DNA.
Electroporación.
• Acción de un breve pulso eléctrico,
• Permeabiliza células procariotas como eucariotas
• Se forman poros
• Entrada de moléculas de ADN grandes y
partículas víricas.
Lipofección.
• Uso de liposomas capaces de unirse a la
superficie celular
• Se utiliza con células de mamífero
• El DNA transferido no se integra en el genoma
IV. Técnicas de Manipulación Genética
Microinyección.
• Equipos especializados
Biobalística.
• Microproyectiles a velocidad supersónica
• Macroproyectil, de polietileno, y son impulsados
por una descarga o explosión de gas.
• El gas (helio) recubre las células o tejido a
bombardear se retira con una bomba de vacío ya
que provoca
Fusión de protoplastos.
• Mezcla directa de protoplastos bacterianos con
alto número de copias de un plásmido.
• Fusión de las membranas en presencia de PEG,
• Es posible que se den fusiones múltiples entre
líneas que sean naturalmente incapaces de
conjugar.
• Se obtienen células híbridas viables, capaces de
dividirse y de formar colonias.
IV. Técnicas de Manipulación Genética
IV. Técnicas de Manipulación Genética
IV. Técnicas de Manipulación Genética
PCR
Polimerase
Chain
Reaction
IV. Técnicas de Manipulación Genética
V. Técnicas de Purificación
CONSIDERACIONES PARA LA PURIFICACIÓN DE
PROTEÍNAS:
1. Definir un ensayo específico que identifique a la proteína
(actividad biológica) (específico, sensible, rápido y barato)
2. Matriz Biológica
3. Proteínas intraceluares o extracelulares
4. Estabilidad de la molécula
5. Aislamiento y concentración (fraccionamiento)
6. Pureza y calidad del producto final requerido
V. Técnicas de Purificación
ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS
V. Técnicas de Purificación
TIPOS DE PURIFICACIÓN
1. Precipitación o Centrifugación
i. Precipitación
ii. Diálisis y Ultrafiltración
iii. Centrifugación por Gradientes
iv. Centrifugación Diferencial
2. Cromatográficos:
a) Exclusión Molecular
b) Intercambio Iónico
c) Cromatografía Hidrofóbica
d) Cromatografía de Afinidad
3. Electroforéticos
 Nativa-PAGE
 SDS-PAGE
 Isoeléctrico
V. Técnicas de Purificación
Precipitación (“Salting in Salting out”)
Basado en la alteración de la
Solubilidad de las Proteínas en
presencia de Soluciones saturadas de
sales.
V. Técnicas de Purificación
Diálisis y Ultrafiltración
Separar las moléculas en
una solución por la
diferencia en sus índices de
difusión o presión osmótica
a través de una membrana
semipermeable
Normalmente el objetivo es
la remoción de sales o
partículas muy pequeñas,
separándolas de las
macromoléculas.
V. Técnicas de Purificación
Centrifugación Diferencial y por Gradientes
Basado en el peso molecular de las
proteínas.
V. Técnicas de Purificación
EXCLUSIÓN MOLECULAR
Las separaciones
cromatográficas se basan en
las diferencias de carga,
tamaño o afinidad de las
diferentes proteínas
Cada proteína migrará a distinta
velocidad según su grado de
afinidad por la fase estacionaria
V. Técnicas de Purificación
INTERCAMBIO IÓNICO Y CROMATOGRAFÍA HIDROFÓBICA
V. Técnicas de Purificación
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V. Técnicas de Purificación
ELECTROFORESIS
V. Técnicas de Purificación
ELECTROFORESIS
V. Técnicas de Purificación
ELECTROFORESIS ENFOQUE
ISOELÉCTRICO
• Esta técnica se utiliza para separar a las
moléculas por las diferencias en sus cargas
eléctricas
• Se genera un gradiente de pH basado en el punto
isoeléctrico de las moléculas
• El punto isoeléctrico se refiere al pH en donde la
molécula no posee una carga
VI. Aplicaciones
ADN Recombinante
(Plásmidos)
VI. Aplicaciones
VI. Aplicaciones
VI. Aplicaciones
Gracias
QFB. Nazul Edmundo Becerril López
: nbecerril@cofepris.gob.mx

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Tecnicas de Modificación Genética y Purificación de Proteínas Recombinantes

  • 1. Abril 2016 TÉCNICAS DE MODIFICACIÓN GENETICA Y PURIFICACIÓN DE PROTEINAS RECOMBINANTES
  • 2. 2 Contenido I. Objetivo de la presentación II. ADN y Mutaciones III. Gen, Cromatina y Cromosomas IV. Técnicas de Manipulación Genética V. Técnicas de Purificación VI. Aplicaciones
  • 3. • Dar a conocer los principales métodos de Modificación Genética en Bacterias y otros organismos, así como dar los fundamentos de las técnicas de purificación de Proteínas Recombinantes. I. Objetivo
