Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas

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Segunda aula do curso ICB5721-2 dada em Março de 2015

Open Access, políticas de publicação, métricas alternativas, métricas por artigo e ferramentas de organização de notas e artigos.

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Organização Digital para Escrita Científica - Aula 2 - Open Access e Métricas Alternativas

  1. 1. Publicação acadêmica digital: Open Access Atila Iamarino e Mário Henrique Barros Parte I: os problemas e o acesso
  2. 2. Origem da Publicação Adadêmica Como começa e quais os problemas
  3. 3. A criação dos periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Philosophical Transactions (of the Royal Society of London) é criado em 1665: • Inaugura o conceito de peer- review • Estabelece prioridade de descoberta Arquivo das edições mais antigas: http://onlinebooks.library.upenn.edu/webbin/se rial?id=philtransactions
  4. 4. Papel dos primeiros periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão – edição – distribuição – arquivamento
  5. 5. Problemas: peer-review Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://dx.doi.org/10.1126/science.1219861
  6. 6. Problemas: edição Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://dx.doi.org/10.1111/eth.12282
  7. 7. Problemas: journal-affordability • Publicação tradicional: ótima para poucas revistas • 2,5M artigos por ano em 2004*: quem paga? – Não seriam viáveis a preço de custo * Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314. doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  8. 8. Com a distribuição digital Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão (email) – edição (automatizada) – distribuição (grátis) – arquivamento (digital)
  9. 9. No entanto Association of Research Libraries http://www.arl.org/bm~doc/monser04.pdf Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 • Cientista: – resultados • Periódicos: – revisão (email) – edição (automatizada) – distribuição (grátis) – arquivamento (digital)
  10. 10. No entanto Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://poeticeconomics.blogspot.ca /2012/01/enormous-profits-of-stm-scholarly.html http://poeticeconomics.blogspot. com.br/2014/03/elsevier-stm-publishing-profits-rise-to.html • Elsevier (2014): £826 milhões, lucro de 39% • Springer (2010): € 294 milhões, lucro de 33,9% • Wiley & Sons (2011): $106 milhões, lucro de 42%
  11. 11. Porque não discutimos • Acesso à artigos em 2013: $ 93.872.151,111 – ~$32 milhões à Elsevier2 • ~$1,60 por artigo (desde 2005)3 [1] http://www.capes.gov.br/images/stories/download/Contas_Publicas/Relatorio-de-Gestao-2013.pdf [2] https://gowers.wordpress.com/2014/04/24/elsevier-journals-some-facts/ [3] Almeida, E. C. E. de, Guimarães, J. A., & Alves, I. T. G. (2011). Dez anos do Portal de Periódicos da Capes: histórico, evolução e utilização. Revista Brasileira de Pós-Graduação, 7(13). Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  12. 12. Eis que Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://www.michaeleisen.org/blog/?p=807
  13. 13. Eis que Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Timothy Gowers - http://gowers.wordpress.com/2012/01/21/elsevier-my-part-in-its-downfall/
  14. 14. Eis que Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://thecostofknowledge.com/
  15. 15. Open Access Acesso livre vs grátis
  16. 16. Acesso Grátis vs Acesso Aberto Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Atribuição (by) Atribuição - Compartilhamento pela mesma Licença (by-sa) Atribuição - Não a Obras Derivadas (by-nd) Atribuição - Uso Não Comercial (by-nc) http://creativecommons.org.br/
  17. 17. Tipos de Open Access Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 • Green: – 6 meses a um ano para arquivamento próprio do manuscrito submetido • Gold: – Disponível imediatamente – Quem paga entre $1000 e $5000? • Preprints e repositórios – ArXiv - http://arxiv.org/
  18. 18. Open Access: Acesso ao Público Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Fausto, S., Machado, F. A., Bento, L. F. J., Iamarino, A., Nahas, T. R., & Munger, D. S. (2012). Research Blogging: Indexing and Registering the Change in Science 2.0. PLoS ONE, 7(12), e50109. doi:10.1371/journal.pone.0050109
