Carbon sequestration in agricultural soils: The “4 per mil” program presented by Hervé Saint Macary, Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement (CIRAD), Montpellier, France
6. INITIATIVE 4 PER 1 000
QUALITÉ
PHYSIQU
E
FERTILITÉ
ET
QUALITÉ
CHIMIQUE
Matière
organique
des sols
(mos)
> Today, agriculture releases 14 % of GHG
SOM
It is carbon (as in CO2)
The more carbon in
soils, the less in the
atmosphere
A LOW ENVIRONMENTAL FOOTPRINT
AGRICULTURE
8. AN INTERNATIONAL RESEARCH
PROGRAMME
> Mecanisms and potentials
> Cropping systems performances evaluation
> Appropriate policies
> Monitoring and verification
INITIATIVE4PER1000
4 ‰ INITIATIVE
TWO MAIN STRANDS OF ACTION
… and others : OSU, WUR, ARC…
9. A MULTIPARTNER PROGRAM OF ACTIONS
> Integration in the LPAA (Lima Paris Agenda
for Action)
> Encourage stakeholders to get involved in a
coordinated effort
> Official launch in Paris COP 21 on 1st
december
INITIATIVE4PER1000
4 ‰ INITIATIVE
TWO MAIN STRANDS OF ACTION
14. INITIATIVE4POUR1000
Another way of looking at the question
GPP
451 GtCO2 yr
Plant Resp
220 GtCO2 yr
Net Primary
Productivity
231 GtCO2 yr
Heterotrophic
Respiration
Exportations
194 GtCO2 yr
Net Ecosystem
Productivity
37 GtCO2 yr
Disturbance
(Fire, ..)
26,4 GtCO2 yr
Net Biome
Productivity
10,6 GtCO2 yr
15. Sorghum : a good model to improve Carbon sequestration
16. INITIATIVE4POUR1000
Another way of looking at the question
GPP
451 GtCO2 yr
Plant Resp
220 GtCO2 yr
Net Primary
Productivity
231 GtCO2 yr
Heterotrophic
Respiration
Exportations
194 GtCO2 yr
Net Ecosystem
Productivity
37 GtCO2 yr
Disturbance
(Fire, ..)
26,4 GtCO2 yr
Net Biome
Productivity
10,6 GtCO2 yr
Increase the
Gross Primary
Production (GPP)
17. Improve tolerance to heat, water stress,
nutrient deficit is a key to maximize Carbon
sequestration in the soil
Tin gene in Wheat : Shoot / root ratio
impacts on water uptkake efficiency and
drought tolerance
Optimize Productivity under biotic
and abiotic stress
18. Change annual crops to perennial : genes identification in grain sorghum
Ratoon sorghum : stay in the field over season + take advantage of early precipitations
Perennial plants : decrease management and soil disturbance . Optimize Carbon
sequestration !
Wild sorghum relatives are perennial (Sorghum propinqum) : understand genetic
determinism of perenniality and rhizome development
Washburn et al 2013 Molecular
breeding
Transcriptome sequencing of
rhizomes and aerial shoots of S
Propinquum (Zhang et al 2014)
19. Optimizing light interception : genetically optimizing leaf angle represents a
promising way to sustainably increase sorghum productivity (Truong et al 2015 Genetics)
K= Light extinction
coefficient
Small K => less PAR
intercepted by Upper
leaves and more PAR
available at lower
levels of canopy
Dwarf3 gene affects Leaf Angle, it
encodes a P-Glycoprotein, that regulates
polar auxin transport
A potential tool to monitor leaf angle in
Sorghum breeding
20. INITIATIVE4POUR1000
Another way of looking at the question
GPP
451 GtCO2 yr
Plant Resp
220 GtCO2 yr
Net Primary
Productivity
231 GtCO2 yr
Heterotrophic
Respiration
Exportations
194 GtCO2 yr
Net Ecosystem
Productivity
37 GtCO2 yr
Disturbance
(Fire, ..)
