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ESTRUCTURA y
FUNCION DE PROTEINAS




     Biología Celular Medicina
     Prof. Catherine Guzmán.
                         2011
FUNCIONES DE LAS PROTEINAS
                   Histonas
                   Colágeno
Estructural        Elastina
                   Queratina
                   Ribonucleasa
Enzimática         DNA polimerasa
                   Glucoquinasa
                   H. de crecimiento
Hormonal           Eritropoyetina
                   Calcitonina
                   Inmunoglobulinas
Defensiva          Trombina
                   Fibrinógeno
                   Hemoglobina
Transporte         Transferrina
                   Citocromos
                   Miosina
Motoras            Quinesina
                   Dineína
FUNCIONES DE LAS PROTEINAS

                N-CAM
Adhesión        Integrinas
                Caderinas
                Citoquinas
Señales         EGF
                NGF
                NF-kB
Regulación      p53
                Ciclinas
                Lactoalbúmina
Reserva         Ovoalbúmina
                Ferritina
                Rodopsina
Receptor        Receptores
                hormonales
LAS PROTEINAS PRESENTAN DIFERENTES NIVELES
ESTRUCTURALES QUE DETERMINAN SU CAPACIDAD PARA
       REALIZAR DIFERENTES FUNCIONES BIOLOGICAS
ESTRUCTURA PRIMARIA
                             DE PROTEINAS




- Las proteínas son macromoléculas formadas por la asociación de aminoácidos mediante
un enlace peptídico.
- La estructura primaria corresponde a la secuencia lineal de aminoácidos que forman una
proteína.
-La función de una proteína dependen de su secuencia de aminoácidos, pues ella
determina la estructura espacial que esta macromolécula adopte.
- Es única para las proteínas de un especie, se encuentra codificada por el material
genético (ADN).
AMINOACIDOS POLARES
                                                                                             Aminoácidos polares con carga

                                           Aminoácidos ácidos                                                                                    Aminoácidos básicos

                                      O                    O                      O                                O                                  O                            NH2                  O
                                                                                                                                             +                                                                                         +
                                                           C                                           O-                               NH                              CH2                +                               CH2   NH3
                                -O                      CH2        O-        -O                  C            -O                                 -O                  CH2   NH        NH2           -O                   CH2   CH2
                                                                                             +                                +                                  +                                                  +
                                                +                                      NH3       O                      NH3                                NH3                                                NH3
                                          NH3                                                                                           N
                                                                                                                                        H
                                     Acido Glutámico                           Acido Aspártico                          Histidina                                Arginina                                        Lisina
                                         (Glu, E)                                  (Asp, D)                                                                                                                     (Lys, L)
                                                                                                                        (His, H)                                 (Arg, R)



               O     CH3                            O
                                CH3                                      CH3
3         -O                 CH2          -O
                         +                                     +
                   NH3                                   NH3       CH3

               Isoleucina                               Leucina
                  (Ile, I)
                                                        (Leu, L)                                            Aminoácidos polares sin carga
                                      O                                               O          CH3                     O                                O                                    O                    NH2
                                                                                                                                                                             NH2
                               -O                                                                    OH                                 OH                                                                    CH2       O
                                                                               -O                                  -O                             -O                                     -O
          +                                     +
    NH3                                   NH3                                                    +                                  +                                +                                    +
                                                                        OH                NH3                                 NH3                             NH3        O                          NH3
Fenilalanina                               Tirosina                                   Treonina                            Serina                          Asparragina                              Glutamina
  (Phe, F)                                 (Tyr, Y)                                    (Thr, T)                           (Ser, S)                          (Asp, N)                                (Gln, Q)



