Testes em Bioinformática

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Analisar sequencia genética? Formar proteínas? Classificar miRNA? esta é a bioinformática. Mas, como testar? Demostraremos como fazer algumas operações de teste em bioinformática.

Por Willian Reis
Evento: OctoberTest
www.octobertest.com.br

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Testes em Bioinformática

  1. 1. Willian Reis
  2. 2. A tarefa de organizar e analisar dados incrivelmente complexos resultantes de modernas técnicas de Biologia molecular e bioquímica.
  3. 3. A tarefa de organizar e analisar dados incrivelmente complexos resultantes de modernas técnicas de Biologia molecular e bioquímica. Uma importante ferramenta para a compreensão de como as informações contidas nos genes são refletidas em características fisiológicas, como inteligência, crescimento dos cabelos ou susceptibilidade ao câncer.
  4. 4. A tarefa de organizar e analisar dados incrivelmente complexos resultantes de modernas técnicas de Biologia molecular e bioquímica. Uma importante ferramenta para a compreensão de como as informações contidas nos genes são refletidas em características fisiológicas, como inteligência, crescimento dos cabelos ou susceptibilidade ao câncer. A ciência da criação e manutenção de base de dados (ou Bancos de Dados) e eventualmente a simulação de fenômenos dos organismos vivos
  5. 5. Umfuturopromissor... BioCientistas BioInformatas BioQuímicos Biologia Molecular Biologia Molecular Quimica Organica Quimica Organica Fonte: http://genfis40.esalq.usp.br/genfis/index.php?option=com_phocadownload&view=category&id=7:apostilas-e-artigos&Itemid=68#
  6. 6. Biologia
  7. 7. Biologia Programação Testes
  8. 8. Biologia Programação Testes Estatística
  9. 9. Biologia Programação Testes Estatística Matemática
  10. 10. Biologia Programação Testes Estatística Matemática
  11. 11. (...) hoje a genética aliada à bioinformática consegue prever até 70 doenças inscritas no código genético (genoma) de qualquer pessoa.
  12. 12. (...) hoje a genética aliada à bioinformática consegue prever até 70 doenças inscritas no código genético (genoma) de qualquer pessoa.
  13. 13. Mineração de Dados
  14. 14. Mineração de Dados
  15. 15. Estatística
  16. 16. Estatística Simulando sequências de DNA com Cadeias de Markov (Markov Chain) http://recologia.com.br/2014/03/simulando-sequencias-de-dna-com-cadeias-de-markov-markov-chain/
  17. 17. Testes de Software Testes de Caixa Preta Testes Unitários Testes Funcionais Etc...
  18. 18. Testes de Software Testes de Caixa Preta Testes Unitários Testes Funcionais Etc... Testes de Hipótese Teste de Qui-Quadrado
  19. 19. Projeto OpenSource Python 2.X O que existe? Parser em arquivos FASTA e GenBank Conexão direta com bases de BioInfo(PubMed, ExPASy, SCOP) Variadas rotinas e classes que trabalham com sequencia. Alinhamento de sequencias Algoritmos de Aprendizado Supervisionado Naive, Markov
  20. 20. Framework Teste:

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