  19. 19. Open Access: Citações Harnad, S., Brody, T., Vallières, F., Carr, L., Hitchcock, S., Gingras, Y., Oppenheim, C., et al. (2004). The Access/Impact Problem and the Green and Gold Roads to Open Access. Serials Review, 30(4), 310–314. doi:10.1016/j.serrev.2004.09.013 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  20. 20. Open Access: Citações Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Eysenbach, G. (2006). Citation advantage of open access articles. PLoS biology, 4(5), e157. doi:10.1371/journal.pbio.0040157 Para a PNAS, artigos OA: • Citado antes • Mais chances de sere citados pelo menos 1 vez • Mais citações
  21. 21. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://plos.org/ • PLOS ONE • PLOS Biology • PLOS Medicine • PLOS Genetics • PLOS Computational Biology • PLOS Pathogens • PLOS Neglected Tropical Diseases
  22. 22. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://www.biomedcentral.com/
  23. 23. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://www.nature.com/srep/index.html
  24. 24. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://advances.sciencemag.org/
  25. 25. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 https://peerj.com/
  26. 26. Open Access: Periódicos Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://www.jnrbm.com/
  27. 27. Cuidado! • Alguns periódicos adotam as práticas predatórias de publicação http://scholarlyoa.com/publishers/ Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Fonte: The Scientist
  28. 28. Cuidado! http://scholarlyoa.com/2014/11/20/bogus-journal-accepts-profanity-laced-anti-spam-paper/ http://www.scs.stanford.edu/~dm/home/papers/remove.pdf Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  29. 29. Para mais: Open Access: An Introduction http://www.ercim.eu/publication/Ercim_News/enw64/jeffery.html Wiki sobre OA http://oad.simmons.edu/oadwiki/Main_Page Blog do Kuramoto: Blog brasileiro sobre OA http://kuramoto.blog.br/ Editorial Reformando a Ciência da Infection and Imunnity http://iai.asm.org/content/80/3/891.full http://iai.asm.org/content/80/3/897.full Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  30. 30. Publicação acadêmica digital: Altmetrics Atila Iamarino e Mário Henrique Barros Parte II: os dados gerados
  31. 31. Fator de Impacto O que podemos medir não é tudo que há para medir
  32. 32. O Fator de Impacto Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Como saber a relevância de um artigo? • Eugene Garfield propõe em 1955 a contagem de citações • Em 1961 começa o Science Citation Index proposto po Garfield e Irving H. Sher Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90
  33. 33. Como funciona o IF Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Quantas citações cada periódico recebeu nos dois anos anteriores / total de artigos publicados no período “Correspondence, letters, commentaries, perspectives, news stories, obituaries, editorials, interviews, and tributes are not included in the JCR’s denominator.” Artigos de 2013 Artigos de 2012 Artigos de 2011 FI 2013 FI 2012 FI 2011 Garfield, E. (2006). The history and meaning of the journal impact factor. JAMA : the journal of the American Medical Association, 295(1), 90–3. doi:10.1001/jama.295.1.90
  34. 34. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 • Nem todas áreas concentram citações em 2 a 3 anos – Nature: sim Ecology: 7 a 8 anos* • É tão acurado quanto a base de dados (Web of Science) – 25 a 35% das citações contém erros* • Pune áreas de interesse específicas • Se aplica à revista, e não ao artigo *Vanclay, J. K. (2011). Impact factor: outdated artefact or stepping-stone to journal certification? Scientometrics, 92(2), 211–238. doi:10.1007/s11192-011-0561-0
  35. 35. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Seglen, P. O. (1997). Why the impact factor of journals should not be used for evaluating research. BMJ (Clinical research ed.), 314(7079), 498–502.
  36. 36. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Rossner, M., Epps, H. Van, & Hill, E. (2007). Show me the data. Cell, 179(6), 1091–1092. doi:10.1371/journal Propriedade da Thomson Scientific e não é reproduzido http://noctique.deviantart.com/art/Fog-on-road-175259064
