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Linux day 2021 Analisi Open Source dei dati pandemici

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  6. 6. Lo scenario precedente l’insediamento della struttura Commissariale mostrava una situazione iniziale in cui tutti i flussi informativi erano disgregati e di difficile accesso, in particolare: -Il dipartimento di prevenzione non riusciva nell’intento di accentrare le informazioni delle U.S.C.A. e di rispondere in tempo all’avanzare dell’andamento epidemiologico; -Le U.S.C.A non avevano procedure univoche con conseguenti difficoltà nelle comunicazioni tra il territorio e con il dipartimento di prevenzione -I laboratori di analisi operavano in maniera disgregata con una scarsa capacità di distribuzione dei carichi di lavoro che generava delle latenze di refertazione spesso notevoli -La mancanza di un unico software di gestione comportava la raccolta e l’invio di segnalazione dei nuovi positivi e/o contatti unicamente su supporto cartaceo e la carenza di sistemi di caricamento massivi dei dati epidemiologici raccolti e delle attività svolte sul territorio comportava ritardi e missing nel caricamento dei portali ministeriali e regionali Tali condizioni ovviamente rendevano difficile se non impossibile le analisi sull’impatto e sullo stato del virus nel territorio Da dove siamo partiti…
  7. 7. I padiglioni 16/20 della Fiera del Mediterraneo A dicembre 2020, su intuizione del Commissario Costa, venne costituita la Struttura Commissariale presso il pad 16 della Fiera del Mediterraneo dove vennero centralizzate le figure delle U.S.C.A. della città di Palermo e del dipartimento di prevenzione. Tra le varie attività di potenziamento, si annovera, tra l’altro: -L’ ottimizzazione e potenziamento servizi Fiera Drive-In ed istituzione Centrale Operativa CoVid. -Il monitoraggio, studio e gestione flussi laboratori molecolari. - La gestione dei servizi USCA, Interfaccia con Centralino Regionale e Aziendale, Comunicazione con i Medici Curanti. -Il caricamento ed allineamento dati con Istituto Superiore di Sanità. -Il controllo e verifica dei monitoraggi dei pazienti in carico. -La strutturazione unità statistiche e raccolta dati. -Lo studio e follow-up sul gestionale ASP e integrazione e valutazione altri software di gestione.
  8. 8. C B A - Rilevazione dei tamponi rapidi - Calcolo dei nuovi posi ti vi - Calcolo dell’incidenza cumula ti va D - Calcolo della prevalenza E - Rilevazione del tasso di ospedalizzazione F - Confronto dei dataset e sta ti s ti che ponderate G - Analisi dinamiche su serie storiche Alcune rilevazioni effettuate sul territorio
  9. 9. misura la proporzione di "eventi" presenti in una popolazione in un dato momento PREVALENZA rappresenta la proporzione di individui che vengono colpiti dalla malattia in un determinato periodo di tempo . INCIDENZA 38% 74% A B Incidenza e Prevalenza
  10. 10. Da quando abbiamo iniziato, sono sta ti fa tti passi da gigante nella rilevazione dei da ti pandemici, ma ancora molte operazioni sono ridondan ti e complesse e meritano ulteriori approfondimen ti . Più speci fi catamente i prossimi obie tti vi che ci siamo pre fi ssa ti riguardano: -implementazione di tu tti i task del so ft ware ges ti onale -miglioramento con ti nuo dei sistemi di data cleaning e qualità oltre alla sensibilizzazione a tu tti gli operatori che operano sui sistemi a cercare di raggiungere la completezza dei da ti -rendere i da ti aggrega ti di pubblico dominio e con rappresentazioni cristalline e di facile interpretazione per non ingenerare s fi ducia nelle informazioni che forniamo -Allineamento di tu tt e le fon ti da ti -Creare una procedura esportabile ad altri ambi ti sanitari al fi ne di sfru tt are l’esperienza della fi era come modello di un nuovo conce tt o di medicina, più vicina alle reali esigenze del paziente e di ausilio ai medici che, a tt raverso l’immediatezza delle informazioni e strumen ti predi tti vi basa ti sulle serie storiche, possano intervenire con maggiore accuratezza e in tempi rido tti . Dove vogliamo arrivare
  11. 11. 21 • Management • Team Leader • Quality Manager • Web Architect • Healthcare IT Consultant • UX Expert General O.S. • PHP • Javascript • ASP • MySQL HTML, CSS3 • Ruby, Rails • Python Developer • Ubuntu, CentOS • Mac OSX • Windows • IOS - Android • Embedded OS • Raspai, Pidora Classe 1971- Cresciuto tra coin up, Super Santos e libri, nell’estate del 1986 mi regalano un COMMODORE 64 che cambia la mia vita. Un nerd prestato all’imprenditoria (ed alla PA!)
