8. Welke invloed heeft het zink-complex op CO 2 -hydratatie. De binding van een watermolecuul aan het positief geladen zink centrum verlaagt de pK a van water van 15,7 tot 7.
11. Protonation en deprotonation van zink-gebonden H 2 O k -1 kleiner dan 10 11 dan k 1 is kleiner dan 10 4 echter CO 2 wordt gehydrateerd met een snelheid van 10 6
12. Effect van bufferconcentratie op de snelheid van CO 2 -hydratatie Wat zorgt in het enzym Carbonic anhydrase voor de buffercomponent?
20. Model 1: Twee verplaatsinsreacties vinden plaats: dus de overall configuratie blijft gelijk. Model 2; Een verplaatsingsreactie vindt plaats: dus omgekeerde conformatie. Vraag: Is de stereochemie van fosforatoom veranderd na knippen?
23. Restrictie-enzymen vereisen magnesium Het Mg 2+ -ion is gebonden aan twee Asp-groepen van het enzym en aan een zuurstofatoom van de fosfaatgroep. Verder bindt het water. Het activeert het watermolecuul.
24. Specificiteit van restrictie-enzymen De herkenningssequentie van vele restrictie-enzymen zijn inverted repeats: bevatten een tweetallige rotatie-as. Restrictie-enzymen vertonen gelijksoortige symmetrie.
25. EcoRV plus DNA-molecuul De bindingsaffiniteit voor substraat bepaalt meestal de specifiteit. Echter uit studies blijkt dat EcoRV endonuclease even goed bindt aan andere DNA-sequenties. Vraag : waar berust de specificiteit dan op?
26. Waterstof bindingsinteracties tussen EcoRV endonuclease en zijn DNA-substraat 5’ GATATC 3’ GA en CT waarmee ze baseparen gaan waterstof bruggen aan met aminozuren in het enzym. Gevolg: distortion van de DNA-helix.