      +
NH3
               NH
    Triptófano
La carga de los aminoácidos polares depende de la capacidad de ionización de los
    grupos –COOH y –NH2 presentes en la cadena lateral de aminoácidos ácidos y
                                                       básicos respectivamente
AMINOACIDOS APOLARES
                                                                                            O                              O         CH3                    O         CH3                           O
                                                                                                          CH3                                                                  CH3                                      CH3
                                                                                       -O                             -O                   CH3         -O                   CH2            -O
                                                                                                          +                           +                                 +                                         +
                                                                                                 NH3                            NH3                               NH3                                       NH3       CH3
                                                                                            Alanina                        Valina                                                                       Leucina
                                                                                                                                                             Isoleucina
                                                                                            (Ala, A)                       (Val, V)                O                               O                    (Leu, L)              O
     O                            O     CH3                        O     CH3                              O                                                     (Ile, I)
                                                                                                                                                                                                H
               CH3                                                                 CH3          O                              CH3          O                   H                    O
                                                                                                                                                                                                N
-O                           -O                  CH3          -O                 CH2            -O                     S                    -O                               -O                                         -O                  SH
                   +                        +                                +           -O                        CH+   CH           -O                                      -O                                                        +
             NH3                      NH3                              NH3                                        NH3 2 CH3 3                                     +                                                               NH3
                                                                                                              +
                                                                                                     NH3 Leucina                                 NH3
                                                                                                                                                       +    NH3                          NH3
                                                                                                                                                                                                +
     Alanina                      Valina                           Isoleucina                                                                    Glicina                          Prolina                              OH     Cisteína
     (Ala, A)                     (Val, V)                            (Ile, I)                    Metionina L)
                                                                                                      (Leu,                           Fenilalanina                                      Tirosina
                                                                                                   (Met, M)
                                                                                                                                       (Gly, G)
                                                                                                                                        (Phe, F)
                                                                                                                                                                                  (Pro, P) Y)
                                                                                                                                                                                        (Tyr,
                                                                                                                                                                                                                              (Cys, C)
         O                                          O                                       O           O                               O                                              O
                                                                                                                                    O            H
                              S
 -O                        CH2  CH3         -O                                     -O                                      H                     N
                                                                                                      -O                         -O -O                                         -O                             SH
                       +                                      +                                       +
              NH3                                       NH3                                     NH3                                                +                                                    +
                                                                                                                        OH +                 NH3                                            NH3
                                                                                                                      NH3                                    NH
              Metionina                             Fenilalanina                                 Tirosina
               (Met, M)                               (Phe, F)                                        Glicina
                                                                                                 (Tyr, Y)                                       Prolina
                                                                                                                                                 Triptófano                            Cisteína
                                                                                                              (Gly, G)                          (Pro, P)
                                                                                                                                                  (Trp, W)                             (Cys, C)
                                                O

                                       -O
                                                          +
                                                    NH3
                                                                   NH
                                                        Triptófano
                                                         (Trp, W)
ENLACES Y FUERZAS NO COVALENTES
                  QUE CONTRIBUYEN AL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS




                                                                          3. ENLACES HIDROGENO

                                        2. FUERZAS DE VAN
1. ENLACES IÓNICOS                          DER WAALS



 La fuerza de atracción entre las
 dos cargas opuestas disminuye
 rápidamente a medida que se
 aumenta la distancia entre ellas.   La distancia de contacto entre dos
                                     átomos que no están unidos por un    Se forma en átomos de H atrapados
                                     enlace covalente que minimiza las    entre dos átomos electronegativos
                                     fuerzas de repulsión entre los       (generalmente O, N).
                                     radios atómicos
ENLACES Y FUERZAS NO COVALENTES QUE CONTRIBUYEN AL
                          PLEGAMIENTO DE PROTEINAS




     4. FUERZAS HIDROFOBAS




       Las moléculas hidrófobas se estabilizan asociándose entre sí evitando la interacción con la
       red de enlaces hidrógenos del agua.
LAS PROTEÍNAS DESNATURALIZADAS PUEDEN RECUPERAR
                           SUS FORMAS ORIGINALES




La información necesaria para especificar la forma tridimensional está contenida en la secuencia
aminoacídica.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
                     DE PROTEINAS




