En el ámbito del desarrollo del Programa SciELO con base en sus líneas prioritarias de acción en pro de la profesionalización e internacionalización de las revistas científicas que indexa, la adopción de la marcación de los textos completos en XML representa un avance crítico que todas las colecciones y revistas deberán adoptar en el futuro próximo. Tratase de un cambio significativo que afecta los sistemas tradicionales de edición de revistas científicas. En el Modelo SciELO de publicación el archivo con el texto completo en XML pasa a ser considerado como fuente primaria para preservación digital y generación de los diferentes formatos de presentación como el HTML, el PDF, el ePUB, etc. La estructura del archivo es descrita en el SciELO Publishing Schema (PS) que es basado en la norma NISO Journal Article Tag Suite (JATS). La gestión y operación de servicios de publicación con textos estructurados en el formato XML según el SciELO PS, permite la identificación detallada y precisa de los elementos bibliográficos de los artículos, contribuí para mejorar la calidad bibliográfica de los textos, su indización e interoperabilidad en la Web, la preservación digital y la posibilidad de publicación en diferentes tipos de formatos y presentación en diversos dispositivos. En ese sentido, el Taller de Actualización la Metodología SciELO tiene como objetivo intercambiar informaciones y experiencias acerca del flujo de publicación basado en el SciELO PS de manera a facilitar su adopción. El taller comprende aspectos teóricos y prácticos acerca de la metodología SciELO y de los programas utilizados para generación de los archivos en XML de acuerdo con el SciELO PS-v1.3.

1. Solange Santos
SciELO Brasil
www. .org
Scientific Electronic Library Online
Taller de Actualizacion de la Metodología SciELO
06 a 10 de Junio de 2016, São Paulo - Brasil
Líneas de acción 2014 a 2016 y desafíos
de la migración para el flujo de
publicación en XML

2. Líneas de acción prioritarias del Programa SciELO
1. Profesionalización de las funciones y de los procesos editoriales
- Sistemas de gestión online de manuscritos;
- Servicios de edición y revisión de idiomas;
- Servicios de maquetación y layout ;
- Servicios de estructuración de textos en XML;
2. Internacionalización de la revistas;
- Internacionalización del cuerpo editorial y del cuadro de revisores
- Inserción nos índices internacionales ;
- Marketing y servicios de diseminación por medio de las Redes Sociales en la Web;
- Capacitación continuada de editores para profesionalización e internacionalización;
- Sistema de indicadores de evaluación y desempeño de las revistas
3. Sustentabilidad de las revistas en el proceso de profesionalización e
Internacionalización

3. SciELO Publishing Schema
El caso de SciELO Brasil
 Estudios y pilotos realizados con algunas revistas en 2011;
 Iniciadas las primeras reuniones con los editores para adopción
en 2012;
 En 2013 primeras revistas publicadas en XML.
 Adopción por el área de la salud obligatoria en 2014;
 Obligatorio para otras áreas en inicio de 2015;
 Evaluación de calidad de XML generados por empresas
nacionales e internacionales;
 Creación en 2014 de grupo de trabajo multidisciplinar para
documentación y evaluación de la especificación de reglas para
SciELO PS.

4.  EL XML (eXtensible Markup Language, o lenguaje de Marcación
Extendida) es una metalenguaje de marcación recomendada por
W3C;
 Fue creada para ser auto descriptiva, transportar y almacenar
datos, tiene su enfoque en el contenido propiamente dicho;
 Permite identificar claramente los elementos bibliográficos que
componen al documento;
 Permite verificar la estructura y exactitud del artículo, y asegurar
que cumple con las especificaciones con que debe contar el
contenido de acuerdo con las reglas de formación.
 Lenguaje que puede ser entendido tanto por humanos como por
maquinas
¿Qué es el XML?

5.  Mientras el HTML fue creado para presentar el texto con enfoque
en la exihibición del texto tiene (se trata de un lenguaje para
exhibición).
 O XML ya viene sendo utilizado en el mercado editorial desde de los
años 90. área de periódicos científicos foi uma das pioneiras na
adoção do XML para estruturação do texto completo con suceso;
 La separación entre estructura y exhibición;
 Exhibición del mismo texto puede ser de distintas maneras ;
 Mayor reutilización del contenido para producir otros formatos (Ej.:
ePub);
¿Por qué adoptar el XML?