  12. 12. Analisi dei processi e piccoli cambiamenti per adeguarli alle norme e alle Best Practices Miglioramento dei processi Obiettivo: trovare degli strumenti che permettessero di accelerare i tempi delle analisi per il monitoraggio Cambio tecnologico 38% Analisi iniziale
  13. 13. IL GDPR è un regolamento dell'Unione europea in materia di trattamento dei dati personali e di privacy, entrato in vigore nel 05/2018. La Commissione europea si propone di rafforzare e rendere omogenea la protezione dei dati personali sia dentro che fuori i confini UE Viene restituito ai cittadini il controllo dei propri dati personali, semplificando il contesto normativo unificando la norma privacy dentro l'UE. General Data Protection Regulation
  14. 14. ISO 27001- Sistema di gestione della sicurezza delle informazioni Lo standard  ISO/IEC 27001  è una norma internazionale certificabile che definisce i  requisiti per un Sistema di Gestione della Sicurezza delle Informazioni ed è progettata per garantire la selezione di controlli di sicurezza adeguati e proporzionati. Concetto di informazione con relativa valorizzazione Efficacia delle contromisure adottate per trattare i rischi. Aspetto organizzativo (non solo tecnologico) della Sicurezza delle Informazioni
  15. 15. C B A Esplorazione dei dati Elaborazione dei dati Rappresentazione dei dati A B C Workflow nella elaborazione dei dati
  16. 16. Dai dati alla conoscenza Informazioni Dati Cooscenza
  17. 17. Software utilizzabili
  18. 18. VisiData è un fantastico strumento open source per esplorare  e  manipolare dati. Mette insieme la chiarezza di un foglio di calcolo, con l'efficienza del terminale  e  la potenza di Python, in una utility leggera in grado di gestire milioni di righe con facilità Il coltellino svizzero dei dati
  19. 19. Open Source e disponibile per diversi Sistemi Operativi Open Source Utilizza CSV tramite shell Velocità e Potenza In Visidata possibile utilizzare espressioni e librerie Python Librerie Python Si possono registrare macro per utilizzarli dopo come script Generazione Script 05 04 E’ possibile gestire diversi foglie aprendo diversi files o come selezione dei altro foglio aperto Multifogli L’uso di espressioni regolari permette di effettuare facilmente ricerche e analisi Utilizzo delle RegEx 06 03 01 02
  20. 20. l'Istituto superiore di Sanità cambia licenza il ministero salute cambia licenza Basta PDF scansione dal comitato tecnico scientifico Gli open data assurdi del portale PNRR Open Data Sicilia e A. Borruso
  21. 21. La vera cultura open! Robert o Baggio Andre a Borruso Daniele
 Mondello Francesc o Totti Hurricane 
 Polymar github.com/ondata/guidaVisiData/
  22. 22. Strumenti per la visualizzazione
  23. 23. Possono essere utilizzati diversi DB Totalmente Web Based User Friendly con ricerche con o senza SQL Permette la generazione di script Multi DB Web Based No SQL Self Hosted Caratteristiche di Metabase
  24. 24. www.yourwebsite.com datastudio.google.com Google Data Studio è un tool pensato appositamente per creare, in poco tempo, dashboard dinamiche e report efficaci
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  26. 26. Grazie ed arrivederci al prossimo evento! @DMONDELLO DANIELEMONDELLO INFO@DANIELEMONDELLO.IT Linux day 202 1 Palermo 23/10/2021 Daniele Mondello SIRAGUSA8 R.SIRAGUSA@GMX.COM Roberto Siragusa ROBERTO-SIRAGUSA/8 DANIELEMONDELLO
  27. 27. “One more thing”… si può dire al linux day?! I HUB!

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