1. Guia d’ús avançat vr. 2
Duració del tutorial: 29’
28/06/2013

2. Què és?
PUBMED permet l’accés gratuït a bases de dades
bibliogràfiques de ciències de la salut com MEDLINE, de
la National Library of Medicine dels Estats Units.
MEDLINE està format per uns 19 milions de referències
d’articles de revistes publicades des de 1946 fins a
l’actualitat, el 91% en anglès.
My NCBI permet personalitzar l’ús de PUBMED gravant
perfils d’interès, i agregar alertes al nostre correu-e per a
seguir temes actuals.
La llista amb els resultats de PubMed no inclou el text
complet de l’article. Si més no, la vista Abstract mostra
enllaços al text complet de l’editor o el distribuïdor de les
revistes.
L’accés al text complet pot requerir una subscripció.
Algunes revistes s’ofereixen en accés lliure.

3. Recomanem usar el
navegador de Mozilla
Firefox per obtenir un ple
rendiment de totes les
funcions de la base de
dades.

4. Cerca simple

5. Autocompletat
Quan escrivim en el quadre de cerca el
sistema mapeja i ens suggereix múltiples
propostes d’autoescriptura. Triem la que
més s’ajusta amb el cursor.

6. Cerca simple d’un tema / 1
Introduïm el terme o la frase en la finestra de cerca i cliquem el botó
SEARCH

7. Cerca simple d’un tema / 2
PubMed traduirà de forma automàtica el nostre plantejament en els
descriptors pels quals s’indexaria formalment l’article i en d’altres etiquetes,
en tots els sinònims associats (Entry term mappings), els autors, els títols de
les revistes, etc.

8. Cerca simple de un tema / 3
El botó URL ens permet generar un localitzador
d’internet per poder guardar-lo i reproduir una
cerca idèntica en el futur:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22%5BMeSH%20Terms%5D
%20OR%20%22silicosis%22%5BAll%20Fields%5D%29%20AND%20%28%22lung%20neo
plasms%22%5BMeSH%20Terms%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D
%20AND%20%22neoplasms%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20neopl
asms%22%5BAll%20Fields%5D%20OR%20%28%22lung%22%5BAll%20Fields%5D%20A
ND%20%22cancer%22%5BAll%20Fields%5D%29%20OR%20%22lung%20cancer%22%5
BAll%20Fields%5D%29&cmd=DetailsSearch

9. Cerca simple de un tema / 4
Podem usar operadors lògics (AND, OR, NOT), en majúscules
sempre, per orientar la cerca:
percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)

10. Cerca amb filtres / 1
PubMed preveu la cerca
d’articles usant filtres que són
molt habituals.

11. Cerca avançada

12. Camps de Pubmed
Els registres de Pubmed estan de forma latent
formats per uns camps característics que són
directament interrogables.
Camps
característics de
PubMed

13. Cerca avançada
◘ Cerca per autors, revistes, etc.
(camps concrets)
◘ Cerca a través dels descriptors
MeSH (Medical Subject Headings)
◘ Altres fonts per a cerques molt
orientades.

14. Search builder / 1
En la finestra del Search builder
podem obtenir amb els menús
desplegables tots els noms dels
camps i consultar l’índex de
cada camp.

15. Search builder / 2

16. Search builder / 3
L’índex s’obre per la paraula o frase més aproximada a la
paraula que hem teclejat en el Search Builder. En 5210
registres apareix la seqüència “vall d’hebron”. Amb el
cursor podem marcar-la i clicant el botó “Search”
aconseguiríem visualitzar una llista amb els resultats.

17. Search builder / 4
Mitjançant el Search Builder i els índexs
podem anar incorporant elements a la
finestra de cerca i combinar-los. Després
el botó Search ens porta als resultats.

18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1
Una cerca a través dels descriptors MeSH ens permet
capturar informació d’una manera més consistent,
més metòdica i més rigorosa.
El thesaurus de MeSH conté uns 26.000 termes i
s’actualitza cada any.
Podem consultar la base de dades de MeSH i els
detalls referents a cada descriptor o bé usar l’índex
directament.