6.  XML posibilita/garantizar maior flexibilidad, neutralidad y
compatibilidad con sistemas o formatos futuros;
 Capacidad de preservación digital del contenido a largo plazo,
sin importar los sistemas operativos o programas de cómputo
que existan en el futuro.
 Facilita la interoperabilidad entre sistemas y bases da dados;
 Abre la posibilidad de ingreso de las revistas de Ciencias de la
Salud y C. de la Vida en el PMC.
 Los Mega journals fueron pioneros en la utilización del XML en
toda cadena de producción editorial. PLOS One, Nature e eLife.
¿Por qué adoptar el XML?

7. ESTRUCTURACONTENIDO PRESENTACIÓN
TEXTO XML XSL
Eder Maciel Autor: Eder Maciel
Como Citar: MACIEL, Eder
XML – eXtensible Markup Language
El XML describe la estructura y el significado de los datos y hace
posible el reutilización del contenido de distintas formas.

8. PRESENTACIÓN
XSL
Autor: Eder Maciel
Como Citar: MACIEL, Eder
XSL - eXtensible Stylesheet Language

9. XSL

10. XSL

11. XSL

13. MANUSCRITO
REVISION POR
PARES
REVISIÓN
Gram, Estat., Trad.
EDICIÓN
MAQUETACIÓN
PUBLICACIÓN
Donde debería ser insertado el XML en el flujo de
edición de la revista?
Producción del XML en el Flujo Editorial
XML Publishing

14. MANUSCRITO
REVISION POR
PARES
REVISIÓN
Gram, Estat., Trad.
EDICIÓN
MAQUETACIÓN
PUBLICACIÓN
Producción del XML en el Flujo Editorial
XML Publishing
XML
Donde será incluido el XML en el flujo de edición de
la revista?

15. XML – Posibilita ...
Salida en diversos
formatos
Exhibición en varios
Dispositivos

16. Revista en
Formato Epub

17. Portada de la Revista
en Formato Epub

18. Tabla de contenido
de la Revista en
formato Epub

19. Artículo
en
formato
Epub

20. Flujo de Publicación basado en HTML

21. Flujo de Publicación basado en XML

22. JATS: Journal Article Tag Suite
 Journal Article Tag Suite (JATS) es una norma (NISO Z39.96-2012)
que define y describe un conjunto de elementos y atributos para
identificación de los elementos de artículos científicos.
 Principal objetivo es preservar y promover el intercambio de los
contenidos.
 Actualmente en la versión 1.0 y es compatible con a versión 3.0
de NLM (National Library of Medicine), su antecesora.
 JATS es flexible, o sea, la mayoría de sus elementos no son
obligatorios para algunos atributos los valores son libres.

23. SciELO Publishing Schema (SciELO PS)
 SciELO Publishing Schema (SciELO PS) basada en PMC y JATS.
 El SciELO PS se basa en un subconjunto de JATS Publishing 1.0.
entonces "La especificación SciELO Publishing Eschema - SciELO PS
- se compone a partir de NISO JATS Journal Publishing DTD en
version 1.0 + el Estilo SciELO, que son las reglas que especializan
aspectos de la especificación JATS Publishing
 Para atender las necesidades de SciELO, el SciELO PS da prioridad a
la identificación de los elementos importantes para generación de
los índices bibliometricos y que garantiza la interoperabilidad de
los datos.
 Actualmente se encontra en la versión 1.4.

24. JATS, PMC y SciELO PS

25. XML SciELO: Macroestructura
Article
Front
Body
Back
Floats
Group
Sub-article
y Response
Metadatos de la revistas (journal-meta) y
del artículo (article-meta)
Cuerpo del artículo - Texto completo
(secciones, parráfos, enlaces, figuras,
material adicional, tablas etc.)
Agradecimientos, referencias, notas de
de pie, apendices etc.
Grupo de objetos no mencionados en el
texto (tabelas, figuras etc).
Texto dentro de outro texto (cartas y
respuestas, traducciones, artículos
con comentarios, etc).

26. PubMed Central (PMC)
 PubMed Central (PMC) es un repositorio de textos
completos en acceso abierto de revistas del área
biomédicas y de ciencias de la vida.
 Tras evaluación del contenido científico, la revista debe
enviar sus archivos en formato XML compatible con JATS.
 Hay un guía de buenas prácticas que debe ser consultado
para preparación del XML requerido por PMC.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pmcdoc/tagging-guidelines/article/style.htm

27. Diferenças entre PMC e SciELO PS
1. Objetivo principal publicar en
texto completo;
2. Sigue norma Vancouver para
las referencias;
3. Identificación más sencilla de
las afiliaciones;
4. No hay necesidad de
identificar datos de
finananciación y registros de
ensayos clinicos.
1. Además de la publicación hay la
necesidad de generar indicadores de
producción científica;
2. Las revista publicadas adoptan
distintas normas y no solamente
Vancouver;
3. identificación detallada de las
afiliaciones;
4. Es necessário identificar datos de
financiamento y registros de ensayos
clinicos.
5. obligatorio el uso del atributo
@specific-use (version del SPS
adoptada)
SciELO PS