  37. 37. Problemas com o IF Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Fang, F. C., & Casadevall, A. (2011). Retracted science and the retraction index. Infection and immunity, 79(10), 3855-9. doi:10.1128/IAI.05661-11
  38. 38. Fator de impacto Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 É o que tem É o que tem?
  39. 39. Altmetrics Medidas individuais de artigos e pesquisadores
  40. 40. Métricas alternativas: o que medir Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  41. 41. Altmetrics Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  42. 42. Métricas alternativas: agilidade Eysenbach, G. (2011). Can tweets predict citations? Metrics of social impact based on Twitter and correlation with traditional metrics of scientific impact. Journal of medical Internet research, 13(4), e123. doi:10.2196/jmir.2012 • Menções no Twitter: - menos de 2 dias • Mais twetados: - mais downloads • 11x mais chances de serem bem citados Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  43. 43. Métricas alternativas: agilidade Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Tags associadas
  44. 44. Métricas alternativas: abrangência Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  45. 45. Métricas alternativas: abrangência Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  46. 46. Métricas alternativas: abrangência Priem, J., Piwowar, H. A., & Hemminger, B. M. (2012). Altmetrics in the wild: Using social media to explore scholarly impact. http://arxiv.org/abs/1203.4745 A: Citados e lidos B: Lidos e pouco citados C: Populares D: Escolhidos por especialistas E: Pouco impacto por estas medidas Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  47. 47. Métricas alternativas: abrangência http://blog.impactstory.org/2012/09/14/31524247207/ Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  48. 48. Métricas por artigo: quem perde Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 Lariviere, V., Lozano, G. A., & Gingras, Y. (2013). Are elite journals declining?, 12. Digital Libraries. Retrieved from http://arxiv.org/abs/1304.6460
  49. 49. Métricas por artigo: quem perde Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 http://www.nature.com/news/science-publishing-the-golden-club- 1.13951?WT.ec_id=NEWS-20131022
  50. 50. Problemas com o glamour Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015 [1] http://www.nature.com/news/retraction-challenges- 1.16023?WT.ec_id=NATURE-20141002 “Why the sudden pulse of Nature retractions in 2013 and 2014? […] We can only speculate.“1
  51. 51. Métricas alternativas: como fazer? http://altmetric.com/ Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015
  52. 52. Métricas alternativas: como fazer? Atila Iamarino | ICB-5721-9 Março 2015http://impactstory.org/
  53. 53. Programas de organização Atila Iamarino e Mário Henrique Barros
  54. 54. Leitura Atila Iamarino | ICB-5721-2 Março 2015 • Pocket – http://getpocket.com/ • Instapaper – http://www.instapaper.com/ • Readability – http://www.readability.com/ • Evernote Web Clipper
  55. 55. Captura Atila Iamarino | ICB-5721-2 Março 2015 • Web • Ideias • Fotos • Arquivos • PDFs http://evernote.com/evernote/
  56. 56. Captura e organização de artigos Atila Iamarino | ICB-5721-2 9 Março 2015 • Captura automática de artigos • Páginas Web • Acesso offline • Anotação • Sincronização • PDFs • Reference Manager http://www.zotero.org/
  57. 57. Captura e organização de artigos Atila Iamarino | ICB-5721-2 Março 2015 • PDFs • Acesso offline • Anotação • Sincronização • Reference Manager • Rede social • Compartilhamento http://mendeley.com/
  58. 58. Para aula prática: Montar caderno de notas do Evernote com: • Uma nota com PDF anotado • Uma nota com áudio • Uma nota com um links • Uma nota com link para arquivo do computador • Uma nota com a resenha de um programa relacionado à disciplina • Uma nota descrevendo seu projeto e como um dos programas poderia ajudar • Uma nota de laboratório (documentação de arquivo, foto de gel, etc) Atila Iamarino | ICB-5721-2 Março 2015

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