- Corresponde al plegamiento característico de la cadena aminoacídica
-La estructura secundaria es establecida por enlaces hidrógeno entre los
grupos carbonilo y amino del esqueleto polipeptídico.
Existen tres tipos de estructuras secundarias conservadas en proteínas:
                     1.- a Hélice
                     2.- Hoja b
                     3.- Vuelta
                     (4.-Random coil (estructura al azar))
a- HELICE




                            0.54 nm/ vuelta




La estructura de a hélice es estabilizada por enlaces hidrógeno entre el grupo -C=O de un
aminoácido y el grupo -NH del cuarto aminoácido que le sigue en la cadena polipeptídica
HOJA b                        Hoja b paralela




                                                                Hoja b antiparalela




-En la estructura hoja b los aminoácidos forman hebras en forma de zig-zag
-El plegamiento es estabilizado por enlaces hidrógeno entre grupos C=O y NH de cadenas vecinas
-Cuando las hebras b tiene el mismo sentido (N-C) forman una hoja b paralela, si presentan sentidos
opuestos forman una estructura antiparalela
VUELTAS




-Comprende regiones de al menos 4 aminoácidos generalmente
con presencia de prolina y glicina (tb. asparragina).
-Están presentes en la transición entre diferentes tipos de
estructuras secundarias dentro de una cadena polipeptídica.
-Plegamiento establecido por la formación de puentes hidrógeno
en las posiciones 1 y 4.
MOTIVOS ESTRUCTURALES
Estructura de algunas proteínas de
 membrana
  Algunas hélices-alfa son estructuras anfipáticas que permiten la
  formación de proteínas transmembrana con una región interior
  hidrofílica, como por ejemplo en las proteínas transportadoras.




Bacteriorrodopsina (bomba de H+) presente en la membrana de las
arqueobacterias Halobacterium halobium
PRIONES

                                                                                           Kuru en
                                                                                           nativos de
                                                                                           Nueva Guinea




-Responsable del mal de las vacas loca o en humanos de la
enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (ECJ) y Kuru caracterizada por la
neurodegeneración (encefalopatía espongiforme)
- Producida por el mal plegamiento de las proteínas pre-priónicas
(glucoproteínas normales de la membrana plasmática) en
proteínas priónicas
- Stanley Prusiner demostró que se trataba de partículas puramente proteicas sin ácido nucleico, por
lo que recibió el Premio Nobel de Medicina en 1997.
PRIONES


          •Las partículas priónicas
          infectivas son proteínas con un
          plegamiento anómalo
          •Cuando una proteína priónica
          anómala entrar en contacto con
          las proteínas originales, las
          induce a adoptar la forma
          anómala del prión, mediante un
          mecanismo todavía desconocido,
          generando una reacción en
          cadena sobre otras proteínas
          sensibles lo que lleva a la
          formación de agregados de
          proteínas que dañan la función de
          las células nerviosas.
          •A principios del siglo XX se
          describieron los primeros casos
          de encefalopatía espongiforme en
          el ser humano (enfermedad de
          Creutzfeldt-Jakob)
ESTRUCTURA TERCIARIA
                        DE PROTEINAS
Disposición tridimensional de los aminoácidos en la cadena polipeptídica.

El reordenamiento espacial de los aminoácidos en la proteína es mantenido
por diferentes fuerzas de enlace:

Fuerzas covalentes        -puentes disulfuro (entre dos Cys)
                          -enlace amida (entre Lys-Glu o Lys-Asp)

                          - fuerzas electrostáticas
                          - puentes hidrógeno
Fuerzas no covalentes     - fuerzas de van der Waals
                          - interacciones hidrofóbicas
FUERZAS COVALENTES
             PUENTE
             DISULFURO




           ENLACE
           AMIDA
Existen dos grandes agrupaciones de estructura
                      tridimensional:

-Proteinas globulares           -Proteinas fibrosas
DOMINIOS ESTRUCTURALES

Regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de una
proteína que actúan como unidades individuales de plegamiento.
DOMINIOS ESTRUCTURALES
•Los dominios son segmentos de una
proteína que presentan una organización
espacial definida.
•Presentan una particularidad estrutural o
cumplen un rol funcional determinado.
DOMINIOS ESTRUCTURALES
Algunos ejemplos...