26,4 GtCO2 yr
Net Biome
Productivity
10,6 GtCO2 yr
Reduce respiration
21. Sorry…no obvious gains demonstrated until now
Reduce / optimize plant respiration
(C02 production)
22. INITIATIVE4POUR1000
Another way of looking at the question
GPP
451 GtCO2 yr
Plant Resp
220 GtCO2 yr
Net Primary
Productivity
231 GtCO2 yr
Heterotrophic
Respiration
Exportations
194 GtCO2 yr
Net Ecosystem
Productivity
37 GtCO2 yr
Disturbance
(Fire, ..)
26,4 GtCO2 yr
Net Biome
Productivity
10,6 GtCO2 yr
Modify ratios :
- Shoot / root
Monitor :
- Soil & Rhizosphere
23. Allocation of C to the root systems : Impacts on Soil C
sequestration
• Soil deposition of C through allocation to deep roots=> long term
C sequestration (Direct positive effect)
• C loss through root exudates boosts soil respiration and
negatively affects both C sequestration (…but soil improvement
has to be taken into account)
=> Need to unravel the genes involved in carbon partitioning and
exudation
Control the Shoot-Root ratio
24. SOIL FUNCTIONS MONITORING:
THE METAGENOMICS PROCESS
DETERMINEWHO ISTHERE
(Sequence-based metagenomics)
• Identify organisms, genes and metabolic pathways
• Compare to other communities
• Compare treatments and cultural practices
DETERMINEWHATTHEY ARE DOING
(Function-based metagenomics)
• Screen to identify functions of interest,
such as nitrate reduction, or carbone fixation
• Find the genes that code to functions of interests
Extract all DNA
from microbial
community in
sampled
environment
DNA sequencing
25. INITIATIVE4POUR1000
Another way of looking at the question
GPP
451 GtCO2 yr
Plant Resp
220 GtCO2 yr
Net Primary
Productivity
231 GtCO2 yr
Heterotrophic
Respiration
Exportations
194 GtCO2 yr
Net Ecosystem
Productivity
37 GtCO2 yr
Disturbance
(Fire, ..)
26,4 GtCO2 yr
Net Biome
Productivity
10,6 GtCO2 yr
Monitor
plant quality
26. Sorghum for biofuels : increasing cell wall digestibility, and
reducing lignin in the aboveground biomass are favorable traits
But reduced recalcitrance is not an advantage for C sequestration
The more recalcitrant the soil organic C, the longer it will escape
to microbial respiration and reentry in atmosphere
=> Need to be able to modulate C allocation, and C use
differentially to roots and stem
Monitor biomass
quality
27. Optimization of the plant compartment through biotechnologies :
The targets
Reduce plant
respiration Modify Shoot-
Root ratio
Biochar
Productivity
under biotic and
abiotic stress
Optimize their use as
bioenergy / biomaterials
Increase Plant
Photosynthetic
efficiency
Increase Phytoliths
Monitor biomass quality
Perenniality / optimize
plant to new crop
management
Ecosystemic services :
reduce soil erosion
28. With Soil Organic Matter increase, food
security and combating climate change
(adaptation + mitigation) are
complementary
http://www.4p1000.org/
Agriculture is already part of the solution :
local agroecological practices, public
policies, funding mechanisms
Biotechnologies will help
INITIATIVE4PER1000
4 ‰ INITIATIVE
i)
A large adaptability : 38°South to 52° North
Used in subsahelian regions and temperate ones
A pilar crop for food security in subsahenelian regions
Used for feed, food and bioenergy / biomaterial in developped countries
Integrated in different crop system : dedicated, relay cropping, associations…
A good model for north and south comparisons , crop managment optimization..
ii) Sorghum is used in a variety of applications : food, feed and non-food-non-feed applications including energy, biomaterials
iii) Sorghum has a C4 photosynthesis (efficient at high temperature, no photorespiration, lower photoinhibition), Sorghum is drought tolerant, it has a deep root system
iv) A large genetic and phenotypic variability exists ensuring large genetic gains for different end-products developemnt
Its genome is relatively simple compared to maize, miscanthus and other cereals crops
v) Sorghum is sometimes cropped as ratoon over seasons and close relatives are perenial offering the opportunity to develop perenial sorghum
Vi) And analysis of sorghum roots and soil microbiome have been initiated and are showing that there is a genotype effect on the advanatges provided by the soil microbiome
Une autre voie pour optimiser la séquestration du C dans le sol est la maximiser la production végétale en condition de stress biotique et abuiotique.