  • 4. II. ADN ADN: ácido nucleico que contiene las instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su transmisión hereditaria
  • 5. II. ADN DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR DNA polimerasa RNA Polimerasa “Priones” Neomicina y Ribosomas
  • 6. II. ADN 2 Purinas 2 Pirimidinas
  • 10.  GEN: unidad de información en un locus de Ácido desoxirribonucleico (ADN) que codifica un producto funcional, o Ácido ribonucleico (ARN) o proteínas y es la unidad de herencia molecular III. Gen, Cromatina y Cromosomas
  • 11.  El genoma humano presenta una densidad de genes muy inferior a la que inicialmente se había predicho, con sólo en torno al 1.5 % de su longitud compuesta por exones codificantes de proteínas  GENES HUMANOS: 25,000 (Proyecto Genoma Humano esperaba más de 100,000 genes)  Del genoma humano solo 1–2% consistan de genes codificantes de proteínas III. Gen, Cromatina y Cromosomas
  • 12. III. Gen, Cromatina y Cromosomas Especie Tamaño del genoma (Mb) Número de genes Candidatus Carsonella ruddii 0.15 182 Streptococcus pneumoniae 2.2 2300 Escherichia coli 4.6 4400 Saccharomyces cerevisiae 12 5800 Caenorhabditis elegans (nemátodo) 97 19000 Arabidopsis thaliana 125 25500 Drosophila melanogaster (mosca) 180 13700 Oryza sativa (arroz) 466 45 000-55 000 Mus musculus (ratón) 2500 29 000 Homo sapiens (ser humano) 2900 27 000
  • 13. III. Gen, Cromatina y Cromosomas  El genotipo se refiere a la información genética que posee un organismo en particular, en forma de ADN.  El fenotipo se refiere a la expresión del genotipo más la influencia del medio.
  • 14. III. Gen, Cromatina y Cromosomas Interacción con el Medio Ambiente
  • 15. III. Gen, Cromatina y Cromosomas Interacción con el Medio Ambiente
  • 16. III. Gen, Cromatina y Cromosomas
  • 17. III. Gen, Cromatina y Cromosomas
  • 18. IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 19. VECTOR DE CLONACIÓN es el vehículo que transporta un gen dentro de la célula receptora y es responsable de su replicación. CARACTERÍSTICAS ESENCIALES • Replicación en Célula Receptora. • Agentes o Genes de Selección. • Secuencias de Restricción IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 20. ENZIMAS DE RESTRICCIÓN O ENDONUCLEASAS • Enzimas que catalizan la ruptura de enlaces fosfodiéster en diferentes regiones ubicadas en el interior de una cadena polinucleotídica • La secuencia de nucleótidos reconocida para escisión por una enzima de restricción se denomina sitio de restricción • Típicamente un sitio de restricción es una secuencia palindrómica de entre cuatro a seis nucleótidos de extensión IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 21. IV. Técnicas de Manipulación Genética Ejemplos de Vectores: 1. Plásmidos 2. PAC (Fago P1) 3. BAC (bacterial) 4. YAC (yeast artificial cromosome) 5. Bacteriofago Lamda o Virus 6. Cósmidos 7. Fagémidos (ADN monocatenario OR Fago F1 8. HAC (human)
  • 22. IV. Técnicas de Manipulación Genética Diferentes sitios para la enzima de restricción. Ayuda en la selección de Cepas Transformadas
  • 23. IV. Técnicas de Manipulación Genética YACS BAC Originado del Factor F que genera los procesos de fertilidad de E. Coli Puede integrarse en el cromosoma bacteriano o liberarse Altamente estable Bajo Quimerismo (dos copias diferentes del mismo gen o cromosoma)
  • 24. IV. Técnicas de Manipulación Genética YACS YAC Región Centromérica (Cromosoma 4 de S. cerevisae) Función: Unión al Huso mitótico Región Telomérica (Tetrahymena) Función: Estabilidad del Cromosoma Gen de Selección Región de Clonación
  • 25. IV. Técnicas de Manipulación Genética Bacteriófago Lambda
  • 26. IV. Técnicas de Manipulación Genética CÓSMIDOS Plásmidos con borde cohesivo procedente del genoma del Fago lambda (COS)