   Domino catalítico    Domino de unión a NAD de la     Domino variable
   del citocromo b562   enzima láctico deshidrogenasa   de la cadena liviana la
                                                        Inmunoglobulina
DOMINIOS ESTRUCTURALES
DE LA INMUNOGLOBULINA
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Estructura presente en proteinas que
presentan más de una cadena polipeptídica:
proteinas oligoméricas.
Las fuerzas que mantiene unidas las distintas
subunidades de una proteína son en general
las misma que median la estructura terciaria
(fuerzas covalentes y no covalentes).




                                                El oligómero presenta un mínimo de energía
                                                libre respecto de los monómeros.
                                                Ejemplo: hemoglobina, proteína compuesta
                                                por cuatro subunidades (2 a y 2b) .
Estructura cuaternaria de las Inmunoglobulinas




En algunos casos los puentes disulfuro median la asociación de las diferentes subunidades
que conforman la proteina.
EL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS ES
                ASISTIDO POR CHAPERONAS




Chaperonas asisten el plegamiento de las cadenas polipetídicas recién sintetizadas
haciendo más eficiente el plegamiento de las proteínas celulares.
GroEL y GroES forman una chaperonina de procariontes que asiste el plegamiento de
proteínas. Su homólogo en eucariontes es TriC.

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Proteinas 2011

  • 1. ESTRUCTURA y FUNCION DE PROTEINAS Biología Celular Medicina Prof. Catherine Guzmán. 2011
  • 2. FUNCIONES DE LAS PROTEINAS Histonas Colágeno Estructural Elastina Queratina Ribonucleasa Enzimática DNA polimerasa Glucoquinasa H. de crecimiento Hormonal Eritropoyetina Calcitonina Inmunoglobulinas Defensiva Trombina Fibrinógeno Hemoglobina Transporte Transferrina Citocromos Miosina Motoras Quinesina Dineína
  • 3. FUNCIONES DE LAS PROTEINAS N-CAM Adhesión Integrinas Caderinas Citoquinas Señales EGF NGF NF-kB Regulación p53 Ciclinas Lactoalbúmina Reserva Ovoalbúmina Ferritina Rodopsina Receptor Receptores hormonales
  • 4. LAS PROTEINAS PRESENTAN DIFERENTES NIVELES ESTRUCTURALES QUE DETERMINAN SU CAPACIDAD PARA REALIZAR DIFERENTES FUNCIONES BIOLOGICAS
  • 5. ESTRUCTURA PRIMARIA DE PROTEINAS - Las proteínas son macromoléculas formadas por la asociación de aminoácidos mediante un enlace peptídico. - La estructura primaria corresponde a la secuencia lineal de aminoácidos que forman una proteína. -La función de una proteína dependen de su secuencia de aminoácidos, pues ella determina la estructura espacial que esta macromolécula adopte. - Es única para las proteínas de un especie, se encuentra codificada por el material genético (ADN).
  • 6.
  • 7. AMINOACIDOS POLARES Aminoácidos polares con carga Aminoácidos ácidos Aminoácidos básicos O O O O O NH2 O + + C O- NH CH2 + CH2 NH3 -O CH2 O- -O C -O -O CH2 NH NH2 -O CH2 CH2 + + + + + NH3 O NH3 NH3 NH3 NH3 N H Acido Glutámico Acido Aspártico Histidina Arginina Lisina (Glu, E) (Asp, D) (Lys, L) (His, H) (Arg, R) O CH3 O CH3 CH3 3 -O CH2 -O + + NH3 NH3 CH3 Isoleucina Leucina (Ile, I) (Leu, L) Aminoácidos polares sin carga O O CH3 O O O NH2 NH2 -O OH OH CH2 O -O -O -O -O + + NH3 NH3 + + + + OH NH3 NH3 NH3 O NH3 Fenilalanina Tirosina Treonina Serina Asparragina Glutamina (Phe, F) (Tyr, Y) (Thr, T) (Ser, S) (Asp, N) (Gln, Q) + NH3 NH Triptófano