19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2
Un MeSH Major Topic és un MeSH Term que està
marcat amb un asterisc (*) i que es considera un
tema principal de l’article. En l’exemple veiem que
“Asthma” és un Major Topic i que a més a més
porta el MeSH subheading “Rehabilitation”

20. Medical Subject Headings (MeSH) / 3
També podem fer la mateixa
cerca des de MeSH Database

21. Medical Subject Headings (MeSH) / 4

22. Visualització
de resultats

23. Visualització de resultats / 1
Articles de lliure
accés (15)

24. Visualització de resultats / 2
Si l’Hospital té accés a determinades
suscripcions o llicències d’ús, aquesta
informació també ens la podrà
proporcionar PubMed

25. Visualització de resultats / 3
Vista “Abstract”
Text complet
Captura de
registres

26. My NCBI

27. Què es My NCBI?
My NCBI és un instrument de
PubMed que permet que ens
registrem i així retenir la
informació recollida per un
usuari i les seves preferències.

28. Registre en My NCBI / 1
Podem obrir gratuïtament un compte en My
NCBI

29. Registre en My NCBI / 2
Existeix l’opció d’usar el
nostre compte de Google si no
volem crear un compte nou.

30. Funció Collections / 1
Quan volem conservar un conjunt de registres
bibliogràfics en PubMed podem fer-ho amb la
funció Clipboard, que només ens deixa retenir fins
a 500 registres i es perden si estem inactius 8
hores seguides.
La funció Collections és pel contrari per a usuaris
que s’han registrat a My NCBI i permet conservar
indefinidament una o vàries col·leccions de
registres, i a més a més compartir-les, marcar
favorits, etc. No hi ha límit de col·leccions.

31. Funció Collections / 2
Podem compartir una col·lecció de registres
configurant-la com a “pública” i proporcionant la
URL o enllaç directe a col·laboradors nostres.
Podem veure que es pot generar un arxiu de text
o de base de dades (csv); també podem depurar
registres, afegir, etc.

32. Funció Save search / 1
Tenir un compte en My
NCBI també ens permet
gravar una cerca (la seva
estratègia) per a poder-la
executar en el futur.
La funció Save Search genera un formulari on
podem inscriure les nostres preferències per a
rebre continuadament els resultats que es van
incorporant a PubMed sobre el nostre tema en
un correo-e personal.

33. Funció My Bibliography /1
Per últim, una altra funció de My NCBI útil és My
Bibliography, dissenyada específicament per a
guardar registres d’un autor com a tal i editar-los
en llistes.

34. Captura
de registres

35. Podem capturar els resultats de la cerca, sigui a
partir de la llista total, sigui fent una selecció de la
llista marcant els botó de selecció

36. Quan enviem registres a una adreça de
correu-e no podem enviar més de 200
registres per missatge, però es poden
enviar per fraccions, de 200 en 200.

37. Importar registres
a

38. Zotero i Pubmed / 1
La icona de document en la barra d’adreces ens indica que
Zotero ha detectat les “metadades” d’un article en PubMed

39. Zotero i Pubmed / 2
Obrim Zotero clicant el seu botó en la barra.
En la columna esquerra elegim la carpeta on gravarem un registre.
Cliquem la icona que apareix a la barra d’adreces per a incorporar-lo.

40. Altres funcions

41. Enllaç permanent a un article
Una forma de crear un enllaç permanent a un
registre és amb un URL que contengui l’expressió
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ i el número
PMID. P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894

42. Funció Images
L’ octubre de 2010
PubMed va incorporar
imatges en els articles
que pertanyen a les
publicacions de Pubmed
Central, de lliure accés

43. Agregadors RSS
PubMed ofereix diversos canals RSS per a obtenir
fàcilment informació continuada sobre un tema, etc.

44. Elaborat per: Marta-R. Domínguez Senra
mrdominguez@vhebron.net