  • 27. TRANSFORMACIÓN: Introducción del ADN en la Célula Huésped IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 28. Choque Térmico. • Cl₂Ca a 0ºC para afectar la pared celular • El DNA se adhiere a sitios accesibles de la pared. • Choque térmico a 42ºC favorece la incorporación del DNA. Electroporación. • Acción de un breve pulso eléctrico, • Permeabiliza células procariotas como eucariotas • Se forman poros • Entrada de moléculas de ADN grandes y partículas víricas. Lipofección. • Uso de liposomas capaces de unirse a la superficie celular • Se utiliza con células de mamífero • El DNA transferido no se integra en el genoma IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 29. Microinyección. • Equipos especializados Biobalística. • Microproyectiles a velocidad supersónica • Macroproyectil, de polietileno, y son impulsados por una descarga o explosión de gas. • El gas (helio) recubre las células o tejido a bombardear se retira con una bomba de vacío ya que provoca Fusión de protoplastos. • Mezcla directa de protoplastos bacterianos con alto número de copias de un plásmido. • Fusión de las membranas en presencia de PEG, • Es posible que se den fusiones múltiples entre líneas que sean naturalmente incapaces de conjugar. • Se obtienen células híbridas viables, capaces de dividirse y de formar colonias. IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 30. IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 31. IV. Técnicas de Manipulación Genética PCR Polimerase Chain Reaction
  • 32. IV. Técnicas de Manipulación Genética
  • 33. V. Técnicas de Purificación CONSIDERACIONES PARA LA PURIFICACIÓN DE PROTEÍNAS: 1. Definir un ensayo específico que identifique a la proteína (actividad biológica) (específico, sensible, rápido y barato) 2. Matriz Biológica 3. Proteínas intraceluares o extracelulares 4. Estabilidad de la molécula 5. Aislamiento y concentración (fraccionamiento) 6. Pureza y calidad del producto final requerido
  • 34. V. Técnicas de Purificación ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS
  • 35. V. Técnicas de Purificación TIPOS DE PURIFICACIÓN 1. Precipitación o Centrifugación i. Precipitación ii. Diálisis y Ultrafiltración iii. Centrifugación por Gradientes iv. Centrifugación Diferencial 2. Cromatográficos: a) Exclusión Molecular b) Intercambio Iónico c) Cromatografía Hidrofóbica d) Cromatografía de Afinidad 3. Electroforéticos  Nativa-PAGE  SDS-PAGE  Isoeléctrico
  • 36. V. Técnicas de Purificación Precipitación (“Salting in Salting out”) Basado en la alteración de la Solubilidad de las Proteínas en presencia de Soluciones saturadas de sales.
  • 37. V. Técnicas de Purificación Diálisis y Ultrafiltración Separar las moléculas en una solución por la diferencia en sus índices de difusión o presión osmótica a través de una membrana semipermeable Normalmente el objetivo es la remoción de sales o partículas muy pequeñas, separándolas de las macromoléculas.
  • 38. V. Técnicas de Purificación Centrifugación Diferencial y por Gradientes Basado en el peso molecular de las proteínas.
  • 39. V. Técnicas de Purificación EXCLUSIÓN MOLECULAR Las separaciones cromatográficas se basan en las diferencias de carga, tamaño o afinidad de las diferentes proteínas Cada proteína migrará a distinta velocidad según su grado de afinidad por la fase estacionaria
  • 40. V. Técnicas de Purificación INTERCAMBIO IÓNICO Y CROMATOGRAFÍA HIDROFÓBICA
  • 41. V. Técnicas de Purificación CROMATOGRAFÍA DE AFINIDAD
  • 42. V. Técnicas de Purificación ELECTROFORESIS
  • 43. V. Técnicas de Purificación ELECTROFORESIS
  • 44. V. Técnicas de Purificación ELECTROFORESIS ENFOQUE ISOELÉCTRICO • Esta técnica se utiliza para separar a las moléculas por las diferencias en sus cargas eléctricas • Se genera un gradiente de pH basado en el punto isoeléctrico de las moléculas • El punto isoeléctrico se refiere al pH en donde la molécula no posee una carga
  • 49. Gracias QFB. Nazul Edmundo Becerril López : nbecerril@cofepris.gob.mx

Notas del editor

  1. Elaborar una ruta crítica que permita la coordinación y monitoreo del proyecto de construcción de la Planta de Birmex-Cuatitlánen estricto apego a la regulación en materia de Buenas Practicas de Fabricación garantizando la seguridad, eficacia y calidad de la vacuna formulada para su uso en la población. Producto: Vacuna trivalente de Influenza. Operaciones: Formulación, llenado y acondicionamiento Material precursor (inicial): Antígenos provenientes de la planta de Sanofi Pasteur (SP) ubicada en Ocoyoacac.