  • 8. La carga de los aminoácidos polares depende de la capacidad de ionización de los grupos –COOH y –NH2 presentes en la cadena lateral de aminoácidos ácidos y básicos respectivamente
  • 9. AMINOACIDOS APOLARES O O CH3 O CH3 O CH3 CH3 CH3 -O -O CH3 -O CH2 -O + + + + NH3 NH3 NH3 NH3 CH3 Alanina Valina Leucina Isoleucina (Ala, A) (Val, V) O O (Leu, L) O O O CH3 O CH3 O (Ile, I) H CH3 CH3 O CH3 O H O N -O -O CH3 -O CH2 -O S -O -O -O SH + + + -O CH+ CH -O -O + NH3 NH3 NH3 NH3 2 CH3 3 + NH3 + NH3 Leucina NH3 + NH3 NH3 + Alanina Valina Isoleucina Glicina Prolina OH Cisteína (Ala, A) (Val, V) (Ile, I) Metionina L) (Leu, Fenilalanina Tirosina (Met, M) (Gly, G) (Phe, F) (Pro, P) Y) (Tyr, (Cys, C) O O O O O O O H S -O CH2 CH3 -O -O H N -O -O -O -O SH + + + NH3 NH3 NH3 + + OH + NH3 NH3 NH3 NH Metionina Fenilalanina Tirosina (Met, M) (Phe, F) Glicina (Tyr, Y) Prolina Triptófano Cisteína (Gly, G) (Pro, P) (Trp, W) (Cys, C) O -O + NH3 NH Triptófano (Trp, W)
  • 10. ENLACES Y FUERZAS NO COVALENTES QUE CONTRIBUYEN AL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS 3. ENLACES HIDROGENO 2. FUERZAS DE VAN 1. ENLACES IÓNICOS DER WAALS La fuerza de atracción entre las dos cargas opuestas disminuye rápidamente a medida que se aumenta la distancia entre ellas. La distancia de contacto entre dos átomos que no están unidos por un Se forma en átomos de H atrapados enlace covalente que minimiza las entre dos átomos electronegativos fuerzas de repulsión entre los (generalmente O, N). radios atómicos
  • 11.
  • 12. ENLACES Y FUERZAS NO COVALENTES QUE CONTRIBUYEN AL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS 4. FUERZAS HIDROFOBAS Las moléculas hidrófobas se estabilizan asociándose entre sí evitando la interacción con la red de enlaces hidrógenos del agua.
  • 13. LAS PROTEÍNAS DESNATURALIZADAS PUEDEN RECUPERAR SUS FORMAS ORIGINALES La información necesaria para especificar la forma tridimensional está contenida en la secuencia aminoacídica.
  • 14. ESTRUCTURA SECUNDARIA DE PROTEINAS - Corresponde al plegamiento característico de la cadena aminoacídica -La estructura secundaria es establecida por enlaces hidrógeno entre los grupos carbonilo y amino del esqueleto polipeptídico. Existen tres tipos de estructuras secundarias conservadas en proteínas: 1.- a Hélice 2.- Hoja b 3.- Vuelta (4.-Random coil (estructura al azar))
  • 15. a- HELICE 0.54 nm/ vuelta La estructura de a hélice es estabilizada por enlaces hidrógeno entre el grupo -C=O de un aminoácido y el grupo -NH del cuarto aminoácido que le sigue en la cadena polipeptídica
  • 16. HOJA b Hoja b paralela Hoja b antiparalela -En la estructura hoja b los aminoácidos forman hebras en forma de zig-zag -El plegamiento es estabilizado por enlaces hidrógeno entre grupos C=O y NH de cadenas vecinas -Cuando las hebras b tiene el mismo sentido (N-C) forman una hoja b paralela, si presentan sentidos opuestos forman una estructura antiparalela
  • 17.
  • 18. VUELTAS -Comprende regiones de al menos 4 aminoácidos generalmente con presencia de prolina y glicina (tb. asparragina). -Están presentes en la transición entre diferentes tipos de estructuras secundarias dentro de una cadena polipeptídica. -Plegamiento establecido por la formación de puentes hidrógeno en las posiciones 1 y 4.
  • 20. Estructura de algunas proteínas de membrana Algunas hélices-alfa son estructuras anfipáticas que permiten la formación de proteínas transmembrana con una región interior hidrofílica, como por ejemplo en las proteínas transportadoras. Bacteriorrodopsina (bomba de H+) presente en la membrana de las arqueobacterias Halobacterium halobium