La tolérance au stress biotique et abiotique est depuis toujours une cible de l’amélioration des plantes et de nombreux gènes on déjà été identifié.
Nous reprenons ici l’exemple du gène d’inhibition du tallage chez le blé (Tin) dont nous avons parlé précédemment
Dans le graphique du haut à droite, Bank- correspond au gène non muté et Banks ++ au génotype muté au niveau de Tin.
On remarque que le géntoype muté qui a un rapport root/shoot plus élevé économise plus d’eau : il a plus d’eau disponible que l’autre génotype
Cela se traduit aussi dans le profil de disponibilité en eau : le génotype ayant un rapport root/shoot plus élevé maintient plus d’eau dans les couches superficielles du sol que le génotype sauvage.
El sorgho est une espèce intéressante dans ce contexte :
D’une part, des variétés de sorgho cultivés appelées rattoon sont de façon traditionnelle
Exemple 1 : l’optimisation de l’interception de la lumière chez le sorgho via l’exploitation de la diversité naturelle
Chez le sorgho il existe une variabilité naturelle pour l’angle des feuilles (photo : 2 genotypes avec différentes orientations foliaires)
Ces génotypes ont des capacités d’interception de la lumière différente qui se traduit par un coefficient d’extinction de la lumière différentes => les génotypes ayant les feuilles les plus érigés ont plus de lumière qui pénètrent dans les étages inférieurs (K plus petit) => photo + graph de droite
Les régions du génome contrôlant l’angle d’insertion ont été détectées dans 2 populations de cartographie différentes.
Une région expliquant la majeure partie de la variabilité a été identifiée, elle correspond au gène Dw3 (gène de nanisme)
En ce qui concerne l’optimisation de la respiration des plantes (réduction du CO2 émis), même si elle constitue un but évident pour optimiser la séquestration du C dans le sol, il y a peu de résultat probant montrant que l’on peut la manipuler
Une des clés pour optimiser la séquestration du C dans le sol est la modification du rapport Tige / racine.
La modification de ce ratio va entrainer
La déposition de C en profondeur dans le sol via le développement de systèmes racinaires profond ce qui est un caractère favorable
La perte de C via l’exudation et une augmentation de la respiration du microbiome du sol (cela peut entrainer une réduction de la biomasse produite et une diminution de la séquestration de C). Néanmoins l’exudation est aussi favorable au développement de communauté microbienne qui sont garante d’une sol riche et vivant et donc apte à stocker du C organique
Dans ce contexte l’identification des gènes impliqués dans la force de puits des racines / l’allocation de C aux différents organes et dans l’exudation es crucial
Au niveau des plantes
Différentes cibles ont été identifiées
Le premier est d’améliorer l’efficacité photosynthétique des plantes : améliorer leur captage de CO2 et leur capacité à accumuler du Carbone organique
Ensuite on peut mentionner :
La réduction de la respiration des plantes (leur émission de CO2 via la respiration)
Modifier le ratio Tige / Racine
Augmenter le rendement en condition de stress biotique et abiotique
Améliorer la qualité de la biomasse : non seulement au niveau aérien pour améliorer l’utilisation des organes (alimentation, industrie) mais aussi au niveau racinaire (pour maximiser le stockahe du C sous une forme qui est le moins possible dégradable)
Une piste concerne aussi l’optimisation du stcockage du C sous la forme Phytolith
L’utilisation de la pérennisation des espèces est aussi une piste importante, il serait notamment possible de développer des espèces céréalières pérennes
Les 3 derniers points ne sont pas à proprement parler des cibles d’amélioration, mais elles constituent des bénéfices entrevus via la maiximization de l’utilisation des plantes sous différentes formes :
- la culture de plante ayant des systèmes racinaires profiond et faviorisant un sol vivant et riche (microbiome) réduit l’érosion du sol et son lessivage
- l’utilisation du Biochar (charbon de plantes obtenu via torrefaction) a des bénéfices pour la vie des sols et constitue un puits de C
- le développement global de l’utilisation des plantes dans un contexte de bioéconomie est pertinent car on va augmenter les surfaces travaillées (colonisation de sols marginaux de préférence) ce qui augmente donc la séquestration du C