28. Principales desafíos en la
adopción del XML SciELO PS
 Conocimiento más allá de la reglas básicas estructurales del
estándar JATS y SciELO PS,
 Conocimiento tanto de la estructura del XML como de la
estructura de un artículo científico;
 La información debe estar adecuadamente presentada en el
documento original (Garbage in = Garbage out);
 Necesidad tratamiento detallado del cuerpo del artículo el
proceso de marcación es más completo y complejo;
 Control de calidad pasa a ser clave tanto en flujo de edición,
como en la producción y publicación de las revistas;
 Reordenamiento de todo el flujo de edición de las revistas y de
SciELO.

29. Algunas herramientas para editar y verificar
errores en los archivos XML:
Comerciales
 Altova XML Spy
www.altova.com
 Liquid XML Studio
http://www.liquid-technologies.com/xml-studio.aspx
 <oXygen/>
www.oxygenxml.com
 XMLwriter
http://xmlwriter.net
 eXtiles
http://www.inera.com/extyles-products
Gratuitos
 XML Pad 3
www.wmhelp.com/xmlpad3.htm
 Notepad++
http://notepad-plus-plus.org/
 Eclipse
http://www.eclipse.org/
 XML Copy Editor
http://www.eclipse.org/
Conocimiento necesario...

30. Material de apoyoGuía de uso del SciELO Publishing Schema – SciELO PS (en traducción
al castellano)
http://docs.scielo.org/projects/scielo-publishing-schema/pt_BR/1.4-branch/

31. Herramientas SciELO
PC-Programs:
 Conjunto de herramientas de la Metodologia SciELO para producir XML
hacer el control de calidad y la publicación en el sitio.
http://docs.scielo.org/projects/scielo-pc-programs/en/latest/

32.  Herramienta web valida estructura (no el contenido) de un XML frente a la
especificación SciELO PS. Valida las versiones 1.3 e 1.4 do SciELO PS.
 Cadena de validación JATS + SPS (Estilo SciELO)
 Validacion individual de los XML
 También puede ser ejecutado localmente o integrado em otras
herramientas
http://manager.scielo.org/tools/validators/stylechecker/
Herramientas SciELO
Stylechecker

33. Material de apoyo
Vídeos disponibles en el Canal Red SciELO
https://www.youtube.com/user/RedeSciELO?nohtml5=False

34. Material de apoyo
Guia del Markup
http://docs.scielo.org/projects/scielo-pc-programs/en/latest/es_how_to_generate_xml.html

35. Material de apoyo
Lista de discusión
scielo-xml@googlegroups.com

36. Enlaces importantes
• Guia de uso de los elementos para documentos em XML -
http://docs.scielo.org/projects/scielo-publishing-schema/pt_BR/1.4-branch/
• Journal Article Tag Suite – http://jats.nlm.nih.gov
• Download programas de marcación y package maker -
http://docs.scielo.org/projects/scielo-pc-programs/en/latest/installation.html
• Package Maker - http://docs.scielo.org/projects/scielo-pc-
programs/en/latest/xml_package_maker.html
• FAQ SciELO PS - http://docs.scielo.org/projects/scielo-pc-
programs/en/latest/faq-scielo-xml.html
• Pubmed Central - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

37.  Revisión de Editores de XML –
http://www.cmsreview.com/XML/Editors
 Comparaciones de Editores XML-
http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_XML_editors
 Preguntas sobre XML-
http://www.w3schools.com/xml/xml_quiz.asp
 BROWN, Alex. XML in serial publishing: past, present and future. OCLC
Systems & Services, v. 19, n. 4, p.149-154, 2003. Disponível em:
<http://www.emeraldinsight.com/journals.htm?articleid=863213>. Acesso em: 25 jul. 2013.
 MILLER, Dick R. XML: libraries’ strategic opportunity. Library Journal: net
connect, v. 125, n. 10, 2000. Disponível em: <http://cds.cern.ch/record/450652/files/ext-2000-
173.pdf>. Acesso em: 25 jul. 2013.
 TENNANT, Roy. XML in libraries. New York: Neal-Schuman Publishers, 2002.
Enlaces adiconales

38. Gracias!
Programa SciELO
scielo@scielo.org
www.scielo.br / www.scielo.org
http://blog.scielo.org/es/
@redescielo