  • 21. PRIONES Kuru en nativos de Nueva Guinea -Responsable del mal de las vacas loca o en humanos de la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob (ECJ) y Kuru caracterizada por la neurodegeneración (encefalopatía espongiforme) - Producida por el mal plegamiento de las proteínas pre-priónicas (glucoproteínas normales de la membrana plasmática) en proteínas priónicas - Stanley Prusiner demostró que se trataba de partículas puramente proteicas sin ácido nucleico, por lo que recibió el Premio Nobel de Medicina en 1997.
  • 22. PRIONES •Las partículas priónicas infectivas son proteínas con un plegamiento anómalo •Cuando una proteína priónica anómala entrar en contacto con las proteínas originales, las induce a adoptar la forma anómala del prión, mediante un mecanismo todavía desconocido, generando una reacción en cadena sobre otras proteínas sensibles lo que lleva a la formación de agregados de proteínas que dañan la función de las células nerviosas. •A principios del siglo XX se describieron los primeros casos de encefalopatía espongiforme en el ser humano (enfermedad de Creutzfeldt-Jakob)
  • 23. ESTRUCTURA TERCIARIA DE PROTEINAS Disposición tridimensional de los aminoácidos en la cadena polipeptídica. El reordenamiento espacial de los aminoácidos en la proteína es mantenido por diferentes fuerzas de enlace: Fuerzas covalentes -puentes disulfuro (entre dos Cys) -enlace amida (entre Lys-Glu o Lys-Asp) - fuerzas electrostáticas - puentes hidrógeno Fuerzas no covalentes - fuerzas de van der Waals - interacciones hidrofóbicas
  • 24. FUERZAS COVALENTES PUENTE DISULFURO ENLACE AMIDA
  • 25. Existen dos grandes agrupaciones de estructura tridimensional: -Proteinas globulares -Proteinas fibrosas
  • 26. DOMINIOS ESTRUCTURALES Regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de una proteína que actúan como unidades individuales de plegamiento.
  • 27. DOMINIOS ESTRUCTURALES •Los dominios son segmentos de una proteína que presentan una organización espacial definida. •Presentan una particularidad estrutural o cumplen un rol funcional determinado.
  • 28. DOMINIOS ESTRUCTURALES Algunos ejemplos... Domino catalítico Domino de unión a NAD de la Domino variable del citocromo b562 enzima láctico deshidrogenasa de la cadena liviana la Inmunoglobulina
  • 29. DOMINIOS ESTRUCTURALES DE LA INMUNOGLOBULINA
  • 30. ESTRUCTURA CUATERNARIA Estructura presente en proteinas que presentan más de una cadena polipeptídica: proteinas oligoméricas. Las fuerzas que mantiene unidas las distintas subunidades de una proteína son en general las misma que median la estructura terciaria (fuerzas covalentes y no covalentes). El oligómero presenta un mínimo de energía libre respecto de los monómeros. Ejemplo: hemoglobina, proteína compuesta por cuatro subunidades (2 a y 2b) .
  • 31. Estructura cuaternaria de las Inmunoglobulinas En algunos casos los puentes disulfuro median la asociación de las diferentes subunidades que conforman la proteina.
  • 32.
  • 33. EL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS ES ASISTIDO POR CHAPERONAS Chaperonas asisten el plegamiento de las cadenas polipetídicas recién sintetizadas haciendo más eficiente el plegamiento de las proteínas celulares. GroEL y GroES forman una chaperonina de procariontes que asiste el plegamiento de proteínas. Su homólogo en eucariontes es TriC.